protTMHMM
MyspiRboh31	939	113.77	0.00	4	o375-397i517-539o559-581i738-755o

View Redoxidase 19073
Entry information : MyspiRboh31(Myrspi0037g0760320.t1)
Entry ID 19073
Creation 2025-06-11 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2025-06-11 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: MyspiRboh31(Myrspi0037g0760320.t1)
Name MyspiRboh31(Myrspi0037g0760320.t1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Myriophyllum spicatum    [TaxId: 208873 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value MyspiRboh31
start..stop
S start..stop
MyspiRboh17 1914 0 1..939 1..939
MyspiRboh12 1904 0 1..939 1..939
CcaRboh05 1555 0 9..939 7..945
CcaRboh01 1555 0 9..939 7..945
Literature and cross-references MyspiRboh31(Myrspi0037g0760320.t1)
Protein sequence: MyspiRboh31(Myrspi0037g0760320.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   939
PWM (Da)   %s   107162.22 Transmb domain   %s   o375-397i517-539o559-581i738-755o
PI (pH)   %s   9.61
A INSERT TMH
INSERT INTO TMH(TMH_IdPerox,TMH_PeroxName,TMH_Type,TMH_Length, TMH_Expa,TMH_First60,TMH_PredHel,TMH_Topo) VALUES ('19073','MyspiRboh31','pep','939','113.77','0.00','4','o375-397i517-539o559-581i738-755o')

Insert TMH record :
INSERT INTO TMH(TMH_IdPerox,TMH_PeroxName,TMH_Type,TMH_Length, TMH_Expa,TMH_First60,TMH_PredHel,TMH_Topo) VALUES ('19073','MyspiRboh31','pep','939','113.77','0.00','4','o375-397i517-539o559-581i738-755o')

Update Perox 19073 Properties = '939;9.61;107162.22'
signalp /usr/local/bioinfo/src/SignalP/signalp-4.1/signalp -m ./assets/temp/tmp_mature ./assets/temp/tmp_pep 2>/dev/null
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MRELRTTTHE QSWSCDAMTP GSTRSHSVNS SNSEFVEVVL DVQDDDTIIL RSVEPAAATA TTLENSPSLA ATDGGSRSSS MRHSSSSSRI RQFSQELKAG ARHYSQELKT ELRRFSWSHS  HAAKMLTPSL SAGGGSNSDA LAARALRRQR AQLDRTRSGA RKALQGLRFI SKSGGSGENK NNVEAWNEVQ ENFSKLEKNG FLLRADFAQC IGMKDSKEFA LEIFDALSRR RRLKFEMISK  EELFEYWSQI TDQSFDSRLQ IFFDMVDKNE DGRITEEEVK EIIVLSASAN KLSRLKEQAE EYAALIMEEL DPERLGYIEL WQLETLLLQK DTYMNYSQAL SYTSQALSQN LQGLRRRSRI  RRISSKFLYS LQENWRRIWV LLIWILIMIG LFTWKFLQYK NKDAFKVMGY CLCTAKGAAE TLKFNMALIL FPVCRNTITW LRSTRLGHCV PFDDNINFHK TIAAAIVIGV ILHAGNHLSC  DFPRLINESE ATYRLYLIEL FGPNKPSYVD LLRGVEGITG VLMVILMALA FILATHWFRR SQVKLPKPFD RLTGFNAFWY SHHLFVIVYI LLVIHGIFLY LVQKWYLKTT WMYLAIPVLL  YAGERTLRYF RAGFYTVRLL KVAIYPGNVL TLQMSKPPQF RYKSGQYMFV QCPAVSPFEW HPFSITSAPG DDYLSVHIRQ LGDWTRELRR IFSEVCEAPV AGKSGLLRAD ETTKTTLPKL  KIDGPYGAPA QDYKKYDVLL LVGLGIGATP FISILKDLLN NIIKMEEQAD SISDFSRFSD QSFGMTDSTN SNRISPSKRK LKTTNAYFYW VTREQGSFDW FKGVMNEVAE LDQRGVIEMH 
NYLTSVYEEG DARSALITMV QALNHAKNGV DIVSGTRVKT HFARPNWKKV LSKLSSKHTN ARIGVFYCGQ PVLGKELSKL CYEFNQKGST KFEFHKEHF 

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Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGAGAGT TGAGGACGAC GACCCACGAA CAGAGTTGGA GTTGTGACGC CATGACTCCC GGATCAACCC GGTCGCACTC CGTGAACTCT TCCAACTCGG AGTTCGTCGA AGTCGTCCTC  GACGTCCAGG ACGACGACAC CATCATTCTC CGCAGCGTTG AGCCAGCAGC GGCAACCGCA ACAACCCTCG AGAACTCTCC GTCGTTAGCA GCGACTGATG GTGGCTCGAG GTCGTCGTCG  ATGAGGCACA GCTCGTCCAG CAGCCGCATA CGTCAGTTCT CGCAGGAGCT CAAGGCCGGA GCTCGGCATT ACTCGCAGGA GCTCAAGACT GAGCTGCGGC GGTTTTCTTG GAGCCACAGT  CACGCTGCTA AGATGCTAAC GCCGTCTCTG AGCGCCGGCG GAGGTTCTAA CTCCGATGCA TTGGCGGCGA GGGCGCTCCG GCGGCAAAGG GCGCAGCTTG ATCGAACCCG GTCTGGAGCC  CGCAAGGCGC TGCAAGGCCT TAGGTTTATT AGTAAAAGTG GAGGCAGCGG TGAAAATAAG AACAACGTGG AAGCTTGGAA CGAGGTTCAA GAAAACTTCT CTAAGCTTGA GAAAAATGGG  TTTCTTCTTC GAGCAGATTT TGCACAATGC ATAGGTTTTT TTTCCTCTCT TTTTACCTTT CATCTCATAT TTTACTTAAG ATTGTTTTTC CGGTCGACAC CAACTAGTTT GAGATTAAAA  TCCGATAACC ATGAATCAAT CCAATATATA TATATATAAA TATGTGTGTG TGTGTTGTGA CGACAATCTT GATACGTTTT CAAAGAGTTT TTGTGGGTCT TAATTGGCAT TATCTTTTGT  CGTTGTGATT AAATTATTGA AGGGATGAAA GATTCAAAGG AGTTTGCTTT GGAGATATTT GATGCATTGA GTCGAAGAAG AAGATTGAAG TTTGAGATGA TCAGCAAAGA GGAGCTGTTT  GAGTATTGGT CACAAATTAC CGACCAAAGT TTTGATTCTC GACTACAAAT CTTCTTCGAC ATGTATGGAA ATCAATTTCT TCTTTTCCCT TCAATTATCA TTTTCAAAAT TATTACTAAC  CATTTTTTTA AAAAAATAAA TTAATGGAAG TTAACGGTGA GAACTGCAGT GTCTGCAGGT GTGGCCGTAG CATTTGCCTG ATTTAATTTA CTGTTTCATT GAAAATAATT AATGTAATTA  TTCTACGTGT TTGGGTATTA AAATTACAGG GTGGACAAGA ATGAAGATGG TAGAATTACA GAGGAGGAAG TAAAAGAGGT AAAGTATATA TTATTCAAAT GTACTTCACA ACTCATTTTT  TTCCTTTAAA AAAATTATCA TAGAAAAACT AAGGGTTGAG AAAATAAAAA TTGATAAAGC AAGTCACTAT ATATGTCCAA TATTCCATCA TATTTGTTGG AGCAAATAAG AAGAAATTTT  TTTTTTTAAA AAAAAAAAGA AGTGTAAGAA ATTTGCTGGC ATTTTGCCAT TTCGTCTAGA CATAACAAAA ACGTTTAGTG TGTTTTAATT TACTCACAAA CTTTAGTTTA AACAATAAAC  GGTAGGCGGG ATTCGGTGAA CTTATGACAA TGATCATTGT GGTTAGATTG AATCACAAAG TTACACGATC CATAATATAA GTTCATCGTT ATTGTTTTCC TTTTAGCAAA AGAAATACGT  TGCATTTCGC ATTTTCCAAC CAGTCCATGG GTGAATAATC GGAATCGAAT CTCGCCGATT TTGATCGTTC ACCGATTTTT ATCGAAGGTG AGCTAATTAC CGGATTTAAA GAACCTATTG  AAAATTATTA GTCTAGCTAT ACCAATTGTT TGAAGTCTGT AATTTGCATT AATTGAGTTG TTGTTGAAGC TTACATGACT TAGGACGTCG AATTTTTCTT TCCTTATTGC ATGGGTGAGG  TAGTTGAATC AGATAAGGTC ATTTCAATGA AGTTGGATAG GGATCCATCC AAACGACGAC GTTTTGATTT CGTTTGTCCA AATTTTCGAA AAAGATTTTC ATCACTTTTC CTCCAACTTT  ATTATAATTA ATTATGTACG TCAATTTGTG TGATATAGAT AATCGTATTG AGTGCTTCAG CAAATAAGTT ATCGAGGTTG AAGGAGCAGG CAGAAGAATA CGCAGCATTG ATCATGGAGG  AGTTAGATCC CGAAAGACTT GGTTATATAG AGGTAGGTCA ACTCTCCTTT TCACATCAAT ATATAATTAT CCAACTTATA TATTATACAA ATATATTCAC TGTTTATTTT TATTATCTTG  TAAGTGATCT TTACTATTTA AATTAAAATT TAATATATAA TAAAAATAGA GAAATTCTCT ATTTCGAAAC GAATACACGC CTTAAGATGC AGGAGATGTA GCATTCGATA ATTATTTTTA  TTTAAGATAA TTCGAAATGA ATCTGAATAG ATGGTAGTGT GGTTGGTAAG TGATGATAAA AAAAAAACCC TCAACCTTGC AAATTAATAA TTATTTTTGT ATGTGTTCGG TGTACCAAAT  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CTTCAATGCG TTTTGGTACT CGCACCATCT TTTTGTGATT GTGTATATCC TGCTCGTAAT CCATGGAATA TTTCTTTATC TTGTCCAAAA ATGGTACCTG AAGACGGTAT ATTTTTCTAA  CCTTTTGCTT ACTATTTCAA TACTGGCATT AATCGGTGCC ATTCTGTCAT TGTTCTTACT TATTTTATCT CTCGTGGTAG CAGACATGGA TGTATCTAGC AATTCCTGTT TTACTATATG  CTGGTGAAAG GACCCTCAGA TACTTTAGAG CTGGATTCTA CACCGTGCGT CTTTTGAAGG TATGCATAAA AAATATTCTC TAGTATATTA AGATAAGAGT AACAATTTCT CCTATGCTCA  TGCTTTTGAT GTGATTTGGA CATCAACCTT TACAACTCAA CACTTGCTTT GTTGCGGAAT GTTTACAGGT AGCAATTTAT CCTGGGAACG TTCTTACACT GCAGATGTCC AAACCTCCAC  AATTCCGCTA CAAGAGTGGA CAATATATGT TTGTCCAATG CCCTGCTGTT TCTCCATTTG AATGGTAAGG CCACATCAAC CTCTCTGAAA TCACGCATTT CTCTACTTTG GGGATAATTG  AGACATGGTT TCAGAACTAT GTTACCTTGA TCAAATTAGT GATCATGGTG TCTTTTTGCA AACGCCGTAA GAATTCGAAC CCACGTATTC TCAACTGGAT CTTTCTTTGT GCAAACTACA  CAGGCATCCA TTTTCCATAA CTTCAGCTCC AGGTGATGAC TACCTCAGTG TTCACATCCG GCAACTGGGT GACTGGACAC GGGAGCTTAG AAGGATATTC TCTGAGGTTT GTGAGGCTCC  TGTTGCAGGG AAGAGTGGTC TGCTAAGGGC CGATGAAACA ACAAAGACAA CGTAAGTGAG CTGAATTCGA TATTTATTTT CAGTTTAAAC TTCTCCATGT GTTCTCAACT ACCGTATTTC  AATGTTTCAG TCTACCAAAG CTCAAAATTG ATGGCCCTTA TGGAGCTCCA GCACAAGACT ACAAAAAATA TGATGTCTTG CTACTCGTAG GCCTCGGGAT TGGAGCAACA CCTTTCATTA  GCATTCTGAA AGATCTGCTA AACAACATTA TCAAAATGGA GGAACAGGCT GTGAGTGAAT ACGTCCTCAA TTTAACCATT GGATATCTTC TGTCTTCCAA CACGAATAAG ATGAAGTGGT  CCTATACAAT CTAATTACAT GACTTACTGA GTATAGTGTG AATGATAAGA AAATGGTATT GAAATTCCTG ATTTGGAAGA GTATCTTTAC ACTACTAAAA AATTACAATT TGACTTGTTA  CTGCTTTACA GGATTCAATA TCCGACTTCA GTAGATTTTC GGACCAAAGT TTCGGCATGA CGGATTCCAC CAATTCTAAC AGAATATCTC CAAGTAAAAG AAAACTCAAG ACAACCAATG  CCTACTTCTA TTGGGTCACT AGGGAGCAGG GCTCGTTTGA TTGGTTCAAA GGGGTTATGA ATGAAGTCGC CGAGCTTGAT CAAAGAGTAA TAATAATTCT CTATTGGTTC TGTTTCTTTC  TAAACTGATC AATAGTAGTA CTTCGACTCA TATATGTAAA AATTCAGGGG GTGATTGAAA TGCACAACTA CTTGACTAGT GTTTATGAAG AAGGTGATGC ACGTTCTGCA CTCATCACTA  TGGTCCAAGC ACTGAACCAT GCCAAGAATG GGGTCGACAT TGTCTCCGGT ACTCGGGTAT AGCTTCATCT GCTTTGTGTC AATAACTCTG GATTCTCCAG ATTTGGAGTT ATACAGGCCA  GCTTTTACAT GCCATTTCCT AGTGTTCGGA CATTAAACTT ACGGATGCTT TCTTAATATC AGGTGAAAAC ACATTTTGCA AGGCCAAATT GGAAGAAGGT ACTGTCCAAG TTATCTTCCA  AACATACAAA TGCAAGAATA GGTAAGTTTA TTCTCCATTT CCCTTTCAGA CGATAATAGA TTACTCAATT TATTCATGAA CCCGTATAAT TTGTGTGTGC ATGTATGTTT TGGCAGGTGT 
ATTCTACTGC GGACAGCCAG TCCTAGGCAA AGAACTCAGC AAATTATGCT ATGAGTTCAA CCAGAAAGGT TCCACTAAAT TCGAGTTTCA CAAGGAGCAT TTCTAA 

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CDS
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGAGAGT TGAGGACGAC GACCCACGAA CAGAGTTGGA GTTGTGACGC CATGACTCCC GGATCAACCC GGTCGCACTC CGTGAACTCT TCCAACTCGG AGTTCGTCGA AGTCGTCCTC  GACGTCCAGG ACGACGACAC CATCATTCTC CGCAGCGTTG AGCCAGCAGC GGCAACCGCA ACAACCCTCG AGAACTCTCC GTCGTTAGCA GCGACTGATG GTGGCTCGAG GTCGTCGTCG  ATGAGGCACA GCTCGTCCAG CAGCCGCATA CGTCAGTTCT CGCAGGAGCT CAAGGCCGGA GCTCGGCATT ACTCGCAGGA GCTCAAGACT GAGCTGCGGC GGTTTTCTTG GAGCCACAGT  CACGCTGCTA AGATGCTAAC GCCGTCTCTG AGCGCCGGCG GAGGTTCTAA CTCCGATGCA TTGGCGGCGA GGGCGCTCCG GCGGCAAAGG GCGCAGCTTG ATCGAACCCG GTCTGGAGCC  CGCAAGGCGC TGCAAGGCCT TAGGTTTATT AGTAAAAGTG GAGGCAGCGG TGAAAATAAG AACAACGTGG AAGCTTGGAA CGAGGTTCAA GAAAACTTCT CTAAGCTTGA GAAAAATGGG  TTTCTTCTTC GAGCAGATTT TGCACAATGC ATAGGGATGA AAGATTCAAA GGAGTTTGCT TTGGAGATAT TTGATGCATT GAGTCGAAGA AGAAGATTGA AGTTTGAGAT GATCAGCAAA  GAGGAGCTGT TTGAGTATTG GTCACAAATT ACCGACCAAA GTTTTGATTC TCGACTACAA ATCTTCTTCG ACATGGTGGA CAAGAATGAA GATGGTAGAA TTACAGAGGA GGAAGTAAAA  GAGATAATCG TATTGAGTGC TTCAGCAAAT AAGTTATCGA GGTTGAAGGA GCAGGCAGAA GAATACGCAG CATTGATCAT GGAGGAGTTA GATCCCGAAA GACTTGGTTA TATAGAGCTA  TGGCAACTGG AAACACTTCT GTTGCAGAAA GACACCTACA TGAACTACAG TCAAGCACTG AGTTACACTA GCCAAGCACT GAGTCAGAAC CTACAAGGAC TAAGAAGAAG AAGCCGCATT  AGAAGAATTA GCTCGAAATT TCTCTACTCT CTGCAAGAGA ATTGGAGGAG AATATGGGTG CTTCTCATCT GGATATTGAT CATGATCGGA TTGTTCACCT GGAAATTCCT TCAGTATAAG  AACAAGGATG CTTTTAAGGT CATGGGGTAT TGTCTCTGTA CGGCCAAAGG TGCGGCGGAG ACGCTGAAAT TCAATATGGC TCTCATCCTC TTCCCCGTTT GCCGGAACAC CATCACTTGG  CTCAGGTCCA CTCGGCTCGG ACATTGTGTG CCGTTTGATG ACAACATTAA TTTTCACAAG ACTATTGCCG CTGCCATTGT GATTGGTGTT ATTTTACATG CCGGGAATCA TCTTTCATGT  GATTTTCCAA GGCTAATAAA CGAGAGTGAG GCAACCTATA GGCTGTATCT TATTGAATTG TTTGGTCCTA ATAAACCGAG CTATGTTGAT CTGCTTCGAG GGGTAGAGGG TATCACAGGA  GTCTTGATGG TGATCCTCAT GGCTCTCGCT TTTATACTTG CCACCCACTG GTTTAGGCGG AGCCAAGTTA AGCTGCCAAA GCCCTTTGAT AGACTAACTG GCTTCAATGC GTTTTGGTAC  TCGCACCATC TTTTTGTGAT TGTGTATATC CTGCTCGTAA TCCATGGAAT ATTTCTTTAT CTTGTCCAAA AATGGTACCT GAAGACGACA TGGATGTATC TAGCAATTCC TGTTTTACTA  TATGCTGGTG AAAGGACCCT CAGATACTTT AGAGCTGGAT TCTACACCGT GCGTCTTTTG AAGGTAGCAA TTTATCCTGG GAACGTTCTT ACACTGCAGA TGTCCAAACC TCCACAATTC  CGCTACAAGA GTGGACAATA TATGTTTGTC CAATGCCCTG CTGTTTCTCC ATTTGAATGG CATCCATTTT CCATAACTTC AGCTCCAGGT GATGACTACC TCAGTGTTCA CATCCGGCAA  CTGGGTGACT GGACACGGGA GCTTAGAAGG ATATTCTCTG AGGTTTGTGA GGCTCCTGTT GCAGGGAAGA GTGGTCTGCT AAGGGCCGAT GAAACAACAA AGACAACTCT ACCAAAGCTC  AAAATTGATG GCCCTTATGG AGCTCCAGCA CAAGACTACA AAAAATATGA TGTCTTGCTA CTCGTAGGCC TCGGGATTGG AGCAACACCT TTCATTAGCA TTCTGAAAGA TCTGCTAAAC  AACATTATCA AAATGGAGGA ACAGGCTGAT TCAATATCCG ACTTCAGTAG ATTTTCGGAC CAAAGTTTCG GCATGACGGA TTCCACCAAT TCTAACAGAA TATCTCCAAG TAAAAGAAAA  CTCAAGACAA CCAATGCCTA CTTCTATTGG GTCACTAGGG AGCAGGGCTC GTTTGATTGG TTCAAAGGGG TTATGAATGA AGTCGCCGAG CTTGATCAAA GAGGGGTGAT TGAAATGCAC  AACTACTTGA CTAGTGTTTA TGAAGAAGGT GATGCACGTT CTGCACTCAT CACTATGGTC CAAGCACTGA ACCATGCCAA GAATGGGGTC GACATTGTCT CCGGTACTCG GGTGAAAACA  CATTTTGCAA GGCCAAATTG GAAGAAGGTA CTGTCCAAGT TATCTTCCAA ACATACAAAT GCAAGAATAG GTGTATTCTA CTGCGGACAG CCAGTCCTAG GCAAAGAACT CAGCAAATTA 
TGCTATGAGT TCAACCAGAA AGGTTCCACT AAATTCGAGT TTCACAAGGA GCATTTCTAA 

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