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Entry information : SpolRboh02Spipo0G0118600
Entry ID 13262
Creation 2015-06-19 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2015-06-19 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: SpolRboh02Spipo0G0118600
Name SpolRboh02Spipo0G0118600
Class Respiratory burst oxidase homolog     [Orthogroup: Rboh003]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Monocotyledons Araceae Spirodela
Organism Spirodela polyrhiza (great duckweed)    [TaxId: 29656 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value SpolRboh02
start..stop		 S start..stop
LminRboh03 599 0 1..507 1..459
LminRboh05 574 0 1..507 45..503
CescRboh01 504 2.36e-171 1..507 30..564
PnodRboh01 486 3.42e-165 88..507 96..500
Literature and cross-references SpolRboh02Spipo0G0118600
Protein sequence: SpolRboh02Spipo0G0118600
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   507
PWM (Da):   %s   56171.65 Transmb domain:   %s   o292-311i429-451o477-499i
PI (pH):   %s   8.32
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAGDPDGDTP VVEVYFHSQD SSRSSGSSFS LESTAGSSGH ELPVTIKFPQ HSSGNIDLHC SSSSSCSSSS SSGNLGGCIP ALRGGGCGVA AKRSDRVVEE LMEHVDRRQV EWREVEGKFD  QLAVPVPGRP PAVKSSDFML CIGSDWVLLK QISFLHFVLD SSGDAKSPHG SYSSGMEETP EFASELLRAL RGGKNDCQWI TKPELLECRN VDGEITEKEM KQVIRLSAAA NHLSMSHQEV  GEYTRLIMEA ILGRNLSSHS DQETPRKPED EGRRFRRRSP PSAAEVLVRA NWRQAWVVSL WLIACAALFT WKFEQYRRRR AFEVMGYCLC AAKGAAETLK LNMALVLLPI CRNTVTWLRR  HRLLNSLIPF NDAINFHKLV AGGIVIGVIL HGGTHLACDF PRIAGADQTL FRQTIAANFR HRQPSYLEIL ATTEVASGIA MVVLMAAAFA LATRLPRRDP ASLPRLLRRI AGFNTFWYSH 
HIFVVVYVLL IIHSMFLFLT KDVTEKT* 

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Remarks
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGGGGG ACCCTGACGG CGATACGCCG GTGGTGGAGG TGTACTTCCA CTCCCAAGAC AGTTCTCGTT CGTCTGGTTC ATCCTTCTCG TTGGAGTCTA CGGCAGGATC TTCAGGCCAT  GAGCTACCGG TGACGATCAA ATTCCCCCAG CATTCTTCGG GCAACATTGA CCTGCACTGC TCCTCTTCTT CTTCCTGTTC CTCCTCTTCT TCGTCGGGGA ACCTCGGAGG CTGTATCCCG  GCGCTGAGAG GCGGCGGCTG CGGCGTCGCC GCCAAGCGGT CCGACCGCGT TGTAGAGGAG CTCATGGAAC ATGTGGACCG CCGGCAGGTC GAGTGGCGAG AGGTGGAGGG GAAGTTCGAC  CAGCTGGCCG TGCCAGTGCC GGGACGACCT CCAGCGGTGA AATCATCGGA TTTCATGCTC TGTATTGGTA GCGATTGGGT TCTTCTCAAG CAGATTTCTT TTTTACATTT TGTTCTTGAT  TCATCTGGTG ATGCCAAGTC TCCACATGGT TCGTATTCCT CAGGCATGGA GGAGACGCCG GAATTCGCCT CAGAGCTTTT GAGGGCCCTC CGCGGGGGAA AGAATGACTG TCAATGGATC  ACAAAGCCAG AGCTTCTTGA GTACTGGAGG CGCATCAACG ACCCTCGTCT CAGCTCGAGG ATCCAAATTT TCCTCGACAT GCGAGTCTCC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC  TCCCCCCCCC TCTCTCCTCT CTCCTCTCTC TCTTACGCGG AGAACTATGC CTGAACCAGG TGTAGAAATG TGGACGGGGA GATCACGGAG AAGGAGATGA AGCAGGTGAT CCGACTGAGC  GCCGCCGCCA ACCACCTGTC GATGTCTCAC CAGGAAGTCG GAGAATACAC CCGACTGATC ATGGAGGCCA TCCTCGGGAG AAACCTCTCG AGTCACAGCG ACCAAGAAAC CCCACGGAAG  CCAGAGGATG AAGGGCGGAG ATTCCGGCGA CGATCCCCTC CTTCGGCGGC GGAAGTCCTC GTCCGGGCCA ACTGGCGGCA GGCATGGGTC GTCTCCCTCT GGCTCATCGC CTGCGCCGCC  CTCTTCACGT GGAAGTTCGA GCAGTACCGC CGCCGGCGGG CCTTTGAGGT GATGGGCTAC TGCCTCTGCG CCGCCAAAGG CGCCGCCGAA ACCTTGAAGC TGAACATGGC CCTCGTCCTC  CTCCCCATCT GCCGCAACAC GGTGACTTGG CTCCGGCGAC ACCGCCTCCT CAACTCCCTC ATCCCCTTCA ACGACGCCAT CAACTTCCAC AAGGTAAGCT CCGCTCCACT TGCGCTCAGT  TCCGCCGCCG CCCATGGGCG GGTTGACTTC TGAACCCGGG TTCGTCTCGT TCTAGTGTAG CTGGTCGCAG GGGGGATAGT CATCGGCGTG ATCCTCCACG GCGGCACCCA CCTGGCATGT  GACTTCCCCA GGATCGCTGG CGCGGACCAG ACGCTGTTCC GGCAGACGAT CGCAGCCAAC TTCCGGCACC GGCAGCCGTC GTATCTGGAG ATCCTAGCCA CCACCGAGGT CGCCTCCGGG  ATAGCCATGG TGGTCCTCAT GGCCGCCGCC TTTGCCCTCG CCACGCGGCT GCCCCGCCGC GATCCCGCAT CCCTCCCGCG GCTGCTCCGC CGGATCGCCG GCTTCAACAC CTTCTGGTAC  TCTCACCACA TCTTCGTCGT CGTCTACGTG CTGCTGATTA TCCACTCGAT GTTCCTTTTC CTCACCAAAG ACGTCACCGA GAAGACCGTA AGCCCCTTCT CTTTCTCCGA CCTCCACCCG  TTGACTCCCG ATCTCTCTTA ATTATCTATT TCTGCTGCGA CAGACCTGGA TGTACATCGC CGTCCCCGTG TTGCTCTACA TCGGTGAGCG AGCCATCCGG GCCTTCCGAT CCCAAGTCTA  TGACGTGAAC ATTATCAAGG CATCATCCTC TCTCTCTCTC TCTCnCTCTC TCTCTCTnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnAGAGT AGAGAGAGAG AGAGGAGAGA GAGAGAGGTC TTATGGAAGT TTAAAATGGG CTTGAGTTTC  TTTTGGGTGG GCCTAAATAC ATTTTTGAAT ATTAAAAGTA ATATTAAATC CATTTTTGTA GAGTAGCTTT TTGAAAAATT AAGCTAGACG ATTAATTAAA TAATTATTTA AATTAAAATT  TTAGATGGAA AAGTAGTGTT TTTGGTGTAC ATTGATTCAC TTTTGCTTGC ATTGCATAGG TGAGACGAAC AGTTTTCCAA ATTTTTATTT TTAAAATGAG GGCAGAGATA TTAATGAGAA  AGATATCGTG AAATTTTATT TTCAAATTAA ATATGGAAAT AATTTTATGT TCAAATATTA TGATTTTATT TATTTACGGC ATGCTTATTT GAATGCTTAA TGAATAATCA GGATTAATTA 
TTTATTTTAA CTCCGCTCAC AAGATTTTAG TAATCGTTGA CATTTCTGGA TAAGTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGGGGG ACCCTGACGG CGATACGCCG GTGGTGGAGG TGTACTTCCA CTCCCAAGAC AGTTCTCGTT CGTCTGGTTC ATCCTTCTCG TTGGAGTCTA CGGCAGGATC TTCAGGCCAT  GAGCTACCGG TGACGATCAA ATTCCCCCAG CATTCTTCGG GCAACATTGA CCTGCACTGC TCCTCTTCTT CTTCCTGTTC CTCCTCTTCT TCGTCGGGGA ACCTCGGAGG CTGTATCCCG  GCGCTGAGAG GCGGCGGCTG CGGCGTCGCC GCCAAGCGGT CCGACCGCGT TGTAGAGGAG CTCATGGAAC ATGTGGACCG CCGGCAGGTC GAGTGGCGAG AGGTGGAGGG GAAGTTCGAC  CAGCTGGCCG TGCCAGTGCC GGGACGACCT CCAGCGGTGA AATCATCGGA TTTCATGCTC TGTATTGGTA GCGATTGGGT TCTTCTCAAG CAGATTTCTT TTTTACATTT TGTTCTTGAT  TCATCTGGTG ATGCCAAGTC TCCACATGGT TCGTATTCCT CAGGCATGGA GGAGACGCCG GAATTCGCCT CAGAGCTTTT GAGGGCCCTC CGCGGGGGAA AGAATGACTG TCAATGGATC  ACAAAGCCAG AGCTTCTTGA GTGTAGAAAT GTGGACGGGG AGATCACGGA GAAGGAGATG AAGCAGGTGA TCCGACTGAG CGCCGCCGCC AACCACCTGT CGATGTCTCA CCAGGAAGTC  GGAGAATACA CCCGACTGAT CATGGAGGCC ATCCTCGGGA GAAACCTCTC GAGTCACAGC GACCAAGAAA CCCCACGGAA GCCAGAGGAT GAAGGGCGGA GATTCCGGCG ACGATCCCCT  CCTTCGGCGG CGGAAGTCCT CGTCCGGGCC AACTGGCGGC AGGCATGGGT CGTCTCCCTC TGGCTCATCG CCTGCGCCGC CCTCTTCACG TGGAAGTTCG AGCAGTACCG CCGCCGGCGG  GCCTTTGAGG TGATGGGCTA CTGCCTCTGC GCCGCCAAAG GCGCCGCCGA AACCTTGAAG CTGAACATGG CCCTCGTCCT CCTCCCCATC TGCCGCAACA CGGTGACTTG GCTCCGGCGA  CACCGCCTCC TCAACTCCCT CATCCCCTTC AACGACGCCA TCAACTTCCA CAAGCTGGTC GCAGGGGGGA TAGTCATCGG CGTGATCCTC CACGGCGGCA CCCACCTGGC ATGTGACTTC  CCCAGGATCG CTGGCGCGGA CCAGACGCTG TTCCGGCAGA CGATCGCAGC CAACTTCCGG CACCGGCAGC CGTCGTATCT GGAGATCCTA GCCACCACCG AGGTCGCCTC CGGGATAGCC  ATGGTGGTCC TCATGGCCGC CGCCTTTGCC CTCGCCACGC GGCTGCCCCG CCGCGATCCC GCATCCCTCC CGCGGCTGCT CCGCCGGATC GCCGGCTTCA ACACCTTCTG GTACTCTCAC 
CACATCTTCG TCGTCGTCTA CGTGCTGCTG ATTATCCACT CGATGTTCCT TTTCCTCACC AAAGACGTCA CCGAGAAGAC CTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGGGGG ACCCTGACGG CGATACGCCG GTGGTGGAGG TGTACTTCCA CTCCCAAGAC AGTTCTCGTT CGTCTGGTTC ATCCTTCTCG TTGGAGTCTA CGGCAGGATC TTCAGGCCAT  GAGCTACCGG TGACGATCAA ATTCCCCCAG CATTCTTCGG GCAACATTGA CCTGCACTGC TCCTCTTCTT CTTCCTGTTC CTCCTCTTCT TCGTCGGGGA ACCTCGGAGG CTGTATCCCG  GCGCTGAGAG GCGGCGGCTG CGGCGTCGCC GCCAAGCGGT CCGACCGCGT TGTAGAGGAG CTCATGGAAC ATGTGGACCG CCGGCAGGTC GAGTGGCGAG AGGTGGAGGG GAAGTTCGAC  CAGCTGGCCG TGCCAGTGCC GGGACGACCT CCAGCGGTGA AATCATCGGA TTTCATGCTC TGTATTGGTA GCGATTGGGT TCTTCTCAAG CAGATTTCTT TTTTACATTT TGTTCTTGAT  TCATCTGGTG ATGCCAAGTC TCCACATGGT TCGTATTCCT CAGGCATGGA GGAGACGCCG GAATTCGCCT CAGAGCTTTT GAGGGCCCTC CGCGGGGGAA AGAATGACTG TCAATGGATC  ACAAAGCCAG AGCTTCTTGA GTGTAGAAAT GTGGACGGGG AGATCACGGA GAAGGAGATG AAGCAGGTGA TCCGACTGAG CGCCGCCGCC AACCACCTGT CGATGTCTCA CCAGGAAGTC  GGAGAATACA CCCGACTGAT CATGGAGGCC ATCCTCGGGA GAAACCTCTC GAGTCACAGC GACCAAGAAA CCCCACGGAA GCCAGAGGAT GAAGGGCGGA GATTCCGGCG ACGATCCCCT  CCTTCGGCGG CGGAAGTCCT CGTCCGGGCC AACTGGCGGC AGGCATGGGT CGTCTCCCTC TGGCTCATCG CCTGCGCCGC CCTCTTCACG TGGAAGTTCG AGCAGTACCG CCGCCGGCGG  GCCTTTGAGG TGATGGGCTA CTGCCTCTGC GCCGCCAAAG GCGCCGCCGA AACCTTGAAG CTGAACATGG CCCTCGTCCT CCTCCCCATC TGCCGCAACA CGGTGACTTG GCTCCGGCGA  CACCGCCTCC TCAACTCCCT CATCCCCTTC AACGACGCCA TCAACTTCCA CAAGCTGGTC GCAGGGGGGA TAGTCATCGG CGTGATCCTC CACGGCGGCA CCCACCTGGC ATGTGACTTC  CCCAGGATCG CTGGCGCGGA CCAGACGCTG TTCCGGCAGA CGATCGCAGC CAACTTCCGG CACCGGCAGC CGTCGTATCT GGAGATCCTA GCCACCACCG AGGTCGCCTC CGGGATAGCC  ATGGTGGTCC TCATGGCCGC CGCCTTTGCC CTCGCCACGC GGCTGCCCCG CCGCGATCCC GCATCCCTCC CGCGGCTGCT CCGCCGGATC GCCGGCTTCA ACACCTTCTG GTACTCTCAC 
CACATCTTCG TCGTCGTCTA CGTGCTGCTG ATTATCCACT CGATGTTCCT TTTCCTCACC AAAGACGTCA CCGAGAAGAC CTGA 

Retrieve as FASTA