protTMHMM
MyspiTrxH100	360	17.13	17.13	1	i5-24o

View Redoxidase 19193
Entry information : MyspiTrxH100(Myrspi0032g0702440.t1)
Entry ID 19193
Creation 2025-07-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2025-07-03 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: MyspiTrxH100(Myrspi0032g0702440.t1)
Name MyspiTrxH100(Myrspi0032g0702440.t1)
Class Thioredoxin Type H    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Myriophyllum spicatum    [TaxId: 208873 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value MyspiTrxH100
start..stop
S start..stop
MyspiTrxH23 724 0 1..360 1..360
MyspiTrxH75 718 0 1..360 1..360
CbraTrxH25 386 1.36e-133 26..342 39..356
CbraTrxH27 158 3.22e-46 5..253 26..278
CbraTrxH27 96 8.32e-23 28..148 171..288
Literature and cross-references MyspiTrxH100(Myrspi0032g0702440.t1)
Protein sequence: MyspiTrxH100(Myrspi0032g0702440.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   360
PWM (Da)   %s   39430.11 Transmb domain   %s   i5-24o
PI (pH)   %s   5.57
A INSERT TMH
INSERT INTO TMH(TMH_IdPerox,TMH_PeroxName,TMH_Type,TMH_Length, TMH_Expa,TMH_First60,TMH_PredHel,TMH_Topo) VALUES ('19193','MyspiTrxH100','pep','360','17.13','17.13','1','i5-24o')

Insert TMH record :
INSERT INTO TMH(TMH_IdPerox,TMH_PeroxName,TMH_Type,TMH_Length, TMH_Expa,TMH_First60,TMH_PredHel,TMH_Topo) VALUES ('19193','MyspiTrxH100','pep','360','17.13','17.13','1','i5-24o')

Update Perox 19193 Properties = '360;5.57;39430.11'
signalp /usr/local/bioinfo/src/SignalP/signalp-4.1/signalp -m ./assets/temp/tmp_mature ./assets/temp/tmp_pep 2>/dev/null
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MANSLLQICV VFGTVALFFA SVLADDVVVL TEDNFEKEVG KDRGSLVEFY APWCGHCKKL APEYEKLGAS FKKAKSVLIG KVDCDEHKGV CSKYGVTGYP TIQWFPKGSL EPKKYEGPRN  AESLAEFVNN EGGSNVKIAT PPSHVVVLTA DNFNSIVLDE SKDVLVEFYA PWCGHCKNLA PVYEKVASAF KLEEDVVIAN LDADNFKDLA EKYGISGFPT LKYFPKSNKA GEDYDGGRDL  DDFVTFINEK CGTSRDAKGQ LTASAGKIES LDTLVKEFVA ASDAEKKSIM SKIEEEVEKL SGSAARHGKI YLKTAKKCVE KGNDYATKEL ARIQRILEKT ISEAKADEFT LKKNILSAFA 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGAATT CACTCCTTCA GATCTGTGTA GTTTTTGGAA CGGTGGCGCT GTTCTTTGCG TCAGTATTGG CGGATGACGT CGTCGTTTTG ACGGAAGACA ATTTCGAGAA GGAAGTCGGT  AAAGATCGCG GATCTCTCGT TGAGTTCTAC GCACCATGGT TCGCCTCATT ATTAATTTTA TTTCGTATAC GAATCTACGA ATCGATTGAT AATTTGATGC GCTACGTCCA TTGATTTTTG  AGTCTTAATA GGTTGACCCT TAGATCAAAT GGAAATTATT TTAGTAGACA GTTCATCTGA ATTCTATAGA TGTAAGAAAT CAGACACAAT GAAGTGTGTA TATAGTTAAA AAATTAAAAG  TTGCTCTTAT CTGGGTTTTA GAATTGTTAG CATTTGGTGT AAATTTGGAT GGTTGAACTG TAATTCTATG CTAGTGGTTT TTGACATTTC GTTGTAATTC TGATGCGTTC GTAGCGTGAT  GATTTATTTC TGCACATCGC AGGTGTGGGC ACTGTAAGAA GCTAGCTCCC GAGTACGAGA AGCTTGGAGC TAGTTTCAAG AAGGCGAAAT CTGTTTTGAT TGGAAAGGTC TGCTGATTCT  TAAATTGAAA GGCGTGTCTT ATAGAAATCT GCATTTTGGA TTTGTTAAGT GTCCTTTCTT GTATAATAGC ATTAGGTCTT CTTACGGCTT CTCTACGATG TTCACTATAG CTTAGAGTTC  AAGTCTCTTT TAAGAAGATC ATTTTAGTGC TTACTGGTTG ATATTTTGAT CTAGGTGGAC TGTGATGAGC ACAAGGGGGT GTGCAGCAAA TATGGTGTCA CAGGATACCC AACAATTCAA  TGGTTTCCTA AAGGATCATT GGAACCAAAA AAGTAAGAAA ATCCTTAGAT AGAAAGAGAC CTTGCTCTTT GGAAAGCCTC GTTAATAAAA TTACTTGTGC CTGAAATCAT GTAATTTGTT  CGTTATAGGT ATGAAGGACC GCGTAACGCA GAATCCCTTG CTGAATTTGT CAATAATGAA GGAGGTATGA GTTTTTCTCG TGAACCTACT CATATTTACT GCATCTTTGG AATCTTGTTT  TAATCTGTTG ACTTATTTCT CCCTTGCTTT CTCTCCACTG TTGTCTGTTT ACAGGGAGCA ATGTGAAGAT AGCCACTCCA CCATCCCATG TCGTGGTTCT TACTGCAGAT AATTTTAATT  CAATCGTTTT GGATGAATCA AAGGATGTTT TAGTTGAATT CTATGCACCA TGGTGTGGCC ATTGCAAAAA CTTGGCTCCT GTAAGTCAAT GCACCTTATA AAATTTTTAA GTTCTTGTTC  TTTGTGATTC TAGTCTAATT TTAGGATAGA TATAGCCTTA CTCTTTGTCT GGTTATTGTG GTACAGGTTT ATGAGAAGGT AGCCTCAGCA TTTAAGTTGG AGGAAGATGT GGTGATTGCT  AACCTGGATG CTGACAATTT CAAGGATCTA GCAGAAAAGT AAGTCTACTC TAATTCTTAT GCTCATGTCT TTTTGTCAGT GTTGTGTTTC TGTTCGTGTA TGGTTCTCCT TCTGCTACTT  ATTTCATTTT GTGATAAAAA AGAACCTGGC AGTTATCTTC TTACTAGAGG TACTTGTGAT CACAAACCGA AATAAACTCT TCAGAGTGAT TTTTGCACAG GATCTTGATT TTGTGATACT  TTAAGGAATG CCTATTAGTT TTATTGAAAC TGGAGGTAGA CTTGTATCTC AGATCCGTAT TCTTATTATT CAGGGTTTCT AGAAAGAGTG TGTTTGATTA ACTAACTTGA AGGTTGACTC  AAGGAATATA TTGCACCTAC TTAGTGGAGT TGTGCATAAA TTGAATTTAA ACTGATCTAA AAATTGTATT TGCTGCAGGT ACGGCATTAG TGGTTTCCCC ACATTGAAGT ACTTCCCAAA  AAGCAACAAA GCGGGGGAAG ATTATGATGG TGGCAGAGAT CTTGATGACT TTGTGACTTT CATCAATGAA AAATGTGGTA CCAGCCGTGA CGCGAAAGGA CAACTGACTG CTAGTGTTAG  TAACTTCTAA TCGAATATGC TAATTCAAGT TGTTGCCTGT GTTATTATTC TCCACTTAAC GTGTTAATTC AACAGGCTGG AAAGATTGAA AGTTTGGACA CCCTAGTAAA GGAGTTCGTG  GCTGCTAGTG ATGCAGAAAA GAAGTCAATA ATGTCCAAGA TTGAAGAGGA AGTTGAGAAG CTTTCTGGTT CTGCTGCCAG GTATTTACAT CATAGGTCCA GTCATTTGTG GGGTTTTCTC  GCTCCATAAA TGTTGTCCCG GATACCTTGC GCATTATTTC TTTTTGTTCC TTGAGCTTAT GGAGTATCTT AAACTTTCTC GTAGGCATGG GAAGATATAT TTGAAAACAG CTAAGAAGTG  TGTGGAGAAG GGCAATGATT ATGCAACAAA GGAACTTGCA CGCATCCAGC GCATACTTGA AAAGGTTCGG TCTTTTTTTT TCCGATCAAA TATAACTGAA ATTGTCTAGC TGTGTTCTTA  TAAAGAGATC CCAATTTAGT TCAAAACATC ATCATACCTT ACAAATAGAA AGAAAACTGG AGTTTGAAGT TCTAAAAACC AAAACCCAAA ACCTTAGCAG AACGCATGGC CTGTCCCCCA  TAATTGTTCT AGATATTGTT GAATCACTTG AAGCACTTGG CATCCAGCAA TGGCTCTCCC TCAAAAGGCT CATGATCCTC AATCATGATA ACTGTTTTCC TTTTTTCTCA ACAACCAAAT 
TGACAATGAT CCTCTTTGGT TTGATGCAGA CAATTAGCGA AGCAAAAGCC GACGAGTTCA CCCTGAAGAA GAACATCCTT TCAGCCTTTG CTTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGAATT CACTCCTTCA GATCTGTGTA GTTTTTGGAA CGGTGGCGCT GTTCTTTGCG TCAGTATTGG CGGATGACGT CGTCGTTTTG ACGGAAGACA ATTTCGAGAA GGAAGTCGGT  AAAGATCGCG GATCTCTCGT TGAGTTCTAC GCACCATGGT GTGGGCACTG TAAGAAGCTA GCTCCCGAGT ACGAGAAGCT TGGAGCTAGT TTCAAGAAGG CGAAATCTGT TTTGATTGGA  AAGGTGGACT GTGATGAGCA CAAGGGGGTG TGCAGCAAAT ATGGTGTCAC AGGATACCCA ACAATTCAAT GGTTTCCTAA AGGATCATTG GAACCAAAAA AGTATGAAGG ACCGCGTAAC  GCAGAATCCC TTGCTGAATT TGTCAATAAT GAAGGAGGGA GCAATGTGAA GATAGCCACT CCACCATCCC ATGTCGTGGT TCTTACTGCA GATAATTTTA ATTCAATCGT TTTGGATGAA  TCAAAGGATG TTTTAGTTGA ATTCTATGCA CCATGGTGTG GCCATTGCAA AAACTTGGCT CCTGTTTATG AGAAGGTAGC CTCAGCATTT AAGTTGGAGG AAGATGTGGT GATTGCTAAC  CTGGATGCTG ACAATTTCAA GGATCTAGCA GAAAAGTACG GCATTAGTGG TTTCCCCACA TTGAAGTACT TCCCAAAAAG CAACAAAGCG GGGGAAGATT ATGATGGTGG CAGAGATCTT  GATGACTTTG TGACTTTCAT CAATGAAAAA TGTGGTACCA GCCGTGACGC GAAAGGACAA CTGACTGCTA GTGCTGGAAA GATTGAAAGT TTGGACACCC TAGTAAAGGA GTTCGTGGCT  GCTAGTGATG CAGAAAAGAA GTCAATAATG TCCAAGATTG AAGAGGAAGT TGAGAAGCTT TCTGGTTCTG CTGCCAGGCA TGGGAAGATA TATTTGAAAA CAGCTAAGAA GTGTGTGGAG  AAGGGCAATG ATTATGCAAC AAAGGAACTT GCACGCATCC AGCGCATACT TGAAAAGACA ATTAGCGAAG CAAAAGCCGA CGAGTTCACC CTGAAGAAGA ACATCCTTTC AGCCTTTGCT 
TGA 

Retrieve as FASTA