Entry information : AnLDS02
| Entry ID | 5305 |
|---|---|
| Creation | 2007-05-01 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2012-04-23 (Catherine Mathe (Scipio)) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Marcel Zamocky |
| Last annotation changes | 2013-09-04 (Catherine Mathe (Scipio)) |
Peroxidase information: AnLDS02
| Name | AnLDS02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Linoleate diol synthase (PGHS like) [Orthogroup: LDS001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Fungi Ascomycota Eurotiomycetes Trichocomaceae Aspergillus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Aspergillus niger [TaxId: 5061 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | Mycelium |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '5305' 'complement(join(854693..854841,855110..855386,855446..855679,855746..856166,856235..856711,856771..856832,856894..857680,857751..858093,858154..858243,858297..858405,858481..858645,858721..859152))' |
Exons►
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Literature and cross-references AnLDS02
| Literature | Hoernsten L., Su C., Osbourn A.E., Garosi P., Hellman U., Wernstedt C., Oliw E.H.;
"Cloning of linoleate diol synthase reveals homology with prostaglandin H synthases."; J. Biol. Chem. 274:28219-28224(1999). |
|---|---|
| Protein ref. | UniProtKB: A2QYI1 |
| DNA ref. | JGI genome: chr_3_1 (859152..854693) |
| EST ref. | GenBank: DR709174 |
Protein sequence: AnLDS02
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (11 introns) and 2 ESTs (DR709174 (5') and DR704511 (3')). Some mismatches have been observed between genomic and ESTs. Strain="N402". Fusion with CypX on the C-terminus. | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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