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Entry information : HaDiOx02 (HanXRQChr12g0385531)
Entry ID 13771
Creation 2016-06-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2017-12-07 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-12-07 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: HaDiOx02 (HanXRQChr12g0385531)
Name (synonym) HaDiOx02 (HanXRQChr12g0385531)
Class Alpha-dioxygenase    [Orthogroup: DiOx001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaDiOx02
start..stop		 S start..stop
HaDiOx06 1060 0 1..642 1..642
HaDiOx04 1053 0 1..642 1..642
HaDiOx05 1014 0 1..642 1..628
CclDiOx02 1008 0 9..642 5..638
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '13771' 'join(163454027..163454146,163454671..163454937,163462850..163462999,163463455..163463588,163463859..163464072,163464148..163464293,163464661..163464888,163464956..163465158,163465791..163466034,163466401..163466623)' Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 163454027..163454146 118 N° 2 163454671..163454937 265 N° 3 163462850..163462999 148 N° 4 163463455..163463588 132
N° 5 163463859..163464072 212 N° 6 163464148..163464293 144 N° 7 163464661..163464888 226 N° 8 163464956..163465158 201
N° 9 163465791..163466034 242 N° 10 163466401..163466623 221  
join(163454027..163454146,163454671..163454937,163462850..163462999,163463455..1 63463588,163463859..163464072,163464148..163464293,163464661..163464888,16346495 6..163465158,163465791..163466034,163466401..163466623)


exon

Literature and cross-references HaDiOx02 (HanXRQChr12g0385531)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr12 (163454027..163466623)
Cluster/Prediction ref. HanXRQ:   HanXRQChr12g0385531
Protein sequence: HaDiOx02 (HanXRQChr12g0385531)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   642 (619)
PWM (Da):   %s   73278.18 (71060.6)  
PI (pH):   %s   8.83 (8.99) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-641
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
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Retrieve as FASTA  
Remarks Very long intron 2, prediction confirmed with 1 EST from Helianthus petiolaris.
DNA ►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGATTCCATTCTTATCTTCTACAAAATCTCTTCTTCTTTCACCCGTCAAACACTTCATCCATCACGACTTCCATGTTGTCGTTCAAAAGATGCCACTCATTGATAGGCTTCTTTTCATG
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GATCAGATGTTTAATCAATGAATGGTGTTATATACTTGCTGAATGGTTTATATACTTACTGAATGGTGTTATATACTTGCTGAATGGTGTTATATACTTACTGAATGGTGTTACATACTT
GTTGAATGCTGAATGGTGTTATATACTTGTTGAATGGTGTTATATACTTGTTGAATGGTGTTATATACTTGTTGAATGGTGTTATATACTTACTGAATGGTGTTATATACTTGTTGAATG
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GGTCGCGTCGTTTAAATTTTTTTTTTACGGCTGTGTTTATAATATACACATCTAGTAGTAAAAAAAAATCATGGTGAACGCCCACCCGTGGGGTGTAGTTCTCGCGGTTCTTACAACTCG
AGGTGGTTTTCATTCTAGCGGCTCCCTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAGGACAAAGATCCGTTAGGAACCACCCTTTATTGCGAGAACCGCGAGAACCAGTG
TGAGCGCAAACAGTAATACCTAAAAAAATCTAAAAAACACCCAAAATTTTTTTTTTATTTTTTACTATTTTTTATATAAAAATCGCTACTTTTAGTATAAAAAAAAATTTTAAATATTTA
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AAAACACCACAATTTCAACCATAAAACACACTTAAAACCCACAAAAAACAGAGTGAAGATTACTAAAACACAATAGCCAAACCGTAACAATCTATAAAAACTTCAAATACACCATCATAG
AAATATGAATATAAAACACAACATGATAATCAACATAAAACACACTAATGTTAGTCATTCGATAATCAAAGCCTTAGCATCTAAAACACAACATAAACCCACAAATATGACATTTTAGTA
ATCTTCACTTTGTTATTTTTAGGTTTTGAGTGTGTTTTATGGTTGACATTATGGTGTTTTATGACTTTTTACACTTTGTAGGAAAAGTAGACTTTGTAGCAAACTCACACCCTATATATA
TATATATATATATATATATATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACAGACAGACAGACAGAGAGAATCATTTCAGAACCATAAATATTTACAGAACTCGCAGAACTCCTAATAAACAATCT
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TGTAATTAGTTTTTTTTACATATATGTAATTAGTTATGACACATATATATAATTTTGGCAATTAAACATATGTAAACTACTTTTAACATGTATGTAATCAAAGAAATACATATAATAGAT
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TTTGTATTTAGGATATTTTTATCATCTATTATATGTATTTCTTTGATTACATACATGTTAAAAGTAGTTTACATATGTTTAATTGCCAAAATTATATATATATGTGTCATAACTAATTAC
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ATAATTTTTTTATCCCTTTTGCTTTCAATGTATTTTCTTAGGCCCCTCTCTAAATATATTCCTCTAATGTTGGAAGCATTTAGGTTTTTGTTAATAAGGAATTTCTTTAATTCTTTTATT
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TGAGCGGATTTTGTCAGATTTAGTTAAAATCCGTTAGAAACAAGGATACTCCCTTGAACCACCTACAACGCTCTTTGAAACCCTAAACCACCTAAACGACCAAAAATTAAAATTCATGCA
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GGATGGGAGCGCGATATATGGAAGCAACTCGACTAAGTTGAAGAAACTGAGAACATTCAAAGATGGGAAACTAAAGATCGGAGAAGACGGCCTCCTCCAACATGACAATGATGGAGTTCC
ATTATCAGGCGATGTTCGTAATGGTTGGATTGGTCTATCAACCTTACAAGCTCTCTTTATGCTAGAGCACAATAAAATTTGTGATGCGTTGAAGAGGTTATACCTATTCAAACAATTTAT
TTCAAACTCATTAGTCATTCTCCTTTGAAAATTAACTAATCATTTTATCAGAAAGAGGATCATACTTTGAGCGATGAAGATCTATATCGTCATGCAAGACTAGTAACTTCGGCTGTCATT
GCCAAGATTCACACCATCGATTGGACCGTTGAGCTTCTCAAAACAGACTTGCTTCATGTAGCAATGAGAGCTAACTGTGGTAAATTAGTTGAAACTACATTTTTTTATATTTTCAGGTTT
TTTTTAAATATAAGCGTTTCAAGGAGATTTTTGTACTTGTCTTGGTTTCTAGCGAGTCTGCTAGTCAATGGAGCAGACACAATTGGAGTTCGCTAGTCATAGGAGTAGACTCATTTCGTT
TAGTTTTGTCATGTCAGCGTATTCAAGTAATACGCTTGTCACGTTAACCAGAACACTTCCAAAATTGTGAAACTAGAACACTTCCAAAACCTTCTAGAAGCACTTATCATTTTGCTAAAA
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TTACCTGATCAACTTCTTATTAGGGATGTCAATTCAACACCAGGCCCTAACAAGTCTCTAAATGTGACCCAAAAAAGTAAGACCTTTCACCCTCTTATTTTATAAAACAATATTCAAGCA
TTGTGTTCATGATAGATTTACAGGGTTGATATGATAAATTTGATTGGGAAGAAAGGTGAGAACGAATTATCGAAAATTGGATCAAGAACACTAATGGTATCAATGGGACATCAAGCATGT
GGGGCACTTGAACTATGGAACTATCCGGCGTGGCTTAGGTTTGTGGTGCCACAAAATGTTGATGGCACTGATCGTCCTGATCAGGTGGACTTACCCTCACTTGAGAGAGTAAGTATAGCT
ATTTCTCTCACTAAACTTGATCATATAAATGAGTCTTATGGCTCTATATATGTCTTATTCCATTTGATCAACTCTAATATAATTTGTTTATCATTTGAATGAAAGCTATAAAAGATGACA
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AATCTTTATCATCATGGCATCAAGAGGTACAACTCCAACAATAGCAAAACTGAAATATATAATTACAAACATAAACAAACTAAACCTATGCCACCCCAAAACTCAAACGAACGATAGACG
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CCTTAGCATGACCCCTAATTAATATAACAAGCCCTAATCTTCAAATGGTCATTCAGTGCAACCTCCAACAACATTTGTTTGAAAACGGTTTAAGATTAGATTGTTTGGGACTGTGTATAG
CATGCCTCCTAATTAATATATTGATTTCTTAGGAGACTCGAAGCAGATAGATTTTTCACAAGTGACTTCACCGAAGAAGTGTACACAAAAAGGGGGTTGGAATGGGTGAACACAACCGAG
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TTCCGTGTGCCTTGA

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGATTCCATTCTTATCTTCTACAAAATCTCTTCTTCTTTCACCCGTCAAACACTTCATCCATCACGACTTCCATGTTGTCGTTCAAAAGATGCCACTCATTGATAGGCTTCTTTTCATG
ATTATACACGGTGTTGATAAGTTAGGGATCCGGTGGTACCGTCTGCCAGTGTTCTTGGGGCTGGTATACCTAGCCATACGGAGGTATCTTCATGACGAGTACAATTTGCTCAATGTTGGG
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ATGCCACCGGTTGATCAAAAAGAAAAGTTACTACAACCAGATCCTATGGTGGTGGCAACAAAGCTCTTGACACGCAGAGAATTTAAAGGTACTGGAAAGCAGTTCAACATGATTGCTGCT
TCATGGATTCAATTCATGATTCATGATTGGATCGATCATCTAGAAGAAACCAACCAGATTGAGCTGAAGGCACCTGCAGAAGTAGCTAGTCAGTGCCCTCTTAAATCCTTTAAATTTTAC
AAGACTAAAGAAGTCGATACAGGATTTTATGGTATCAATAAAGGTCATATTAACATCAGAACTCCTTGGTGGGATGGGAGCGCGATATATGGAAGCAACTCGACTAAGTTGAAGAAACTG
AGAACATTCAAAGATGGGAAACTAAAGATCGGAGAAGACGGCCTCCTCCAACATGACAATGATGGAGTTCCATTATCAGGCGATGTTCGTAATGGTTGGATTGGTCTATCAACCTTACAA
GCTCTCTTTATGCTAGAGCACAATAAAATTTGTGATGCGTTGAAGAAAGAGGATCATACTTTGAGCGATGAAGATCTATATCGTCATGCAAGACTAGTAACTTCGGCTGTCATTGCCAAG
ATTCACACCATCGATTGGACCGTTGAGCTTCTCAAAACAGACTTGCTTCATGTAGCAATGAGAGCTAACTGGTATGGGCTATTGGGTAAAAAATTCAAGGACAAATTTGGGCATGTTGGA
GGAGCCATTTTAGGAGGTATTATAGGGTTAAAGAAACCCAATAATCATGGGGTACCCTACTCACTAACCGAAGAGTTTGTGAGTGTTTACAGAATGCACTCTCTCTTACCTGATCAACTT
CTTATTAGGGATGTCAATTCAACACCAGGCCCTAACAAGTCTCTAAATGTGACCCAAAAGGTTGATATGATAAATTTGATTGGGAAGAAAGGTGAGAACGAATTATCGAAAATTGGATCA
AGAACACTAATGGTATCAATGGGACATCAAGCATGTGGGGCACTTGAACTATGGAACTATCCGGCGTGGCTTAGGTTTGTGGTGCCACAAAATGTTGATGGCACTGATCGTCCTGATCAG
GTGGACTTACCCTCACTTGAGATTTACAGGGATAGGGAAAGGAATGTAGCAAGGTATAATGAGTTTCGTAGATCACTTTTCTTGATCCCAATCTCAAAGTGGCAAGATCTAACAGACGAT
AAAAAAGCAATTGACACATTGCGTGAAGTGTATGGTGACGATGTGGAACAACTCGATCTTTTGGTGGGAATGGCAGCTGAGAAAAAGATCAAAGGTTTCGCCATTAGCGAGACGGCTTTT
GTAATCTTTATCATCATGGCATCAAGGAGACTCGAAGCAGATAGATTTTTCACAAGTGACTTCACCGAAGAAGTGTACACAAAAAGGGGGTTGGAATGGGTGAACACAACCGAGAGTTTA
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