Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein) |
Length (aa): |
643 |
PWM (Da): |
73342.6 |
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PI (pH): |
6.67 |
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Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MKTFMSFAKQQLLSPVKHFIHADFHELFERMTLIDKFLFLIIHGVDKSGIGWHRFPVFLGLTYLAIRRSLHDKYNLLNVGKTRVGVRFDTDDVDFRTANGKFNDPFNESAGSEGTFIGRN MPPVDQKEKLLKPDPMLVATKLLARKQLIDTGKQFNMIAASWIQFMIHDWIDHLEETNQIELRAPAEVASECPLKSFKFFETKEIDTGLSDIKKGHRNIRTPWWDGSVVYGSNSKAGRHV RTFIDGKLKIADDGLLQHDNDGLPIAGDVRNSWIGVSTLQALFIHEHNAVCDALKEYPYLDDEDLYRHARLVTSAVIAKVHTIDWTIELLKTDMLVAGMRANWYGLLGKRFKDTFGHVGG SILGGLVGLKKPENHGVPYSLTEEFTSVYRMHSLLPDQLVIRDVNSTPGPNKSPKITKEIDMINLIGKNGEKELSKIGFTTQMVSMGHQACGALELFNYPVWLRDIVPQNVDGTDRPDHI DLASLIYRDRERKVARYNEFRRSLFLIPISKWEDLTEDKEAIATLREVYGDDVEELDLLVGLMAEKKINGFAISETSFIIFLAMASRRLQADRFFTSDFNENVYTKKGFEWVNTTESLKD VLDRHYPEMSDRWMNSTSAFSVWDATPEPHNPVPIYFRLPK |
Retrieve as FASTA
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Remarks |
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DNA ►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGAAAACATTCATGTCTTTTGCAAAACAACAACTTCTTTCACCCGTCAAACACTTCATCCATGCCGACTTTCATGAACTCTTTGAAAGGATGACACTCATCGACAAGTTTCTCTTCTTG TGGTACGTTAATGCTGCATGCATGTAATTAAACACTTAATTAAACTTTTAATTTACTATAGCTCATTCTAAGATTATAATACTTTGGCAGATCATTCATGGTGTCGATAAATCCGGGATA GGATGGCACCGTTTTCCTGTGTTCTTAGGTCTTACTTACTTGGCCATTCGCCGGAGTCTTCATGATAAGTATAATCTGCTCAATGTTGGGAAAACTCGGGTAGGGGTTCGGTTTGATACC GATGACGTTGATTTCAGGACCGCCAATGGAAAGTTTAACGATCCTTTCAATGAAAGTGCCGGCAGTGAAGGAACTTTCATTGGCCGTAACATGCCCCCCGTTGATCAGAAAGAGAAGAGG TATATTAATCGATGAACTTCAAATTAACACATATTGACATATATATCACTAGCTAGTTATTTTTTACAACGTTGACTGGTTAATTAGGGTTTCTTTTAGGTTTTGATTGACAAAGAGCAC AAGAAAAATATTAGTATATCCTTTTACTATTTTATTTCAAGTTAGTCTTAATAGAGACATGATAGAAAAAGCAACCACGACGTCTTTGCTTTAATTTTCAAGCTTTTTAGACACGAACTT TTCCCAAAGTTTTATTTGTAAGATGTTTAGGATGATATTTAAAAAGATTATACATGTTTTTTTTTTAAATCCTAGCACAAATCTATACATATATCCAGTGGCGGAACTAGAAAATCTTCA TAGGGGTAACGTCTTAAAAGAAAAGGGTAACGAAATCGAAAAAAGGTTAAAAAAATGTCAATTTTTTCCAAAATTTACACTACCGCCGGAGCGCCAAGGGGTAGCGGAGGCTACCCCTTC TCATATGGTACATCCGCCCCTGCATATATCCTTAAATTTACGTAACATGTTTTGCAAAATAAATTAGTGATAGTTTGATAGTCATTTGGGTGATTTCCGTGTATTTATGTAAGCATTATT AGGTCTACATGAGGGGAGTATATTAGAGATCATCAATTGTCTCAACCAAACTTAATATTTAGAGCTTTGTATATCTATATATTTTAGGCTTTTTTCATACTAATTAATCCAACTTCATAA TTAGAGGCTTAGAGCTTTGTATATCGATATTCTTACTAATTAATTCTAAATATAAATCTCAAGGTCAGATAAGCTTGACACACGTGATTATCTAAAATTTTAATAATCATCAAGAGAATT CTGTCCATCTTTAAATTAGATGTTTATTACTCTTGTAGATAATACAAAAGTCATATATAAACATACCGATCGATTCACTGTCATTGTTCATGATTTGTTATTCTTTCTTTCGTGTTTTCA TTTGTAATGTAGTTATTGGCAGTACTAGATATTCTAACTGCCACTCCGATATATCCCATTAAAACATCACGTAAGGTCCACACCAACATTTATAAAATAAGATTAAAATTTTTTAGTCTA AATACTTTCCTTTTTATATAATATGTGACAATGACCTGACTTCCTTTCGTTAGATGGTAATAGCAATTTTATCCGACATAATTATCAATGAGATTAAAGTGAGATATGATATACACGAAA CCCACTTTTTAACAAGAATTTTTTACACATAAATATCATCCAACTTTTCACTTACAAAGATTTAAATTCATTTTCTATGAGGAAAAAAAAACACCATCCTACTAGACCATTAGATCATGA GTACATATCCAGTTTATTAATCACACGTTTGTCTAATCAGTAAAAATTAAACAAGCAGGTCTCGAAGATTTCATTCTTATTATACCTTATAAATTTTATAATCATTTTTATACAAGTGTC ATCCTTTGCTTGTGTTCTTGTCTAAAGCTGATATTACTATCAAATTTAAAGCAAGTAAATAACTTCTAGATAAAAATGCAACATGCAAAAAAGTTCGTTCATCTAATAGTAGTTATTCAA TGCAACTCACAATAAACCTAAGAAATTTGAAATGGTAGTCGAGCTTTGAATGTAGGGTGAGACAATTGTACTAAAACGTATTTCTGTGTGCAGCTGTTGAAGCCGGATCCGATGTTGGTA GCAACAAAGCTTCTAGCACGTAAACAACTTATAGACACCGGAAAGCAGTTCAACATGATTGCTGCTTCATGGATTCAGTTCATGATTCATGATTGGATTGATCACCTTGAAGAAACAAAT CAGAGGTTCGATTAATCAAGATATTATATAATCTCGTGACATAAGAAGGATGAACTTTTGTACTAACACATAATATGTTACCATGGATTATTATGATAACAGATTGAGCTTAGGGCGCCA GCAGAAGTAGCAAGTGAATGCCCTCTCAAATCCTTCAAGTTCTTCGAGACTAAAGAAATCGATACTGGTCTTTCTGACATTAAGAAAGGTCATCGTAACATCAGAACTCCTTGGTGTGGT ATGATTTCTATAATTTAATTAATCATATTTTATAACCTCGCATTGTTAAAAACTCTCAAAGTTATAATAAAAGAATTGAGAAAGACAATCATTGTATATACAAATAAATAGTACGAAGTT AAGAGTGGGATATATATGATATGTACAGGGATGGGAGTGTGGTATATGGAAGCAACTCAAAGGCTGGACGTCACGTAAGAACGTTCATTGACGGAAAGCTCAAGATTGCAGATGATGGTC TCCTTCAACATGACAACGATGGATTGCCTATAGCGGGAGACGTTCGTAATAGTTGGATTGGGGTGTCAACTTTGCAAGCCCTCTTTATCCACGAGCACAATGCGGTTTGTGACGCCTTAA AGAGGTATATGTGTATATGATAAACATGTAGCTAGTTATTTTTAGTTTATTAGCTAGCTAGTGGCTTACAATATACTTATGTCAATCAGAAAGAATATCCTTATTTGGACGATGAAGATC TGTATCGCCACGCAAGACTAGTAACTTCTGCGGTGATCGCAAAGGTGCACACCATTGATTGGACCATTGAGCTTCTCAAAACTGACATGCTTGTTGCTGGAATGAGAGCTAACTGTGGTA ATTACTTACTTTAAAATAAATAATTAATCTAGTCTTATGTGTTAATTACATTCATGAAATGAAGCATATTTACTAATATTTTGTTGAAATATGATATATTAAGGTATGGGCTATTGGGGA AAAGATTCAAGGACACATTTGGGCATGTTGGAGGATCTATTTTGGGAGGACTAGTAGGGCTAAAGAAACCCGAAAACCACGGGGTACCCTACTCGCTAACAGAAGAGTTTACAAGTGTTT ATCGAATGCATTCTCTCTTACCTGATCAACTTGTCATAAGGGATGTTAATTCCACACCAGGACCTAACAAGTCTCCAAAGATTACCAAGGAGAGTATGTAAATCGCACCTAAGTTATTTT CTCTTAATTTGAATAACAATTTACTTCTTTGTATCTTCATGTAATAACCAACAAATAAGTATGCTCATAGTTATTAATTTATATTCAGGATTGACATGATCAATTTGATTGGAAAGAATG GAGAAAAGGAATTATCAAAAATTGGATTTACCACACAAATGGTATCCATGGGACATCAAGCGTGTGGGGCGCTTGAGCTATTCAACTATCCAGTCTGGCTTAGGGACATTGTGCCTCAAA ACGTGGACGGGACAGATCGCCCTGACCACATTGACTTAGCATCACTCGACACAGTACGATACTATTTTCTTTCACCAAAGAATGTGTACATACATGATTTATTTTGATCCTAACATATGA TCATGATGCGTGCAGTTTATAGGGATAGGGAGAGGAAAGTAGCAAGATACAATGAGTTCCGTAGATCACTTTTCTTGATCCCAATTTCCAAATGGGAAGATCTAACGGAGGACAAAGAAG CTATTGCCACATTGCGTGAAGTGTACGGTGATGATGTCGAAGAGCTTGATTTGTTAGTAGGATTGATGGCTGAGAAAAAGATCAATGGGTTCGCCATTAGCGAAACCTCTTTTATAATCT TTCTAGCCATGGCCTCAAGAGGTATATATACAAATCACTACGATAAAGAGAATGAAAACTGTAAATTAACAAACTAATGGATCAATTATATATACCAACTAAATATATTGGGTCATGTGT GCAGGCGACTCCAAGCGGATAGATTCTTCACTAGCGATTTCAACGAAAATGTGTACACGAAAAAAGGGTTCGAATGGGTAAACACAACAGAGAGTCTGAAAGATGTGTTGGACCGACACT ATCCAGAGATGAGCGATAGATGGATGAACTCAACGAGTGCTTTTTCGGTGTGGGATGCTACCCCAGAACCTCATAATCCCGTACCAATTTATTTTCGTCTCCCCAAGTGA |
Retrieve as FASTA
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CDS►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGAAAACATTCATGTCTTTTGCAAAACAACAACTTCTTTCACCCGTCAAACACTTCATCCATGCCGACTTTCATGAACTCTTTGAAAGGATGACACTCATCGACAAGTTTCTCTTCTTG ATCATTCATGGTGTCGATAAATCCGGGATAGGATGGCACCGTTTTCCTGTGTTCTTAGGTCTTACTTACTTGGCCATTCGCCGGAGTCTTCATGATAAGTATAATCTGCTCAATGTTGGG AAAACTCGGGTAGGGGTTCGGTTTGATACCGATGACGTTGATTTCAGGACCGCCAATGGAAAGTTTAACGATCCTTTCAATGAAAGTGCCGGCAGTGAAGGAACTTTCATTGGCCGTAAC ATGCCCCCCGTTGATCAGAAAGAGAAGCTGTTGAAGCCGGATCCGATGTTGGTAGCAACAAAGCTTCTAGCACGTAAACAACTTATAGACACCGGAAAGCAGTTCAACATGATTGCTGCT TCATGGATTCAGTTCATGATTCATGATTGGATTGATCACCTTGAAGAAACAAATCAGATTGAGCTTAGGGCGCCAGCAGAAGTAGCAAGTGAATGCCCTCTCAAATCCTTCAAGTTCTTC GAGACTAAAGAAATCGATACTGGTCTTTCTGACATTAAGAAAGGTCATCGTAACATCAGAACTCCTTGGTGGGATGGGAGTGTGGTATATGGAAGCAACTCAAAGGCTGGACGTCACGTA AGAACGTTCATTGACGGAAAGCTCAAGATTGCAGATGATGGTCTCCTTCAACATGACAACGATGGATTGCCTATAGCGGGAGACGTTCGTAATAGTTGGATTGGGGTGTCAACTTTGCAA GCCCTCTTTATCCACGAGCACAATGCGGTTTGTGACGCCTTAAAGAAAGAATATCCTTATTTGGACGATGAAGATCTGTATCGCCACGCAAGACTAGTAACTTCTGCGGTGATCGCAAAG GTGCACACCATTGATTGGACCATTGAGCTTCTCAAAACTGACATGCTTGTTGCTGGAATGAGAGCTAACTGGTATGGGCTATTGGGGAAAAGATTCAAGGACACATTTGGGCATGTTGGA GGATCTATTTTGGGAGGACTAGTAGGGCTAAAGAAACCCGAAAACCACGGGGTACCCTACTCGCTAACAGAAGAGTTTACAAGTGTTTATCGAATGCATTCTCTCTTACCTGATCAACTT GTCATAAGGGATGTTAATTCCACACCAGGACCTAACAAGTCTCCAAAGATTACCAAGGAGATTGACATGATCAATTTGATTGGAAAGAATGGAGAAAAGGAATTATCAAAAATTGGATTT ACCACACAAATGGTATCCATGGGACATCAAGCGTGTGGGGCGCTTGAGCTATTCAACTATCCAGTCTGGCTTAGGGACATTGTGCCTCAAAACGTGGACGGGACAGATCGCCCTGACCAC ATTGACTTAGCATCACTCGACATTTATAGGGATAGGGAGAGGAAAGTAGCAAGATACAATGAGTTCCGTAGATCACTTTTCTTGATCCCAATTTCCAAATGGGAAGATCTAACGGAGGAC AAAGAAGCTATTGCCACATTGCGTGAAGTGTACGGTGATGATGTCGAAGAGCTTGATTTGTTAGTAGGATTGATGGCTGAGAAAAAGATCAATGGGTTCGCCATTAGCGAAACCTCTTTT ATAATCTTTCTAGCCATGGCCTCAAGGCGACTCCAAGCGGATAGATTCTTCACTAGCGATTTCAACGAAAATGTGTACACGAAAAAAGGGTTCGAATGGGTAAACACAACAGAGAGTCTG AAAGATGTGTTGGACCGACACTATCCAGAGATGAGCGATAGATGGATGAACTCAACGAGTGCTTTTTCGGTGTGGGATGCTACCCCAGAACCTCATAATCCCGTACCAATTTATTTTCGT CTCCCCAAGTGA |
Retrieve as FASTA
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cDNA►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
GTTATATATA GGCCATCTTG GCATTGTAAA CCTCACAAAA ACATCTCACT TTGCCCATCA AACACTTCAT CAATACCCAA AATGAAAACA TTCATGTCTT TTGCAAAACA ACAACTTCTT
TCACCCGTCA AACACTTCAT CCATGCCGAC TTTCATGAAC TCTTTGAAAG GATGACACTC ATCGACAAGT TTCTCTTCTT GATCATTCAT GGTGTCGATA AATCCGGGAT AGGATGGCAC
CGTTTTCCTG TGTTCTTAGG TCTTACTTAC TTGGCCATTC GCCGGAGTCT TCATGATAAG TATAATCTGC TCAATGTTGG GAAAACTCGG GTAGGGGTTC GGTTTGATAC CGATGACGTT
GATTTCAGGA CCGCCAATGG AAAGTTTAAC GATCCTTTCA ATGAAAGTGC CGGCAGTGAA GGAACTTTCA TTGGCCGTAA CATGCCCCCC GTTGATCAGA AAGAGAAGCT GTTGAAGCCG
GATCCGATGT TGGTAGCAAC AAAGCTTCTA GCACGTAAAC AACTTATAGA CACCGGAAAG CAGTTCAACA TGATTGCTGC TTCATGGATT CAGTTCATGA TTCATGATTG GATTGATCAC
CTTGAAGAAA CAAATCAGAT TGAGCTTAGG GCGCCAGCAG AAGTAGCAAG TGAATGCCCT CTCAAATCCT TCAAGTTCTT CGAGACTAAA GAAATCGATA CTGGTCTTTC TGACATTAAG
AAAGGTCATC GTAACATCAG AACTCCTTGG TGGGATGGGA GTGTGGTATA TGGAAGCAAC TCAAAGGCTG GACGTCACGT AAGAACGTTC ATTGACGGAA AGCTCAAGAT TGCAGATGAT
GGTCTCCTTC AACATGACAA CGATGGATTG CCTATAGCGG GAGACGTTCG TAATAGTTGG ATTGGGGTGT CAACTTTGCA AGCCCTCTTT ATCCACGAGC ACAATGCGGT TTGTGACGCC
TTAAAGAAAG AATATCCTTA TTTGGACGAT GAAGATCTGT ATCGCCACGC AAGACTAGTA ACTTCTGCGG TGATCGCAAA GGTGCACACC ATTGATTGGA CCATTGAGCT TCTCAAAACT
GACATGCTTG TTGCTGGAAT GAGAGCTAAC TGGTATGGGC TATTGGGGAA AAGATTCAAG GACACATTTG GGCATGTTGG AGGATCTATT TTGGGAGGAC TAGTAGGGCT AAAGAAACCC
GAAAACCACG GGGTACCCTA CTCGCTAACA GAAGAGTTTA CAAGTGTTTA TCGAATGCAT TCTCTCTTAC CTGATCAACT TGTCATAAGG GATGTTAATT CCACACCAGG ACCTAACAAG
TCTCCAAAGA TTACCAAGGA GATTGACATG ATCAATTTGA TTGGAAAGAA TGGAGAAAAG GAATTATCAA AAATTGGATT TACCACACAA ATGGTATCCA TGGGACATCA AGCGTGTGGG
GCGCTTGAGC TATTCAACTA TCCAGTCTGG CTTAGGGACA TTGTGCCTCA AAACGTGGAC GGGACAGATC GCCCTGACCA CATTGACTTA GCATCACTCG ACATTTATAG GGATAGGGAG
AGGAAAGTAG CAAGATACAA TGAGTTCCGT AGATCACTTT TCTTGATCCC AATTTCCAAA TGGGAAGATC TAACGGAGGA CAAAGAAGCT ATTGCCACAT TGCGTGAAGT GTACGGTGAT
GATGTCGAAG AGCTTGATTT GTTAGTAGGA TTGATGGCTG AGAAAAAGAT CAATGGGTTC GCCATTAGCG AAACCTCTTT TATAATCTTT CTAGCCATGG CCTCAAGGCG ACTCCAAGCG
GATAGATTCT TCACTAGCGA TTTCAACGAA AATGTGTACA CGAAAAAAGG GTTCGAATGG GTAAACACAA CAGAGAGTCT GAAAGATGTG TTGGACCGAC ACTATCCAGA GATGAGCGAT
AGATGGATGA ACTCAACGAG TGCTTTTTCG GTGTGGGATG CTACCCCAGA ACCTCATAAT CCCGTACCAA TTTATTTTCG TCTCCCCAAG TGATAATGCT TTGATGGAAA AAAATATGTT
ACATGTTTGG TATATATGTA TAGGTATTGC ATCTGTTGGG GGTGCCTTAT TTAATCTATT TGCTTAGTAT GCGTTATTTA ATTTTCTTAT AGAATAAATG AATAATATAT TATATGTATC
TTGATTAAAT AAAAGG
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