protTMHMM
MyspiTrxH49	440	36.58	16.25	2	i5-24o415-434i

View Redoxidase 19142
Entry information : MyspiTrxH49(Myrspi0012g0321060.t1)
Entry ID 19142
Creation 2025-07-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2025-07-03 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: MyspiTrxH49(Myrspi0012g0321060.t1)
Name MyspiTrxH49(Myrspi0012g0321060.t1)
Class Thioredoxin Type H    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Myriophyllum spicatum    [TaxId: 208873 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value MyspiTrxH49
start..stop
S start..stop
MyspiTrxH125 874 0 1..440 1..481
MyspiTrxH68 872 0 1..440 1..481
LeMDAR01 676 0 1..440 1..481
HaMDAR02 671 0 1..440 1..480
Literature and cross-references MyspiTrxH49(Myrspi0012g0321060.t1)
Protein sequence: MyspiTrxH49(Myrspi0012g0321060.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   440
PWM (Da)   %s   47731.17 Transmb domain   %s   i5-24o415-434i
PI (pH)   %s   7
A INSERT TMH
INSERT INTO TMH(TMH_IdPerox,TMH_PeroxName,TMH_Type,TMH_Length, TMH_Expa,TMH_First60,TMH_PredHel,TMH_Topo) VALUES ('19142','MyspiTrxH49','pep','440','36.58','16.25','2','i5-24o415-434i')

Insert TMH record :
INSERT INTO TMH(TMH_IdPerox,TMH_PeroxName,TMH_Type,TMH_Length, TMH_Expa,TMH_First60,TMH_PredHel,TMH_Topo) VALUES ('19142','MyspiTrxH49','pep','440','36.58','16.25','2','i5-24o415-434i')

Update Perox 19142 Properties = '440;7;47731.17'
signalp /usr/local/bioinfo/src/SignalP/signalp-4.1/signalp -m ./assets/temp/tmp_mature ./assets/temp/tmp_pep 2>/dev/null
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGRAFVYVIL GGGVAAGYAA LEFVNRGISR GELCIISDEP VVPYERPALS KGFLLPEAPA RLPSFHTCVG ANEERLTPKW YKEHGIELVL GTAVKSADVR RKTLLTTTGE TISYKILIVA  TGARSLQLEE FGVSGSDSDN VCYLRDLADA TRLVDVMQSS SGGDAVVIGG GYIGMECAAS LVINKINVTM VFPEAHCMAR LFTPKIANYY EEYYRARGIS FVKGTVLSSF EMASNGKVTA  VNLRDGSRIE TDMVVVGIGI RPNTSLFEGQ LTMEKGGIKV NGHMQTSNSS VYAVGDVAAF PVKLFGETRR LEHVDSARKS AKHAVTAIME PEKTADFDYL PFFYSRVFTF SWQFYGDNVG 
EVIHFGDYSS GHTFGAYWGL AFAKEVVANS TPEPSMDQSG SAIASPEEKP LYTKHAAAGV ILAASIAAFA YWYGRRRRRW 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAAGGG CGTTTGTGTA TGTGATTTTA GGAGGTGGTG TAGCTGCTGG ATATGCTGCT CTTGAATTCG TCAACCGCGG TATTTCTCGC GGCGAACTAT GCATCATTTC CGATGAGCCC  GTAACTCTTC TTCTTTGAAT CCGCTTTTTT GTTTAATTTC ATTTCCTCCT TCTTCTCAAA TGTGCTTTTC CATCATCAAA TTGATCTTCC AAGGCCAAGC AATGATTGCC TCCCGCGAAT  CTTGAGCAAA TTACGCTTCT TTGTTTCTCT CCAAAGATGA ATTAAAAGTC TACATTAATT GCTGATATTG GAGCAGCTTA ATTTTTTTTA CTTGAGCATG AATTTGAGCT TGTCTTTTCT  TCCAGTGACG AGTGTCACAT GAGCTTGGTC CACGAGATGA CGACCCATCC CCTATAATCT AATGGGACCT GTTTCACTTA CCTTGCAGGT TGTTCCATAT GAGAGGCCAG CACTAAGCAA  AGGTTTTTTA CTTCCTGAAG GTATCGCTTC TTTGTAAAAG TCTTTACTTT TGCCATTTAT CCAATTTCTT CTTATAAAGG TCGATTTTTC AAAACTGACG TCAACTTCTT TTCCTGTATT  TCTAAGTACT TTGATTTGTG GGGCGCTAGA TGTCCTGTAC CTATAGTTTT GTTAGTTTTG GAAATGAATG GATCAAGTTA ATTGTTTTTA TATGTCCTTA TCACAAAGTG GGACTTCTTG  AAAAACAGTG AGCGTGAATC AGAACCGTAG TTGGTTATAC TGAAAGTTGA GTTCTTTTAT TACTTCTAGA TTGGACATCT GAATGAGCTT AAGGAAACAG TGAAAGTTTT CAGTGGATCC  GGTGGTCACT TAGTTCGTTT GCATCGTCAG ATGTTATGCA AATGAATGTT GGGCACTCTA AATCTCAAAG CTTTGTAAAA AGAATACGCC TTAATCTGGG CGCTTGAAAC ATAAATCTCG  TATGTTGCTA GAATGGGAAA GTAATTTTGG GGTACACCGC ACGTGTTCTT ACAGAACTGG GGTTCTAGTG ATGTATTCTT AAAGTTAAGG ACAAAATTTT GCATGATACC TTTTAGTAGT  TTGGTCTAGA TTTTATATCT GATTGTTTTT CTTTAATTGC TAACTTTACG TAATTACATT CGTGATATCT TACTATGTGC AGCTCCTGCA CGCCTTCCTT CATTTCACAC TTGTGTTGGT  GCCAATGAGG AAAGATTAAC TCCAAAATGG TACAAAGAAC ACGGTACTTC CTCCTCATCT CCATGTCCCC CTCTATTTCA GTTCTCCAGG AAATAATTTT TGTTTGATGT AAATACTTCT  TGAGACATCC CATTCTTTCA GGAATTGAAC TGGTTCTTGG GACCGCTGTT AAGTCTGCTG ATGTGAGACG GAAGACATTG TTGACCACAA CTGGGGAAAC TATAAGTTAC AAGATACTCA  TTGTTGCAAC TGGTGCTCGG GTACTGAGGC TGATCTTTTT CTGTTCTAGT ACTTCCTTCG AAATAAATGT AGTTAACTTC AGTAAACATG TTGAAATCAT AACTAAGCTG TCTCGTGGCA  GTAGATAATG AGATTATATT AATTAGTATA ATTCTTCTTT TTAGAGTGAA TTGAACTAAT GCGAACCGCA TTTGGCTTGT TGTAGTCTTT GCAGCTTGAA GAGTTTGGAG TGAGTGGATC  AGATTCTGAT AATGTCTGTT ATCTTCGTGA TTTAGCTGAT GCCACTAGGC TTGTCGACGT CATGCAATCT TCTTCCGGTG GAGATGCTGT TGTCATTGGG GGAGGATATA TAGGAATGGA  GTGTGCCGCA TCCTTGGTGA TAAATAAAAT AAATGTAACT ATGGTATTCC CAGAGGCACA TTGCAGTAAG TACATCTCTT TTACTTTTCT TCACCTCAAT ATGTGGATTG AGTTTGTGGG  GACTATTCTA AATGTTAAGC CTCTGGAGTC AATTTGTGGT TGCATCAAAG TGAAGCCATT GAAAGTTGAG GAATTTATGT TCAGTATTCA AATGTAGTTG AATGTCGCTA GAGTTTTTTC  TTAATTATTG AACTGATGAT GTGGCTCATA GTCGATCATT GGAGCTCATA TTGTTGAACT CTCATGCATG AGTTTTTTTT TCTTTGAGAG AAGGGCCGAT CAAACCATCA AGTAATATCG  TCTTCTTTTT GCAGTGGCCC GCTTGTTTAC ACCCAAAATT GCAAATTATT ATGAAGAATA TTACAGGGCC AGAGGAATAA GCTTCGTCAA AGGAACAGTC TTATCATCAT TTGAGATGGC  TTCCAATGGG AAGGTAACTA CTTCATAACT TTTAGATGAA TCACTCAGGC TTTTCAAGTA GTTAGAGATA AAACTAGCTT CTTATGTCCT TGTTTAAAAC TGTTGCTGAA ATGATGTCAT  CTTCTCTGAT CATTTACTAG AAGATATATA GGCTTCCAAA ATTCTGTTTA GCCATGTGGA ACAATAAAAT GCAATCTTGA CAAAACAACT ATGTTAAACA GGTAACTGCA GTGAATCTAA  GGGATGGGAG CCGCATAGAA ACTGACATGG TTGTGGTGGG AATTGGAATA CGACCAAACA CGAGTCTATT TGAAGGTCAA CTGACAATGG AGAAGGGTGG AATCAAAGTA AATGGACACA  TGCAAACTAG CAATAGCTCA GTGTATGCTG TTGGAGATGT GGCGGCATTC CCAGTGAAAC TTTTTGGTGA AACCCGTAGA CTTGAGCATG TCGACTCCGC TAGAAAGTCT GCAAAGCATG  CTGTCACTGC AATAATGGAA CCTGAGAAAA CAGCAGACTT TGACTACTTA CCCTTCTTCT ACTCCAGAGT CTTCACATTC TCTTGGCAGT TCTACGGAGA CAATGTTGGG GAGGTGATCC  ATTTTGGTGA TTACTCTAGT GGTCATACAT TTGGAGCTTA TTGGGTGAGT AAGGGCCACC TCCTTGGTTC TTTCCTTGAA GGTGGAACCA AAGAGGACTA CTAATTCATA GCCAAAGCTA  CAAGGCTCAA GCCAGTAATA ACAGATTTGG TAGAATTGGA AAGACAGGGA TTAGCTTTTG CCAAAGAAGT TGTTGCAAAT AGCACCCCTG AACCTTCTAT GGACCAAAGT GGTTCGGCTA 
TTGCTAGTCC GGAGGAGAAA CCGTTGTACA CAAAGCATGC AGCCGCTGGT GTCATCCTAG CGGCGTCGAT AGCTGCCTTT GCATATTGGT ATGGCAGGAG GCGTCGAAGA TGGTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAAGGG CGTTTGTGTA TGTGATTTTA GGAGGTGGTG TAGCTGCTGG ATATGCTGCT CTTGAATTCG TCAACCGCGG TATTTCTCGC GGCGAACTAT GCATCATTTC CGATGAGCCC  GTTGTTCCAT ATGAGAGGCC AGCACTAAGC AAAGGTTTTT TACTTCCTGA AGCTCCTGCA CGCCTTCCTT CATTTCACAC TTGTGTTGGT GCCAATGAGG AAAGATTAAC TCCAAAATGG  TACAAAGAAC ACGGAATTGA ACTGGTTCTT GGGACCGCTG TTAAGTCTGC TGATGTGAGA CGGAAGACAT TGTTGACCAC AACTGGGGAA ACTATAAGTT ACAAGATACT CATTGTTGCA  ACTGGTGCTC GGTCTTTGCA GCTTGAAGAG TTTGGAGTGA GTGGATCAGA TTCTGATAAT GTCTGTTATC TTCGTGATTT AGCTGATGCC ACTAGGCTTG TCGACGTCAT GCAATCTTCT  TCCGGTGGAG ATGCTGTTGT CATTGGGGGA GGATATATAG GAATGGAGTG TGCCGCATCC TTGGTGATAA ATAAAATAAA TGTAACTATG GTATTCCCAG AGGCACATTG CATGGCCCGC  TTGTTTACAC CCAAAATTGC AAATTATTAT GAAGAATATT ACAGGGCCAG AGGAATAAGC TTCGTCAAAG GAACAGTCTT ATCATCATTT GAGATGGCTT CCAATGGGAA GGTAACTGCA  GTGAATCTAA GGGATGGGAG CCGCATAGAA ACTGACATGG TTGTGGTGGG AATTGGAATA CGACCAAACA CGAGTCTATT TGAAGGTCAA CTGACAATGG AGAAGGGTGG AATCAAAGTA  AATGGACACA TGCAAACTAG CAATAGCTCA GTGTATGCTG TTGGAGATGT GGCGGCATTC CCAGTGAAAC TTTTTGGTGA AACCCGTAGA CTTGAGCATG TCGACTCCGC TAGAAAGTCT  GCAAAGCATG CTGTCACTGC AATAATGGAA CCTGAGAAAA CAGCAGACTT TGACTACTTA CCCTTCTTCT ACTCCAGAGT CTTCACATTC TCTTGGCAGT TCTACGGAGA CAATGTTGGG  GAGGTGATCC ATTTTGGTGA TTACTCTAGT GGTCATACAT TTGGAGCTTA TTGGGGATTA GCTTTTGCCA AAGAAGTTGT TGCAAATAGC ACCCCTGAAC CTTCTATGGA CCAAAGTGGT  TCGGCTATTG CTAGTCCGGA GGAGAAACCG TTGTACACAA AGCATGCAGC CGCTGGTGTC ATCCTAGCGG CGTCGATAGC TGCCTTTGCA TATTGGTATG GCAGGAGGCG TCGAAGATGG 
TGA 

Retrieve as FASTA