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Entry information : HaFer01 (HanXRQChr07g0203041)
Entry ID 13697
Creation 2016-05-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-05-12 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaFer01 (HanXRQChr07g0203041)
Name (synonym) HaFer01 (HanXRQChr07g0203041)
Class Ferritin    [Orthogroup: Fer001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaFer01
start..stop		 S start..stop
HaFer03 413 1.37e-148 1..241 1..243
HaFer06 383 8.8e-137 1..241 1..242
HaFer02 380 1.27e-135 22..241 30..248
LeFer01 376 9.44e-134 10..241 25..253
Gene structure Fichier Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 89909038..89909300 261 N° 2 89910541..89910624 82 N° 3 89911109..89911169 59 N° 4 89911237..89911324 86
N° 5 89911898..89911959 60 N° 6 89912495..89912560 64 N° 7 89912660..89912723 62 N° 8 89912816..89912871 54
join(89909038..89909300,89910541..89910624,89911109..89911169,89911237..89911324 ,89911898..89911959,89912495..89912560,89912660..89912723,89912816..89912871)


exon

Literature and cross-references HaFer01 (HanXRQChr07g0203041)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr07 (89909038..89912871)
Protein sequence: HaFer01 (HanXRQChr07g0203041)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   248
PWM (Da):   %s   27731.09  
PI (pH):   %s   5.67
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MLLKPPATLFFQNGVVFGNGVVSTPPAIVCAAAKGGSPPNSRTITGVVFEPFEEVKKELSLVPNAPQQSLARQKYADQSEAAVNEQINVEYNVSYVYHAMYAYFDRDNIALKGLAKFFKE
SSEEEREHAEKFMEYNKRGGKVKLQSILMPLSEFDHAEKGDALYAMELALSLEKLTNEKLLHMQVANKNNDVQLADFVENNFLGEQVKAIKKMSEYVAQLRRVGKGHGVWHFDQMLLDEV
LPFDV

Retrieve as FASTA  
Remarks No EST.
DNA ►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGCTTCTCAAACCTCCTGCAACTCTCTTCTTCCAAAACGGTGTCGTTTTCGGAAACGGTGTAGTTTCGACTCCGCCGGCGATCGTTTGTGCGGCGGCGAAAGGTGGTTCTCCTCCGAAC
AGTAGAACGATTACAGGTGTGGTGTTTGAACCGTTTGAGGAAGTGAAAAAGGAGCTCAGTCTTGTACCTAATGCTCCTCAACAGTCTCTTGCTCGTCAAAAGTATGCTGATCAATCTGAA
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ATCTTTAGACTGACTATAAAACAACCTCAAGCCAGCTTGCGAGCTGAACGAGTTTTTTATTTATAGAATTATATTATTTAGAGTAAATTGCCATTTTAGTCCCTGAGTTTTTGTCAAATT
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GCATTAAATTATTATGAGGTTTATAACTTATGTTGTAAACTACCCCGGTTATCACTACACAACAGTTATGCCAAAAATACTCCTGGTTATAACCAAATTTTTAGACTGAGTTAGGTAATG
TGATCAAAATGGCAAGAAAATGGAAAAGTCAGGGACCCAGAGGAGAAAAAAAACTATTTGGACTAAAATGACAATTTGGACCAAACCTCAGGGACTAAAATGGCAATTTACTCATTATTT
AATATATTGAATATATATTAATATAATAATTATCATTATCATTGTGAATGAAAAGTATAAATAAAAATATATGTGTAAATAATTATTAAATAAAATAACTAAATATATAATAAGTGAGCT
GAGCTCGATCTTTAGAAATAAAGTTCCAAACAGCTAGAAATAAAGTTCCAAACAAGCTGCGCTCAAGCCTAAACGAGCTCTGTTCTTTTCTTTTACTGTCATATTGCATTTAATTAATTT
TATTTAAAGGATTTTCTTGATGGTGACTTTATTCGTGTTTCTAATGATAATTTTGTTCCTTTCAGTGTTGAGTACAACGTTTCGTACGTGTACCATGCCATGTATGCATACTTCGATAGG
GACAATATTGCTCTCAAGGGTTTAGCCAAAAGTTAGTTACCAAAATCATTGTCATGTCAATTAATAACATATAGAGTTTAATGCCATTTTAATCCCTGTGGTGGTTTGGGCCATTTTGGC
AGTTTAGTCCAAAGGTTTCTTTTTTCGCATGTGGGTTCAAAAAGGTTTCACCGTTGCCATTTTAGTCCACTGGGTTAACTTCATCTATTTTTTCTGTTAACGAGAAGGGCAATTCGGTCA
TTTTATATGGCCGAATTGCCTTTCTAGTTAACAGAATTACATATAAAATGACCGAATTGCCCTTCTCGTTAACAGAAAAAATGGATGAAGTTAACCCAGTGGACTAAAATGGCAACGGTG
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CATTTACCCTGACTATGCTACATAAATACTTACAGATTCTTTAAGGAGTCCAGCGAAGAGGAAAGGGAACATGCCGAAAAGTTTATGGAATACCAGAGGTGTTTGATTCTAGCATTTCTT
CACTTAATTGTCACTGATTATAATCATAAAGTTTTTCTGTTTTAGAACAAACGCGGTGGGAAAGTGAAGTTGCAATCTATTTTGATGCCTTTATCCGAGTTTGATCATGCAGAGAAAGGA
GATGCACTTTATGTGGTAAGTTTTGTGTTATGATATGTTCGATTGCCCAAATATTAGTTGCTACATTACATTAAGTGAGATCTTGTGAATCACTTTGATTATTATTCGAAGAGTAAAATG
CAATTTTCGTCCCTGAGGTTTAGCCAGTTTTGCGACTTTCATCCAATGGTTTGTTTTTCCACTATATGGATCCAAAAGGTTTGAAATCTTGCCATTTCCATCCGGCTCGTTAACTCCATC
CATTTTTCTCTGTTTAGTAAGGGGTATTTCCGTCTTTTTTGTTAACTTAAAGGGCAATTCGGTCATTTTCACTTTATGTACAAGCATTTAGCATAATGTACATAAAGTGAAAATGACCAA
ATTACCCTTTAAGTTACCAAAAAAATTGGAAATACCACTGTCTTGACGGAGAAAAATGGATTGAGTTAACGAGACGGATGAAAATAGCAAGATTTCAAACCTTTTGGATCCACATGCGAA
AAACAAACCTATGGACGAAAGTCGCAAAACTGGCCAAACCTTAGGGACGAAAATGGCATTTTACTCTTGATTGAATTATTATGTTTCATTGGTTTGTTTATTTTGTAGCAATGGAGCTTG
CATTGTCGCTGGAGAAATTAACAAATGAGAAACTACTACACATGCAAGCGCGGTATGACATGTTCTTTTGCATTTTGTGTATGCCGATTAATGTTTAATATGAAGATCAAGAAAATGTGG
GATTTGGGTGTATGTTTAAAAAATGCTTGAGTCGTGCGCCTCAAGGCGCGCCTCGAGGCGAAACGACCAAAAAACGAGTCTGAGGCGCGCCTCATGGGGTTTTAACTGCATATGCGCCTC
AGAGGAGTTGAGGCGCTAAAAAAGGTTGCGCCTCAGGTGCGCCTCATGGGATTTTCATAGTTGTTTTTGATGTTTTTGACTTTTTGTGTCAATTTCAAGCATTTCATGTCTTTTTATGTA
TGTTTTTGATGATTTTGATGAATCTGATGATGAAATTAGTTGGTATTATTATTTTTATAATATATATAATTTTTATATTTATTTATTAATACCGCCTCGGCCTTACGCCTCATTTTGCCT
CGAGGCTTACGCCTCGTAAGGCAAAGGGAAAACGCCTCGAAACTCGTTTCCGTTCTTTTAAACAATTAAACCTCGGGTGTATGAATTGTGATATTTGATGAGAACAGGTAGCCAACAAGA
ACAATGATGTCCAATTAGCTGATTTTGTTGAAAACAACTTCTTGGGTGAACAGAGGTAGAAATATAATTTATAAATTCGACTACTTTATAAATATCCGGTAGTTCATTTGCGCCACGAGG
GGAAGTTGATAATTTTTTTTCATTTTGTTAAAAGGTCAAGGCGATTAAAAAGATGTCTGAATATGTTGCTCAGTTAAGAAGAGTCGGCAAAGGACACGCGGTAAACTTATTCGTAACCAA
TTTTTCACTTAAAATTGAATGTATCAAATTATTATTCGGTCACTAGAGATGACGATTTTCTTGCAATATCAGGAGTTTGGCATTTTGATCAGATGCTGCTCGACGAAGTGCTGCCGTTTG
ATGTATTG

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGCTTCTCAAACCTCCTGCAACTCTCTTCTTCCAAAACGGTGTCGTTTTCGGAAACGGTGTAGTTTCGACTCCGCCGGCGATCGTTTGTGCGGCGGCGAAAGGTGGTTCTCCTCCGAAC
AGTAGAACGATTACAGGTGTGGTGTTTGAACCGTTTGAGGAAGTGAAAAAGGAGCTCAGTCTTGTACCTAATGCTCCTCAACAGTCTCTTGCTCGTCAAAAGTATGCTGATCAATCTGAA
GCTGCTGTTAATGAGCAGATTAATGTTGAGTACAACGTTTCGTACGTGTACCATGCCATGTATGCATACTTCGATAGGGACAATATTGCTCTCAAGGGTTTAGCCAAATTCTTTAAGGAG
TCCAGCGAAGAGGAAAGGGAACATGCCGAAAAGTTTATGGAATACCAGAACAAACGCGGTGGGAAAGTGAAGTTGCAATCTATTTTGATGCCTTTATCCGAGTTTGATCATGCAGAGAAA
GGAGATGCACTTTATGCAATGGAGCTTGCATTGTCGCTGGAGAAATTAACAAATGAGAAACTACTACACATGCAAGCGGTAGCCAACAAGAACAATGATGTCCAATTAGCTGATTTTGTT
GAAAACAACTTCTTGGGTGAACAGGTCAAGGCGATTAAAAAGATGTCTGAATATGTTGCTCAGTTAAGAAGAGTCGGCAAAGGACACGGAGTTTGGCATTTTGATCAGATGCTGCTCGAC
GAAGTGCTGCCGTTTGATGTATTG

Retrieve as FASTA  
cDNA►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
GATTTTCTTC TTATCATTAT CAGTTTCAAT TTCTCGTTAA AATCATGCTT CTCAAACCTC CTGCAACTCT CTTCTTCCAA AACGGTGTCG TTTTCGGAAA CGGTGTAGTT TCGACTCCGC  CGGCGATCGT TTGTGCGGCG GCGAAAGGTG GTTCTCCTCC GAACAGTAGA ACGATTACAG GTGTGGTGTT TGAACCGTTT GAGGAAGTGA AAAAGGAGCT CAGTCTTGTA CCTAATGCTC  CTCAACAGTC TCTTGCTCGT CAAAAGTATG CTGATCAATC TGAAGCTGCT GTTAATGAGC AGATTAATGT TGAGTACAAC GTTTCGTACG TGTACCATGC CATGTATGCA TACTTCGATA  GGGACAATAT TGCTCTCAAG GGTTTAGCCA AATTCTTTAA GGAGTCCAGC GAAGAGGAAA GGGAACATGC CGAAAAGTTT ATGGAATACC AGAACAAACG CGGTGGGAAA GTGAAGTTGC  AATCTATTTT GATGCCTTTA TCCGAGTTTG ATCATGCAGA GAAAGGAGAT GCACTTTATG CAATGGAGCT TGCATTGTCG CTGGAGAAAT TAACAAATGA GAAACTACTA CACATGCAAG  CGGTAGCCAA CAAGAACAAT GATGTCCAAT TAGCTGATTT TGTTGAAAAC AACTTCTTGG GTGAACAGGT CAAGGCGATT AAAAAGATGT CTGAATATGT TGCTCAGTTA AGAAGAGTCG  GCAAAGGACA CGGAGTTTGG CATTTTGATC AGATGCTGCT CGACGAAGTG CTGCCGTTTG ATGTATTGTG AAGGTTTTGA GGTCATTTCG ATATTAGCTG ATCGGCTAGG TGTGTAGTTC 
TTTATTTTCC TACTATGTTT TTTTTTTTTT TTTCAAATGC TTGACCTTAT T 

Retrieve as FASTA