Entry information : MeAPx01 (cassava4.1_009867m)
Entry ID 9050
Creation 2011-07-01 (Qiang Li)
Last sequence changes 2016-01-06 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2016-01-06 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: MeAPx01 (cassava4.1_009867m)
Name (synonym) MeAPx01 (cassava4.1_009867m)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx2002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Euphorbiaceae Manihot
Organism Manihot esculenta (cassava)    [TaxId: 3983 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value MeAPx01
start..stop
S start..stop
MeAPx05 649 0 1..375 1..373
HbAPx02 644 0 17..375 1..359
PtAPx07 599 0 1..375 1..369
PtAPx08 590 0 17..374 1..353
Literature and cross-references MeAPx01 (cassava4.1_009867m)
DNA ref. Phytozome 12:   scaffold04314 (122027..127581)
Protein sequence: MeAPx01 (cassava4.1_009867m)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   375 (97)
PWM (Da):   %s   40638.6 (10317.8)  
PI (pH):   %s   8 (4.63) Peptide Signal:   %s   cut: 27 range:27-123
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MADCLSHLTL SPSQKTMASL TGAASSRLLP AASRARIHLS SPSSASSSRS PLSLSSSSSY SISPLKCLRS SPFVPHFFLN QKRSSMSTVA AASDPVQLKS AREDIKELLK SKFCHPILVR  LGWHDAGTYN KNIEEWPKRG GADGSIRFEV ELKHGANAGL VNALNLLQPI KDKYSGVTYA DLFQLASATA IEEAGGPKIP MKYGRVDVSA PEDCPEEGRL PSAGPPKPAD HLREVFYRMG  LNDQEIVALS GAHTLGRSRP DRSGWGKPET KYTKSGPGAP GGQSWTAEWL KFDNSYFTDI KERRDEDLLV LPTDAVIFED SSFKVYAEKY AADQEAFFKD YAEAHAKLSN LGAKFDPPQG 
IVLDGVAGEK FVAAN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAGACT GCTTGTCCCA CTTGACACTA TCGCCGTCGC AAAAAACAAT GGCTTCGCTA ACCGGCGCCG CCTCTTCTCG TCTTCTCCCC GCCGCTTCTC GTGCTCGAAT CCATCTCTCC  TCACCTTCTT CTGCTTCTTC TTCTCGCTCT CCTTTATCTC TATCCTCCTC TTCCTCTTAT TCTATTTCTC CTCTCAAATG TCTCCGATCA TCACCTTTTG TTCCTCATTT CTTCTTAAAT  CAGGTCTCAT TCTCTGTATA TTTATGCTTA CACGTTAAGC CACTGTTAGC AGCGTTTTCA AAAAGTGCAG GAAAGATAAA ATTGCAGCAA GTAAAAGTGC AATAGACCAA ATAGAAGTGA  AATCCCATAT ATAAAATAGA AAACAAATAG CCATAAACAG GCTTTACAAG GCAGTAACCA ACTCCTATGT TAGGAAACAC TAAACCACTA ATAAAAGGAA TGGTTAAACG TAGGAGAAAA  TCACTAAGCT ATTTAGATCC GAACAAAACG GAAATTAATT ATTTACTGCT AACAAAGCTT GGTATTGGTT TTTGTAGTAG TTGTTGGTTC TTATCTGGTG GTTTTGGTTT GCTGTGGAGT  GCAGAAGCGA TCGTCGATGA GTACGGTAGC TGCGGCGTCG GATCCTGTTC AGCTGAAGAG TGCGAGAGAG GATATTAAAG AGCTTCTCAA GTCTAAATTT TGCCATCCTA TACTGGTAAC  TTCTTTTTTA ACTATGAGTT TTTAGGTACA TTTACATGTG CTCTTTCATT TTTTTTTAGT TATCTGGTAG ACTTGCTTTA AAATTTGATT AATTTGTTAG TGGAATGCTC GAAATTACTT  GGTAAATGTA ATTTATGTGG CTTTATCTAA TTAAATTTTC TCGTCTGGAA AGTGAAGTTT TCCAAATATT GAAAATGTAA ATTTAGGTGA AGTTAAGTAT AGTTGACTCG TTTGTAGTTG  TGTGTTCTCC TGTTAAGTTG CTATATTAAG CAATGCTTCT CGAGAATGCA TGACGCGTCG TCATGCATAT AATTGATACG GTTCATCAGA TCAAGAAGTT TGGTATTTTT AGTCCATCTT  TATGTAGTGC ATGAAAATGG TGATATAAAA AAAATGTGAA TATGGAAACT TTTTTTTTAA AATAGAAAGA CTGTGTTGTC TAATTAGCTA ATATATGAAG AGAAATGTAG TCCGATTGAA  CATAAGATAT GTAAAAAGTA TAATGATGCA TTTATCTTTA TTTTTAAGTA TATCCTCCCT GAATCACATC CTATTTTTTT ATGCAAGGAT CTTATATCCC CCATCGTATC CTTGTTTCTT  GCACATCTCA TAAAGATTTG TTTTTGGACA TATACAACGT TCTTGTCTCT TTGGGGCAAA AGAAACAGAT ATAACCAAGA GGAAAAAGCT TTTGGCATTT GCCCTGTCAA AGAATTATAT  TCTAAGTTGT ATAGATTTTT GGGTAATGCA TCGAATGGTG CTTTGCATTG TTCTTCTTTA TTTTTTTGCA ATTTACGTCT CTGAATTTTT AATTGACGAC AAAAGTTACT CTTTTACCTT  TTACAATCTA AACTTGTGAG TTCTATTACT CTTGCCTGCC TCATAACACT CGACATTGAT GCTTACAAGT CACAACTATT GAAAAGGTTT ACTTTCTTTA TGATTGTTTT TATTATTTCC  ATTTTACAAT TACAGGTTCG CCTGGGATGG CATGATGCTG GTACATATAA CAAGAACATA GAGGAGTGGC CAAAGAGAGG TGGAGCCGAT GGTAGTATCA GATTTGAAGT TGAGTTGAAA  CATGGAGCCA ATGCAGGTAA TTTTTTTTGA ACATTATGCC TAAGTTAGGT TAGTTTATAA TATAAAATTT GTTCCTAATG GACTGGCATT TCAATTCAGG CCTGGTGAAT GCATTGAACC  TTCTTCAGCC TATCAAGGAC AAGTACTCTG GTGTGACATA CGCAGATTTG TTCCAATTGG CCAGTGCTAC TGCTATAGAG GTCTTTATTT CTCTTAAAAT GGATTAGTAT AATGTTTCAC  TTATTCTCAA AACGGCATAT TGATATTTGC AATTTTAGGA AGCTGGGGGG CCCAAGATTC CCATGAAATA TGGAAGGGTG GACGTTTCAG CACCTGAAGA TTGTCCTGAA GAGGGGAGGC  TTCCTAGTGA GTGAATTAGT TTTGCATTTG TTGTATTACT TGTGTAACAA AGGTCTATTT CCTTTTTATT GCCTCCTTTA TAAGATGCAC TCTTGTAAAA TCCTGCTGCT TGATATATGC  ATATAATCAT ATATATGTGT GTGTGTGTGT GTGTTTCTTT GCATTATGTG ATTGAAATGC CTGATCTCCA GCAAATATTC GATGTACTGT ACCAGCATAC CTTGTTCTGC CTATCAGATT  TTGGAGTTCT AGATGGTTCT ATATATTTCT AAGGAGTATT TTAATGATTC CATATACAAG AATATTTGTG AAAACTCATG GTACAAATAT ATCAAAAGCA TAGATGTCAA ACTTTTCCTT  GGAAATGTTA AGCCAATTTA GTTATGGTAG AATTAAAATA AATTTAATTT CATACTTGTT GGCAACCATT CACTTTTCAG TTAAGTATGC TTGTTCATGT ATGGATGTTA GTTTGTGTTC  TTATTTATTT ATTTTGTGGA TTTGAAGCTC ATTGTTTCCA GATGCAGGAT AAACACTGTA CCCACTGCAT GGCATATTAT GTTATTCTCA AGAATTTTGA ATATCAACCC GAAACTATCC  ATATCTGATG TTTAAAGATG AACTGTGTCT TTAGCTGTCT TGCACAGTTG AAGTTATCAA ATTTCAGGCC ATTAGATTCA TAGATCATTT CCAGATTAGT TTGTTTTTGT TATACATTTG  CTTTTGCCTA TCACAGATTG CTTTAAAACT TCTGCGTCAA AGTAGTGACT GATTTTGACA ATATTAATTT AATGCTTAGG TGCTGGCCCT CCTAAACCTG CGGATCATTT ACGAGAAGTT  TTCTACAGAA TGGGTTTAAA TGACCAGGTA ACCTTTATTG AACGCAGACT TTATTATTGA TGCTATCTTG ATAAGCATCT GGCGCTTGTT GAATTATTTT ATCTGCAGGA AATAGTTGCA  TTATCCGGTG CACACACCCT AGGAAGGTCC AGACCTGACC GCAGTGGCTG GGGAAAACCA GAGACAAAGT ATACGGTATA AAAACCAAAA TCAGCTGATT ATTTGGAAAT AGTAATTTTC  TGTGCTGCTT ACATTGGATG ATTGTTGTAT CCTATCTTCA AATGAGGATT GGAAATTTTG CGGTCAAATG TTTAGCATGC AATTTATTTT GCTTTATCAC CCGATGTGCA AAAGGTTCTT  TTAGCTGCTA CCAAAGCTAA GTAGCTAACA TATCCTCTCT CTATCTTCTC TTTTGCTCTC CCATGTACGC TAGCATGCCT CTACGCTCTC AATTTGTATT GCTAAACCCT AGAATTTCTT  CTTTTTGCCG TTGTATAATT AGTTGTCGCA TGTATGGTTT TGGCTGATTG ATAGCAACAA CACAGCCAAA AAGTTAAATA GCATAACCTC ATAGGATTTA GGTGGTCAAA GCTTGGCTGG  TAATTTCTTC CTTGTCTTTG AAAAGTTCAA GAAGCGAATG GTGTATGTTA AATAACACAG AATTATTCTA ATGCACGACT GCTGGTAGCT TTCTTAGGAG AAAAGTGAAA TGCAGTTTGA  CATGCTAGAT TTACCAGTTC AAATTACTTG TTATATATAT ACATATTCTG ACACGCACAC TCATCATTAA TTCCCTCTAT ATTTAATTGT TTAAATATAT GATATCTAGC GTTTCTATCG  GTTGCCGTTT ATGTGCAAGT GCAATTAAGC GTACATAGTC TGGTTTTTTT TGTCATACGT ATCAAGGCCC TTTTGTTTCT TTGCGTGGAA TGTGCCAAAA TGTAGCTTGA CAAATGAATA  AACTAGTAAT AACTTCCAAT ATTAGAAACA AGAAGAGTTA GATTTTTCAC ATTTTGCATT GTGCATGACA GAAAAGTGGA CCAGGAGCAC CGGGAGGACA ATCCTGGACA GCAGAATGGC  TGAAGTTTGA TAACTCTTAC TTCACGGTTT GCATTCAGAA CTCACATTTT ATATTGCAAG GAGAAATGGA GGGGTGTTAA AATTCTAGCT TGCTGAATGA GATTTCTCCA TACAGGATAT  CAAAGAAAGA AGGGATGAGG ATCTACTTGT ATTACCAACT GATGCTGTTA TCTTCGAAGA TTCTTCTTTC AAGGTCAATT AATTAATGCT TCGAAGTCAG ATATGTAAGA GGCAAAGAAG  AATATCAGTA TCTAAGCAAT TGAAAACTTT GCAGGTATAT GCTGAGAAAT ATGCTGCAGA TCAGGAAGCA TTTTTCAAGG ATTACGCTGA AGCCCATGCG AAGCTCAGCA ATCTTGGAGC  TAAATTTGAT CCTCCTCAGG TTTGTTATTA TGAGTATCAT GAGCACTCGT CTTTTGATAA TAGATTCTTG TTTTATTTGA ACTCTATAGT TCAGCGTGAA TTTATATTCT AAATAATGCC  CCTGCGTTGA AAAATTTTTG GAGGATCCTG GAGAAATTTT AACCAAAAAT ATATAACCCA ATTATTTTCT ATGAACGGAT TTGAGATTAT TATGCCTGAT GTATACAATT CTCAGGCTGT  AAAGCCTTTG ATTGATGACA CAGTACTTGG CATGTGTAGC GGGTAACTTA AAAAATTTAT TGATGAATCT GAATTTGGTG ATCAGGGTAT TGTGTTAGAT GGAGTTGCAG GAGAGAAATT 
TGTGGCGGCC AATTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAGACT GCTTGTCCCA CTTGACACTA TCGCCGTCGC AAAAAACAAT GGCTTCGCTA ACCGGCGCCG CCTCTTCTCG TCTTCTCCCC GCCGCTTCTC GTGCTCGAAT CCATCTCTCC  TCACCTTCTT CTGCTTCTTC TTCTCGCTCT CCTTTATCTC TATCCTCCTC TTCCTCTTAT TCTATTTCTC CTCTCAAATG TCTCCGATCA TCACCTTTTG TTCCTCATTT CTTCTTAAAT  CAGAAGCGAT CGTCGATGAG TACGGTAGCT GCGGCGTCGG ATCCTGTTCA GCTGAAGAGT GCGAGAGAGG ATATTAAAGA GCTTCTCAAG TCTAAATTTT GCCATCCTAT ACTGGTTCGC  CTGGGATGGC ATGATGCTGG TACATATAAC AAGAACATAG AGGAGTGGCC AAAGAGAGGT GGAGCCGATG GTAGTATCAG ATTTGAAGTT GAGTTGAAAC ATGGAGCCAA TGCAGGCCTG  GTGAATGCAT TGAACCTTCT TCAGCCTATC AAGGACAAGT ACTCTGGTGT GACATACGCA GATTTGTTCC AATTGGCCAG TGCTACTGCT ATAGAGGAAG CTGGGGGGCC CAAGATTCCC  ATGAAATATG GAAGGGTGGA CGTTTCAGCA CCTGAAGATT GTCCTGAAGA GGGGAGGCTT CCTAGTGCTG GCCCTCCTAA ACCTGCGGAT CATTTACGAG AAGTTTTCTA CAGAATGGGT  TTAAATGACC AGGAAATAGT TGCATTATCC GGTGCACACA CCCTAGGAAG GTCCAGACCT GACCGCAGTG GCTGGGGAAA ACCAGAGACA AAGTATACGA AAAGTGGACC AGGAGCACCG  GGAGGACAAT CCTGGACAGC AGAATGGCTG AAGTTTGATA ACTCTTACTT CACGGATATC AAAGAAAGAA GGGATGAGGA TCTACTTGTA TTACCAACTG ATGCTGTTAT CTTCGAAGAT  TCTTCTTTCA AGGTATATGC TGAGAAATAT GCTGCAGATC AGGAAGCATT TTTCAAGGAT TACGCTGAAG CCCATGCGAA GCTCAGCAAT CTTGGAGCTA AATTTGATCC TCCTCAGGGT 
ATTGTGTTAG ATGGAGTTGC AGGAGAGAAA TTTGTGGCGG CCAATTAG 

Retrieve as FASTA