Entry information : PcLDS03
| Entry ID | 6648 |
|---|---|
| Creation | 2009-03-26 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2011-12-14 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Catherine Mathe |
| Last annotation changes | 2015-12-11 (Catherine Mathe) |
Peroxidase information: PcLDS03
| Name | PcLDS03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Linoleate diol synthase (PGHS like) [Orthogroup: LDS001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Fungi Basidiomycota Agaricomycetes Corticiaceae Phanerochaete | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Phanerochaete chrysosporium [TaxId: 5306 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '6648' 'join(165164..165193,165510..166058,166120..166347,166455..166576,166742..166838,166892..166942,167023..167192,167242..167675,167727..167983,168020..168102,168157..168214,168245..168364,168468..168617,168686..168980,169057..169133,169229..169510,169567..169608)' |
Exons►
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Literature and cross-references PcLDS03
| Literature | Martinez,D., Larrondo,L.F., Putnam,N., Sollewijn Gelpke,M.D., Huang,K., Chapman,J., Helfenbein,K.G., Ramaiya,P., Detter,J.C., Larimer,F., Coutinho,P.M., Henrissat,B., Berka,R., Cullen,D. and Rokhsar,D. Genome sequence of the lignocellulose degrading fungus Phanerochaete chrysosporium strain RP78. Nat. Biotechnol. 22 (6), 695-700 (2004) |
|---|---|
| DNA ref. | JGI genome: scaffold_18 (165164..169608) |
| Cluster/Prediction ref. | JGI gene: 140491 [Incorrect prediction] |
Protein sequence: PcLDS03
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (14 introns) and 3 ESTs (DV756780, DV763275 and DV760262). Strain="RP-78". Uncorrect prediction from JGI. |
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| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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