Entry information : ScomLDS01
| Entry ID | 10727 |
|---|---|
| Creation | 2012-03-08 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2012-04-05 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Not yet reviewed |
| Last annotation changes | 2016-02-10 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: ScomLDS01
| Name | ScomLDS01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Class | Linoleate diol synthase (PGHS like) [Orthogroup: LDS001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Fungi Basidiomycota Agaricomycetes Schizophyllaceae Schizophyllum | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Schizophyllum commune [TaxId: 5334 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '10727' 'join(415610..415888,415928..416021,416087..416242,416295..416488,416544..416621,416683..416799,416957..417110,417170..417304,417360..417457,417543..417739,417796..417889,417959..418084,418141..418279,418330..418383,418438..418585,418641..418797,418848..419024,419073..419158,419210..419345,419396..419696,419747..419865,419916..420001,420053..420160,420216..420306,420359..420370)' |
Exons►
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Literature and cross-references ScomLDS01
| DNA ref. | JGI genome: scaffold_19 (415610..420370) |
|---|---|
| EST ref. | GenBank: GW386594.1 [3' end] GW386593.1 [Fragment] |
| Cluster/Prediction ref. | JGI gene: 1177102 |
Protein sequence: ScomLDS01
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (24 introns) and 2 ESTs. | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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