Entry information : Ptro2CysPrx03(PrxIII / PRDX3)
Entry ID 4497
Creation 2007-01-25 (Filippo Passardi)
Last sequence changes 2010-10-20 (Filippo Passardi)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2023-04-18 (Bruno Savelli)
Peroxidase information: Ptro2CysPrx03(PrxIII / PRDX3)
Name Ptro2CysPrx03(PrxIII / PRDX3)
Class Typical 2-Cysteine peroxiredoxin    [Orthogroup: 2CysPrx001]
Taxonomy Eukaryota Metazoa Chordata Mammalia Hominidae Pan
Organism Pan troglodytes (chimpanzee)    [TaxId: 9598 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value Ptro2CysPrx03
start..stop
S start..stop
Hs2CysPrx03 530 0 1..256 1..256
Pabe2CysPrx03 521 0 1..256 1..256
Mmul2CysPrx03 516 0 1..256 1..256
Mfa2CysPrx03 511 0 1..256 1..256
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '4497' 'complement(join(119926579..119926632,119927273..119927438,119930475..119930578,119931680..119931815,119932393..119932534,119934960..119935092,119936708..119936743))' Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 119936708..119936743 34 N° 2 119934960..119935092 131 N° 3 119932393..119932534 140 N° 4 119931680..119931815 134
N° 5 119930475..119930578 102 N° 6 119927273..119927438 164 N° 7 119926579..119926632 52  
complement(join(119926579..119926632,119927273..119927438,119930475..119930578,1 19931680..119931815,119932393..119932534,119934960..119935092,119936708..1199367 43))


exon

Literature and cross-references Ptro2CysPrx03(PrxIII / PRDX3)
DNA ref. GenBank:   NC_006477.2 (119936743..119926579)
mRNA ref. GenBank:   XM_001154193.1
EST ref. GenBank:   CB294907.1 [5' end]
Protein sequence: Ptro2CysPrx03(PrxIII / PRDX3)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   256 (202)
PWM (Da):   %s   27547.12 (22849.4)  
PI (pH):   %s   7.88 (6.12) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-226
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MAAAVGRLLRASVARHVSAIPWGISATAALRPAACGRTSLTNLLC
SGSSQAKLFST
SSSCHAPAVTQHAPYFKGTAVVNGEFKDLSLDDFKGKYLVLFFYPLDFTFVCPTEIVAFSDKANEFHDVNCEVVAVSVDSHFSHLAWINTPRNGGLGHMNIALLSDLT
KQISRDYGVLLEGSGLAL
RGLFIIDPNGVIKHLSVNDLPVGRSVEETLRLVKAFQYVETHGEVCPANWTPDSPIKPSPAASKEYFQKVNQ*

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from frpm genomic (chromo 10, 6 introns) and 4 ESTs (CB294908.1, CB294905.1, CB294906.1). Transcript variant 2 is identical. Variant 1 lacks a small part in the 3' region.

test
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCGGCTGCTGTAGGACGGTTGCTCCGAGCGTCGGTGAGTGGCTGTCGGCTGGGGACAGGCGTGGAGACACTGGTGGCTCCGGGAACGTGCTTCTCAGACAGGACCCCGCGCTTCTGG
GCATGAGGGCCATTCGCCCTTCTTGGAGGGTTTCCGCGGGTAACGGACCCAGAGGCCTCCCTCCGGGAAGGTTCCATGCGCCTGCGCAGAACCGCCCTTCCTCACTCCGTCCTCGCGGTC
TCTTCCCCGAGTCCCTCCTCTTTAGGCGTCCCCGGTCCCCAGGCCCATCTCCACTTAAGGTCCTGGCCCTGATTCTGCCACCGACCCTGTGATCTTGGGCAAGCGCCTTCGCCTTTCTCA
GACTGTGTACTTAAGATGGAAAGAATGATGCCTACATCAAGGCGTTGCTGTGAACAGCCCCTTAAATACTGGATAAAAACGCGCAAAGTGCTAAAAAACTCACAAAGGCTTTCCCTCCCA
ATCCCACTCCCGCGTGTTTCTGCTGCTGTTTCCTGCTTAACTGTGGGCAATGCGTCGTGCTCTTTTGGTACACGGCTTTCTCTGGTGGGGTTCAACACAGCCCCTTTCGTTCTCCTGAGT
CATTTTGAACATTAAAGTTGAGCAAACCGGCAGAGTGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTG
GACAATAATAGTGAGACCTTGTCTCTAAAAAAAAAAAATAGCCGGGCATGGTGGTCAGTGCTCCTGGGGAGGTTAAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGTCGAGACTGCAGCGAG
CCGAGATCGCGCCACTGCACTGTAGCCTGGGTAAAAGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTGAGTAAACATGTCCCTTGAGCCTTTAACAGACTCCCAGAGGCTGAAT
TTGGCTCTTCTTGTTTACTTGTCGCTGGTGCTGGAGGGGCCTTGTTTTTCTAAGAAAAACCTTGAAATGGTAGAACATACTCAGCAGATAGTGCTGGGAAAAGCCTGCACAAGTCCCCTG
GCTTCTGAACCCTGTGTTGCTTTAAGCGCATGGAGTTTCTGTTTTTTTTGTTTTTTTGTTTTTTTTTTGAGACGGAGTATTGCTCTGTCGCCCAGGTTAGAGTGCAATGGCGCGATCTCG
GCTCTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGAATTACAGGTGCCCGCCACCGCCGCCTGGCTAAGTTTTGTGTTTTTAGTAGAGATGG
AGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTGGTGATCAACCCGTCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCAACCGCGCCCAGCCGGTCTTTGTGTTC
TTATAGTTCCTCTCCACCTTCCAGTCTCCTAGGAGAAGGAAGCAGAAGGGAGTGTTAAGAACATGCAGATCCAATCCATGCTCTTAGAGTTTGGGGTTTGCTATTTGGTTCACAGGAACA
GGGACAGCTGAAACCACCGTTGGCACGATGCCCTTTCAGCCTTCAGTCACCAGTCCAGGAAAACTTTCTAATAAAAAGTTTCTCTTTCCAGGTGTTGCCCGACATGTGAGTGCCATTCCT
TGGGGCATTTCTGCCACTGCAGCCCTCAGGCCTGCTGCATGTGGAAGAACGAGCTTGACAAATTTATTGTGTTCTGGTTCCAGTCAAGCAAAATTATTCAGCACCA
GTAAGTGTTATGTC
ATGTCTTGGCTGGAGCCAGGTAAAGGAAAAATGAACCATCGTCTCTGGACAGGGGCTCTGAACCCTGGCCAAACGTTAGAGTCACCTGGGAGCTTTCAGGAACACAGCACTGCCCCCGTC
CCACCCCAGACAAGTTAGTCTCTGGGGTGAGACCAGGATGTGCCAGGTGATTCTAACGTGCAGCCAGGGTTGAGAATCACTGAGGCAAACTGCCCTTGTCACATTTCCATGTTGGTTGTC
AGAGCTTCTAATCCACTGTGTTGAGGAGGGTGTTACTGGGAGCTCAGATGCCTTCTGAGTCTAGTGTGTCTGAAGAGCTGTGAGTGGTGGGCAGCCTGTGGGGACCTGAGAGGGCAGCTG
CTCTAAGATTCAAACCTGTGTACTGGCCCCAGCTGGCCACTTAGGAACCAGACCTGTCTAATGGTATCTGTAATCTGAGTGAAATTTAGCTGTTTCTTGAGATTTACACTCCCTTCTCTA
GGATATGGGCTTTGCTAAGATCAGCCTCAGATAATGAGTGGTAGTTGAAAATACCTTGTCTAGATTTGACTAGCCTTTGAAAAAGCACGTATTTAATATGTAATGGTTTGGGGGGATATA
CTTTAGTAAAGCCTTTGTTTGTGGGCAAAATGTTCTAAGAGCTTTCGCAATTTTACTACCCTGGAGCTTCAAAATATTTCTAGTAGTGATGTGATACCACAGGCTTAAAACTTTACTCCA
CTGGTTTCGAATCCTCATCCCCAGCAGCGCCTCCTGTTTCTGTTCATGGCGGTGTCAGGCATTTTGACATTGGAACTACTCTGTCGCTCATTCCTGGGTAGAAGCAAGTCCTTTTCAGTT
TTGACACATCTCTTGCATCCATTCCTTTCTGTTCTTTCTGCCCCATCCCTCCCCTCAATACGTCTAAGATCACTGAAATCGAGGCTGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACT
TTGAGAGGCCAAGGCAGGCGAATTACTTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCATCCTGGCCAACCTGGTGAAATCCCGTCTCTACTAAAAATACTTAAAAAAATAAGCCGGGTGTGGTGGTGTG
CTACTGGAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGACCATGCCACTACACTCCAGCCTAGGTGACAGAGCGAAAC
TCTGTCTCAAAAAAAAAAAAATCACTGAAACCACCTCCTAACATGTCTCCCCCTTCCTCCTGCTCCTCTTTCCCTCCTGCCGGACTAATCTTCCTAAAAACCCCCATCTCAGCCAGGCAC
TGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCTGGCAGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAATCCCCTCTCTACTAAAAATACAAAA
AATTAGCCGGGCGGGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCAGAGCTTGCAGCGAGCTGAGATCGTGCCACTGCACTC
CAGCCTGGGTGAACAGAGCGAGACTCCGCCCTTGACTCTGTTATCTTTCCTGTTAAGAAGACCCAGCAGCCTGGTATTTAAGGACTGTTGCAACATGGCCTTCAACTATTCCTGCCTGCT
GCCTGCTCTTCACTCCGTACTCTTAGACACTCTCTGTTCTCATTAGACTGCCACACGCTGCTCCACACACATGTCCTGTCTTCCTTCCTGCTGTTTCCTACATGCCATCTGCCCCATCCC
ATCTAGACTTGACAAAATCTGAACCATATTTAAAATCCATCTCTAGTCTCATGTCTTCCTTAATTCTATCCCTACTTTGTCTTCCTCTTTTTAGTTTCCGTAGCACTTGGAATTGAATTT
GTGCACAATCTAAAACTATAGAAGGAGAAATTACAGTTGGCCCTCTGTATCTGGATTCTGCATCTGTGGTTGGTTGAATCGAAAATATTGGGAGGGAAAAATGGATGGTTGTGTCTATAC
TGAACACAAAGTCTTTTTTCTTGTCATTCCCTAAACAATACAGCTTAACGACTATTTACGTAGCATTTACGTCGTATTAGGTATTATGAGTAATCTAGAGATGATTTAAGTATACTGGAG
GGTGTGTGTAGATTATATGCAAATCACCACTTTATGTAAGAGACTTGAGCATCTGTAGATTTCGATATCCTAGAACCAATCCCCCCACAGGTGGCAAAGGATGACTGTGCCTAAGATGTA
CAGTTGAACCGAATGTTTTGATTTATACTAAGCACTTTATACTACTAATTAATTATGAGAAGTTTAAATAAAATCATAGGTGCTTGACATAGCAAATGATGAACTCCATATGAGTGTGGG
TTTTTTTTCAGGTGTTCCTCATGCCATGCACCTGCTGTCACCCAGCATGCACCCTATTTTAAGGGTACAGCCGTTGTCAATGGAGAGTTCAAAGACCTAAGCCTTGATGACTTTAAGGGG
AAATATTTGGTGCTTTTCTTCTATCCTTTGGATTT
GTAAGTGTAATTTCTATGATGCTTTCGTGTCATTCTGAGAGCAAGCACATATCCTGTTCCCGCACTGAATTGTCTATCCCTAGAT
ACCCTTGTGAAAGGAAGGATTCTTTCTGACCCTTTATCACTGATGGCCTTGTTGATTACAGCTGGGATCTGTAGCTTGTTTACAAGTGATAAACTTCGGGGGTGGGATAGGACAGCTTTC
TTTATAGTACACCTCTGTGCTCTGGAGCACTGCTTCCCTAAGCCAGTCTATGAAAAAGTTTTCACTGGTCTGGGGAAAAATGAGAAAAGTAGGCATAATAAAATGATTTTTTTCAAAAAG
CAACTTTATTGAACTGTAATTTTTTTTTCTTAAAATATGTGTTCCCTTTCCCCATTTTTTGATACAATTCCTAAAATAAAAAGGTGAGGGGAGGTAGTAGTACTTTTGCCAGCACAACAC
TATAGTCCAGTGAGGATGGTAAACCATTTTGCCTTTTTTACCCTTAGCAAGTTGAACTAGTTGTTAGACCACTAATTGTTAAAATCCTTGTTTTTAAATGCTCTAATGAGAATTTCTATC
CTTTTTTTCCAGCACACCTTTGTGTGTCCTACAGAAATTGTTGCTTTTAGTGACAAAGCTAACGAATTTCACGACGTGAACTGTGAAGTTGTCGCAGTCTCAGTGGATTCCCACTTTAGC
CATCTTGCCTGGATAAATACACCAAGAAAG
GTATAGCATTGTACCCCTAGCTTTTGCTCTTATAAACTTGCTTGGAAGAATCTAAATTTCTAGCTATGCTGCTGGACTATCAAGATCAAA
TTACGCAAGGGTTGGGTTTTTTTGTTTTTTTTTTGAGACGGAGCTTCACTCTTGTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCACCTGCGTTCAAGCA
ATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGTCACCACCCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTGTCTCCCATGTGGTCACGCTGGTCTCGAACT
CCTGACCTCANNNNNNNNNNGCTGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCGAGACAGGTGGATCACAAAGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACACGGT
GAAACCCCATCTCTACTAAAAATAAAAAAAATTAGCCAAGTGTGGTGGTGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCGGTGGTTG
CCATGAGCCAAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGCGCGACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAATAAATAAATAAATAAATAAAATAATAAATAATTAGAAAAAGCATCTGTAGTCCCAG
CTACTCAGGAGACTGGGGTAGGATGATTGCATGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCTGTGAGCTGTGATCGCATCACTGCATTCCAGCCTGGTGACAGCGAGACTCTGTGTCTTAAAAAAAA
AATTGGAAAAGGTCTGTAGTATTAGCCGGGTGTAAATCTTCCTTCTGCTTCTTTCTAGCTGGGACCTGGAACAAGTTACTTAGGTTTTTCTTGCCTCAGTTTCCTCATTCTGATAGTGTC
TTCTCCAGGGTGGTTTCGAGGAGGCAGTAGGTTAATAGAGTAAGCAGTGCTTGGCCCGTTGTTGAATTACTGTTACCTATCACCGTTATTGTTGGTCTCAAACATTGTGGTACGTGGTCA
AGAATGTTGTGAGGCCACACATTCTAACAGTCATGTTTGCATTTTGATTAGAAAATGGTGGTTTGGGCCACATGAACATCGCACTCTTGTCAGACTTAACTAAGCAGATTTCCCGAGACT
ACGGTGTGCTGTTAGAAGGTTCTGGTCTTGCACTAAG
GTAAGATCCTGTTTCTGATGAACTTAAGATTATTTTTCATGTTTAGTATCATTCTACTTCTTAGGGGATTTATGTAGACCTTG
GTAAAGCATTTTTAAAACCAGAAGATCCTGGCTGGGCATGGTGGCTCGTGCCTGTAATCGTAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGAAGATCACTTGAGTTCAGAAGTTCAAGACCAGCCT
GGGCAACATAGTGAGACCTCATCCCTATTATATTAAAAAGAATTAAAATGTATAATAATCAAAAAATCCTTAATTTTAGTCTTTAATAAACACTGATAAAATGCCTCCTGCAAGGGTTGG
CGGTCTCTCAGAAATGCTGAGACATGCATGTCCCCTCCACCACCTTGGGTCTCTTTCTGAAGAAGGCTGTCTGCGTCTTGAGGCCACACTGCTCCATACTCCCTATGTGGGAGCCACTTC
CATGGGGACACACACCTGACATTGAAGCCATCAGACTCTTTGCAGAAGGGGGGACTAGCAGGGTAAGAGGTAGTCTCTTGGAATGGTGACCATCTTCAGCCCTGGAACCAAACAATCCTT
GGTTTGAGTTTTTCTTTTTTTTTTAACTCAGCTACTTAATAGCTGTGTGACTTTGGGTAACTGATTTGATTTAACCTTGTTGAGCCCCAGTTTTCCCATAACTAAAATGAGGTGGTACCT
CAAAGGTGGGTGTGAGGATTAAATAGTGACACAGCTAGAGTTTTTAGCATAGTTACTGGCAGCAGTTGTTAGGATTTCTGCCCCAGAACATCATTTCTATCTGTATTCAGTCCCTTATTA
AACCTTTATTCCTTTGAGTGTGAAAAGCTTTCAGTCCTCAGCAGCCCCACATTCAAACACAACCTTCCTGGGAGGGATGAGAACTTGGGTCTTAGAATTGGCATCTTGAAGTCTGCTGAG
AATAGGAGTGAAGGAGGGATAGGGCAGAACTTGACCTCCAGGAAGGAAGAGAGGGGATCCCCCTTTGATATGCTGTGCCTCACAGTTTTGCTGGGGGCTGATCAGCTTAAAGCCAGCTCA
CCTGGCCGGGCGCGGTGGCTCACACCTGTAATGCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCATCTCTAC
TAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCG
CACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAGCAAACAAACAAACAAACAAAGCCAGCTCACCTGCCTCTCTTGTAGGTGACCTCTGGCCTGCTCTTTCTTGG
GTTACACCTTGGATTTTAGCGCTGAGTGGCATCTTAGAGTTTGGGCCTTTTTTTCCTCTCTTTTTTTTTTTCTTTTCTTTTCGAGACGGTGTCTTGCTTTATCGCCCAGGCTGGAGTGCA
GTGGTGTGATCTCGGCTCACTGCAGCCTCCATCTCCCGGGTTCAAGCAGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTACACGCCATCACGCCCGGCCAATTTTTGTAT
TCTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAAACTCTTGACTTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCTCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCT
GGCAGACCAATTTTTTTTTTTTAACTTTATAGAGATTATCAAACGAATGCCTAGGTCTTTCAGAATTGTCAATGGCCAGAGAAAGGGTACTGGCTATTTTTCTCCTACGGTCCCTTTCCC
TATGAGAACTCACTAATTTTGCAGTTACCTCTGTACCCGTTTTAATATTGAGATTAACAAGAGAGAGAAGCTGAGTCTGGCTTATAAGATAAAGACTTTTGGGAGTCTGTGGGCCCTGCT
CTGTCCCAGCTCTGCCTCACCTTCTATTGGTGGACTTCAGCTGGCTGCACCCTCTGGGAACAGTTTCACCTCAAACCCCAGGCTTCCAGTGCCTGACCCAGGGAGGGAGAAGCATCTTTT
ACCCTGAGTTTTCTTTAACCTGCCTTTTCCATGAGTGATTGATACCTGAAATTTCCACATCCTTTTAAGACAGACTGTTAAAACCTGTAGGTTAAATAACCGGACACAGTGATACACACC
TATAGTCACGCTACTTGGGAGTCTGAGGTGGGAGGATCAGTTGAGCCAGAAGTTCGAGGCTGCAGCCTGCTGTGATCACACCTGAGAAGAGCACTGCACTCCAGCGTGGGCAATATAGTG
AGACCCTATATTTAAACCAAACAACCAAAAAAACTTCTAGGCTAAACATATCTGCATCTGTCACAGTAACACCAACACAGAAGATAAACACAGACCACTGTGGTAGCGTGGTTCATCTCA
TTACATGCTGCAACATGATTAAAAGTGATGGGCATGGTTTTCTGTTTTGCATAGACTTAGAGCCTATACATTCTTTCTATGAAGATTTTTCCCATGGGATTTCCCCCCATTTACCCAATA
ATTCATTCATAATAAACAGTTGTTGAACCTAGATAAAATACACCTCTGTCTCTTCCCATTTGCCTATAAGTTTCTTGCCAAGATGTGATACAGCAGCTCAAAGAATGCTTGCCAAGTCAC
TAATAGTCTTTGCTCTCTCTAGTTCAGTGACTTTCCGATACTGTGTAACATTCAGGGCACTATGTGAACTTGTAAGTGTGACCATACCGCATGTTTTATGGTGACCTGGTCCAGTACTGC
CTTTGTTAAAGCATCTGTCATCAGTAAGAGATGATAAGTTTTTTGCACAACAGTGAAAACCCCACCTTTAAGCATATGATTACGCTTAATAAATATTTTATTAAAAGGAGAATTAAAGAC
CTAAAAGGGAAGAAGTTAGACTGTTCTACTTCTGGTACTGTTGAGGCACTGATGAGGATAAATGATCATGCAGAGAGGTCTCTTCATAATTGACCCCAATGGAGTCATCAAGCACTTAAG
CGTCAACGATCTCCCAGTGGGCCGAAGCGTGGAAGAAACCCTCCGCTTGGTGAAGGCGTTCCAGTATGTAGAAACACATGGGGAAGTCTGCCCAGCGAACTGGACACCGGATTCTCCTAC
G
GTAGGTTTTTTCCCCAAAAGCAGTGAGGTCCATGTTCTCTCAGCCTCGAGAGCTATTGACCTGAAATATCCACAAAAGGGAGCCCACTCTTGGAGCAAGCGTGCAGATGATGTGCAAAT
GGGTGAAGCTGCTGTGGGGTAGAGGGGGTGGGGTGGGGAGCCAGGAACCAATTATCAGAGACAGGCAGGCCTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTCGCCCAGGGTGGAGTGCA
GTGGCGCTCTCTCAGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCTGGGTTCACGCCATTGTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTAGGACTACAGGGTGCCCACCACCATGGCTAATTTTTTGAATTT
TAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTGGATCTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACCGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCCT
AGAGACAGGCAGGCCTTAATGAAACTTTCATCTTTATGTTTTAAAGGAAATCTTTAAAAGTTTAAAGAACTTTAGGTTAAAAATTGGGAGATTGCCACTCACTTTTGGGACTATTATTAT
GGTAAAGTCACAGTTACCTAATTAAGCTTTTCTATTTTCAGATATCAAGCCAAGTCCAGCTGCTTCCAAAGAGTACTTTCAGAAGGTAAATCAGTAG

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCGGCTGCTGTAGGACGGTTGCTCCGAGCGTCGGTTGCCCGACATGTGAGTGCCATTCCTTGGGGCATTTCTGCCACTGCAGCCCTCAGGCCTGCTGCATGTGGAAGAACGAGCTTG
ACAAATTTATTGTGTTCTGGTTCCAGTCAAGCAAAATTATTCAGCACCA
GTTCCTCATGCCATGCACCTGCTGTCACCCAGCATGCACCCTATTTTAAGGGTACAGCCGTTGTCAATGGA
GAGTTCAAAGACCTAAGCCTTGATGACTTTAAGGGGAAATATTTGGTGCTTTTCTTCTATCCTTTGGATTT
CACCTTTGTGTGTCCTACAGAAATTGTTGCTTTTAGTGACAAAGCTAAC
GAATTTCACGACGTGAACTGTGAAGTTGTCGCAGTCTCAGTGGATTCCCACTTTAGCCATCTTGCCTGGATAAATACACCAAGAAAG
AATGGTGGTTTGGGCCACATGAACATCGCACTC
TTGTCAGACTTAACTAAGCAGATTTCCCGAGACTACGGTGTGCTGTTAGAAGGTTCTGGTCTTGCACTAAG
AGGTCTCTTCATAATTGACCCCAATGGAGTCATCAAGCACTTAAGCGTC
AACGATCTCCCAGTGGGCCGAAGCGTGGAAGAAACCCTCCGCTTGGTGAAGGCGTTCCAGTATGTAGAAACACATGGGGAAGTCTGCCCAGCGAACTGGACACCGGATTCTCCTACG
ATC
AAGCCAAGTCCAGCTGCTTCCAAAGAGTACTTTCAGAAGGTAAATCAGTAG

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
GCCCCTGCGT CTCTGCCCGC CCCGTGGCGC CCGAGTGCAC TGAAGATGGC GGCTGCTGTA GGACGGTTGC TCCGAGCGTC GGTTGCCCGA CATGTGAGTG CCATTCCTTG GGGCATTTCT  GCCACTGCAG CCCTCAGGCC TGCTGCATGT GGAAGAACGA GCTTGACAAA TTTATTGTGT TCTGGTTCCA GTCAAGCAAA ATTATTCAGC ACCAGTTCCT CATGCCATGC ACCTGCTGTC  ACCCAGCATG CACCCTATTT TAAGGGTACA GCCGTTGTCA ATGGAGAGTT CAAAGACCTA AGCCTTGATG ACTTTAAGGG GAAATATTTG GTGCTTTTCT TCTATCCTTT GGATTTCACC  TTTGTGTGTC CTACAGAAAT TGTTGCTTTT AGTGACAAAG CTAACGAATT TCACGACGTG AACTGTGAAG TTGTCGCAGT CTCAGTGGAT TCCCACTTTA GCCATCTTGC CTGGATAAAT  ACACCAAGAA AGAATGGTGG TTTGGGCCAC ATGAACATCG CACTCTTGTC AGACTTAACT AAGCAGATTT CCCGAGACTA CGGTGTGCTG TTAGAAGGTT CTGGTCTTGC ACTAAGAGGT  CTCTTCATAA TTGACCCCAA TGGAGTCATC AAGCACTTAA GCGTCAACGA TCTCCCAGTG GGCCGAAGCG TGGAAGAAAC CCTCCGCTTG GTGAAGGCGT TCCAGTATGT AGAAACACAT  GGGGAAGTCT GCCCAGCGAA CTGGACACCG GATTCTCCTA CGATCAAGCC AAGTCCAGCT GCTTCCAAAG AGTACTTTCA GAAGGTAAAT CAGTAGATCA CCCATGTGTA TCTGCACCTT  CTCAACCGAG AGAAGAACCA CAGTTGAAAC CTGCTTTTAT CATTTTCAAG ATGGTTATTT GTAGAAGGCA AGGAACCAAT TATGCTTGTA TTCATAAGTA TTACTCTAAA TGTTTTGTTT  TTGTAATTCT GGCTAAGACC TTTTAAACAT GGTTAGTTGC TAGTACAAGG AATCCTTTAT TGGTAACATC TTGGTGGCTG GCTAGCTAGT TTCTACAGAA CATAATTTGC CTCTATAGAA  GGCTATTCTT AGATCATGTC TGAATGGAAA CACTCTTCTT TCTTAGCCTT ACTTGAATCT TGCCTATAAT AAAGTAGAGC AACACACATT GAAAGCTTCT GATCAACGGT CCTGAAATTT  TCATCTTGAA TGTCTTTGTA TTAAACTGAA TTTTCTTTTA AGCTAACAAA GATCATAATT TTCAATGATT AGCCGTCTAA CTCCTGCAAT GAATGTTTAT GTGATTGAAG CAAATGTGAA  TCGTATTATT TTAAAAAGTG GCAGAGTGAC TTAACTGATC ATGCATGATC CCTCATCCCT GAAATTGAGT TTATGTAGTC ATTTTACTTA TTTTATTCAT TAGCTAACTT TGTCTATGTA  TATTTCTAGA TATTGATTAG TGTAATCGAT TATAAAGGAT ATTTATCAAA TCCAGGGATT GCATTTTGAA ATTATAATTA TTTTCTTTGC TGAAGTATTC ATTGTAAAAC ATACAAAATA 
AACATTTTAA AACATTTGCA TTTTGCCACC ATTAA 

Retrieve as FASTA