Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein) |
Length (aa): |
236 |
PWM (Da): |
26379.53 |
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PI (pH): |
9.84 |
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Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MVSMASSTTFFTPLHNFNQARTNSIPSISLPFVKSSIPSSKSPFFQHGFSQPTSFDFPKAVLKSRSFSVNARAVTDKSIYDFTVKDIDKKDVPLSKFKGKVLLIVNVASRCGLTSSNYTE LSHLYENFKDGLEVLAFPCNQFGMQEPGSNEEIKKFACTRFKAEFPIFDVDVNGPFTAPVYQFLKSSSGGFFGDLVKWNFEKFLVDKNGKVVERYPPTTSPFQIEKDIQKLLAA* |
Retrieve as FASTA
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Remarks |
Complete sequence from genomic (chromo 1, 5 introns) and 22 ESTs. Cultivar="A17". |
DNA ►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGTTTCCATGGCTTCTTCCACAACATTCTTCACACCTCTTCACAATTTCAATCAAGCTAGAACAAATTCAATACCTTCAATTTCTTTGCCTTTTGTAAAATCCTCAATTCCTTCTTCA AAGTCACCTTTTTTTCAACATGGCTTTTCTCAACCAACTTCTTTCGATTTTCCTAAGGCTGTTTTGAAGTCAAGGTCTTTCTCTGTCAACGCTAGAGCTGTTACTGATAAATCCATTTAT GATTTTACTGTAAAGGTATCATTTTTAATTTTCAATTTTAATGTTGTGTTAGAATTGAGTAGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGTGGTTTTTGTTGTGATAATTTGTTAAGGGTTTAT CATGATAAGTGTTAATGGATAAGTTTTTTATATAACGGAAGATAAAATAAAGTTAATTGTTGTTTTCATAAGCTATTTGGGAGAACTTATAATAATTAAGCTGAAAACAGCTTATGAACA TGTCATAAGTTGTTTATTATGATAGGTTTTATGGATAAGCTGTTTATATAACGGAAGATAAAATGAAGTTAAATTGTTTTTCGTATATGCTATAAGCTGTTTTCGTAAGCTATCTTGGAG AACAGGGCCCGTTTGGATTGGCTATTTTTTTTTTTTAGCTTATACAAATAAGTAAGCTTTAATGTATTATTCATAAGCTTGTCAAGGTAGTTTATGAAAAAACAGCTTATGAAGATACAA TTTTCACTAGTGAGAACTTATGAATTAACATAAAAGCTTATTTATTGTCATAAGCTGTTTTCGTGAATTCTCCCAGACAGTCTCACAATGTTTATGCTAGTAGATGAGTGCAGATAAGCC AATCGAAACAGGCATATAGTTTTGTTTAACGGAGGAACCCTTTTTTGGAATTGAAGAAAAAAATGTTAATTTATTTGTTATAAGATGATCATACTATTATTATGTGGTGCAGGAGATATT GATAAGAAGGATGTGCCTCTTAGCAAATTCAAGGGGAAGGTTCTTTTGATTGTTAATGTTGCTTCAAGATGGTATGTATTATTATTCACTTTATATTTGTGGTCGGCCCTTTTTTTTTCA ATTGTAATGTTCGGGAGGGATTTGCAATTTAGAACCATCACTTTCTCACTCCTCTAATGTAAGACATCAAATTCCCCTTAGTTACACACACCTCTAGTTTGTTATACAAAAATAGAGTCG GTGACTTTGTGTGTGACTTGATGAGAGCATGAATTTGGTGTCACTTATCCAACAAGTTAGAGTGGTGAGTCTTCATTCAAGTATGCTCTATTTAAGCATACTTGAGGAGAGATAAGTCAG TTTCTCCTGCTATTTGAAAAGGTCTAATCAAATAACTTGAAAGTTATGTCAAAGTTTATGGTGAGTTACGTTTCTATTGAATGGTTTCCTTTGAATGGCAGCGCGGTTTGACATCATCAA ACTACACGGAACTCTCACACTTATATGAAAATTTTAAAGACAAAGGTACGTTACTTATGGATCATAGTTATTTGTTTATATTTCTTATATTTTTTATTTTGACTATTGGTCACTACCTGT TATCTGGATCTTGTACCCTTCCTTCCTATCGAAACATTTCTCTATAGGCTAAACATATCTTTATATGGAAAGCTATTGGTTATGCTTGTAAAGCACATGTCCATTTTAACCAACGGGGTT GAGTCTAGCAGATGTGCTAGTCCCCCCAATTGACAAACACATTTTGAATCTTCACTGGAAGAGATGCTCGTATTAGTGTCTAATCGTGTCTCAAATAGGATTGGCTTCTGTATAAGGATA TCCTGGGGAAACCTCAAATAAAAAATGCATGTGTTTTCGTGGGTAATGCTATATGCAATTTATACAGACTACCTATCTTGCTTTATTTCCACCATTTGCAATTTAGGATATTAACTTGTC TGACACTAGTATTGTTATTCTCATTCCCCTGCTTTCTGTTTGGCATTTAACGGTGTTTGTTGTGGAGATGGAAAACATAAAAGTGAAAAATTAGGCAGGGGGTAAAGTGAACTAATGAAG AAGATGGAAAACTTTTCATTTTACCTTGTTTTGTTTTGTAATTTGGGGCTGAGAAGCTATTTGTTTGCAGCTTTCTGAGAGCTTTTTAATAGGAAAACAATTTCCCCCCTAAAAGTAACT GAACAAAAATGTGCATAGTTGCATTCTGATTACAATTTTGGTGTTGAAGAATTTGCTAAAGGATAGATAGACTAATGTAAGGAGCATATCAGGGTCACTATATGGTGGAACATGAGTGAG CTCTTGCTGGAAAATTAAATTTTTTCCAAATGATAGATTCAAAAGTGACTGAAATTTGATTTTCTACTTTGTTGTTTCTCTTTGAACACGGCTTTCAGATTTTTAGTTCAAAAAACATTT TTGTACGAGCCACACATTTTTATTGTCCTTGTGCATTTTCTTTCCAGGTGTTTGGAGGTTCTAGCTTTCCCTTGCAATCAATTTGGCATGCAGGAGCCTGGATCAAATGAAGAAATTAAG AAATTCGCTTGCACTAGGTTCAAAGCAGAATTTCCAATTTTCGATAAGGTTCGATAATGTTTCTTTATCTAGTAGTTCAGAATAGATTACATGTGAGTAAACCAAGTACTGAAGTTTTGT AAAACAGGTGTTGATGTAAATGGACCATTTACTGCTCCAGTATACCAGTTTCTGAAGTCAAGTTCTGGAGGGTTTTTTGGTGATCTTGTCAAGTGGAATTTTGAGAAATTCTTGGTTGAT AAAAATGGTAAAGTTGTTGAACGATACCCACCAACAACCTCTCCTTTTCAAATTGAGGTATGTTAAACTTTCCAACAGCATCAAAAGTCTAGCTTCTAATTTTTACGGTGGCAATGAATT ATTAACTAGTTAGGTACCTCCTCAAGTATGTCAATGTGATTTTCCGGACAAAATTGAAGATGAGAGTAATACATCTTTAGTGGTGTTTTAAGCTAAAAGAAAATGTTCAGAAAACTGTCT TTGAGCTGATTTTAAGCTGTATTTGATTATATCGGAAAATTTAGCTCTGAAGATTCACTATCGAAATTTTGTGCTGAAAATTCTGACGCTAAAATTAAGTGTTTAAAATTCTCTCATTTA AATTCAAGTAGTTTCTCACTCACGTAAATTTTTAGTACATATAAAACAAATATATAGTATTATTTTCAGCACAGCTGAATTTTGAAATTAGCCCTATATATGATAGTCAAGACAACAAGT TATTTAATAAAGTTACACTGATTAATACCTCTGCCACTCATATGTATCATAAATGAAGCTTTTACTGGCAAGGGACAAACAATTGAGGCTTTAGTGAAGAAGAAAATGAGTTGTTCTTAG GTACTAACAAATTGTTGATATGGCGTATAGTTTCTTATTTGAATAACTTGGTATGGTATGTATGATATGGTATCATTGTATGTCAGTATGTGAGAGTAAGGATAATAGTATGTATGACTA AGGTTGACTTTAAGAGTTGACTTGAACATAACACTTATATGATAAACACTTAGTTAAGCAGTTTGCCTGTTTTCACTAAACTTAATTAATTAAGGGCTTCAGCATACCAGTTTTCACTCT ACCAGAGTCTGATGTAAATTGCCATTGATTTGTTGAGTTGGTTATACTCTACCAAAGCCAACAATATCACCAGATCAAGCTTCCACATTGGATTTCTTTTTGCAATTACAAGAAACTATA TTGGTTCATAAATAATATAAGGGGATTTCTTATTGCAATAACAAGAAACTATAATGATAATGTATCCACGATTAATATCCGTATACTATGGACTTCCTAAAACATTTTATGCTTAATCTG ATCTACCCCGTTTCACATCTTTGCAGAAAAGGATATCCAGAAGTTACTTGCTGCGTGA |
Retrieve as FASTA
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CDS►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGTTTCCATGGCTTCTTCCACAACATTCTTCACACCTCTTCACAATTTCAATCAAGCTAGAACAAATTCAATACCTTCAATTTCTTTGCCTTTTGTAAAATCCTCAATTCCTTCTTCA AAGTCACCTTTTTTTCAACATGGCTTTTCTCAACCAACTTCTTTCGATTTTCCTAAGGCTGTTTTGAAGTCAAGGTCTTTCTCTGTCAACGCTAGAGCTGTTACTGATAAATCCATTTAT GATTTTACTGTAAAGGATATTGATAAGAAGGATGTGCCTCTTAGCAAATTCAAGGGGAAGGTTCTTTTGATTGTTAATGTTGCTTCAAGATGCGGTTTGACATCATCAAACTACACGGAA CTCTCACACTTATATGAAAATTTTAAAGACAAAGGTTTGGAGGTTCTAGCTTTCCCTTGCAATCAATTTGGCATGCAGGAGCCTGGATCAAATGAAGAAATTAAGAAATTCGCTTGCACT AGGTTCAAAGCAGAATTTCCAATTTTCGATAAGGTTGATGTAAATGGACCATTTACTGCTCCAGTATACCAGTTTCTGAAGTCAAGTTCTGGAGGGTTTTTTGGTGATCTTGTCAAGTGG AATTTTGAGAAATTCTTGGTTGATAAAAATGGTAAAGTTGTTGAACGATACCCACCAACAACCTCTCCTTTTCAAATTGAGAAGGATATCCAGAAGTTACTTGCTGCGTGA |
Retrieve as FASTA
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