Entry information : PtroPxd01
| Entry ID | 5828 |
|---|---|
| Creation | 2007-10-09 (Marcel Zamocky) |
| Last sequence changes | 2016-02-11 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Achraf Jemmat |
| Last annotation changes | 2016-02-11 (Achraf Jemmat) |
Peroxidase information: PtroPxd01
| Name | PtroPxd01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Class | Peroxidasin [Orthogroup: Pxd001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Metazoa Chordata Mammalia Hominidae Pan | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Pan troglodytes (chimpanzee) [TaxId: 9598 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '5828' 'complement(join(1..132,898..1011,19756..19885,25964..26078,52003..52211,54627..54761,87940..89434,91119..91276,93023..93131,103430..103586,106514..106626,128134..128292,130133..130249,134675..134941,138440..138609,152977..153094,155749..155918,164411..164482,183766..183837,238798..238869,274403..274474,341845..341916,497127..497290))' |
Exons►
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Literature and cross-references PtroPxd01
| Literature | Chimpanzee Sequencing and Analysis Consortium Initial sequence of the chimpanzee genome and comparison with the human genome. Nature 437 (7055), 69-87 (2005). |
|---|---|
| Protein ref. | GenBank: XP_519754.2 |
| DNA ref. | GenBank: NC_006475.2 (49843902..49346613) |
| mRNA ref. | GenBank: XM_519754 |
| Cluster/Prediction ref. | Genebank: 464171 |
Protein sequence: PtroPxd01
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (chromo 8, 15 introns). No EST. Isolate="Yerkes chimp pedigree #C0471 (Clint)". Peroxidase domain located between positions 726-1273 | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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