Entry information : MePrx84(Manes.11G046500 / cassava4.1_025400m)
Entry ID 9139
Creation 2011-07-01 (Qiang Li)
Last sequence changes 2012-01-05 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-08-22 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: MePrx84(Manes.11G046500 / cassava4.1_025400m)
Name MePrx84(Manes.11G046500 / cassava4.1_025400m)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx022]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Euphorbiaceae Manihot
Organism Manihot esculenta (cassava)    [TaxId: 3983 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value MePrx84
start..stop
S start..stop
RcPrx65 486 4.02e-172 50..420 19..401
PtPrx19 464 6.83e-165 62..421 1..317
PtPrx61 459 1.54e-162 63..421 3..315
CsPrx02 451 1.27e-158 11..421 2..379
Literature and cross-references MePrx84(Manes.11G046500 / cassava4.1_025400m)
DNA ref. Phytozome 12:   scaffold04324 (117906..119484)
Protein sequence: MePrx84(Manes.11G046500 / cassava4.1_025400m)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   421 (389)
PWM (Da):   %s   46091.01 (42290.0)  
PI (pH):   %s   6.64 (6.06) Peptide Signal:   %s   cut: 33 range:33-421
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MLNVIFEVAN MKKLSFLFFF ICILISLKNQ NAETKKGSST FCTATNRFPS SWDLCPSLFL SMEDEEDGHS RGSLSYDFYR NSCPQAENIV RELVRDINRV KSSVAAALLR LAFHDCFIEG  CDASILLDPA GGLKSEKESS PNLNLKGFDI INKIKSQIEE VCPGVVSCAD IVVLAAREGV VQSGGPFYPV FTGRRDSTHS FPDEATLKLP SPQAQLPETL ASFASKGFDQ RETVSLLGGH  SIGMIHCKFF INRLYNYNGT NKPDPSLDTQ FLNILRFICN NSSASLADSL PSTLVAPFGC SKLLSKASSP DCMGSQSSTS EKPRSSTQLS SLEEPGINMA YEGPGVDFGR LYYRTLLQGR 
GILVSDQQLM SGEETAKWVN AYASDVSLFR RDFARAMVKL SNLQVLTGSD GQVRVNCSKM A* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCTGAATG TAATCTTTGA AGTTGCAAAT ATGAAGAAGC TTAGCTTCCT CTTTTTCTTT ATCTGTATCT TGATATCTCT CAAGAACCAA AATGCAGAGA CCAAGAAAGG TTCTTCGACT  TTTTGCACTG CAACCAATAG GTTTCCTTCT TCCTGGGATT TGTGTCCTTC ATTATTCTTG TCTATGGAGG ATGAAGAAGA TGGCCATTCT CGGGGCTCAC TGTCGTATGA TTTTTACCGT  AATTCCTGCC CACAAGCTGA GAACATCGTT CGAGAGTTGG TTCGGGATAT TAACAGAGTC AAGTCCAGTG TCGCTGCTGC TCTCTTGAGA CTTGCCTTCC ATGATTGTTT CATTGAGGTC  ATGATCTTTC TTTCTTGTTC TTCTTGAATT TTTTCTTGGT TTCTGGGTTT TTTGGCCAAA TTAAGTTGAT CTGTGTTTTA GCAAAATTTT TGCTTTCCGG TTTTGGCGTT TTCTCTTGTT  CTTGTTTTCC CCCTTTTATC ATATTGGCAT CTCAATTATC GATGGACTCT GATGTGGGTT TTGTAATACT AGTATATCCT AGTGGTAATT TTGTTTGGCT TTTCCGCTGG TAATACTATT  TCATTGTAAG TTTATTTCTC TCTTTTTTTT TTTTTTAATT CTCCTCTGTG AGTCTTGATC CAATTTCATT TTATAATGTG TTTGGTTCAG TCTCCAATTT TGATTAGTAC TTTAAGACAA  CCCATGTATT TACAGTTCTG TGTTGAAGCT AAAATCTCTT TCAATCTGGT TCACAAATTT TGTTCAGTGT TGGGATTTCT TGATTCCTCA TTTTATATTT CTATGCTTCA TTTGCTGTTA  TCTGAACCAG TGTAAATTTG ATTTATTTAC TTTATCAATG CAAGTTGTGC AGGGGTGTGA TGCTTCTATT TTACTGGATC CTGCTGGAGG CTTAAAATCT GAGAAAGAAT CATCACCCAA  TCTAAATCTG AAAGGATTTG ATATAATTAA CAAAATAAAG TCACAGATTG AAGAAGTATG CCCTGGAGTT GTTTCTTGTG CTGATATTGT TGTTTTAGCG GCCAGAGAAG GTGTTGTTCA  GGTATATATC TCCGCCGCCC ACCTCCCTTC TCTGTCTCTC CGAGAGTCTC ACTGAATTTG TGAATTTCAG AGTGGTGGTC CATTCTATCC AGTGTTCACT GGCAGAAGAG ATTCTACTCA  TTCTTTCCCA GATGAGGCGA CATTGAAGCT TCCTTCACCC CAAGCTCAGC TACCTGAAAC CCTTGCATCT TTTGCATCTA AGGGATTTGA TCAAAGAGAA ACTGTCAGTC TCTTGGGTAT  TACTCTTCCC CCACTATGTT CCTCAATCTC TTGATTGCAC ATTGTATAAA TAATAAATGT TTCCTTGTGT TGCTTCTAGG TGGTCACAGC ATTGGAATGA TCCACTGCAA ATTTTTCATT  AACCGTCTCT ACAACTATAA TGGGACTAAT AAACCTGATC CTTCTCTCGA TACTCAATTC CTTAACATTT TGAGGTTCAT ATGCAACAAC AGTTCTGCAT CATTAGCAGA TTCATTACCA  TCAACACTGG TAGCTCCGTT TGGTTGCTCA AAGTTATTAT CAAAAGCATC ATCACCTGAC TGTATGGGAT CACAGTCTTC AACTTCTGAG AAGCCGAGAA GTAGCACACA ACTGTCTTCG  CTTGAGGAGC CAGGAATCAA TATGGCTTAT GAGGGACCTG GAGTAGATTT TGGCAGATTG TATTACCGGA CTCTTCTACA AGGTAGAGGA ATCCTAGTTT CCGATCAACA ACTGATGTCT  GGGGAAGAAA CTGCCAAATG GGTGAATGCA TACGCTTCAG ATGTCTCTCT TTTCCGCCGA GATTTTGCAC GAGCAATGGT GAAGCTCTCC AATCTCCAAG TCTTGACAGG TTCAGATGGA 
CAGGTCCGGG TCAATTGTTC AAAGATGGCA TGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCTGAATG TAATCTTTGA AGTTGCAAAT ATGAAGAAGC TTAGCTTCCT CTTTTTCTTT ATCTGTATCT TGATATCTCT CAAGAACCAA AATGCAGAGA CCAAGAAAGG TTCTTCGACT  TTTTGCACTG CAACCAATAG GTTTCCTTCT TCCTGGGATT TGTGTCCTTC ATTATTCTTG TCTATGGAGG ATGAAGAAGA TGGCCATTCT CGGGGCTCAC TGTCGTATGA TTTTTACCGT  AATTCCTGCC CACAAGCTGA GAACATCGTT CGAGAGTTGG TTCGGGATAT TAACAGAGTC AAGTCCAGTG TCGCTGCTGC TCTCTTGAGA CTTGCCTTCC ATGATTGTTT CATTGAGGGG  TGTGATGCTT CTATTTTACT GGATCCTGCT GGAGGCTTAA AATCTGAGAA AGAATCATCA CCCAATCTAA ATCTGAAAGG ATTTGATATA ATTAACAAAA TAAAGTCACA GATTGAAGAA  GTATGCCCTG GAGTTGTTTC TTGTGCTGAT ATTGTTGTTT TAGCGGCCAG AGAAGGTGTT GTTCAGAGTG GTGGTCCATT CTATCCAGTG TTCACTGGCA GAAGAGATTC TACTCATTCT  TTCCCAGATG AGGCGACATT GAAGCTTCCT TCACCCCAAG CTCAGCTACC TGAAACCCTT GCATCTTTTG CATCTAAGGG ATTTGATCAA AGAGAAACTG TCAGTCTCTT GGGTGGTCAC  AGCATTGGAA TGATCCACTG CAAATTTTTC ATTAACCGTC TCTACAACTA TAATGGGACT AATAAACCTG ATCCTTCTCT CGATACTCAA TTCCTTAACA TTTTGAGGTT CATATGCAAC  AACAGTTCTG CATCATTAGC AGATTCATTA CCATCAACAC TGGTAGCTCC GTTTGGTTGC TCAAAGTTAT TATCAAAAGC ATCATCACCT GACTGTATGG GATCACAGTC TTCAACTTCT  GAGAAGCCGA GAAGTAGCAC ACAACTGTCT TCGCTTGAGG AGCCAGGAAT CAATATGGCT TATGAGGGAC CTGGAGTAGA TTTTGGCAGA TTGTATTACC GGACTCTTCT ACAAGGTAGA  GGAATCCTAG TTTCCGATCA ACAACTGATG TCTGGGGAAG AAACTGCCAA ATGGGTGAAT GCATACGCTT CAGATGTCTC TCTTTTCCGC CGAGATTTTG CACGAGCAAT GGTGAAGCTC 
TCCAATCTCC AAGTCTTGAC AGGTTCAGAT GGACAGGTCC GGGTCAATTG TTCAAAGATG GCATGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCTGAATG TAATCTTTGA AGTTGCAAAT ATGAAGAAGC TTAGCTTCCT CTTTTTCTTT ATCTGTATCT TGATATCTCT CAAGAACCAA AATGCAGAGA CCAAGAAAGG TTCTTCGACT  TTTTGCACTG CAACCAATAG GTTTCCTTCT TCCTGGGATT TGTGTCCTTC ATTATTCTTG TCTATGGAGG ATGAAGAAGA TGGCCATTCT CGGGGCTCAC TGTCGTATGA TTTTTACCGT  AATTCCTGCC CACAAGCTGA GAACATCGTT CGAGAGTTGG TTCGGGATAT TAACAGAGTC AAGTCCAGTG TCGCTGCTGC TCTCTTGAGA CTTGCCTTCC ATGATTGTTT CATTGAGGGG  TGTGATGCTT CTATTTTACT GGATCCTGCT GGAGGCTTAA AATCTGAGAA AGAATCATCA CCCAATCTAA ATCTGAAAGG ATTTGATATA ATTAACAAAA TAAAGTCACA GATTGAAGAA  GTATGCCCTG GAGTTGTTTC TTGTGCTGAT ATTGTTGTTT TAGCGGCCAG AGAAGGTGTT GTTCAGAGTG GTGGTCCATT CTATCCAGTG TTCACTGGCA GAAGAGATTC TACTCATTCT  TTCCCAGATG AGGCGACATT GAAGCTTCCT TCACCCCAAG CTCAGCTACC TGAAACCCTT GCATCTTTTG CATCTAAGGG ATTTGATCAA AGAGAAACTG TCAGTCTCTT GGGTGGTCAC  AGCATTGGAA TGATCCACTG CAAATTTTTC ATTAACCGTC TCTACAACTA TAATGGGACT AATAAACCTG ATCCTTCTCT CGATACTCAA TTCCTTAACA TTTTGAGGTT CATATGCAAC  AACAGTTCTG CATCATTAGC AGATTCATTA CCATCAACAC TGGTAGCTCC GTTTGGTTGC TCAAAGTTAT TATCAAAAGC ATCATCACCT GACTGTATGG GATCACAGTC TTCAACTTCT  GAGAAGCCGA GAAGTAGCAC ACAACTGTCT TCGCTTGAGG AGCCAGGAAT CAATATGGCT TATGAGGGAC CTGGAGTAGA TTTTGGCAGA TTGTATTACC GGACTCTTCT ACAAGGTAGA  GGAATCCTAG TTTCCGATCA ACAACTGATG TCTGGGGAAG AAACTGCCAA ATGGGTGAAT GCATACGCTT CAGATGTCTC TCTTTTCCGC CGAGATTTTG CACGAGCAAT GGTGAAGCTC 
TCCAATCTCC AAGTCTTGAC AGGTTCAGAT GGACAGGTCC GGGTCAATTG TTCAAAGATG GCATGA 

Retrieve as FASTA