protTMHMM
MyspiRboh12	939	115.88	0.00	4	o375-397i517-539o559-581i738-755o

View Redoxidase 19054
Entry information : MyspiRboh12(Myrspi0014g0373050.t1)
Entry ID 19054
Creation 2025-06-11 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2025-06-11 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: MyspiRboh12(Myrspi0014g0373050.t1)
Name MyspiRboh12(Myrspi0014g0373050.t1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Myriophyllum spicatum    [TaxId: 208873 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value MyspiRboh12
start..stop
S start..stop
MyspiRboh17 1922 0 1..939 1..939
MyspiRboh31 1904 0 1..939 1..939
CcaRboh05 1555 0 9..939 7..945
CcaRboh01 1555 0 9..939 7..945
Literature and cross-references MyspiRboh12(Myrspi0014g0373050.t1)
Protein sequence: MyspiRboh12(Myrspi0014g0373050.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   939
PWM (Da)   %s   107301.29 Transmb domain   %s   o375-397i517-539o559-581i738-755o
PI (pH)   %s   9.67
A INSERT TMH
INSERT INTO TMH(TMH_IdPerox,TMH_PeroxName,TMH_Type,TMH_Length, TMH_Expa,TMH_First60,TMH_PredHel,TMH_Topo) VALUES ('19054','MyspiRboh12','pep','939','115.88','0.00','4','o375-397i517-539o559-581i738-755o')

Insert TMH record :
INSERT INTO TMH(TMH_IdPerox,TMH_PeroxName,TMH_Type,TMH_Length, TMH_Expa,TMH_First60,TMH_PredHel,TMH_Topo) VALUES ('19054','MyspiRboh12','pep','939','115.88','0.00','4','o375-397i517-539o559-581i738-755o')

Update Perox 19054 Properties = '939;9.67;107301.29'
signalp /usr/local/bioinfo/src/SignalP/signalp-4.1/signalp -m ./assets/temp/tmp_mature ./assets/temp/tmp_pep 2>/dev/null
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MRELRETTHE RTWSCDAMTP GSTRSHSVNS SNSEFVEVIL DVQDDDTVIL RSVEPAAATA TTLENSPSLA ETDGGSRSSS MRRSSSNSRI RQFSQELKAG ARHFSQELKA ELRRFSWSHT  HASKMLTPSL SAGGGANSDA LASRALRRQR AQLDRTRSGA RRALQGLRFI SKSGGSGGNK NSVEAWNEVQ ENFSKLEKNG FLLRADFAQC IGMKDSKEFA LEIFDALSRR RRLKFEMISK  EELFEYWSQI TDQSFDSRLQ IFFDMVDKNE DGRITEEEVI EIIKLSASAN KLSRLKEQAE EYAALIMEEL DPERLGYIEL WQLETLLLQK DTYMNYSQAL SYTSQALSQN LQGLRRRSRI  RRISSKFLYF LQENWRRIWV LLIWILIMIG LFTWKFLQYK NKDAFKVMGY CLCTAKGAAE TLKFNMALIL FPVCRNTITW LRSTRLGHCV PFDDNINFHK TIAAAIVIGV ILHAGNHLSC  DFPRLINESE ATYRLYLIQF FGPNKPGYVD LLRGVEGITG VLMVILMALA FILATHWFRR SQVKLPKPFD RLTGFNAFWY SHHLFVIVYI LLVIHGFFLY LVHKWYLKTT WMYLAIPVLL  YAGERTLRYF RAGFYTVRLL KVAIYPGNVL TLQMSKPPQF RYKSGQYMFV QCPAVSPFEW HPFSITSAPG DDYLSVHIRQ LGDWTRELRR IFSEVCEAPV AGKSGLLRAD ETTKTTLPKL  KIDGPYGAPA QDYKKYDVLL LVGLGIGATP FISILKDLLN NIIKMEEQAD SISDFSTFSD QSFGMTDSTT SNRISPSKRK LKTTNAYFYW VTREQGSFDW FKGVMNEVAE LDQRGVIEMH 
NYLTSVYEEG DARSALITMV QALNHAKNGV DIVSGTRVKT HFARPNWKKV LSKLSSKHTN ARIGVFYCGQ PVLGKELSKL CYEFNQKGST KFEFHKEHF 

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Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGAGAGT TGAGGGAGAC GACCCACGAA CGGACCTGGA GTTGTGACGC CATGACTCCG GGATCAACCC GGTCGCACTC CGTGAACTCT TCCAACTCGG AGTTCGTAGA AGTCATCCTC  GACGTCCAGG ACGACGACAC CGTCATTCTC CGCAGCGTTG AGCCTGCAGC GGCAACCGCA ACAACCCTCG AGAACTCTCC TTCGTTAGCA GAGACTGATG GTGGCTCGAG GTCGTCGTCG  ATGAGGCGCA GCTCGTCCAA CAGCCGCATA CGTCAGTTCT CACAGGAGCT CAAGGCCGGA GCTCGGCATT TCTCGCAGGA GCTCAAGGCT GAGCTGCGGC GGTTTTCTTG GAGCCACACC  CACGCTTCTA AGATGCTCAC GCCGTCTCTG AGCGCCGGCG GAGGTGCTAA CTCCGATGCA TTAGCGTCGA GGGCGCTCCG GCGGCAAAGG GCGCAGCTTG ATCGAACCCG GTCTGGAGCC  CGCCGGGCGC TGCAAGGCCT TAGGTTTATT AGTAAAAGTG GAGGCAGCGG TGGAAATAAG AACAGTGTGG AAGCTTGGAA CGAGGTTCAA GAAAACTTCT CTAAGCTTGA GAAAAATGGG  TTTCTTCTTC GAGCAGATTT TGCACAATGC ATAGGTTTTT TGTTCCCTCT CTTTTTACCT TTCATCTCAT ATTTTACTTA AGATTGTTTT CCGGCCGACG CCAACTAGTT TGAGATTAAA  ATCCGATAAC CGTGAATCAA TCCAATATAT ATATATAAAT GTGTGTGTGT TGTGACGACA GTCTTGATAC GTTTTCAAAG AGTTTTTGTG GGTCTTAATT GGCATTATCT TTTGTCGTTG  TGATTAAATT ATTGAAGGGA TGAAAGATTC AAAGGAGTTT GCTTTGGAGA TATTTGATGC ATTGAGTCGA AGAAGGAGAT TGAAGTTTGA GATGATCAGC AAAGAGGAGC TGTTTGAGTA  TTGGTCACAA ATTACCGACC AAAGTTTTGA TTCTCGACTA CAAATCTTCT TCGACATGTA TGGAAATCAA TTTCTATTTT TTCCCTTCAA TTATCATTTT CAAAATTATT ACTAACCATT  TTTAAAAAAA AAAAAATTAA TGGAAGTTAA TGGTGAGAAC TGCAGTGTCT GCAGGTGTAG GCCGTAGCAT TTGCCTGATT TAATTTACTG TTTCATTGAA AATAATTAAT GTAATTATTG  TATGTTTGGG TATTAAAATT ACAGGGTGGA CAAGAATGAA GACGGTAGAA TTACAGAGGA GGAAGTAATA GAGGTAAAGT ATATATTATT CAAATGTACT TCAAATCACT TCACAAGTCA  ATTTTTTTTT AAAAAAATTA TCATATAAAA AAATAAAGGT TGAGAAAAAA AAAAGATAAA GCAAGTCACT ATATGTGTCC AATATTCCAT CATATTTGTT GGAGCAATAA GAAGAAAAGT  TTTTTTAATT TTTTTTTAAA AAGAAGTGTA AGAAATTTGC TGGCATTTTG CCATTTCTTC TAGGTATAAC AAAGTCGTTT AGTGTATTTT AATTTACTCA CAACTATAGT TTGAACAGTA  AACGGTAGGC GGGATTTGGT GAACTTATGA CGATGATCAT TTGTGGTTAG ATTGAATCAC AAAGTTACAC GATCCATAAT ATAAGTTCAT CATTATTGTT TTCCTTTTAG CAAAAGAAAT  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AAAAATACCT CAACCTTGTA AATTAATAAT TATTTTTTGT ATGTATTCGG TATGCCAAAT AAATTTTTCA TTGACCTTTT GTATCCAAAA AGGTCAATTA TTCGCAGACG TTTTTGCACA  TAATGAGCAT GCATTTTTCG GAAAACAAGC AAAACACTTT TTCCCATCAT CATTAGATGA CTTTTGTCGC CATTTTCCAA TAAATTAAAT GTTGTAAACT AAAATTAATT ATCTAATTAT  TGATATAGGT GGCAGTCCAA ATGAGCTATG CTATTTCTTT GGTCGTCTAT AATAAAATTA ATTTTGATAT TCTTATATAA AAAACATTTA TATTAGGAAA TCACAAAGTT TAATTGTTAT  AATTTAATAC AAAATTAAAT AAAATTTTGA CAAAAGATAT AAAAAAAATA GGAGAAAATA GTTCAACCTT GTGGAGGTGG TAACAAGACT TTAGTGGTTG AACGGCTTTA ACATATCTAT  CAACTTAACA TTCCTATCCT AAATTTAATA TAATTATTCA CTTAAGATGA ATTATTTTTT ACTTTTTGGA TATTAATTAA GTTAAACTCT TTACTAATAG ATTATATTTT TTACCAAGAT  TTTTTTTTTA TTTTTTGTAA TTTTTTTTTA TCAATTTCAA CCCCAAGTTT TGCTAATGCT GACAATCGTC ACGTCGTCAT CGGTGTTGAA TTATGATACC ATATGCATTA CTTTGCTTTT  CTAGACAATG TTACATGCTC ATAACGCGTA TACAACTTAC AAGGCGTGAT GATGCATCCA CTGAGATCGC AATGATCACA ACATTCTTCA ATCTGTTTCC CTTTTTTACT TCAATTTGAT  TCACTCCTGA TGGCTGACGT GTTATTTCTG TATTCGCCTC TTTTGTTGCA CGATAATTTT GTAACAAAGG ACGTTTATTC TAGGAGAGAT AAGAAATATT TAACGCGAAT CGATCTTACT  CAAACACATA TAAATTGACT TGGTGTTATG TTTATCAATG CATATCTTAG TTTTAAATCG ACAACGTACA ATAATAAACT TATCACATTT GCAAATTTCA AAATAAATTT GAATCTAATA  ATTAAGAATG ACCATGTGTG TGTGTGACAC AAATAAGGGA CTATTGAGTC CATGAATTTG TTGTGTGTAT TATTGTGTTG ACCTTGACCA ATATTGACCA TTTTGTTGAC CTGAAAACCT  GTGCACACTT CTGATGCTGC TGCAGCTATG GCAACTGGAA ACACTTCTGT TGCAGAAAGA CACCTACATG AACTACAGTC AAGCACTGAG TTACACTAGC CAAGCACTGA GTCAGAATCT  ACAAGGACTA AGAAGAAGAA GCCGCATTAG AAGAATTAGC TCGAAATTTC TCTACTTTCT GCAAGAGAAT TGGAGGAGAA TATGGGTGCT TCTCATCTGG ATATTGATCA TGATCGGATT  GTTCACCTGG AAATTCCTTC AGTATAAGAA CAAGGATGCT TTTAAGGTCA TGGGGTATTG TCTCTGTACG GCCAAAGGTG CGGCGGAGAC GCTGAAATTC AACATGGCTC TCATCTTATT  CCCCGTTTGC CGGAACACCA TCACTTGGCT CAGGTCCACT CGGCTCGGAC ATTGTGTGCC GTTTGATGAC AACATTAATT TTCACAAGGT AAATTCTGAT TTCTGAGCTC ATTATTGTAG  TAGAATTCGT TTAAAGGAAG GATCTTTTTT CACGGATTCA ATGAGCAATT CGTATAAAGG AGAGATTTTT ACCGTGGGCC ATTGACTGCA AATTGATGGT AGTTAATCTC GTGTCAGAAG  CAATGAAGAA AAGAACACGG TGGTGAGATT TTAGTTTGGT CTTTTTTCAT ATGATTCCAT TTTGACTATG TGAAAAGTGG TAGTGAAAGT AAACTTTTCT GATTCATACA AGGATGGGCG  ATAAATAGGA TGAGTGTGTT TTACTTTCCA GCAGCATACA GACTGTGATA ACATTATTAG GTACACAGTT GAGAGTGTCT TGTGAATCAT TGTGTTGAAT CGAGTTTGAG AGGGAAGAAA  ATGTCTACAT CTAGAAATGG CAGTGGTCCA ATTTCAGTGG CCACTAGAAC ATTTTCTGAA GTCAGATGAA CTTAGTTGAT TACAATAGTT TCTATGATTA TCTGGAACCC CAAATGTCAA  GCAAGAGTCG ATTATTTCCC ATTCTTGTCA ACAGCATCCT AGCATTGGAT AAACTAATGA AGGACCCTGT ATCGACTCTG TAGGATTAAG GTATCAGATG TGTAGTAGGC ATGATCAGAA  ATATTCCATG CCAGAATGTT TACTATTATA GTCCCTTGTA TATGACAATG TTCACCATCG ATATGTTTTT TTTCTTACAG CTCATGAACA AAATTTAATC AAGGTATCTT ATTTTCTTCA  GACTATTGCC GCTGCCATTG TGATTGGTGT TATTTTACAT GCTGGGAATC ATCTTTCATG CGATTTTCCA AGGCTAATAA ACGAGAGTGA AGCAACCTAT AGGCTGTATC TTATTCAATT  TTTTGGTCCT AATAAACCGG GCTATGTTGA TCTGCTTCGA GGGGTAGAAG GTATCACAGG AGTCTTGATG GTGATCCTCA TGGCTCTCGC TTTTATACTT GCCACCCATT GGTTTAGGCG  TAGCCAAGTT AAGCTGCCGA AGCCCTTTGA TAGACTAACT GGCTTCAATG CGTTTTGGTA CTCGCACCAT CTTTTCGTGA TTGTGTATAT CCTGCTCGTA ATCCATGGAT TCTTTCTCTA  TCTTGTCCAT AAATGGTACC TGAAGACGGT ATATTTTTCT AACCTTTTGC TTACTCATTT CAATATTGGC ATTAATCGGT GCCATTCTGT CATTGTTCTT ACTTATTTTA TCTCTTGTGG  TAACAGACAT GGATGTATCT AGCAATTCCT GTTTTACTAT ATGCTGGTGA AAGGACCCTC AGATACTTTA GAGCTGGATT CTACACTGTG CGTCTTTTGA AGGTATGCAT AAAAAATATT  CTCTAGTATA TTAAGATAAG AGTAACAGTT TCTCCTATGC TCATGCTTTT GATGTGATTT GGACATCAAC CTCACAACCC AACACTTGCT CTGTTGCGGA ATGTTTACAG GTAGCAATTT  ATCCCGGGAA CGTTCTTACA CTGCAGATGT CCAAACCTCC ACAATTCCGC TACAAGAGTG GACAATATAT GTTTGTCCAA TGCCCTGCTG TTTCTCCATT TGAATGGTAA GGCCACATCA  ACCTCTCTGA AATCACGCAT ATCTCTACTT TGGGGATAAG TGAGACATGG TTTTAGAACT ATGTTACCTT GATCAAATTA GTGATCATGA TGTCTTTTTT GCAAACGCCG TAAGAATTCG  AACCCAAGTA TTCTCAACTG GATCTTTCTT TTTGCAAACT ACACAGGCAT CCATTTTCCA TAACTTCAGC TCCAGGTGAT GACTACCTCA GTGTTCACAT CCGGCAACTG GGTGACTGGA  CACGGGAGCT TAGAAGGATA TTCTCTGAGG TTTGTGAGGC TCCTGTTGCA GGAAAGAGTG GTCTGCTAAG AGCCGATGAA ACAACAAAGA CAACGTAAGT GAGCTGAATT CGATATTTAT  TTTCAGTTTG AACTTCTCCA TGTGTCTCAA CTACCGTATT TCAATGTTTC AGTCTGCCAA AGCTCAAAAT TGATGGCCCT TATGGAGCTC CAGCACAAGA CTACAAAAAA TATGATGTCC  TGCTACTCGT AGGCCTCGGG ATTGGAGCAA CACCTTTCAT TAGCATTCTG AAAGATCTGC TAAACAACAT TATCAAAATG GAGGAACAGG CTGTGAGTGA ATATGTGCTC ATTTTAACCA  TTGGATATAT TCTGTCTTCC AACACGAATA AGATGAAGTG GTCCTAGGCA ATATAATTAC ATGACTTACT GAGTATAGTG TGAATGATAA GAAAATGGTA TTGAAATTCC TGATTTGAAA  GAGCATCTTT ACACTGCTAA AAAAATTACA ATTTGACTTG TTACTGCTTT ACAGGATTCA ATATCCGACT TCAGTACATT TTCGGACCAA AGTTTCGGCA TGACAGATTC CACCACTTCT  AACAGAATAT CTCCAAGTAA AAGAAAACTC AAGACAACCA ATGCCTACTT CTATTGGGTC ACTAGGGAGC AGGGCTCGTT TGATTGGTTC AAAGGGGTTA TGAATGAAGT TGCCGAGCTT  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ATTCGAGTTT CACAAGGAGC ATTTCTAA 

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CDS
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGAGAGT TGAGGGAGAC GACCCACGAA CGGACCTGGA GTTGTGACGC CATGACTCCG GGATCAACCC GGTCGCACTC CGTGAACTCT TCCAACTCGG AGTTCGTAGA AGTCATCCTC  GACGTCCAGG ACGACGACAC CGTCATTCTC CGCAGCGTTG AGCCTGCAGC GGCAACCGCA ACAACCCTCG AGAACTCTCC TTCGTTAGCA GAGACTGATG GTGGCTCGAG GTCGTCGTCG  ATGAGGCGCA GCTCGTCCAA CAGCCGCATA CGTCAGTTCT CACAGGAGCT CAAGGCCGGA GCTCGGCATT TCTCGCAGGA GCTCAAGGCT GAGCTGCGGC GGTTTTCTTG GAGCCACACC  CACGCTTCTA AGATGCTCAC GCCGTCTCTG AGCGCCGGCG GAGGTGCTAA CTCCGATGCA TTAGCGTCGA GGGCGCTCCG GCGGCAAAGG GCGCAGCTTG ATCGAACCCG GTCTGGAGCC  CGCCGGGCGC TGCAAGGCCT TAGGTTTATT AGTAAAAGTG GAGGCAGCGG TGGAAATAAG AACAGTGTGG AAGCTTGGAA CGAGGTTCAA GAAAACTTCT CTAAGCTTGA GAAAAATGGG  TTTCTTCTTC GAGCAGATTT TGCACAATGC ATAGGGATGA AAGATTCAAA GGAGTTTGCT TTGGAGATAT TTGATGCATT GAGTCGAAGA AGGAGATTGA AGTTTGAGAT GATCAGCAAA  GAGGAGCTGT TTGAGTATTG GTCACAAATT ACCGACCAAA GTTTTGATTC TCGACTACAA ATCTTCTTCG ACATGGTGGA CAAGAATGAA GACGGTAGAA TTACAGAGGA GGAAGTAATA  GAGATAATCA AATTGAGCGC TTCAGCAAAT AAGTTATCGA GGTTGAAGGA GCAGGCAGAA GAATACGCAG CATTGATCAT GGAGGAGTTA GATCCCGAAA GACTTGGTTA TATAGAGCTA  TGGCAACTGG AAACACTTCT GTTGCAGAAA GACACCTACA TGAACTACAG TCAAGCACTG AGTTACACTA GCCAAGCACT GAGTCAGAAT CTACAAGGAC TAAGAAGAAG AAGCCGCATT  AGAAGAATTA GCTCGAAATT TCTCTACTTT CTGCAAGAGA ATTGGAGGAG AATATGGGTG CTTCTCATCT GGATATTGAT CATGATCGGA TTGTTCACCT GGAAATTCCT TCAGTATAAG  AACAAGGATG CTTTTAAGGT CATGGGGTAT TGTCTCTGTA CGGCCAAAGG TGCGGCGGAG ACGCTGAAAT TCAACATGGC TCTCATCTTA TTCCCCGTTT GCCGGAACAC CATCACTTGG  CTCAGGTCCA CTCGGCTCGG ACATTGTGTG CCGTTTGATG ACAACATTAA TTTTCACAAG ACTATTGCCG CTGCCATTGT GATTGGTGTT ATTTTACATG CTGGGAATCA TCTTTCATGC  GATTTTCCAA GGCTAATAAA CGAGAGTGAA GCAACCTATA GGCTGTATCT TATTCAATTT TTTGGTCCTA ATAAACCGGG CTATGTTGAT CTGCTTCGAG GGGTAGAAGG TATCACAGGA  GTCTTGATGG TGATCCTCAT GGCTCTCGCT TTTATACTTG CCACCCATTG GTTTAGGCGT AGCCAAGTTA AGCTGCCGAA GCCCTTTGAT AGACTAACTG GCTTCAATGC GTTTTGGTAC  TCGCACCATC TTTTCGTGAT TGTGTATATC CTGCTCGTAA TCCATGGATT CTTTCTCTAT CTTGTCCATA AATGGTACCT GAAGACGACA TGGATGTATC TAGCAATTCC TGTTTTACTA  TATGCTGGTG AAAGGACCCT CAGATACTTT AGAGCTGGAT TCTACACTGT GCGTCTTTTG AAGGTAGCAA TTTATCCCGG GAACGTTCTT ACACTGCAGA TGTCCAAACC TCCACAATTC  CGCTACAAGA GTGGACAATA TATGTTTGTC CAATGCCCTG CTGTTTCTCC ATTTGAATGG CATCCATTTT CCATAACTTC AGCTCCAGGT GATGACTACC TCAGTGTTCA CATCCGGCAA  CTGGGTGACT GGACACGGGA GCTTAGAAGG ATATTCTCTG AGGTTTGTGA GGCTCCTGTT GCAGGAAAGA GTGGTCTGCT AAGAGCCGAT GAAACAACAA AGACAACTCT GCCAAAGCTC  AAAATTGATG GCCCTTATGG AGCTCCAGCA CAAGACTACA AAAAATATGA TGTCCTGCTA CTCGTAGGCC TCGGGATTGG AGCAACACCT TTCATTAGCA TTCTGAAAGA TCTGCTAAAC  AACATTATCA AAATGGAGGA ACAGGCTGAT TCAATATCCG ACTTCAGTAC ATTTTCGGAC CAAAGTTTCG GCATGACAGA TTCCACCACT TCTAACAGAA TATCTCCAAG TAAAAGAAAA  CTCAAGACAA CCAATGCCTA CTTCTATTGG GTCACTAGGG AGCAGGGCTC GTTTGATTGG TTCAAAGGGG TTATGAATGA AGTTGCCGAG CTTGATCAAA GAGGGGTGAT TGAGATGCAC  AACTACTTGA CTAGTGTTTA TGAAGAAGGT GATGCACGTT CTGCACTCAT CACTATGGTC CAGGCACTGA ACCATGCCAA GAATGGGGTT GACATTGTCT CCGGCACTCG GGTGAAAACA  CATTTTGCAA GGCCAAATTG GAAGAAGGTA CTGTCCAAGT TATCTTCCAA ACATACAAAT GCAAGAATAG GTGTATTCTA CTGCGGACAG CCAGTCCTAG GCAAAGAACT CAGCAAATTA 
TGCTATGAGT TCAACCAGAA AGGTTCCACT AAATTCGAGT TTCACAAGGA GCATTTCTAA 

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