Entry information : AtRboh08 (At5g60010)
Entry ID | 3281 |
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Creation | 2007-07-23 (Christophe Dunand) |
Last sequence changes | 2015-06-04 (Christophe Dunand) |
Sequence status | complete |
Reviewer | Catherine Mathe |
Last annotation changes | 2016-12-13 (Catherine Mathe) |
Peroxidase information: AtRboh08 (At5g60010)
Name (synonym) | AtRboh08 (At5g60010) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Class | Respiratory burst oxidase homolog [Orthogroup: Rboh003] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Arabidopsis thaliana [TaxId: 3702 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular localisation | Plasma membrane |
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Tissue type | N/D |
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Inducer | N/D |
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Repressor | N/D |
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Best BLASTp hits |
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Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '3281' 'join(24160456..24160909,24161170..24161332,24161441..24161603,24161707..24162510,24162609..24162707,24162924..24163039,24163128..24163230,24163356..24163462,24163578..24163737,24163838..24164011,24164134..24164262,24164454..24164532,24164646..24164755)' |
Exons►
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Literature and cross-references AtRboh08 (At5g60010)
Protein ref. | UniProtKB: Q9FJD6 |
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DNA ref. | Phytozome 12: Chr5 (24160456..24164755) |
mRNA ref. | GenBank: AB015475 |
Cluster/Prediction ref. | Phytozome Gene 12: 19668010 UniGene: At.55632 |
Omic ref. | AtProteome: At5g60010 ATTED-II: At5g60010 e-FP Browser: At5g60010 ePlant: At5g60010 Genevestigator: At5g60010 TAIR: At5g60010 |
Protein sequence: AtRboh08 (At5g60010)
Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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Remarks | Complete sequence from genomic (Chromo 5, 12 introns) and mRNA . No EST. Ecotype="Columbia". mRNA and genomic from TAIR are uncorrect for the last two exons. | ||||||||||||
Promoter► Send to BLAST Send to cis Analysis |
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Terminator +► Send to BLAST Send to cis Analysis |
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DNA ► Send to BLAST |
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CDS► Send to BLAST |
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cDNA► Send to BLAST |
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