Entry information : BdiPrx67(Bradi2g12228 )
Entry ID 9636
Creation 2011-11-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-01-08 (Qiang Li)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2023-01-18 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: BdiPrx67(Bradi2g12228 )
Name BdiPrx67(Bradi2g12228 )
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx050]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Monocotyledons Poaceae Brachypodium
Organism Brachypodium distachyon    [TaxId: 15368 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value BdiPrx67
start..stop
S start..stop
TaPrx78-1D 623 0 1..355 61..416
TaPrx78-1B 623 0 1..355 1..356
TaPrx78-1A 612 0 1..355 1..356
SiPrx03 586 0 9..354 7..361
Literature and cross-references BdiPrx67(Bradi2g12228 )
DNA ref. Phytozome 12:   Bd2 (10579283..10582072)
Protein sequence: BdiPrx67(Bradi2g12228 )
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   355 (336)
PWM (Da):   %s   37571.11 (35714.1) Transmb domain:   %s   i7-29o (i7-29o)
PI (pH):   %s   7.97 (7.97) Peptide Signal:   %s   cut: 20 range:20-355
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSSLAMNSLL ATLAVAVLAL FPIAAVGAGL KVGFYSKTCP SAETLVQQAV AASFKNNGGV AAGLIRLHFH DCFVKGCDGS VLIDSTANNT AEKDAIPNNP SLRGFEVIDA AKKAIEAKCP  KIVSCADILA FAARDSIALA GNVTYKVPAG RRDGRISSDQ NALNNLPSPL STASELVGNF TLKNLTAEDM VVLSGAHTIG VSRCSSFTNR LYGFSNTSQV DPTMSSAYAF LLKNICPANS 
SQFFPNTTMD MDIITPAVLD NKYYVSLINN LGLFTSDQAL LTNSTLKASV DEFVKNENRW KSKFVKSMVK MGNIEVLTGT QGEIRLNCRV INKGSTGLEF NSGINSGEFT EIATS 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Containing IntR (3').
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGCTCCC TCGCCATGAA CTCCCTGCTC GCCACCTTGG CAGTTGCCGT CCTTGCCCTC TTCCCGATTG CTGCTGTCGG AGCTGGCCTG AAGGTCGGGT TCTACAGCAA GACCTGCCCA  TCCGCGGAGA CCCTGGTGCA GCAGGCAGTG GCTGCTTCCT TCAAGAATAA CGGTGGTGTC GCTGCTGGCC TCATCCGATT GCATTTCCAC GACTGCTTTG TGAAAGTATG TACACTGCAT  TTTTTTTCCT TTCTCTTATA CCTGCACTGT TGACATAAAG GAAAGCCTGA GCTGTAAGTC CATCGTAGCA ATCAACTTAC ACCTATAGGA TTCCTTATTT GCACCCCTTA AGCAGAATGA  TAAACTGAGC GATAATTAAA GGAAGGTATT GTTTCTGCTG AAGATATGGC AAATACGGTA TCTAAATTCT AAACATCTTT CTCGTAGCAG GAAATATAAT ACCATCCTTA ATCAACATAA  GTAAATACTC CCTCCGATCC ATAATAAGTA TCGGGGGTTT AGTACAACGT CCCCGGCACT TATTATGGAT CGGAGGGAGT AGCAGACAGT GATCAATATA AGTATTCCTC TCAGTTAGCT  GCAAGTGCAA GCTGAATACC ATGTACTCCC TCCGTTCCAT AATTCTTGTC TCAAATTTGC CCAAATATGG ATGTATCAAT TCCTAAAAAG CATCTATATA GATGTAATAT TTCGACAAGA  ATTATGAAAC GGAGGGAGTA CTAATTTTGT ATCAGTGACT AGTCTGTGCC GACACCAAAG CACCCAAGTC GCATCTCGAA GGTATTGAGT TACTGTTAGT CCTAGCCTCC TAGGAATATG  GGTGTGGATA GATAGACCCT TACTAAAGTA CAGTGTCACA AACATCTACT TTTAGCTAAA TCCATCGAAG TCAGATAGAT CTGAACAAGA AGCAGCATAC AGTCAGTTAG CATAATTTTA  TTCCCCCTGA TGATGATTAC TCTGTATACA CAACATAAAG ATCACTCATA GCTCACTCTC AGTACACAGG TCAAATTTGG TTAACAGCAT AAATTCTCCT GAAAGTTCCA ATTTGTATAA  CGAACTTGCA TTTAGCTCAA AATACCATGA AAGAACACGC ATGTTAACAA AAAGCAAAAG AGGAACCAGC ATATCATGTC TATGATTAAT TCTAATGCAA CGTAAAGTTC ATGCTCACCA  ATATTTGTGA GGTGACCCAA TCTTATCAAA CACCATTATT ATATGCCACA GGGTTGCGAC GGCTCAGTCC TGATCGACTC AACTGCAAAC AACACTGCTG AGAAGGACGC AATCCCCAAC  AACCCCAGTC TCCGCGGGTT TGAGGTTATT GATGCTGCAA AGAAGGCCAT TGAGGCCAAA TGCCCCAAGA TAGTCTCATG CGCTGACATC CTTGCCTTTG CCGCCCGAGA CAGCATAGCA  CTAGCAGGTA ATGTTACTTA CAAGGTGCCT GCTGGTCGCC GTGATGGCAG GATATCCAGT GACCAGAATG CCCTGAACAA CCTCCCCTCG CCGCTCTCAA CGGCATCTGA GCTGGTAGGC  AACTTCACCT TGAAGAATCT CACAGCTGAG GACATGGTCG TCCTCTCCGG TGCCCACACG ATAGGTGTCT CGCGCTGCTC GTCCTTCACG AACAGGCTAT ATGGCTTCAG CAACACCAGT  CAGGTATAAC GTGTTCAAAT CTACAGCAGT TTTCAGACAT TTTCTTTTGG AGCATATGGT ATGCATCTAG CCTTTCTTCC CCTAAATGAT TATCTCTGCT ACCAGGTTGA TCCTACAATG  AGCTCTGCCT ATGCTTTCCT GCTCAAGAAC ATATGCCCTG CCAACAGCAG CCAGTTCTTC CCAAACACAA CGATGGATAT GGATATCATC ACCCCCGCGG TGCTTGACAA TAAGTATTAT  GTGAGTCTGA TAAACAACCT AGGCCTATTT ACGTCAGACC AAGCATTACT CACAAACTCA ACTCTGAAAG CATCAGTGGA CGAGTTTGTG AAGAACGAAA ATAGATGGAA GAGCAAGTTT  GTCAAGTCCA TGGTTAAGAT GGGGAACATT GAGGTGCTAA CAGGAACACA AGGAGAGATT AGGCTCAACT GCAGGGTCAT AAACAAAGGG AGCACTGGTC TTGAGTTTAA TTCTGGTATC 
AACTCTGGTG AATTCACTGA AATAGCAACA AGCTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGCTCCC TCGCCATGAA CTCCCTGCTC GCCACCTTGG CAGTTGCCGT CCTTGCCCTC TTCCCGATTG CTGCTGTCGG AGCTGGCCTG AAGGTCGGGT TCTACAGCAA GACCTGCCCA  TCCGCGGAGA CCCTGGTGCA GCAGGCAGTG GCTGCTTCCT TCAAGAATAA CGGTGGTGTC GCTGCTGGCC TCATCCGATT GCATTTCCAC GACTGCTTTG TGAAAGGTTG CGACGGCTCA  GTCCTGATCG ACTCAACTGC AAACAACACT GCTGAGAAGG ACGCAATCCC CAACAACCCC AGTCTCCGCG GGTTTGAGGT TATTGATGCT GCAAAGAAGG CCATTGAGGC CAAATGCCCC  AAGATAGTCT CATGCGCTGA CATCCTTGCC TTTGCCGCCC GAGACAGCAT AGCACTAGCA GGTAATGTTA CTTACAAGGT GCCTGCTGGT CGCCGTGATG GCAGGATATC CAGTGACCAG  AATGCCCTGA ACAACCTCCC CTCGCCGCTC TCAACGGCAT CTGAGCTGGT AGGCAACTTC ACCTTGAAGA ATCTCACAGC TGAGGACATG GTCGTCCTCT CCGGTGCCCA CACGATAGGT  GTCTCGCGCT GCTCGTCCTT CACGAACAGG CTATATGGCT TCAGCAACAC CAGTCAGGTT GATCCTACAA TGAGCTCTGC CTATGCTTTC CTGCTCAAGA ACATATGCCC TGCCAACAGC  AGCCAGTTCT TCCCAAACAC AACGATGGAT ATGGATATCA TCACCCCCGC GGTGCTTGAC AATAAGTATT ATGTGAGTCT GATAAACAAC CTAGGCCTAT TTACGTCAGA CCAAGCATTA  CTCACAAACT CAACTCTGAA AGCATCAGTG GACGAGTTTG TGAAGAACGA AAATAGATGG AAGAGCAAGT TTGTCAAGTC CATGGTTAAG ATGGGGAACA TTGAGGTGCT AACAGGAACA 
CAAGGAGAGA TTAGGCTCAA CTGCAGGGTC ATAAACAAAG GGAGCACTGG TCTTGAGTTT AATTCTGGTA TCAACTCTGG TGAATTCACT GAAATAGCAA CAAGCTAG 

Retrieve as FASTA