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Entry information : HaAPx04 (HanXRQChr15g0478771)
Entry ID 7354
Creation 2010-05-26 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-04-27 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaAPx04 (HanXRQChr15g0478771)
Name (synonym) HaAPx04 (HanXRQChr15g0478771)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx2003]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaAPx04
start..stop		 S start..stop
HargAPx03 574 0 1..284 1..284
LsaAPx02 539 0 1..284 1..285
HaAPx03 532 0 1..284 1..285
CiAPx02 530 0 1..281 1..282
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '7354' 'join(56400828..56400940,56401018..56401142,56402666..56402715,56402885..56402950,56403160..56403208,56405135..56405217,56405337..56405416,56405514..56405616,56406878..56407063)' Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 56400828..56400940 111 N° 2 56401018..56401142 123 N° 3 56402666..56402715 48 N° 4 56402885..56402950 64
N° 5 56403160..56403208 47 N° 6 56405135..56405217 81 N° 7 56405337..56405416 78 N° 8 56405514..56405616 101
N° 9 56406878..56407063 184  
join(56400828..56400940,56401018..56401142,56402666..56402715,56402885..56402950 ,56403160..56403208,56405135..56405217,56405337..56405416,56405514..56405616,564 06878..56407063)


exon

Literature and cross-references HaAPx04 (HanXRQChr15g0478771)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr15 (56400828..56407063)
EST ref. GenBank:   DY920043.1 [5' end]  CX947796.1 [3' end] Heliagene:   HaT13l001986 [Incorrect prediction]
Cluster/Prediction ref. HanXRQ:   HanXRQChr15g0478771 UniGene:   Han.2832
Protein sequence: HaAPx04 (HanXRQChr15g0478771)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   284
PWM (Da):   %s   31176.13 Transmb domain:   %s   o255-277i
PI (pH):   %s   7.19
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MAIPVVDSEYLKQIEKARRDLRAFIANKNCAPIMLRLAWHDAGTYDVNTKTGGPNGSIRTEEEYSHGSNNGLKIAIDFEDIKSKYPKITYADLYLAGVVAVEVTGGPTVDFVPGRKDSKI
SPKEGRLPNATKGAPHLRDIFYRMGLSDKDIVALSGGHTGRAHADRSGFEGPWTREPLKFDNSYFVELLKGESEGLLKLPTDLALLDDPVFRHYVELYADEDAFFNDYAISHKKLSELGC
NPNAKKVTDSVVLAQSAVGVLVTAAVVVLSYVYEVRKKAK*

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and ESTs.
DNA ►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCGATTCCTGTTGTAGACTCCGAATACCTCAAACAGATCGAGAAAGCTCGTCGGGACCTTCGTGCCTTCATCGCCAACAAGAATTGCGCCCCGATTATGCTTCGATTAGCGCGTATG
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AAGGTGATCACTTATCATAAATGTATCAGAATGTACAAACTTGATCCACTTTTATGAAAATAAAGCAGTTAAGCGAAATAATTTGTACAAATTTGATCCGTCTTTATGAAAATAAAGCAA
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CTAGGGTGCAACCCAAATGCTAAAAAGGTAACCGACAGCGTCGTATTGGCACAAAGCGCAGTGGGGGTTCTGGTGACTGCCGCTGTGGTGGTTCTCAGTTACGTTTATGAAGTCCGTAAA
AAGGCCAAATAA

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCGATTCCTGTTGTAGACTCCGAATACCTCAAACAGATCGAGAAAGCTCGTCGGGACCTTCGTGCCTTCATCGCCAACAAGAATTGCGCCCCGATTATGCTTCGATTAGCGTGGCAT
GATGCTGGAACGTACGATGTGAACACGAAGACTGGAGGACCTAATGGCTCGATTAGAACCGAGGAGGAGTATAGTCATGGATCGAATAATGGATTGAAGATTGCTATTGATTTTTGTGAA
GATATAAAGTCCAAATATCCAAAGATTACGTATGCAGATCTATATCAGCTTGCAGGAGTTGTTGCTGTGGAGGTTACTGGTGGCCCTACTGTGGACTTTGTTCCTGGTAGAAAGGATTCG
AAGATCTCTCCCAAGGAAGGCAGACTCCCAAATGCTACCAAAGGCGCACCACACTTGCGGGACATATTTTATCGCATGGGTTTATCTGACAAGGATATCGTAGCCCTGTCAGGAGGACAC
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GAGCTAGGGTGCAACCCAAATGCTAAAAAGGTAACCGACAGCGTCGTATTGGCACAAAGCGCAGTGGGGGTTCTGGTGACTGCCGCTGTGGTGGTTCTCAGTTACGTTTATGAAGTCCGT
AAAAAGGCCAAATAA

Retrieve as FASTA  
cDNA►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
TGTCAAACCA CGTTGGCGGA CTTTCACGAG TACACAAGCT TCTGATGGAA CTCAACCACA CAGGAACACA CCTTTATCTC CTAATTTTTT ATTCTATCTT TATTCGCCTG CAGTTTCAnn  CTnAGTCCAC GAACACACAC ACGGTAGTTA CACCCATCTT CACTGTGTGC AACTCATCCA TGGCGATTCC TGTTGTAGAC TCCGAATACC TCAAACAGAT CGAGAAAGCT CGTCGGGACC  TTCGTGCCTT CATCGCCAAC AAGAATTGCG CCCCGATTAT GCTTCGATTA GCGTGGCATG ATGCTGGAAC GTACGATGTG AACACGAAGA CTGGAGGACC TAATGGCTCG ATTAGAACCG  AGGAGGAGTA TAGTCATGGA TCGAATAATG GATTGAAGAT TGCTATTGAT TTTTGTGAAG ATATAAAGTC CAAATATCCA AAGATTACGT ATGCAGATCT ATATCAGCTT GCAGGAGTTG  TTGCTGTGGA GGTTACTGGT GGCCCTACTG TGGACTTTGT TCCTGGTAGA AAGGATTCGA AGATCTCTCC CAAGGAAGGC AGACTCCCAA ATGCTACCAA AGGCGCACCA CACTTGCGGG  ACATATTTTA TCGCATGGGT TTATCTGACA AGGATATCGT AGCCCTGTCA GGAGGACACA CTCTGGGAAG AGCACATGCA GATAGATCAG GCTTTGAAGG CCCTTGGACG AGGGAGCCGC  TGAAATTCGA TAACTCGTAT TTTGTGGAAC TTCTCAAAGG AGAATCAGAG GGGCTTTTGA AACTTCCTAC CGACCTTGCA TTGCTGGATG ATCCTGTGTT CCGCCATTAC GTTGAGCTGT  ACGCCAAGGA TGAAGATGCA TTCTTTAATG ATTATGCAAT ATCACACAAG AAACTCTCTG AGCTAGGGTG CAACCCAAAT GCTAAAAAGG TAACCGACAG CGTCGTATTG GCACAAAGCG  CAGTGGGGGT TCTGGTGACT GCCGCTGTGG TGGTTCTCAG TTACGTTTAT GAAGTCCGTA AAAAGGCCAA ATAAATAAAC CATAAAAACT TATAATTTTT AAACAAGTTG CAACTATCAA  TGAAGATGTT ACAAGTTTCT GTACAATTGT TTTGTTTACC TGAATTCTGG ATCTACTGTA AGGATTTATC TCAGCATAAT ACCGTTATTA AAACTCAACA GTTTGACTTT CTGTTTGTTT 
AGTTAATACG CAAAATAATG TAGGAACTTA TATTCCTTTG TGTCGACTCG TGTTTATTAA TATAATAAGT TTTAGATCTG ATCAAAAAA 

Retrieve as FASTA