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Entry information : HaDiOx05 (HanXRQChr14g0450041)
Entry ID 13774
Creation 2016-06-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-06-01 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaDiOx05 (HanXRQChr14g0450041)
Name (synonym) HaDiOx05 (HanXRQChr14g0450041)
Class Alpha-dioxygenase    [Orthogroup: DiOx001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaDiOx05
start..stop		 S start..stop
HaDiOx06 1256 0 1..629 1..643
HaDiOx04 1245 0 1..629 1..643
HaDiOx07 1076 0 1..629 1..626
HaDiOx02 980 0 15..628 15..642
Gene structure Fichier Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 140455826..140455945 118 N° 2 140456034..140456300 265 N° 3 140457840..140457989 148 N° 4 140458090..140458220 129
N° 5 140458374..140458587 212 N° 6 140458673..140458795 121 N° 7 140458854..140459065 210 N° 8 140459181..140459383 201
N° 9 140459466..140459709 242 N° 10 140459807..140460032 224  
join(140455826..140455945,140456034..140456300,140457840..140457989,140458090..1 40458220,140458374..140458587,140458673..140458795,140458854..140459065,14045918 1..140459383,140459466..140459709,140459807..140460032)


exon

Literature and cross-references HaDiOx05 (HanXRQChr14g0450041)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr14 (140455826..140460032)
Cluster/Prediction ref. HanXRQ:   HanXRQChr14g0450041
Protein sequence: HaDiOx05 (HanXRQChr14g0450041)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   629
PWM (Da):   %s   71760.8 Transmb domain:   %s   i5-27o
PI (pH):   %s   6.37
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MKTFMSFAKQQLLSPFKHFIHADFHELFERMTLIDKFLFLIIHGVDKSGIGWHRFPVFLGLTYLAIRRILHDKYNLLSVGKTRVGVRFDTDDVDFRTTNGKFNDPFNESAGSEGTFIGRN
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NSTSAFSVWDAAPEPHNPVPIYFRLPK

Retrieve as FASTA  
Remarks Part of the sequence is missing but not detected in the DNA: pseudogene or mising DNA?
DNA ►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAAAACATTCATGTCTTTTGCAAAACAACAACTTCTTTCACCCTTCAAACACTTCATCCATGCCGACTTTCATGAACTCTTTGAAAGGATGACACTCATCGACAAGTTTCTCTTCTTG
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AATTTATTTCCGTCTCCCCAAGTGA

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAAAACATTCATGTCTTTTGCAAAACAACAACTTCTTTCACCCTTCAAACACTTCATCCATGCCGACTTTCATGAACTCTTTGAAAGGATGACACTCATCGACAAGTTTCTCTTCTTG
ATCATTCATGGTGTCGATAAATCCGGGATAGGATGGCACCGTTTTCCTGTGTTCTTAGGTCTTACTTACTTGGCCATTCGCCGGATTCTTCATGATAAGTATAATCTGCTCAGTGTTGGG
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CCAAAGATTACCAAGGAGATTGACATGATCAATTTGATTGGAAAGAATGGAGAAAAGGAATTATCAAAAATTGGATTTACCACACAAATGGTATCCATGGGACATCAAGCCTGTGGGGCG
CTTGAGCTATTTAACTATCCAGTCTGGCTTAGGGACATTGTGCCTCAAAACGTGGATGGGACTGATCGCCCCGACCACATTGATTTAGCATCACTTGAGATTTATAGGGATAGGGAGAGG
AAAGTAGCAAGATACAATGAGTTCCGTAGATCACTTTTCTTGATCCCAATCTCCAAATGGGAAGATCTAACAGAGGACAAAGAAGCTATTGCCACATTGCGTGAAGTGTACGGTGATGAT
GTCGAAGAGCTTGATCTGTTGATAGGAATGATGGCCGAGAAAAAGATCAATGGGTTCGCCATTAGCGAAACAGCTTTTGTAATCTTTCTAGCCATGGCCTCAAGGCGACTCCAAGCGGAT
AGATTCTTCACTAGCGATTTTAACGAAGATGTGTACACAAAAAAAGGGTTCGAATGGGTGAACACAACAGAGAGTCTGAAAGATGTGTTGGACCGACACTATCCAGAGATGACCGATAGA
TGGATGAACTCAACAAGTGCTTTCTCGGTGTGGGATGCTGCCCCTGAGCCTCATAATCCCGTACCAATTTATTTCCGTCTCCCCAAGTGA

Retrieve as FASTA  
cDNA►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
TCAATACCCA AAATGAAAAC ATTCATGTCT TTTGCAAAAC AACAACTTCT TTCACCCTTC AAACACTTCA TCCATGCCGA CTTTCATGAA CTCTTTGAAA GGATGACACT CATCGACAAG  TTTCTCTTCT TGATCATTCA TGGTGTCGAT AAATCCGGGA TAGGATGGCA CCGTTTTCCT GTGTTCTTAG GTCTTACTTA CTTGGCCATT CGCCGGATTC TTCATGATAA GTATAATCTG  CTCAGTGTTG GGAAAACTCG GGTTGGGGTT CGGTTTGATA CCGATGACGT TGATTTCAGG ACCACCAATG GAAAGTTTAA CGATCCTTTC AATGAAAGTG CCGGCAGTGA AGGAACTTTC  ATTGGCCGTA ACATGCCCCC TGTTGATCAG AAAGAGAAGC TATTGAAGCC GGATCCGATG TTGGTAGCAA CAAAGCTTCT AGCACGTAAA CAACTTATAG ACACCGGAAA GCAGTTCAAC  ATGATTGCTG CTTCATGGAT TCAGTTCATG ATTCATGATT GGATTGATCA CCTTGAAGAA ACAAATCAGA TTGAGCTTAG GGCGCCAGCA GAAGTAGCAA GTGAATGCCC TCTCAAATCC  TTCAAGTTCT TCGAGACTAA AGAAATCGAT ACTGGTCTTT CTGACATTAA GAAAGGTCAT CGTAACATCA GAACTCCTTG GGATGGGAGT GTGGTATATG GAAGCAACTC AAAGGCTGGA  CGTCACGTAA GAACGTTCAT TGACGGAAAG CTCAAGATTG CAGAAGATGG TCTCCTTCAA CATGACAACG ATGGATTGCC TATAGCGGGA GACGTTCGTA ATAGTTGGAT TGGGGTGTCA  ACTTTGCAAG CCCTCTTTAT CCACGAGCAC AATGCGGTTT GTGACGCCTT AAAGAAAGAA TATCCTTATT TGGACGATGA AGATCTGTAT CGCCACGCAA GACTAGTAAC TTCTGCGGTG  ATCGCAAAGG TGCACACCAT TGATTGGACC ATTGAGCTTC TCAAAACTGA CATGCTTTCT TATGTGTTAA TTACATTTGG GCATGTTGGA GGATCTATTT TGGGAGGACT AGTAGGGCTA  AAGAAACCCG AAAACCACGG GGTACCCTAC TCGCTAACAG AAGAGTTTAC AAGTGTTTAT CGAATGCATT CTCTCTTACC TGATCAACTT GTCATAAGGG ATGTTAATTC CACACCAGGA  CCTAACAAGT CTCCAAAGAT TACCAAGGAG ATTGACATGA TCAATTTGAT TGGAAAGAAT GGAGAAAAGG AATTATCAAA AATTGGATTT ACCACACAAA TGGTATCCAT GGGACATCAA  GCCTGTGGGG CGCTTGAGCT ATTTAACTAT CCAGTCTGGC TTAGGGACAT TGTGCCTCAA AACGTGGATG GGACTGATCG CCCCGACCAC ATTGATTTAG CATCACTTGA GATTTATAGG  GATAGGGAGA GGAAAGTAGC AAGATACAAT GAGTTCCGTA GATCACTTTT CTTGATCCCA ATCTCCAAAT GGGAAGATCT AACAGAGGAC AAAGAAGCTA TTGCCACATT GCGTGAAGTG  TACGGTGATG ATGTCGAAGA GCTTGATCTG TTGATAGGAA TGATGGCCGA GAAAAAGATC AATGGGTTCG CCATTAGCGA AACAGCTTTT GTAATCTTTC TAGCCATGGC CTCAAGGCGA  CTCCAAGCGG ATAGATTCTT CACTAGCGAT TTTAACGAAG ATGTGTACAC AAAAAAAGGG TTCGAATGGG TGAACACAAC AGAGAGTCTG AAAGATGTGT TGGACCGACA CTATCCAGAG  ATGACCGATA GATGGATGAA CTCAACAAGT GCTTTCTCGG TGTGGGATGC TGCCCCTGAG CCTCATAATC CCGTACCAAT TTATTTCCGT CTCCCCAAGT GATAATGCTT TGATGGAAAA  GAATATGTTA CATGTTTGGT ATACATATAT GTATAGGTAT TGCATCTGTT GGGGTGCCTT ATTCAATATT TATTTGCTTA GTATATATGC GTTATTTAAT TTTCTTATGG AATAAAAGAA 
TAAGTGATGT ATATTGTATG TATCTTAATG AAATAAAAGG CAATTGGATT ATTATGTTGT TAACGAGAGG 

Retrieve as FASTA