Entry information : PpaGPx02
| Entry ID | 5756 |
|---|---|
| Creation | 2007-08-20 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2007-08-20 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Not yet reviewed |
| Last annotation changes | 2011-01-25 (Toky Ramarohetra (Scipio)) |
Peroxidase information: PpaGPx02
| Name | PpaGPx02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Plant glutathione peroxidase [Orthogroup: Gpx2001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Funariaceae Physcomitrella | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Physcomitrella patens [TaxId: 3218 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue type | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Inducer | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repressor | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Best BLASTp hits |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '5756' 'join(583514..583579,584151..584227,584404..584465,584781..584899,585011..585181,585325..585354)' |
Exons►
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Literature and cross-references PpaGPx02
| Literature | Fujita,T., Nishiyama,T., Shin-i,T., Kohara,Y. and Hasebe,M. Physcomitrella patens EST at a stage of the first asymmetric cell division of protoplasts. |
|---|---|
| DNA ref. | Phytozome 12: scaffold_115 (583514..585354) |
| EST ref. | GenBank: FC413638.1 |
| Cluster/Prediction ref. | UniGene: Ppa.4093 |
Protein sequence: PpaGPx02
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
|
||||||||||||
| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
|
||||||||||||
| Remarks | Complete sequence from genomic (3 introns) aand 24 ESTs. Incorrect prediction fron Phytozome (first exon in missing) confirmed with ESTs. | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
|
||||||||||||
| CDS► Send to BLAST |
|
||||||||||||
| cDNA► Send to BLAST |
|
||||||||||||
