Entry information : TsRboh08 (Thhalv10016055)
Entry ID 17745
Creation 2022-12-10 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2022-12-10 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: TsRboh08 (Thhalv10016055)
Name (synonym) TsRboh08 (Thhalv10016055)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh003]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Eutrema
Organism Thellungiella salsuginea (Eutrema salsugineum)    [TaxId: 72664 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value TsRboh08
start..stop
S start..stop
AlyRboh08 1734 0 1..889 1..886
AtRboh08 1734 0 1..889 1..886
NoffRboh08-1A 1708 0 1..889 1..887
ThasRboh10 1518 0 1..889 1..900
Literature and cross-references TsRboh08 (Thhalv10016055)
Protein sequence: TsRboh08 (Thhalv10016055)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   889 (308)
PWM (Da):   %s   100563.3 (33842.6) Transmb domain:   %s   o458-480i501-523o533-550i695-712o
PI (pH):   %s   9.49 (9.07) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-330
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKNNSPSEDS TKWMLESVEI DSMGGDSSAK EPDDSLNKNE GSNTKKNASR NLGVGSIIRT LSVSNWRKSG NLGSPSTRKS GNLGPPGAPG PPKKMGPQRV ERTTSSAARG LQSLRFLDRT  VTGRERDAWR SIENRFNQFS VDGKLPKEKF GVCIGMGDTM EFAAEVYEAL GRRRQIETEN GIDKEQLKLF WEDMIKKDLD CRLQIFFDMC DKNGDGKLTE EEVKEVIVLS ASANRLGNLK  KNAATYASLI MEELDPDHKG YIEMWQLEVL LTGMVTNADT DKMKKSQTLT RAMIPERYRT PVSKYVSVTA ELMHENWKKL WVLSLWLLIN VYLFMWKYEE FMRNPLYNIT GRCVCAAKGS  AETLKFNMAL ILVPVCRKTL TILRSTFLSR LVPFDDNINF HKVIAYAIAF QALLHTLLHI LCNYPRLSSC SHDVFLMYAS AALGNTQPSY LSLMMTSVSI TGVLMIFVMG FSFTLAMHYF  RRNIVKLPKP FNVVAGFNAF WYAHHLLVLA YVLLIIHGYY LIIEKPWYQK TTWMYVAVPM LFYASERLFS RLLQEHSHRV HVIKAIVYSG NVLALYVTKP PGFKYKSGMY MFVKCPDLSH  FEWHPFSITS APGDDYLSVH IRALGDWTTE LRSRFAKTCE PPQAAAKPKP NSLMRMETRA AGVNPHIEES QALFPKIFIK GPYGAPAQNY QKFDILLLVG LGIGATPFIS ILKDMLNHLK  PGIPRSGQKY EGSVGGESLG GDSVSGGGGK KFPQRAYFFW VTREQASFDW FKGVMDDIAE YDKTHVIEMH NYLTSMYEAG DARSALIAMV QKLQHAKNGV DIVSESRIRT HFARPNWRKV 
FSELSSKHEA CRIGVFYCGS PTLVRPLKEL CQEFSLESST RFTFHKENF 

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Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAAAACA ACAGTCCAAG CGAGGATTCA ACAAAATGGA TGTTAGAGAG TGTAGAGATC GATTCAATGG GTGGTGATAG TTCGGCCAAA GAACCCGACG ATAGCCTAAA CAAGAACGAA  GGTAGTAACA CGAAGAAGAA TGCGTCGAGA AACCTCGGCG TTGGATCCAT AATCCGGACG TTGAGCGTGT CGAACTGGAG AAAGAGCGGG AATCTTGGGT CTCCAAGCAC GAGGAAAAGC  GGAAACCTAG GGCCTCCGGG TGCACCGGGA CCACCGAAGA AGATGGGTCC ACAAAGAGTG GAGAGGACAA CGTCTAGCGC GGCTAGGGGA CTCCAGAGCT TACGTTTCCT TGACCGGACG  GTTACTGGAC GTGAACGAGA TGCATGGAGA TCCATTGAGA ACCGGTTTAA TCAGTTTTCC GTTGATGGAA AGTTGCCTAA AGAGAAATTC GGCGTCTGCA TTGGTAATTT ATTACAAACA  CTAAATATTC ATACGTGATT TTTGTCTGTT TTAAGAAAAT AGTGTAATCA ATAATTATTT TTGTAATGAG TATCTTCAAG GTGATTATTA TCAGAAGGTG TGAATCCAGA TAGAATAACT  AACGACATAA AGAACTTTTC TTTTCAGATT TCTTTTTTTT TTTTTTTAAT AATAATGTTT AGGAAAAAAG TTTAACGTCG ATAGTATACA TTTGCTAGGA ATGGGAGATA CAATGGAGTT  TGCGGCAGAA GTTTATGAGG CATTGGGTCG GAGAAGACAA ATAGAGACTG AAAACGGTAT CGACAAAGAA CAACTCAAGT TGTTTTGGGA AGATATGATC AAGAAAGACC TTGATTGTCG  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TCCATACGCT ACTCCACATT CTTTGTAACT ACCCTAGGTT AAGCTCGTGC TCTCACGACG TGTTCTTGAT GTACGCGAGT GCTGCCTTGG GAAACACGCA ACCGAGCTAC CTAAGTTTAA  TGATGACGTC AGTGTCGATC ACGGGGGTTT TGATGATTTT CGTCATGGGA TTCTCGTTTA CACTCGCGAT GCATTATTTT AGAAGGAACA TCGTGAAATT GCCTAAACCT TTCAACGTTG  TTGCTGGATT TAATGCGTTT TGGTATGCTC ATCATTTGCT GGTTCTTGCT TATGTTCTTC TCATCATCCA TGGTTACTAT CTTATCATCG AGAAGCCTTG GTACCAGAAG ACGGTAAGAT  TTTTTTTAAT AGACATTTAC TCTAATATAA GAAAATTTCC TGCATGATCA TAGTTTTGAT TCGTTGGTAA AATTGAAATG CAGACATGGA TGTACGTGGC CGTACCAATG CTGTTTTACG  CGAGTGAAAG GCTTTTCTCA CGTCTCCTTC AAGAACATAG CCATCGTGTC CACGTAATTA AGGTAATTAA AAAGGCTATT AATTTTTCTT TATTAAGTAA AAGCAACATA TTTTTCCTAT  ATTTGTGTTT CCCTATACAT TTTAATTTAT TTTCCCTTTT ATTTACAGGC TATTGTATAT TCGGGCAACG TTCTTGCACT TTACGTGACC AAACCCCCCG GTTTCAAATA CAAAAGTGGC  ATGTACATGT TTGTCAAGTG TCCTGATCTC TCACATTTCG AATGGTTAGA TCTGAATAAC AATCCATACT TTAGTGAAAT ACGTTAATTT ATAAAATTTT AGGTAAATAG TAATATTGGT  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ATCCACTCGG TTTACTTTCC ACAAGGAAAA CTTTTAA 

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CDS
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAAAACA ACAGTCCAAG CGAGGATTCA ACAAAATGGA TGTTAGAGAG TGTAGAGATC GATTCAATGG GTGGTGATAG TTCGGCCAAA GAACCCGACG ATAGCCTAAA CAAGAACGAA  GGTAGTAACA CGAAGAAGAA TGCGTCGAGA AACCTCGGCG TTGGATCCAT AATCCGGACG TTGAGCGTGT CGAACTGGAG AAAGAGCGGG AATCTTGGGT CTCCAAGCAC GAGGAAAAGC  GGAAACCTAG GGCCTCCGGG TGCACCGGGA CCACCGAAGA AGATGGGTCC ACAAAGAGTG GAGAGGACAA CGTCTAGCGC GGCTAGGGGA CTCCAGAGCT TACGTTTCCT TGACCGGACG  GTTACTGGAC GTGAACGAGA TGCATGGAGA TCCATTGAGA ACCGGTTTAA TCAGTTTTCC GTTGATGGAA AGTTGCCTAA AGAGAAATTC GGCGTCTGCA TTGGAATGGG AGATACAATG  GAGTTTGCGG CAGAAGTTTA TGAGGCATTG GGTCGGAGAA GACAAATAGA GACTGAAAAC GGTATCGACA AAGAACAACT CAAGTTGTTT TGGGAAGATA TGATCAAGAA AGACCTTGAT  TGTCGTCTCC AGATCTTCTT TGACATGTGT GACAAGAACG GAGATGGTAA GCTCACGGAA GAGGAAGTGA AAGAGGTCAT AGTCTTGAGC GCTTCCGCGA ACCGCCTCGG GAACCTCAAA  AAGAACGCTG CGACTTATGC TTCTTTGATC ATGGAAGAAC TAGATCCTGA TCACAAGGGT TACATCGAGA TGTGGCAGTT AGAAGTACTA TTAACAGGAA TGGTAACAAA CGCTGATACG  GATAAAATGA AGAAATCGCA AACGCTGACA CGCGCGATGA TCCCAGAGCG GTACAGAACG CCAGTAAGCA AGTACGTTTC GGTAACCGCG GAATTGATGC ACGAGAATTG GAAGAAGTTA  TGGGTTCTTT CTTTGTGGCT CCTCATCAAC GTCTATCTAT TCATGTGGAA GTACGAAGAG TTCATGAGAA ACCCTCTCTA CAACATCACC GGACGCTGCG TTTGCGCCGC TAAAGGCTCC  GCCGAAACGC TCAAATTCAA CATGGCTCTG ATTTTGGTCC CAGTCTGTAG AAAAACCCTA ACTATCCTTA GGTCAACGTT CTTGAGCCGC CTTGTCCCAT TCGACGACAA CATAAACTTC  CACAAGGTGA TTGCGTATGC CATCGCGTTC CAGGCCTTGC TCCATACGCT ACTCCACATT CTTTGTAACT ACCCTAGGTT AAGCTCGTGC TCTCACGACG TGTTCTTGAT GTACGCGAGT  GCTGCCTTGG GAAACACGCA ACCGAGCTAC CTAAGTTTAA TGATGACGTC AGTGTCGATC ACGGGGGTTT TGATGATTTT CGTCATGGGA TTCTCGTTTA CACTCGCGAT GCATTATTTT  AGAAGGAACA TCGTGAAATT GCCTAAACCT TTCAACGTTG TTGCTGGATT TAATGCGTTT TGGTATGCTC ATCATTTGCT GGTTCTTGCT TATGTTCTTC TCATCATCCA TGGTTACTAT  CTTATCATCG AGAAGCCTTG GTACCAGAAG ACGACATGGA TGTACGTGGC CGTACCAATG CTGTTTTACG CGAGTGAAAG GCTTTTCTCA CGTCTCCTTC AAGAACATAG CCATCGTGTC  CACGTAATTA AGGCTATTGT ATATTCGGGC AACGTTCTTG CACTTTACGT GACCAAACCC CCCGGTTTCA AATACAAAAG TGGCATGTAC ATGTTTGTCA AGTGTCCTGA TCTCTCACAT  TTCGAATGGC ATCCATTCTC CATCACTTCT GCACCGGGAG ATGACTATTT AAGTGTTCAC ATAAGAGCTT TAGGAGATTG GACAACTGAA CTGAGGAGTA GATTCGCAAA GACATGCGAG  CCTCCTCAAG CAGCTGCCAA ACCTAAACCA AATAGTCTTA TGAGGATGGA AACAAGAGCA GCAGGTGTGA ATCCTCATAT TGAAGAATCA CAAGCCTTGT TCCCAAAAAT ATTCATCAAA  GGGCCGTATG GAGCTCCGGC TCAAAATTAT CAGAAATTCG ATATTCTTTT GTTGGTTGGA CTAGGGATTG GGGCAACTCC ATTCATAAGC ATCTTGAAAG ATATGTTGAA CCATCTAAAA  CCCGGGATTC CCAGAAGTGG GCAAAAGTAC GAAGGAAGTG TAGGAGGAGA GAGCTTAGGA GGTGATAGTG TTAGTGGTGG AGGAGGCAAG AAGTTTCCAC AGAGAGCATA TTTTTTTTGG  GTGACAAGAG AACAAGCTTC CTTTGATTGG TTCAAGGGAG TTATGGATGA CATCGCCGAG TATGACAAAA CCCATGTGAT CGAAATGCAT AACTATTTAA CAAGCATGTA CGAAGCAGGA  GATGCAAGAT CTGCCTTAAT TGCTATGGTT CAGAAACTTC AACATGCCAA GAACGGTGTT GACATTGTCT CCGAAAGCAG GATACGAACA CATTTTGCAA GACCTAATTG GAGGAAGGTT  TTTTCTGAAT TGTCAAGCAA ACACGAAGCT TGTCGAATAG GTGTGTTCTA TTGTGGAAGT CCAACACTGG TTCGACCACT TAAAGAACTT TGTCAGGAGT TTAGTCTCGA GTCATCCACT 
CGGTTTACTT TCCACAAGGA AAACTTTTAA 

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