Entry information : CcinPrxQ01
| Entry ID | 6556 |
|---|---|
| Creation | 2009-01-30 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2009-01-30 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Not yet reviewed |
| Last annotation changes | 2010-08-13 (Marie Brette (Scipio)) |
Peroxidase information: CcinPrxQ01
| Name | CcinPrxQ01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Atypical 2-Cysteine peroxiredoxin (type Q) [Orthogroup: PrxQ001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Fungi Basidiomycota Agaricomycetes Psathyrellaceae Coprinopsis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Coprinopsis cinerea (Coprinus cinereus) [TaxId: 5346 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '6556' 'complement(join(1697619..1697745,1697883..1698004,1698080..1698177,1698243..1698293,1698367..1698499))' |
Exons►
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Literature and cross-references CcinPrxQ01
| Literature | Birren et al., The Broad Institute Genome Sequencing Platform. Annotation of the Coprinopsis cinerea genome.
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|---|---|
| DNA ref. | JGI genome: Chr_8 (1698499..1697622) |
| mRNA ref. | GenBank: XM_001835921.1 |
| Cluster/Prediction ref. | Genebank: 6012513 |
Protein sequence: CcinPrxQ01
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (4 introns) | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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