Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein) |
Length (aa): |
373 |
PWM (Da): |
40345.16 |
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PI (pH): |
8.2 |
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Sequence
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MNYPMKTLTSSIIEDRHSSIYIPYQLLRYFIKKSNSKEETKKPTMFSPKFYSIFTVLIFLLLNPSHAQLTSTFYSNTCPSVSSIVRNVVQQALQNDPRITASLTRLHFHDCFVNGCDASL LLDQGGNITLSEKNAVPNNNSARGFDVVDKIKTSVENSCPSVVSCADILALAAEASVSLSGGPSWNVLLGRRDGLIANQSGANTSIPNPTESLANVTAKFAAVGLNTSDLVALSGAHTFG RGQCRFFNQRLFNFSGTGKPDPTLNSTYLATLQQNCPQNGSGNTLNNLDPSSPNNFDNNYFKNLLKNQGLLQTDQELFSTNGAATISIVNNFASNQTAFFEAFVQSMINMGNISPLIGSQ GEIRSDCKKVNGS |
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Remarks |
Complete sequence from 17 ESTs and genomic sequence (chromo 7, 3 introns). Very long PS. |
DNA ►
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGAATTACCCAATGAAAACTTTAACTTCAAGCATAATTGAAGACAGACATTCTTCAATATATATACCTTATCAACTCCTCAGATATTTCATCAAGAAATCAAACTCCAAAGAAGAAACT AAGAAGCCAACCATGTTTTCTCCTAAATTTTATTCCATTTTCACAGTGCTAATATTCCTCCTTCTTAATCCATCACATGCTCAATTGACCTCAACATTCTACTCCAACACATGCCCCAGT GTTTCTTCTATAGTAAGAAATGTTGTTCAACAAGCTCTGCAAAATGATCCTCGTATTACCGCGAGCCTAACCCGTCTTCACTTTCACGATTGCTTTGTTAATATGTAATTTCTTATACAT TTTGATTAATGAGCCAGAATTTAGGTGATTGATTAATAACTAATGTCCTTAATTTGTGTATTGCAGGGATGTGATGCATCTCTTTTATTAGATCAAGGTGGAAACATAACACTAAGTGAG AAAAATGCTGTTCCTAACAATAATTCAGCTCGTGGCTTTGATGTAGTTGACAAAATCAAAACCTCTGTTGAAAATTCATGTCCTTCTGTCGTGTCTTGTGCTGATATTTTGGCTCTTGCT GCTGAAGCTTCTGTATCTTTGTGGTACCTAATTCATATCTAGTTAATTATTTATCATTACTAATTTTATCCTCAAGTCTACGAGTCGAGTTTAAAGACTTTTTTTCGAGTCTATGTAGAC TCGCGAGTCTAACAATCTTGTTTGCAGTCAGGAGGTCCTTCATGGAATGTACTACTTGGCAGAAGGGATGGTCTGATTGCAAACCAATCTGGTGCCAACACATCCATTCCTAATCCAACT GAAAGCTTAGCCAATGTCACTGCCAAATTTGCTGCTGTTGGCTTAAACACAAGTGATCTAGTTGCATTATCTGTGGTAATCACACTTACTTCTCTAATCTAGACTTTAATTAGAGTATGT TGGATTAGGACATATAAATTTCAACAATTGTATCTAATGGTGGAAATTTGACCGTACGACAGGATGTTTGAAGGGATTCATAGCAAAGAAGTTTTGTAGAAAATTATTGATTTTTTCATT ATGTGTATGATAATTAATAAGCATTTTTTTTTAACTATTGGTTGACTCAAATGGATCAACTTGAATTAGGTGCACATACTTTTGGTCGTGGACAATGTAGATTTTTCAACCAAAGACTAT TCAACTTCAGTGGCACAGGCAAGCCTGATCCAACACTAAATTCAACATATCTAGCAACTCTACAACAAAATTGTCCACAAAATGGAAGTGGTAACACACTAAACAATCTTGACCCTTCAT CACCAAACAATTTCGACAACAACTACTTCAAAAATCTTCTCAAAAATCAAGGTCTTCTTCAAACGGACCAAGAATTGTTTTCCACTAATGGTGCTGCTACAATCTCCATTGTTAACAACT TTGCAAGCAACCAAACAGCTTTTTTTGAAGCCTTTGTTCAGTCCATGATTAACATGGGTAATATTAGTCCATTAATTGGAAGTCAAGGAGAAATTAGATCCGATTGTAAGAAAGTTAATG GAAGTTGA |
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CDS►
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGAATTACCCAATGAAAACTTTAACTTCAAGCATAATTGAAGACAGACATTCTTCAATATATATACCTTATCAACTCCTCAGATATTTCATCAAGAAATCAAACTCCAAAGAAGAAACT AAGAAGCCAACCATGTTTTCTCCTAAATTTTATTCCATTTTCACAGTGCTAATATTCCTCCTTCTTAATCCATCACATGCTCAATTGACCTCAACATTCTACTCCAACACATGCCCCAGT GTTTCTTCTATAGTAAGAAATGTTGTTCAACAAGCTCTGCAAAATGATCCTCGTATTACCGCGAGCCTAACCCGTCTTCACTTTCACGATTGCTTTGTTAATGGATGTGATGCATCTCTT TTATTAGATCAAGGTGGAAACATAACACTAAGTGAGAAAAATGCTGTTCCTAACAATAATTCAGCTCGTGGCTTTGATGTAGTTGACAAAATCAAAACCTCTGTTGAAAATTCATGTCCT TCTGTCGTGTCTTGTGCTGATATTTTGGCTCTTGCTGCTGAAGCTTCTGTATCTTTGTCAGGAGGTCCTTCATGGAATGTACTACTTGGCAGAAGGGATGGTCTGATTGCAAACCAATCT GGTGCCAACACATCCATTCCTAATCCAACTGAAAGCTTAGCCAATGTCACTGCCAAATTTGCTGCTGTTGGCTTAAACACAAGTGATCTAGTTGCATTATCTGGTGCACATACTTTTGGT CGTGGACAATGTAGATTTTTCAACCAAAGACTATTCAACTTCAGTGGCACAGGCAAGCCTGATCCAACACTAAATTCAACATATCTAGCAACTCTACAACAAAATTGTCCACAAAATGGA AGTGGTAACACACTAAACAATCTTGACCCTTCATCACCAAACAATTTCGACAACAACTACTTCAAAAATCTTCTCAAAAATCAAGGTCTTCTTCAAACGGACCAAGAATTGTTTTCCACT AATGGTGCTGCTACAATCTCCATTGTTAACAACTTTGCAAGCAACCAAACAGCTTTTTTTGAAGCCTTTGTTCAGTCCATGATTAACATGGGTAATATTAGTCCATTAATTGGAAGTCAA GGAGAAATTAGATCCGATTGTAAGAAAGTTAATGGAAGTTGA |
Retrieve as FASTA
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cDNA►
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGAATTACC CAATGAAAAC TTTAACTTCA AGCATAATTG AAGACAGACA TTCTTCAATA TATATACCTT ATCAACTCCT CAGATATTTC ATCAAGAAAT CAAACTCCAA AGAAGAAACT
AAGAAGCCAA CCATGTTTTC TCCTAAATTT TATTCCATTT TCACAGTGCT AATATTCCTC CTTCTTAATC CATCACATGC TCAATTGACC TCAACATTCT ACTCCAACAC ATGCCCCAGT
GTTTCTTCTA TAGTAAGAAA TGTTGTTCAA CAAGCTCTGC AAAATGATCC TCGTATTACC GCGAGCCTAA CCCGTCTTCA CTTTCACGAT TGCTTTGTTA ATGGATGTGA TGCATCTCTT
TTATTAGATC AAGGTGGAAA CATAACACTA AGTGAGAAAA ATGCTGTTCC TAACAATAAT TCAGCTCGTG GCTTTGATGT AGTTGACAAA ATCAAAACCT CTGTTGAAAA TTCATGTCCT
TCTGTCGTGT CTTGTGCTGA TATTTTGGCT CTTGCTGCTG AAGCTTCTGT ATCTTTGTCA GGAGGTCCTT CATGGAATGT ACTACTTGGC AGAAGGGATG GTCTGATTGC AAACCAATCT
GGTGCCAACA CATCCATTCC TAATCCAACT GAAAGCTTAG CCAATGTCAC TGCCAAATTT GCTGCTGTTG GCTTAAACAC AAGTGATCTA GTTGCATTAT CTGGTGCACA TACTTTTGGT
CGTGGACAAT GTAGATTTTT CAACCAAAGA CTATTCAACT TCAGTGGCAC AGGCAAGCCT GATCCAACAC TAAATTCAAC ATATCTAGCA ACTCTACAAC AAAATTGTCC ACAAAATGGA
AGTGGTAACA CACTAAACAA TCTTGACCCT TCATCACCAA ACAATTTCGA CAACAACTAC TTCAAAAATC TTCTCAAAAA TCAAGGTCTT CTTCAAACGG ACCAAGAATT GTTTTCCACT
AATGGTGCTG CTACAATCTC CATTGTTAAC AACTTTGCAA GCAACCAAAC AGCTTTTTTT GAAGCCTTTG TTCAGTCCAT GATTAACATG GGTAATATTA GTCCATTAAT TGGAAGTCAA
GGAGAAATTA GATCCGATTG TAAGAAAGTT AATGGAAGTT GAAATGGGGA GGATCGTCAT GCATGCATGA TAGTATATGT ACAAGATATT CTTACTCCAA CTTATATGCT CAAACTTTAA
GACCTTATTT GTGTGATCTG ATTTAATAAA ATAAGGTAAA ATTGCTTTAT CATTTTTTTT TTTTGGGTTG ATAAAATTGT TTTTTGTTTT TGTTTTGAGA GGATTGATAA AATTGTTTAT
CAATATTAAA TAAAATAATG TTTGTGTTGG CCG
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Retrieve as FASTA
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