protTMHMM
MyspiTrxH23	360	17.13	17.13	1	i5-24o

View Redoxidase 19116
Entry information : MyspiTrxH23(Myrspi0005g0131670.t1)
Entry ID 19116
Creation 2025-07-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2025-07-03 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: MyspiTrxH23(Myrspi0005g0131670.t1)
Name MyspiTrxH23(Myrspi0005g0131670.t1)
Class Thioredoxin Type H    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Myriophyllum spicatum    [TaxId: 208873 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value MyspiTrxH23
start..stop
S start..stop
MyspiTrxH100 724 0 1..360 1..360
MyspiTrxH75 719 0 1..360 1..360
CbraTrxH25 387 8.24e-134 26..342 39..356
CbraTrxH27 159 1.94e-46 5..253 26..278
CbraTrxH27 96 5.7e-23 28..148 171..288
Literature and cross-references MyspiTrxH23(Myrspi0005g0131670.t1)
Protein sequence: MyspiTrxH23(Myrspi0005g0131670.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   360
PWM (Da)   %s   39384.14 Transmb domain   %s   i5-24o
PI (pH)   %s   5.81
A INSERT TMH
INSERT INTO TMH(TMH_IdPerox,TMH_PeroxName,TMH_Type,TMH_Length, TMH_Expa,TMH_First60,TMH_PredHel,TMH_Topo) VALUES ('19116','MyspiTrxH23','pep','360','17.13','17.13','1','i5-24o')

Insert TMH record :
INSERT INTO TMH(TMH_IdPerox,TMH_PeroxName,TMH_Type,TMH_Length, TMH_Expa,TMH_First60,TMH_PredHel,TMH_Topo) VALUES ('19116','MyspiTrxH23','pep','360','17.13','17.13','1','i5-24o')

Update Perox 19116 Properties = '360;5.81;39384.14'
signalp /usr/local/bioinfo/src/SignalP/signalp-4.1/signalp -m ./assets/temp/tmp_mature ./assets/temp/tmp_pep 2>/dev/null
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MANSLLQICV VFGTVALFFA SVLADDVVVL TEDNFEKEVG KDRGALVEFY APWCGHCKKL APEYEKLGAS FKKAKSVLIG KVDCDEHKGV CSKYGVTGYP TIQWFPKGSL EPKKYEGPRN  AESLAEFVNN EGGSNVKIAT PPSHVVVLTA DNFNSIVLDE SKDVLVEFYA PWCGHCKNLA PVYEKVASAF KLEEDVVIAN LDADNFKDLA EKYGISGFPT LKYFPKSNKA GEDYDGGRDL  DDFVTFINEK CGTSRDAKGQ LTASAGKIVS LDTLVKEFLA ASDAEKKSIM SKIEEEVEKL SGSAARHGKI YLKTAKKCVE KGNDYATKEL ARIQRILEKS ISEAKADEFT LKKNILSAFA 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGAATT CACTTCTTCA GATCTGTGTA GTTTTTGGAA CGGTGGCGCT GTTCTTTGCG TCAGTATTGG CGGATGACGT CGTCGTTTTA ACGGAAGACA ACTTCGAGAA GGAAGTCGGA  AAAGATCGCG GAGCTCTCGT TGAGTTCTAC GCACCATGGT TCGCCTCATT ATTAATTTAA TTTCGTATAC GAATCTACGA ATTGATTGAT ATTTTGATGC GCTACGTCCA TTCATTTTTG  AGTTTTAATA GGTTGACCTT TAGATCAAAT GGAAATTATT TTAGTAGACA GTTCATCTGA ATTCTATAGA TGTAAGAAAT CAGAAATAAT GAAGTGTGTA TATAGTTAAA AAATTAAAAG  TTGCTCTTAT CCGGGTTTTA GAATTGTTAG CATTTGGTGT AAATTTGGAT GGTTGAACTG TAAGTCTAGG CTAGTGGTTT TGGACATTTC GTTGTAATTC TGATGCGTTC GTAGCGTGCT  GATTTATTTC TGCACATTTC AGGTGTGGGC ACTGTAAGAA GCTAGCTCCC GAGTACGAGA AGCTTGGAGC TAGTTTTAAG AAGGCGAAAT CTGTTTTGAT TGGAAAGGTC TGCCGATTCT  TAAATTGAAA GGCGTGTCTT ATAGAAATCT GCATTTTGGA ATTGTCAAGT GTCCTTTCTT GTATAATAGC ATTAGGTCCT CTTACGGCTT CTCTATGATG GTCACTATAG CTTAGAGTTT  GAGTCTCTTT TAAGAAGATC CTTTTAGTGC TTACTGGTTG ATATTTTGAT CTAGGTGGAC TGTGACGAGC ACAAGGGGGT GTGCAGCAAA TATGGTGTCA CAGGATACCC AACAATTCAA  TGGTTTCCTA AAGGATCATT GGAACCAAAA AAGTAAGAAA ATCCTTAGAT ATTAAGAGAC CTTGCTCTTT GGAAAGCCTC GTTAATAAAA TTACTCGTGC CTGAAATCAT GTAATTTGAT  CGTTATAGGT ATGAAGGACC GCGTAACGCA GAATCCCTTG CTGAATTTGT CAATAATGAA GGAGGTATGA GTTTTTCCCA TGAACCTACT CATATTTACT GCATTTTTGG AATCCTGTTT  TAATCTGTTG ACTTATTTCT TCCTTGTTTT CTCTCCACTA TTGTCTGTTT ACAGGGAGCA ATGTGAAGAT AGCCACTCCA CCATCCCATG TCGTGGTTCT TACTGCAGAT AATTTTAATT  CAATCGTTTT AGATGAATCA AAGGATGTTT TAGTTGAATT TTATGCACCA TGGTGTGGCC ATTGCAAAAA CTTAGCTCCT GTAAGTCAAT GCACCTTCAA AATTTTTTAA GTTCTTGTTC  TTTGTGACTC TTGTCTAATT TTAGGATAGA TATAGCCTCA TTCTTTGTCT AGTTATTGTG GTACAGGTTT ATGAAAAGGT AGCCTCAGCA TTTAAGTTGG AGGAAGATGT GGTGATTGCT  AACCTGGATG CTGACAATTT CAAGGATCTA GCAGAAAAGT AAGTCTACTC TAATTCTTAT GCTCATGTCT TTTTGTCACA GTGTCGTGTT TCTGTTCGTG TATGGTTCTC CTTCTGCTAC  TTATTTCATT TGTGATAAGA AAGAACCTGG CAGTTATCTT CTTACTAGAG GTACTTGTAA TCACAAACCG AAATAAACTC TTCAGAGTGA TTTTTGCACA GGATCTTTAT TTTGTTATAC  TTTAAGGAAT GCCTATTAGT ATTATTGAAA CTGGAGGTAG ACATGTATCT CAGGTCCGTA TTCTTATTAT TCAGGGTTTC TAGAAAGAGT ATGTTTGATT AACTAACTCG AAGGTTGACT  CAAGGAGTAT ATTGCACCCT AGGGGGAGGG TCAATACTTA GTGGAGTTGT GCATAAATTG AATTTAAACT GATCTAAAAA TTGTATTTGC TGCAGGTATG GCATTAGTGG TTTCCCCACA  TTGAAGTACT TCCCAAAAAG CAACAAAGCT GGGGAAGATT ATGATGGTGG CAGAGATCTT GATGACTTTG TGACTTTCAT CAATGAAAAA TGTGGTACCA GCCGTGACGC GAAAGGACAA  CTGACTGCTA GTGTTAGTAA CTTCTAATTG AATATGCTAA TGCAAGTTGT TGGCTGTGTT ATTATTCTCC ACTTAACGTG TTAATTCAAC AGGCTGGAAA GATTGTAAGT TTGGACACCC  TAGTAAAGGA GTTCTTGGCT GCTAGTGATG CGGAAAAGAA GTCAATAATG TCCAAGATTG AAGAGGAAGT TGAGAAGCTT TCTGGTTCTG CTGCCAGGTA TTTACGTCAT AGGTCCAGTC  ATTTGTATTG TGGGGTTTAC TCGCTGCATA AATGTTGTTC CGGATACCTC GTGCATTGTT TCTGTTTGTT CCTTGAGCTT ATGGAGTATC TTAAACTTTC TCGTAGGCAT GGGAAGATAT  ATTTGAAAAC AGCTAAGAAG TGTGTGGAGA AGGGCAATGA TTATGCAACA AAGGAACTTG CACGCATCCA GCGCATACTT GAAAAGGTTC GGTCTTTTTT CTTCTTTCTG CAGAAAGATA  ACTGTTTTCC TTTTTTTTCA ACAACCAAAT TGACAATGTT TCTCTTTGGT TTGATGCAGT CAATTAGCGA AGCAAAAGCC GACGAGTTCA CCCTGAAGAA GAACATCCTT TCAGCCTTTG 
CTTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGAATT CACTTCTTCA GATCTGTGTA GTTTTTGGAA CGGTGGCGCT GTTCTTTGCG TCAGTATTGG CGGATGACGT CGTCGTTTTA ACGGAAGACA ACTTCGAGAA GGAAGTCGGA  AAAGATCGCG GAGCTCTCGT TGAGTTCTAC GCACCATGGT GTGGGCACTG TAAGAAGCTA GCTCCCGAGT ACGAGAAGCT TGGAGCTAGT TTTAAGAAGG CGAAATCTGT TTTGATTGGA  AAGGTGGACT GTGACGAGCA CAAGGGGGTG TGCAGCAAAT ATGGTGTCAC AGGATACCCA ACAATTCAAT GGTTTCCTAA AGGATCATTG GAACCAAAAA AGTATGAAGG ACCGCGTAAC  GCAGAATCCC TTGCTGAATT TGTCAATAAT GAAGGAGGGA GCAATGTGAA GATAGCCACT CCACCATCCC ATGTCGTGGT TCTTACTGCA GATAATTTTA ATTCAATCGT TTTAGATGAA  TCAAAGGATG TTTTAGTTGA ATTTTATGCA CCATGGTGTG GCCATTGCAA AAACTTAGCT CCTGTTTATG AAAAGGTAGC CTCAGCATTT AAGTTGGAGG AAGATGTGGT GATTGCTAAC  CTGGATGCTG ACAATTTCAA GGATCTAGCA GAAAAGTATG GCATTAGTGG TTTCCCCACA TTGAAGTACT TCCCAAAAAG CAACAAAGCT GGGGAAGATT ATGATGGTGG CAGAGATCTT  GATGACTTTG TGACTTTCAT CAATGAAAAA TGTGGTACCA GCCGTGACGC GAAAGGACAA CTGACTGCTA GTGCTGGAAA GATTGTAAGT TTGGACACCC TAGTAAAGGA GTTCTTGGCT  GCTAGTGATG CGGAAAAGAA GTCAATAATG TCCAAGATTG AAGAGGAAGT TGAGAAGCTT TCTGGTTCTG CTGCCAGGCA TGGGAAGATA TATTTGAAAA CAGCTAAGAA GTGTGTGGAG  AAGGGCAATG ATTATGCAAC AAAGGAACTT GCACGCATCC AGCGCATACT TGAAAAGTCA ATTAGCGAAG CAAAAGCCGA CGAGTTCACC CTGAAGAAGA ACATCCTTTC AGCCTTTGCT 
TGA 

Retrieve as FASTA