Entry information : PvPrx07 (Phvul.007G167200)
Entry ID 823
Creation 2005-09-06 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-03-19 (Maxime Neel)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2014-03-19 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PvPrx07 (Phvul.007G167200)
Name (synonym) PvPrx07 (Phvul.007G167200)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx011]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Fabaceae Phaseolus
Organism Phaseolus vulgaris    [TaxId: 3885 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer Nodulation
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PvPrx07
start..stop
S start..stop
GmPrx37 580 0 1..322 1..323
GmPrx66 549 0 1..322 1..310
GmPrx138 514 0 1..321 3..324
MtPrx04 491 4.23e-177 1..320 3..320
Literature and cross-references PvPrx07 (Phvul.007G167200)
Literature Ramirez,M., Graham,M.A., Blanco-Lopez,L., Silvente,S., Medrano-Soto,A., Blair,M.W., Hernandez,G., Vance,C.P. and Lara,M. Sequencing and Analysis of Common Bean ESTs. Building a Foundation for Functional Genomics. Plant Physiol. 137 (4), 1211-1227 (2005).
DNA ref. Phytozome 12:   Chr07 (39899510..39900983)
EST ref. GenBank:   CV536908 [3' end]
Protein sequence: PvPrx07 (Phvul.007G167200)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   321 (303)
PWM (Da):   %s   34958.51 (32906.4)  
PI (pH):   %s   6.5 (6.24) Peptide Signal:   %s   cut: 19 range:19-321
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKFTILLCVV LFLGVCQGGS LTKNFYRNSC PQAEDIIKSQ TQQHVSANPN LPAKLIRLHF HDCFVRGCDG SVLLSSTANN TAERDAIPNL SLAGFDVIDA IKSAVEAKCP KTVSCADILA  LAARDAVSVQ FNNKQMWEVL TGRRDGKVST SNEALANIPA PFFNLTQLRQ SFASKGLTLH DLVVLSGAHT IGVGHCNLFS NRLYNFTGKG DQDPSLNDTY AAFLKTKCQS LSDRTTTVEM 
DPESSTNFDS DFYPNLLQKK GLFQSDAALL TLDQSADIAG ELADKDKFFT EFAQSMKRMG NIEVLTDSAG EIRNKCSVVN S* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (3 introns) and 1 partial cDNA (5' missing).
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AAGTGTGCTG AAACAATTAC ATACACAGGT TTTTTTTATC TAGTTTGTCG AAGTTTGATT TTCTGTTGCT TAGAACATAG TGTTTAAGAG TTCTTATTTT GTTTTATCAT AAGAAATTGT  TGTAGTTGTG CCTAAAAATA AGAGATATTC TATTTGTGTT TGACTCTAAC TTTATTTAAA GATAAAATGA CTAACGAACA TGCATTTATT TGGTTCTCAT CTCTTAATTA TTTTATGCTT  TCACAACAAC ATATACCCAT AAACTCTTCT ATGAAACATG CTTCACATCT GCATAAAAGA TTTTTCTTTC AAATACAGAT TTATTTTCAG AAACATTTTT AAAAAGTCAA AAAAATCAAC  TAAACGTATT TCTAACTTAA TTTTAAGTTT TTCATTGAAA ATGAAGAGAG GAAAGGATTA AACATGTTAC AGGCCATAAG AACCCAAGTT TAGTATATAG TACCTAGTCA GATATAGTAA  TCTCAACCTC TGGCAGAATA TTGACTTTTA TGTGAACATA AAGTCAAACT TGTAGTTTTG TGATTTTTAC ACTAGTTTAC TGCTTATAGG CCAATCGTGC AAGAACGAGG ATATATATAT  ACGTGGTTAT TGAGAGAAGT GAAATGAATG TACCAAAACC ATTTGTGTCT AAAGACAAGA CATCTTAAAG CCCTGATCGA GCAACCATGT GCAGAGGGTC TAACAAGAAG ACAGACATGA  AAACCATGCA CAGATAAGCA TTGACTTTGG TTATAATGAA ATTTCTTTTC CCCCTTAATT AAACCTTCCT TGGAATGCAA ATAACTTCAG TTGTTACCTT CTATCACAAG AAACAACAGG  GCAATGTATG CAACTGTTTG GCATATATCT GCAATTGGTT TGATAATATA AACACGAAAC ATCTGCACAT GTTCGATTTA CTCAGTTTCA TTACCGATCA AAACTCCAGC TCAACCTTTG  AATGAGCATA GCCATATTGA TTTTTATAAC TGGATTGATA TTCAACACCA ACTCTATATA TTTACTATAC AATATACCAT TTTTTATAAC AATCTCCTAA TTAGACAAAC CTCGTAATAG  CATGAAATCA TGTCGTGCTT TTTCTCCCTT TAGTTTTCTT ATAACTATAT ATATCAGCAG GACAAATATT CACTGACTTT ATATATGTCT CCATAAGAAA GCTTGATTTA TTATCTTTAA  CAAATCTTAT CTTTCAATCA CTTTTTTCCA TCTACCATAT TTCAATCAAG ACTTTAACTT ATAAACTCTG GTTTTATAAG GTTGAGTTAT TTCATAGTTT GATTATTGAA TACAAAAGTA  TGAACCTTTC TGATATAAGC TGGTTATGTA TAACTCTTGA TGAAATGGTA ATCAGTACCC CAACTATTAT TTTTTGGGCA AACCAATAAT GGAAGCAGTG TTAATGCTTC AAAACGGCTC  AATCTAAATA TTAAAACACA TATGTAGTGG GCTAAACTAA AGACTTTTAA GATATATTCT GTCTGTATTT GCATCTCACT GTGACTCTTT GATATATATG TTAAGAGACG TGCATAATTC  AGAGAGTTAT CACTACACAA GAAAACTTAA AAGAGGGTTG ACCTAAGAAG ATTATGACAA AAAGGAATAC AATTATACAA GGCTGGCATG TTCTAACCAC TACAGACTAA AAGTTTTTTT  TAAAAGTTGA TTTATTCTTT GGGTTTATAT TCTATTAATT TCAAAACCGT GTCATCACTG TTCATTGGTA GGTGCATATT TGAATGAAAC TATAGCTATA GCTATGCCCT ATGCATGCAT  ATTGCGTCCA ACGATTGAAG AGATGCATGC AATTATATTT ATAACACAAT TATAAAATAC ATAATATATG CTTTAGAAGG ATGACTTGTA ATGCCTATAA AAGGGATCAA GGTCCTTGTA 
GCTAAGCATT CCATTTCTCA AGCTTTATAT CACTATATAC TTACTATAGG GAAGTGAGTT AAGAAGGGTT GCATTTGAAT 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAATTCA CAATTTTGCT ATGTGTTGTA CTTTTCCTTG GGGTTTGTCA AGGAGGAAGC CTGACAAAAA ATTTCTACAG AAATTCCTGC CCTCAAGCCG AGGACATCAT TAAGAGCCAA  ACACAGCAGC ATGTGTCTGC TAATCCCAAT TTGCCAGCCA AGCTGATTAG ATTGCATTTT CATGATTGTT TTGTCAGGGT ATATACATAC ATATTACTAT CAATTCCATT GTTTTATGTA  TTTATGTTTT CTTTTAAGGG ATATTTTCAT CCAGTTTTTG ATACACAAAT TTTGCATGTT ACAACATGCA AAAGTGCTAA CTGTGTATAT ATAGCATAAC ATGGTTTCAC TGCAAACGCA  CATTTCAGGG CTGTGATGGG TCGGTTTTGT TGAGCTCTAC TGCCAATAAC ACAGCAGAGA GGGATGCAAT TCCAAATCTA TCTTTGGCTG GGTTTGATGT CATAGATGCC ATAAAAAGTG  CAGTGGAAGC AAAATGTCCC AAAACTGTAT CTTGTGCTGA CATACTGGCA TTGGCAGCAA GGGACGCTGT TTCTGTTCAA GTAAGCCAAC TCTTCATATC TACTACTCTA ATTATACATA  CATCATAAAT ATTCTTGTTA TCAATTAGTT TATTACTTTT TGCATGTTTT ACTGACATAT AAACTTTGCA GTTTAATAAT AAACAAATGT GGGAAGTTCT CACTGGTAGA AGAGATGGCA  AGGTATCGAC AAGTAACGAA GCCTTGGCCA ATATCCCAGC ACCTTTCTTC AACCTCACCC AACTCAGACA GAGTTTTGCT AGCAAAGGTC TAACTTTGCA CGATCTGGTT GTATTATCAG  GTGACATTCA TAATATCAAT TGCTAATACA TGCCAAAATG CATTTTTTTG TACATATAAA TGATTTTCAT ATATGTAGGG GCTCACACAA TTGGAGTTGG GCATTGCAAC TTGTTCAGTA  ACAGGCTTTA TAATTTCACT GGGAAAGGTG ATCAAGACCC ATCTTTGAAT GACACCTATG CTGCATTCTT GAAGACCAAG TGCCAGAGTC TGAGTGACAG AACCACAACG GTGGAAATGG  ACCCTGAAAG CTCTACCAAT TTCGATAGTG ACTTTTATCC TAACCTTCTC CAGAAGAAGG GTCTGTTCCA ATCAGATGCT GCCCTTCTAA CACTGGATCA GTCAGCAGAT ATAGCTGGAG  AGTTGGCGGA TAAAGACAAG TTCTTCACAG AGTTCGCACA GTCAATGAAG AGAATGGGAA ACATTGAGGT CCTCACTGAC TCTGCTGGAG AAATTCGGAA CAAGTGTTCC GTTGTCAACT 
CATAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAATTCA CAATTTTGCT ATGTGTTGTA CTTTTCCTTG GGGTTTGTCA AGGAGGAAGC CTGACAAAAA ATTTCTACAG AAATTCCTGC CCTCAAGCCG AGGACATCAT TAAGAGCCAA  ACACAGCAGC ATGTGTCTGC TAATCCCAAT TTGCCAGCCA AGCTGATTAG ATTGCATTTT CATGATTGTT TTGTCAGGGG CTGTGATGGG TCGGTTTTGT TGAGCTCTAC TGCCAATAAC  ACAGCAGAGA GGGATGCAAT TCCAAATCTA TCTTTGGCTG GGTTTGATGT CATAGATGCC ATAAAAAGTG CAGTGGAAGC AAAATGTCCC AAAACTGTAT CTTGTGCTGA CATACTGGCA  TTGGCAGCAA GGGACGCTGT TTCTGTTCAA TTTAATAATA AACAAATGTG GGAAGTTCTC ACTGGTAGAA GAGATGGCAA GGTATCGACA AGTAACGAAG CCTTGGCCAA TATCCCAGCA  CCTTTCTTCA ACCTCACCCA ACTCAGACAG AGTTTTGCTA GCAAAGGTCT AACTTTGCAC GATCTGGTTG TATTATCAGG GGCTCACACA ATTGGAGTTG GGCATTGCAA CTTGTTCAGT  AACAGGCTTT ATAATTTCAC TGGGAAAGGT GATCAAGACC CATCTTTGAA TGACACCTAT GCTGCATTCT TGAAGACCAA GTGCCAGAGT CTGAGTGACA GAACCACAAC GGTGGAAATG  GACCCTGAAA GCTCTACCAA TTTCGATAGT GACTTTTATC CTAACCTTCT CCAGAAGAAG GGTCTGTTCC AATCAGATGC TGCCCTTCTA ACACTGGATC AGTCAGCAGA TATAGCTGGA  GAGTTGGCGG ATAAAGACAA GTTCTTCACA GAGTTCGCAC AGTCAATGAA GAGAATGGGA AACATTGAGG TCCTCACTGA CTCTGCTGGA GAAATTCGGA ACAAGTGTTC CGTTGTCAAC 
TCATAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GCTTTATATC ACTATATACT TACTATAGGG AAGTGAGTTA AGAAGGGTTG CATTTGAATA TGAAATTCAC AATTTTGCTA TGTGTTGTAC TTTTCCTTGG GGTTTGTCAA GGAGGAAGCC  TGACAAAAAA TTTCTACAGA AATTCCTGCC CTCAAGCCGA GGACATCATT AAGAGCCAAA CACAGCAGCA TGTGTCTGCT AATCCCAATT TGCCAGCCAA GCTGATTAGA TTGCATTTTC  ATGATTGTTT TGTCAGGGGC TGTGATGGGT CGGTTTTGTT GAGCTCTACT GCCAATAACA CAGCAGAGAG GGATGCAATT CCAAATCTAT CTTTGGCTGG GTTTGATGTC ATAGATGCCA  TAAAAAGTGC AGTGGAAGCA AAATGTCCCA AAACTGTATC TTGTGCTGAC ATACTGGCAT TGGCAGCAAG GGACGCTGTT TCTGTTCAAT TTAATAATAA ACAAATGTGG GAAGTTCTCA  CTGGTAGAAG AGATGGCAAG GTATCGACAA GTAACGAAGC CTTGGCCAAT ATCCCAGCAC CTTTCTTCAA CCTCACCCAA CTCAGACAGA GTTTTGCTAG CAAAGGTCTA ACTTTGCACG  ATCTGGTTGT ATTATCAGGG GCTCACACAA TTGGAGTTGG GCATTGCAAC TTGTTCAGTA ACAGGCTTTA TAATTTCACT GGGAAAGGTG ATCAAGACCC ATCTTTGAAT GACACCTATG  CTGCATTCTT GAAGACCAAG TGCCAGAGTC TGAGTGACAG AACCACAACG GTGGAAATGG ACCCTGAAAG CTCTACCAAT TTCGATAGTG ACTTTTATCC TAACCTTCTC CAGAAGAAGG  GTCTGTTCCA ATCAGATGCT GCCCTTCTAA CACTGGATCA GTCAGCAGAT ATAGCTGGAG AGTTGGCGGA TAAAGACAAG TTCTTCACAG AGTTCGCACA GTCAATGAAG AGAATGGGAA  ACATTGAGGT CCTCACTGAC TCTGCTGGAG AAATTCGGAA CAAGTGTTCC GTTGTCAACT CATAAACAAG TTCACTACTA ATTAAGCTGT TTTGTAGTCT TAATTTCCTT ACATTTATAT 
AATCTATCAG TTGTTACTTA GATTTATTGG TAGTAATATA TAATATTTTT AATACATTTT C 

Retrieve as FASTA