Entry information : MtRboh10 (Medtr2g043900.1 [4.0])
Entry ID | 6454 |
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Creation | 2009-01-07 (Christophe Dunand) |
Last sequence changes | 2014-07-31 (Christophe Dunand) |
Sequence status | complete |
Reviewer | Catherine Mathe |
Last annotation changes | 2016-05-25 (Catherine Mathe) |
Peroxidase information: MtRboh10 (Medtr2g043900.1 [4.0])
Name (synonym) | MtRboh10 (Medtr2g043900.1 [4.0]) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Class | Respiratory burst oxidase homolog [Orthogroup: Rboh002] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Fabaceae Medicago | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Medicago truncatula (barrel medic) [TaxId: 3880 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular localisation | N/D |
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Tissue type | Roots |
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Inducer | N/D |
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Repressor | N/D |
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Best BLASTp hits |
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Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '6454' 'complement(join(19068518..19068627,19068764..19068842,19068929..19069057,19069178..19069366,19069452..19069611,19069859..19070029,19070104..19070219,19070360..19070455,19070549..19070932,19071505..19071927,19072598..19072711,19072818..19072866,19074472..19074634,19075673..19076285))' |
Exons►
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Literature and cross-references MtRboh10 (Medtr2g043900.1 [4.0])
Literature | VandenBosch,K., Endre,G., Hur,J., Moore,J., Beremand,P., Ellis,L., Town,C.D., Bowman,C.L., Craven,M.B., Hansen,T.S., Holt,I.E. and Fraser,C.M. ESTs from uninoculated seedling roots of Medicago truncatula. |
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DNA ref. | Phytozome 12: chr2 (19076285..19068518) |
EST ref. | GenBank: BE203618 [Fragment] |
Cluster/Prediction ref. | Phytozome Gene 12: 31064275 |
Omic ref. | Gene atlas: Mtr.3555.1.S1_at |
Protein sequence: MtRboh10 (Medtr2g043900.1 [4.0])
Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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Remarks | Complete sequence from genomic (chromo 2, 13 introns) and 1 EST. | ||||||||||||
DNA ► Send to BLAST |
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CDS► Send to BLAST |
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