Entry information : VvAPx02 (GSVIVT01025551001 / Vitvi12X-PACid_17833519)
| Entry ID | 5170 |
|---|---|
| Creation | 2009-02-27 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2011-07-02 (Qiang Li) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Christophe Dunand |
| Last annotation changes | 2015-07-29 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: VvAPx02 (GSVIVT01025551001 / Vitvi12X-PACid_17833519)
| Name (synonym) | VvAPx02 (GSVIVT01025551001 / Vitvi12X-PACid_17833519) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Class | Ascorbate peroxidase [Orthogroup: APx2001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Vitaceae Vitis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Vitis vinifera (Grape) [TaxId: 29760 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | Cytosolic |
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| Tissue types | Berries Buds Inflorescences Leaves Seeds |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '5170' 'complement(join(14111452..14111479,14111583..14111641,14111764..14111866,14112003..14112082,14112224..14112306,14112435..14112483,14112825..14112890,14113130..14113304,14113409..14113527))' |
Exons►
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Literature and cross-references VvAPx02 (GSVIVT01025551001 / Vitvi12X-PACid_17833519)
| Literature | Goes da Silva,F., Iandolino,A., Lim,H., Baek,J., Leslie,A., Xu,J., Jones,K. and Cook,D. Expressed sequence tags from Vitis vinifera 'Cabernet sauvignon' berries at various developmental stages
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|---|---|
| DNA ref. | Phytozome 12: chr8 (14113527..14111452) |
| Cluster/Prediction ref. | UniGene: Vvi.737 |
Protein sequence: VvAPx02 (GSVIVT01025551001 / Vitvi12X-PACid_17833519)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (Chromo 8, 7 introns) and 15 ESTs. Cultivar="Pinot Noir", "PN40024" and "Cabernet Sauvignon". Also found in AM444673. | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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