Entry information : LminPrx13(Lemmin2g0043190.t1)
Entry ID 18811
Creation 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LminPrx13(Lemmin2g0043190.t1)
Name LminPrx13(Lemmin2g0043190.t1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx065]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminPrx13
start..stop
S start..stop
LminPrx15 663 0 1..324 1..324
LminPrx14 663 0 1..324 1..324
LminPrx33 598 0 1..323 1..323
LminPrx[P]34 546 0 1..323 1..306
Literature and cross-references LminPrx13(Lemmin2g0043190.t1)
Protein sequence: LminPrx13(Lemmin2g0043190.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   324 (300)
PWM (Da):   %s   35433.17 (32870.8)  
PI (pH):   %s   8.78 (8.56) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-324
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTRGRGKVLL AFVLAFCMAS PLEAHLKVGF YETTCPKAEL IVREEVTKAF KDDSGIVADF VRMHFHDCFV RGCDGSILLD STPDNTAEKD SPINNPSLEG FEIIDNVKTR LEATCKGVVS  CADIVAFAAR DSVRLSKGIY YDLPSGRRDG RLSLSSEAFT ELPLPSSNLH QLTHSFARKG LSQKDLVTLS GAHSIGKADC SSFSDRLYNF SSTEETDPSL DPAYAAQLKQ KCPPGINGTN 
VLIDPRSPLA LDSSYYRNLI RKRGLLTSDQ TLMSSRATAR QVKAFRKNSL FKKKFAKAMV KMGDIGVLTG LEGEIRLNCR VVNK 

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Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GTGACGCCCT TCCCTACCTA GCATGAATAC GTCACAGAAA ACTATGGCAA GGTCAGAACG CTGCTACTGG ACAAGATGCC AAGCAAAATA AGAGAGGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA  GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GACCGAGAGA GAGAGAGAGA AAGGAGGGAG AGGGAAAATA CAATAGGTAC CTAATTAACC TTGTGAGATT TTGTGGAGAT GCTCTGACTT  TGTTGAGATC TGTAGATATT TAAAGATCAT GCTAACGTTA CATCAAATCA CCTACGCTGA AGTTGATTGC GCAAGATTCC TGGAAGAACG CGGCTCTGCG ATCGTTCTCG GGCTTTTTCT  TTGCTTGTTC GGGAATTTTT GTGTCTGAAG CCGCCGTGAC GATAGTCTGG TGAGACATAA AAGATGTTTG TGTACATATG TCATCTAAGG GACGTTAAAC TTCGGCCTTC ATCGGATCCC  ACATGGGATC ATTGACTATA TTATCCAAGC ATCCTCCGCA TTGGATTTTG GTGGGTCTCG GTGTCCCACC AGCCCAAATG GCTCCTGGTG CGCTCCAAGC ATTATTTGTT TTTGCACAAA  TAAGAGACCC AACAAACCCT GTTCTTCTCT TGTCGGCGAC GTCTGCTCCG ACGTCCTCGT GTGGGAAACT CGGACCTGCC CTCGTAAATG ATTTGCAGAG GTAGTTAAGA AGAGTCATGG  AATGCGATCA AGTTTCTTAT TCGTTGTATG ATACCTACTT TCCTCTGTAA ACTCCACTTC GTAAGAGAGC AGTTACTTCA ATTCATCGCC GCATGAATCT TCAGCTATTC CTGGTCTCAT  AATTCTGTCT ATCCAAAAAT TAATAACGTA CAGATTGAAA GTCGTAAGCA AGCCGTTCTA GAACACAGAC AACGAAGTGC CTATTCGTCC GATCTTCGGT CAAAAATTTA ATCGGGGAGA  GGGTGGAGTA CCCTGTGCTA CAGACTTGAA TACTGTTGAA GTGAGCAGCC AGAATGCCAT TTTTTACGCT CGTTTAATTG GGTTGTTCGG TTGTTGATAC CTCCTTTTAG ATAGAGAAAT  AGTATCTACT CATCAGTTTG TTTTGGATAC CTGTAGAAAA TGAAACGATA TCATCGTATC GATTGTCAAC CGAAGATATT GTTAGGGTTT GATCCTCATA ATTGGCGAAG AAAATGGGAA  ATGTATCCCA GCTAAATTGG ATATTATTAG GCGAAATAGA ATATGTCACA CGTTTATTGC CCTGGAATAA AAAAACAGCA TAAGAAATGT TAGGCTTGGA GCCTATCCGG GTTCCCTTTT  TTTCTTCGAC GTCTTGTGAA TATGTCTTCG GCGCCTGAGG TAGCATTGAA CTAGGTCAGT CATGACTAGG TCAGAAGGTC TCTACTCGGT TTCACCGAGG GGGAGAGAGA GAGAGAGAGA  GAGCTCGTAT AATTGGTCCC TAACTTGCCA TGTGAGGTTT CTTGGTGGGT TTTATGGTTT TGTTGAGATC TGTCGACAAA CAAAGATGAG GGTCACTCGA AATAGGATAA AATTATCCTG  AAGTTGATGC GGTCCAGATT CTTAGCGCCG TTCTACGATG GCTTTCGGAC TTTTCCTTTG CTTGACTGGG ATTTCTTTAT GTCTAGATTA TTGAATCCGG GTCATCTGCC GGTGCAAGCC  ACCGGAAGAA CAGTCTGTAG AGATATAAAA CAGTCTGATT CCGAGACAGG AGGAAAGAGA ACGCTGCTTA CGTAATCACC GCCAAACGAA TTCTAGTAAT TCGATTCAAC GCGTTAATCT  CTATCTCTCG AACTCTTTGG CGTCCAGATA AGGGCCAGCT AACCTCCAGA CCGACCGAGT ACGAGATTTC TATTCATCGC ACGCATTATA TGATCTCGTG CGGCCTATAA ATACACTTCC 
CCGTTCCAAG AAGTCCCCAG GAACTCGAGG AGTATTATCC GAGAGAGAGA GAGAGAGAGG GTGAGGATCA ACAGCAGAAC 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TATGTGCACT ACCTGGTCGT CCTCGGCCTT GTATTTATCC TTGTTATTCC TGTGATCTTT GAATGTCCAA TAAGTGTAGA GTTTGAGAGG GAGAGGACAA GAACGGACAA CATTCAAATC  AAAATGCACA GAATCAAAAT TCAAATCAAA AAATTGTTCA GCATTCAGTT TACCCATCTC CGTAAACCTT TTATAGGCAC AGGTCGAACA CGATGCCCAA ATCGGCAGTT TCTTGGAGGA  GAGAAAAGAC TCCAACCGCC GCCACTCTGG GCCAATCACA ATTAACTTAA CTCCACGGGG CCAGCCAATA GCACGCCAGC ATTTCCGCTC CCAGCTGGCT CTTCATCCAC CGTCATAACC  TGCTAGATCG ACGACTGCGA TTAAATCCCT GAAAGAAGAA GAAAAAAAAA GAAAAAGCAC CCAAATTGTT CTTCGGATGG AAAAACTTCC AGATTTTGTG ATCTTTTTGC GAGCTTAATC  CCAACAATAT CTCCCTTACA CTCGTAGCAG ATCACCCACG TCACATACTC CAGCATAACC CCACATTTCA CTGAATTTGA CGTGTCTGAG TGATTTTGTA AGGAAGTCAG CTCGTTGCTT  CTACGTAGGA ATATGCTCCA CTGCAACTCC CTTTTCCTCG AAACACATCC TCACATAGTG AAATTTTATC TTGATGTGCT TCGATTGGCT TTGAAAAGCC GAGTTCTTTG CTAGTTCGAT  AGCAGATTTG TTGTCCACAT AAATCTTGAC AGGCTTGAAT TCATATTTCA TCAATTCTCG GAACAAATTG CTAAGCCACA TTGCCTGACA TGAGGCAAGT GTGAGAGCCA CATACTCAGC  TTCACAAGAA GCCAGAGCCA CCGTTCTCTG CTTCTGCGAC ATTCATGTGA TCACACTTCC TCCGAGGAAG AACATAACAC CTGATGTGCT CTTGCCGTCA TTCGGTTCAC TTGCATAGAC  ACTATCAGAG TAACCCATTA AGAGAAAATT ACTCACCTTG GTGTATCTCA GTCCTTAGTC CAATGTGCCT TTTATGTATC GCAACACCCT CTTAGCACTC TTCATATGCT CAGTTGTAGG  AATTTCCATG TAATGACTGA GAAAACCTAC ATTGAATATT ATATCTGGAC GTCTATGAGT GAGATACCTT AGGGAACCAA GTATACTCCG ATATACTGAT GAATTCACAG AGCTTGCACC  ATCCTTTACA AAACTCGATC TCACTTCAAG TGGTGTCTGA GATGAATTGC AATCGAGCAT AACGAATTAT TTGAGAATTT TTAGTGCAAA AGTCCTCCGA GATAGAATTA TCTCTTCACT  ATACTGAAAC ACTTGAATTC CCAAATAAGA GGTCAAGAGA CCTAGATTAG ACGTCCCAAA TAGGGACTTC ATATTGTCCT TAAACTCTTC AATTATATCA ACCAAGCTTC CAATGATCAA  TAAATCATCC ACATAAATTC CCACTATAAT AGTTAACTCC TTTAAGTGCT TGATGTAAAT TGTCGGCTCG AATGTGCTAC TCTTGAAGCC AAAGTCATTA ATGCTTTTAT CAAGCTTGCT  GTACCCGACC CTCGACGCTT GTTTAAACAC ATACAAGGCC TTCTTGAGCT GATATACGTT CGTCTCTTCT CCAATTTTGA TGAATCCAAC TGAGTGCTCG ACAAAAATCA CTTCCTAAAT  TTCACTGTTG AGAAAAGCTG ACTTTACATC CAGATGATGC ACACACCATC CATTTTGTGC TGACATTGCA AGTAAAATTC GAATGGTCTC CATCCTTCAA ACCAGTACCT TGTCCCATCA  TAGGGACCTT GTCCCATTTT TTCTCAATAG AAGTAAACTC CTCTTTCATC GCCTTTTTCC AAACTTCATC TTCTAATGCT TCTTTCACTA AATTTGGGTC ATCGTCAATT AAATTGCATA 
CTTCTTCATC TGGTAAGTCA ACTTGTTGAG TCTCGGAATA CAACTCACTT AGGTCTCTGA ATCTTCTCGC GGACTCTTCA 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACTCGGG GCCGAGGAAA GGTGCTCTTG GCTTTTGTGC TTGCCTTCTG CATGGCTTCT CCGCTGGAAG CTCATCTTAA AGTGGGCTTT TACGAGACCA CTTGCCCTAA GGCTGAGCTG  ATCGTGAGGG AAGAAGTCAC TAAAGCTTTC AAAGACGACA GCGGTATTGT GGCGGATTTC GTGCGCATGC ATTTCCATGA TTGTTTTGTG AGGGTAAGCA TGTCTCCAGG CTTCGTAATA  GTTCGTTATA TTCTCGAATA TCTCGCTGAA ATACTTGTGT TCGACTTTTA GGGCTGCGAT GGATCAATCC TCCTGGACTC TACGCCAGAC AACACGGCAG AAAAGGACTC GCCCATCAAT  AACCCTAGCC TGGAAGGCTT CGAGATCATT GATAACGTTA AAACCAGACT CGAAGCCACC TGCAAAGGCG TAGTCTCGTG CGCCGATATC GTTGCGTTCG CGGCCAGAGA CAGCGTCAGA  CTGGTATATC CTTTGTCCTG GAAATCAAAT ACTGCGTAGT GATATCTAGT CATATAATCT CTCTCCCAAT CGATCTACGG ATGTCTCATT TTCTCTTCCT CCTGATTGGC AGAGCAAAGG  TATCTATTAT GACTTGCCTT CCGGAAGACG GGACGGAAGA TTGTCTTTGA GCTCGGAGGC GTTCACGGAA TTGCCTCTGC CTTCATCCAA TCTTCATCAG CTCACGCACA GTTTCGCCAG  GAAGGGCCTG TCACAGAAGG ATTTAGTCAC CCTCTCCGGT GAGTATATAC GCGATGCCAT CTACATTCTA GAAGGCTCTA CGCAAGCAGA AGTTAAATCT CATTCGCGCT ACTCCGTGTC  GGTGTTTGAC AGGTGCTCAT TCCATCGGCA AAGCTGACTG CTCCTCGTTC AGCGACCGGC TCTACAATTT CAGCTCCACA GAGGAGACGG ACCCAAGCCT GGATCCGGCA TACGCGGCTC  AGTTGAAACA GAAGTGTCCC CCGGGAATCA ACGGGACGAA CGTGCTAATA GACCCTCGCT CCCCCTTGGC TCTCGATTCC AGCTACTACC GAAACCTGAT AAGGAAACGC GGGCTGCTCA  CGTCGGATCA GACCCTGATG TCCAGCCGCG CCACCGCGAG GCAAGTGAAG GCCTTTCGCA AAAACTCCCT CTTCAAAAAG AAATTTGCCA AGGCCATGGT GAAGATGGGC GACATTGGCG 
TGCTTACCGG ATTGGAAGGA GAGATCCGTT TGAACTGCAG GGTCGTCAAC AAATGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACTCGGG GCCGAGGAAA GGTGCTCTTG GCTTTTGTGC TTGCCTTCTG CATGGCTTCT CCGCTGGAAG CTCATCTTAA AGTGGGCTTT TACGAGACCA CTTGCCCTAA GGCTGAGCTG  ATCGTGAGGG AAGAAGTCAC TAAAGCTTTC AAAGACGACA GCGGTATTGT GGCGGATTTC GTGCGCATGC ATTTCCATGA TTGTTTTGTG AGGGGCTGCG ATGGATCAAT CCTCCTGGAC  TCTACGCCAG ACAACACGGC AGAAAAGGAC TCGCCCATCA ATAACCCTAG CCTGGAAGGC TTCGAGATCA TTGATAACGT TAAAACCAGA CTCGAAGCCA CCTGCAAAGG CGTAGTCTCG  TGCGCCGATA TCGTTGCGTT CGCGGCCAGA GACAGCGTCA GACTGAGCAA AGGTATCTAT TATGACTTGC CTTCCGGAAG ACGGGACGGA AGATTGTCTT TGAGCTCGGA GGCGTTCACG  GAATTGCCTC TGCCTTCATC CAATCTTCAT CAGCTCACGC ACAGTTTCGC CAGGAAGGGC CTGTCACAGA AGGATTTAGT CACCCTCTCC GGTGCTCATT CCATCGGCAA AGCTGACTGC  TCCTCGTTCA GCGACCGGCT CTACAATTTC AGCTCCACAG AGGAGACGGA CCCAAGCCTG GATCCGGCAT ACGCGGCTCA GTTGAAACAG AAGTGTCCCC CGGGAATCAA CGGGACGAAC  GTGCTAATAG ACCCTCGCTC CCCCTTGGCT CTCGATTCCA GCTACTACCG AAACCTGATA AGGAAACGCG GGCTGCTCAC GTCGGATCAG ACCCTGATGT CCAGCCGCGC CACCGCGAGG  CAAGTGAAGG CCTTTCGCAA AAACTCCCTC TTCAAAAAGA AATTTGCCAA GGCCATGGTG AAGATGGGCG ACATTGGCGT GCTTACCGGA TTGGAAGGAG AGATCCGTTT GAACTGCAGG 
GTCGTCAACA AATGA 

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