1. Browse the Database
  2. View Redoxidase
Entry information : NoffFSD02-1B(Nasoff178g0142140.t1)
Entry ID 18939
Creation 2023-10-30 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-11-09 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2023-11-27 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NoffFSD02-1B(Nasoff178g0142140.t1)
Name NoffFSD02-1B(Nasoff178g0142140.t1)
Class FeSOD     [Orthogroup: FSD002]*
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Nasturtium officinale    [TaxId: 65948 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value NoffFSD02-1B
start..stop		 S start..stop
NoffFSD02-1A 571 0 1..304 1..304
AtFSD02 559 0 1..304 1..305
TsFSD02 496 2.76e-179 1..304 1..306
ThasFSD02 411 5.74e-146 2..270 1..274
Literature and cross-references NoffFSD02-1B(Nasoff178g0142140.t1)
Protein sequence: NoffFSD02-1B(Nasoff178g0142140.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   304
PWM (Da):   %s   34499.07  
PI (pH):   %s   4.62
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MMTVAVTATS SVLSCPSLLC SQVPSRRMQW KRNEKRRCST KVAVSGVVTA GFELKPPPYP LDALEPHMSR ETLDYHWGKH HRTYVENLNK QIVGTDLDGL SLEEIVLLSY NRGNMLPAFN  NAAQAWNHEF FWECIQPGGG GKPTGELLKL IERDFGSFKD FMERFKSAAA SNFGSGWTWL AYKANRLEVA NAVNPLPKEE DKKLVIVKTP NAVNPLVWDY SPLLTIDTWE HAYYLDFENR 
RAEYINTYME KLVSWETVST RLESAIARAV EREQEGTETE DEESLDDEEP EVYLDSDIDV SEVD 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATGACAG TAGCAGTGAC AGCCACTTCC TCAGTTCTCT CATGCCCTTC GCTTCTTTGT TCTCAAGGTC TCTCCTTTAT TTATTTTTAA TCTTTCTTAC CTCTTCCTCT TCCTCACTGT  GAACTCCTGG GTTTGTTTAT ATGGGTTTTG TTTATGAATT ACAGTGCCAA GCCGGCGAAT GCAATGGAAA AGAAACGAAA AGGTTGGGTT TTGTAAATTC TCTTTTATCT TCTGAAAGTT  CGAATCAGCT CAAAAAATTC TACAAGGAAC TCTTTTTTCA GTGACAATAT GACCAAGGAA TTATGCATGG ATACTGTTTG ATGAAATGCT TGAATGAAAC TTGAACACTT TCTTTAGTTT  TTTTTTCTTA CTTTTATTTC ACAGAGACGG TGCTCTACAA AGGTGGCTGT TTCCGGAGTT GTTACAGCTG GATTTGAGCT GAAGCCGCCT CCATATCCTC TTGTATGTAT TCTTGAATTC  GTTATCAAGA GTTTAGTTTC GAGTTTTAGA ATAAAGACAC AGTATTTAGA TTGGTGTTTT GGTTGATATA ATGATATCAT TGGATCTGAG TTCGTTTATT CTGTTGCTAA TAATACGGTA  GTGATATAAG TTTGAACCTA TTAGGAAACA TTACTTTCTA TTTGAAGATG AATGTAGGAG CAAGGAATAG GAAGACACTA TATGAATCAT ACTTAAAAGT CAAAGAGGTT GCTGCTTTGG  ATTGGAACCA TATGGGAGAT TTTGCTCACT CTGTGTCTGT TGTTGAATGT GTTGATATAT GGTAGGATGC TTTGGAGCCG CATATGAGTC GGGAAACGTT GGATTATCAT TGGGGAAAAC  ATCACAGAAC TTACGTAGAG AACCTGAACA AGCAAATTGT TGGCACTGAT CTAGATGGAT TGTCCTTAGA AGAAATTGTG CTTCTTTCAT ACAACAGAGG GAATATGCTT CCTGCCTTCA  ACAACGCTGC ACAGGTAAAT TCCATATTGT TTCCCATTAG TACGTATAAG TGGCAGTATC GGTGTTGTAA AGCTTCAGGT TATGTAGATA TATTGCCGTA GAAATTTAGA GGCAGTGACA  CGGTTGAATG CATTGACATG TTGCATTTAG TTTGGTCAAG AAACAACATT TCAGGATAAG TGAGTAAACA CAACGATCCA TACCTTGTTC AGATTAGGAC TACGGCTCAT AATGGCAAGT  CTCATAATGG TTGGTTTCTC TGGATTAGAT GTGAATTAAA AGTATTTGTG GAGCTTGCAG GCATGGAACC ACGAGTTCTT CTGGGAGTGT ATCCAACCTG GGGGTGGAGG AAAGCCAACT  GGAGAGCTCC TCAAATTAAT AGAGAGAGAT TTCGGGTCTT TCAAAGACTT TATGGAAAGA TTCAAGTCGG CTGCAGCCTC TAATTTTGGT TCCGGTTGGA CATGGCTTGC ATGTGAGTGT  TTTCTTTTTA ATTTTGTACC TTTTCAAATG TGCAAACTCC CCAACAACTT ACTTACTTAA GCTTCTGAGG ATCCATTGAT GCAGACAAGG CGAATAGACT TGAAGTTGCA AATGCTGTAA  ATCCGCTCCC AAAGGAAGAA GACAAGAAGC TTGTAATAGT GAAGACTCCC AATGCAGTTA ATCCACTCGT ATGGGATTAT TCTGTAAGTT TCTAAACTTC CAGTATGGAA ATGAATCTTT  GTTGTTGGCT ATTATGGATC CTTATCTCCT CACACTTTTG GTCTTTACTT TTATCTGTAG CCACTTCTCA CCATTGATAC CTGGGAGGTA TAACATTATC CTACTCCGCT CTATATCTTA  ATTTCACCTG GAATTCTTCA TTGCTGACTT CGTTTTCTTT TGCCCTCTCT GTACCAAACA GCACGCTTAC TATCTAGATT TCGAGGTACC ATCAAAAACC CGAATGATTT TCACTAAATT  TGAAAGCAAC GGCTCTCATG TTTGTTGTAT TCTACGCAGA ACCGAAGGGC TGAATACATA AATACATACA TGGAAAAGCT TGTGTCATGG GAAACTGTAA GCACAAGGCT GGAATCTGCA  ATCGCTCGAG CAGTAGAAAG AGAACAAGAA GGAACAGAGA CAGAAGATGA AGAGAGTTTA GATGATGAAG AGCCAGAGGT TTACTTAGAT AGTGATATCG ATGTATCAGA GGTTGATTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATGACAG TAGCAGTGAC AGCCACTTCC TCAGTTCTCT CATGCCCTTC GCTTCTTTGT TCTCAAGTGC CAAGCCGGCG AATGCAATGG AAAAGAAACG AAAAGAGACG GTGCTCTACA  AAGGTGGCTG TTTCCGGAGT TGTTACAGCT GGATTTGAGC TGAAGCCGCC TCCATATCCT CTTGATGCTT TGGAGCCGCA TATGAGTCGG GAAACGTTGG ATTATCATTG GGGAAAACAT  CACAGAACTT ACGTAGAGAA CCTGAACAAG CAAATTGTTG GCACTGATCT AGATGGATTG TCCTTAGAAG AAATTGTGCT TCTTTCATAC AACAGAGGGA ATATGCTTCC TGCCTTCAAC  AACGCTGCAC AGGCATGGAA CCACGAGTTC TTCTGGGAGT GTATCCAACC TGGGGGTGGA GGAAAGCCAA CTGGAGAGCT CCTCAAATTA ATAGAGAGAG ATTTCGGGTC TTTCAAAGAC  TTTATGGAAA GATTCAAGTC GGCTGCAGCC TCTAATTTTG GTTCCGGTTG GACATGGCTT GCATACAAGG CGAATAGACT TGAAGTTGCA AATGCTGTAA ATCCGCTCCC AAAGGAAGAA  GACAAGAAGC TTGTAATAGT GAAGACTCCC AATGCAGTTA ATCCACTCGT ATGGGATTAT TCTCCACTTC TCACCATTGA TACCTGGGAG CACGCTTACT ATCTAGATTT CGAGAACCGA  AGGGCTGAAT ACATAAATAC ATACATGGAA AAGCTTGTGT CATGGGAAAC TGTAAGCACA AGGCTGGAAT CTGCAATCGC TCGAGCAGTA GAAAGAGAAC AAGAAGGAAC AGAGACAGAA 
GATGAAGAGA GTTTAGATGA TGAAGAGCCA GAGGTTTACT TAGATAGTGA TATCGATGTA TCAGAGGTTG ATTAA 

Retrieve as FASTA