Entry information : LbiPrxQ01 (LbPrxQ1)
| Entry ID | 6557 |
|---|---|
| Creation | 2009-01-30 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2009-01-30 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Not yet reviewed |
| Last annotation changes | 2012-04-06 (Catherine Mathe (Scipio)) |
Peroxidase information: LbiPrxQ01 (LbPrxQ1)
| Name (synonym) | LbiPrxQ01 (LbPrxQ1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Atypical 2-Cysteine peroxiredoxin (type Q) [Orthogroup: PrxQ001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Fungi Basidiomycota Agaricomycetes Tricholomataceae Laccaria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Laccaria bicolor [TaxId: 29883 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue type | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Inducer | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repressor | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Best BLASTp hits |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '6557' 'complement(join(752948..753056,753106..753227,753276..753373,753424..753474,753527..753656))' |
Exons►
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Literature and cross-references LbiPrxQ01 (LbPrxQ1)
| Literature | Martin et al., The genome of Laccaria bicolor provides insights into mycorrhizal symbiosis. Nature 452 (7183), 88-92 (2008). |
|---|---|
| DNA ref. | JGI genome: LG_4 (753656..752948) |
| mRNA ref. | GenBank: XM_001875746 |
| Cluster/Prediction ref. | Genebank: 6071410 |
Protein sequence: LbiPrxQ01 (LbPrxQ1)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
|
||||||||||||
| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
|
||||||||||||
| Remarks | Complete sequence from genomic (4 introns). | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
|
||||||||||||
| CDS► Send to BLAST |
|
||||||||||||
