Entry information : GmarCIIBC08
Entry ID | 11880 |
---|---|
Creation | 2013-05-23 (Nizar Fawal) |
Last sequence changes | 2016-06-29 (Catherine Mathe) |
Sequence status | complete |
Reviewer | Not yet reviewed |
Last annotation changes | 2017-04-19 (Catherine Mathe (Scipio)) |
Peroxidase information: GmarCIIBC08
Name | GmarCIIBC08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Class | Other class II peroxidase type C [Orthogroup: CIIBC002] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Taxonomy | Eukaryota Fungi Basidiomycota Agaricomycetes Cortinariaceae Galerina | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Galerina marginata [TaxId: 109633 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular localisation | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue type | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Inducer | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Repressor | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Best BLASTp hits |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '11880' 'complement(join(338623..338683,338752..338816,338878..338955,339007..339095,339152..339187,339241..339317,339370..339426,339480..339494,339552..339577,339637..339651,339713..339807,339862..339983,340038..340103,340157..340169,340224..340279,340332..340338,340405..340537,340592..340687))' |
Exons►
|
Literature and cross-references GmarCIIBC08
DNA ref. | JGI genome: scaffold_49 (340687..338623) |
---|---|
Cluster/Prediction ref. | JGI gene: 147216 |
Protein sequence: GmarCIIBC08
Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
|
||||||||||||
Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
|
||||||||||||
Remarks | complete sequence from genomic (17 introns). Incorrect prediction from JGI | ||||||||||||
DNA ► Send to BLAST |
|
||||||||||||
CDS► Send to BLAST |
|