Entry information : BstrAPx02 (Bostr.22252s0106)
Entry ID 14972
Creation 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: BstrAPx02 (Bostr.22252s0106)
Name (synonym) BstrAPx02 (Bostr.22252s0106)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx2001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Boechera
Organism Boechera stricta    [TaxId: 72658 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value BstrAPx02
start..stop
S start..stop
CagraAPx02 498 0 1..252 1..252
AhalAPx07 495 0 1..252 1..252
AlyAPx02 491 3.63e-179 1..251 1..251
AtAPx02 489 1.72e-178 1..251 1..251
Literature and cross-references BstrAPx02 (Bostr.22252s0106)
Protein sequence: BstrAPx02 (Bostr.22252s0106)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   251 (265)
PWM (Da):   %s   28067.52 (24000.0)  
PI (pH):   %s   6.68 (6.50) Peptide Signal:   %s   cut: 0 range:Ymax-264
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MVKKSYPEVK EEYKKAVQKC KRKLRGLIAE KHCAPIVLRL AWHSAGTFDV KTKTGGPFGT IRHPQELAHE ANNGLDIAVR LLDPIKDLFP ILSYADFYQL AGVVAVEITG GPEIPFHPGR  QDKVEPPPEG RLPQATKGVD HLRDVFGRMG LNDKDIVALS GGHTLGRCHK ERSGFEGTWT QNPLIFDNSY FKEILSGDKE GLLQLPTDKA LLEDPHFRPL VERYAADEDA FFEDYAEAHL 
KLSELGFADK E* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GCTTCATATG ATCATCAGCC AATTTTATAA ATTGATTCGC AAACTAAAGT AAACGACAGC AACTAACAGA CACTTTCTTC AGGTTTTTAT CTTTCGATCA ATCACTGTAT CATCGTAGTA  GAGTATGTTC TTGTAACCTT ATTGATCCAT AGGTTATCAA ATTTCGAATT CTGGTGTGGG TTTTAAAAGT CTTTCACGAT TTGCAGAGAA GAAGCGAATT TGAAAAATGG TGAAGAAGAG  TTACCCGGAA GTGAAAGAAG AGTACAAGAA AGCTGTTCAG AAATGCAAGA GGAAGCTCCG TGGTCTCATT GCCGAGAAGC ATTGTGCTCC CATCGTCCTC CGTCTTGCGT AAGATCCTCT  CTCTCGTTTC AATCTATTTT TTTTTTCTAA ATATTTTCTA TTTTTTTGCT TATGCGTTTG TGAGTTGTTC GATGGATTGA CTCCGAGAGT TTTTTTTTTT TTTTTTTCTC TTTTGGATGG  GGAAATTTGC AGATGGCACT CGGCTGGGAC ATTTGACGTG AAGACGAAGA CGGGAGGACC GTTTGGGACG ATTAGGCATC CTCAAGAGCT AGCCCATGAA GCCAACAATG GTCTTGATAT  TGCCGTCAGG CTTCTTGACC CCATCAAGGA CTTGTTCCCT ATTCTATCCT ATGCTGATTT CTACCAGGTA AATTTCCAAC AATGTGCTGA TTTTTTTTGA GCTGTCATAG TGAAGCAAAG  AGATGAATCA AAATGTAGTA ACTAGGAGTT TGAGGTAGAA CCATCGAATC ATTGCATCAA TGATCGTGGT GCTGTTGGAA ACATTTGAAT GCGATTTTGT TGGTTGAAAC CGCTAAGTTC  TGATATAAAG TGAGTTCTTC TCTATCCTGA GCAGTCTGCT ATTGGCCTCT GGTTTGTTTG GACTGATTTA GATTCACACA TGTTAGACTG AAACTGAATC TAAAAGCTTA CCTTTGTATT  TCCCATGGCT TTAAGGGCTT GATTTATCTG TGTTTCTTGG TTACTGTAGC TAGCTGGAGT TGTTGCTGTT GAGATCACTG GAGGACCCGA GATTCCGTTC CATCCTGGTA GACAGGTGAG  TCATTTTCAA GTTCTCAATT TTTCCTGCTT CCAATTATTT GCTCCATTTC TTCCATTCCC AGTTTATTCG TGTTAAAACG TAACTCGCAG ATGATGATCT GACACAGACA CCATCAAAGC  GACCTTTTCT CTTTGCTAAG TTTTGTCCAT GTGATTAAGT CTGAACCTAA CTTCATCTTT CAGGACAAAG TTGAGCCACC TCCCGAAGGT CGTCTACCTC AGGCCACCAA AGGTAAAGCA  GATCTAGGAA CATGCTTTAG TGTGAATTCA GGTATCAGAT TATAGATACA TGTTCATCAT CTGTTTTATG TAAATTCAGG TGTGGATCAT CTAAGAGATG TGTTTGGTCG GATGGGACTC  AATGACAAAG ATATAGTTGC ATTGTCCGGT GGACACACCT TGGTATGTAT GCTGCATCTA GAAACAAAGA CCTATGTGCT CTTCCCAGTT TTGGCTCATA CCAACTTTTT ACTTTCAGGG  TCGGTGCCAC AAGGAGCGCT CAGGATTTGA GGGAACATGG ACACAAAACC CTCTCATTTT TGACAACTCC TATTTCAAGT AAGATCAGTT TCTCTGCTTC TGTTTCCTCA TGCTTGAATT  GGACCAGAGC TGAATCAGAA GCTATTGAAT CTTGATGGTT ATTAAACAGA GAGATACTAA GCGGAGATAA AGAAGGACTT CTTCAACTAC CAACCGACAA GGCTCTTCTC GAGGATCCTC  ATTTTCGTCC ATTGGTTGAG AGATATGCTG CAGTAAGTTA CACAATTCAT CATTTCAAGA TTCTCATCAT CATACATATG TTGTCAAATC GGATTTATCA CTGATTGAAT TGTTACTCTC  AGGATGAGGA TGCCTTCTTC GAAGACTACG CGGAAGCTCA TCTGAAGTTG TCAGAACTTG GGTAAACAAC ACATAGAACA ATCTCTCTCT CTCTACATTT CTTCAACTTT TTCTTATTGT  CCTAATGTAA TGTCGTAAAC TTTGATTATT CCTCAGAAAA CTCAACTCAG AGAAAGTTAT CACTTACAAA CACCCGATTT TGTCTAAAAC CGATCATAAT GACTTAAAAC TTTTTGGGTA  CGTTTATTTG ATTCGCAGGT TTGCTGACAA GGAGTAATCT GGAATTTGGC GTCATGTCTT CACATTATCA TTGTATTCAT ATTAGAAAAA AACAGTAAAA TCGAATGGAA GGCTTTGTAT 
TGTACGTGTG CCTTGGGGTT GTTTGTAACT AATGAAATAA GACAACTCAG TTGATGAAAA CAACCAAGTC TTCATATGTT TG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTGAAGA AGAGTTACCC GGAAGTGAAA GAAGAGTACA AGAAAGCTGT TCAGAAATGC AAGAGGAAGC TCCGTGGTCT CATTGCCGAG AAGCATTGTG CTCCCATCGT CCTCCGTCTT  GCATGGCACT CGGCTGGGAC ATTTGACGTG AAGACGAAGA CGGGAGGACC GTTTGGGACG ATTAGGCATC CTCAAGAGCT AGCCCATGAA GCCAACAATG GTCTTGATAT TGCCGTCAGG  CTTCTTGACC CCATCAAGGA CTTGTTCCCT ATTCTATCCT ATGCTGATTT CTACCAGCTA GCTGGAGTTG TTGCTGTTGA GATCACTGGA GGACCCGAGA TTCCGTTCCA TCCTGGTAGA  CAGGACAAAG TTGAGCCACC TCCCGAAGGT CGTCTACCTC AGGCCACCAA AGGTGTGGAT CATCTAAGAG ATGTGTTTGG TCGGATGGGA CTCAATGACA AAGATATAGT TGCATTGTCC  GGTGGACACA CCTTGGGTCG GTGCCACAAG GAGCGCTCAG GATTTGAGGG AACATGGACA CAAAACCCTC TCATTTTTGA CAACTCCTAT TTCAAAGAGA TACTAAGCGG AGATAAAGAA  GGACTTCTTC AACTACCAAC CGACAAGGCT CTTCTCGAGG ATCCTCATTT TCGTCCATTG GTTGAGAGAT ATGCTGCAGA TGAGGATGCC TTCTTCGAAG ACTACGCGGA AGCTCATCTG 
AAGTTGTCAG AACTTGGGTT TGCTGACAAG GAGTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GCTTCATATG ATCATCAGCC AATTTTATAA ATTGATTCGC AAACTAAAGT AAACGACAGC AACTAACAGA CACTTTCTTC AGGTTTTTAT CTTTCGATCA ATCACTGTAT CATCGTAGTA  GAAGAAGAAG CGAATTTGAA AAATGGTGAA GAAGAGTTAC CCGGAAGTGA AAGAAGAGTA CAAGAAAGCT GTTCAGAAAT GCAAGAGGAA GCTCCGTGGT CTCATTGCCG AGAAGCATTG  TGCTCCCATC GTCCTCCGTC TTGCATGGCA CTCGGCTGGG ACATTTGACG TGAAGACGAA GACGGGAGGA CCGTTTGGGA CGATTAGGCA TCCTCAAGAG CTAGCCCATG AAGCCAACAA  TGGTCTTGAT ATTGCCGTCA GGCTTCTTGA CCCCATCAAG GACTTGTTCC CTATTCTATC CTATGCTGAT TTCTACCAGC TAGCTGGAGT TGTTGCTGTT GAGATCACTG GAGGACCCGA  GATTCCGTTC CATCCTGGTA GACAGGACAA AGTTGAGCCA CCTCCCGAAG GTCGTCTACC TCAGGCCACC AAAGGTGTGG ATCATCTAAG AGATGTGTTT GGTCGGATGG GACTCAATGA  CAAAGATATA GTTGCATTGT CCGGTGGACA CACCTTGGGT CGGTGCCACA AGGAGCGCTC AGGATTTGAG GGAACATGGA CACAAAACCC TCTCATTTTT GACAACTCCT ATTTCAAAGA  GATACTAAGC GGAGATAAAG AAGGACTTCT TCAACTACCA ACCGACAAGG CTCTTCTCGA GGATCCTCAT TTTCGTCCAT TGGTTGAGAG ATATGCTGCA GATGAGGATG CCTTCTTCGA  AGACTACGCG GAAGCTCATC TGAAGTTGTC AGAACTTGGG TTTGCTGACA AGGAGTAATC TGGAATTTGG CGTCATGTCT TCACATTATC ATTGTATTCA TATTAGAAAA AAACAGTAAA 
ATCGAATGGA AGGCTTTGTA TTGTACGTGT GCCTTGGGGT TGTTTGTAAC TAATGAAATA AGACAACTCA GTTGATGAAA ACAACCAAGT CTTCATATGT TTG 

Retrieve as FASTA