Entry information : PplKat01
| Entry ID | 6719 |
|---|---|
| Creation | 2009-04-29 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2009-04-29 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Not yet reviewed |
| Last annotation changes | 2012-04-17 (Catherine Mathe (Scipio)) |
Peroxidase information: PplKat01
| Name | PplKat01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Catalase [Orthogroup: Kat001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Fungi Basidiomycota Agaricomycetes Coriolaceae Postia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Postia placenta [TaxId: 104341 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '6719' 'join(140717..140840,140893..140943,141005..141184,141240..141397,141454..141747,141801..142045,142102..142325,142382..142507,142567..142694)' |
Exons►
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Literature and cross-references PplKat01
| Literature | Martinez,D. et al., Genome, transcriptome, and secretome analysis of wood decay fungus Postia placenta supports unique mechanisms of lignocellulose conversion. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 106 (6), 1954-1959 (2009) |
|---|---|
| DNA ref. | JGI genome: scaffold_125 (140717..142694) |
| mRNA ref. | JGI transcript: 123169 |
Protein sequence: PplKat01
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (8 introns) and 20 ESTs. Also found in scaffold_49 (226476..224497) with minor mismatches. | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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