Entry information : PtroPGHS02
| Entry ID | 5940 |
|---|---|
| Creation | 2007-10-26 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2010-11-23 (Myriam Duval (Scipio)) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Christophe Dunand |
| Last annotation changes | 2010-12-21 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: PtroPGHS02
| Name | PtroPGHS02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | H synthase [Orthogroup: PGHS001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Metazoa Chordata Mammalia Hominidae Pan | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Pan troglodytes (chimpanzee) [TaxId: 9598 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '5940' 'complement(join(166424665..166425074,166425558..166425705,166426207..166426493,166426776..166427022,166427136..166427219,166427952..166428133,166428563..166428706,166429361..166429504,166429625..166429741,166430542..166430731,166431007..166431276))' |
Exons►
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Literature and cross-references PtroPGHS02
| Literature | Chimpanzee Sequencing and Analysis Consortium Initial sequence of the chimpanzee genome and comparison with the human genome. Nature 437 (7055), 69-87 (2005). |
|---|---|
| DNA ref. | GenBank: NC_006468.2 (166431276..166424665) |
| mRNA ref. | GenBank: XM_524999.2 |
| EST ref. | GenBank: DC525522.1 [5' end] |
Protein sequence: PtroPGHS02
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (chromo 1, 10 introns) and 1 EST. Isolate="Yerkes chimp pedigree #C0471 (Clint)". | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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| cDNA► Send to BLAST |
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