Entry information : EgrPrx05(Eucgr.A00043 / Egrandis_v1_0.043198m)
| Entry ID | 8105 |
|---|---|
| Creation | 2011-02-04 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2016-03-21 (Catherine ) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Not yet reviewed |
| Last annotation changes | 2022-03-28 (Catherine ) |
Peroxidase information: EgrPrx05(Eucgr.A00043 / Egrandis_v1_0.043198m)
| Name | EgrPrx05(Eucgr.A00043 / Egrandis_v1_0.043198m) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Class | Class III peroxidase [Orthogroup: Prx080] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Myrtaceae Eucalyptus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Eucalyptus grandis [TaxId: 71139 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '8105' 'complement(join(422215..422627,422904..423063,423225..423410,423579..423824))' |
Exons►
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Literature and cross-references EgrPrx05(Eucgr.A00043 / Egrandis_v1_0.043198m)
| DNA ref. | Phytozome 12: scaffold_1 (423824..422215) |
|---|---|
| Cluster/Prediction ref. | Genebank: 104450810 |
Protein sequence: EgrPrx05(Eucgr.A00043 / Egrandis_v1_0.043198m)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (3 introns). Incorrect prediction from Phytozome (A short sequence in frame is missing). No EST. | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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