Entry information : PpaKat03
| Entry ID | 6567 |
|---|---|
| Creation | 2009-02-01 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2009-02-01 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Not yet reviewed |
| Last annotation changes | 2011-02-02 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: PpaKat03
| Name | PpaKat03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Catalase [Orthogroup: Kat001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Funariaceae Physcomitrella | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Physcomitrella patens [TaxId: 3218 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | Protonema |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '6567' 'join(150982..151157,151280..151598,151715..152245,152423..152583,152728..153001)' |
Exons►
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Literature and cross-references PpaKat03
| Literature | Rensing,S.A., etal., The Physcomitrella genome reveals evolutionary insights into the conquest of land by plants. Science 319 (5859), 64-69 (2008). |
|---|---|
| DNA ref. | Phytozome 12: scaffold_292 (150982..153001) |
| mRNA ref. | GenBank: XM_001780939 |
| Cluster/Prediction ref. | UniGene: Ppa.17618 [3' end] |
Protein sequence: PpaKat03
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (4 introns), 1 mRNA and 8 ESTs. Incorrecet prediction from Phytozome (two extra exons in 5'. | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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