Entry information : LminPrx33(Lemmin6g0177150.t1)
Entry ID 18831
Creation 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LminPrx33(Lemmin6g0177150.t1)
Name LminPrx33(Lemmin6g0177150.t1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx065]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminPrx33
start..stop
S start..stop
LminPrx15 600 0 1..323 1..323
LminPrx14 600 0 1..323 1..323
LminPrx13 598 0 1..323 1..323
LminPrx[P]34 592 0 1..324 1..307
Literature and cross-references LminPrx33(Lemmin6g0177150.t1)
Protein sequence: LminPrx33(Lemmin6g0177150.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   324 (300)
PWM (Da):   %s   35537.11 (33011.8)  
PI (pH):   %s   8.47 (8.38) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-324
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTRGRGAIFL AFALAFCMAS PLEADLKVGF YEDTCPKAEL IVRKEVEKVF KEDNGIVADF VRMHFHDCFV RGCDGSILLD STPGNTAEKD SPINSPSLEG FDVIDNIKSR LEATCKGVVS  CADIIAFAAR DSVKLSKGIY YDLPSGRRDG RLSFSSETFT DLPPPSDNLH QLTHKFARKG LSQKDLVTLS GAHSIGKADC TSFSDRLYNF SATEKTDPSL DPAYAAQLKH KCPPGINGTN 
VLIDPRSPLA LDSSYYRDLI RNRELLTSDQ ALMSSHATAR QVKAFRKNSL FKKKFAKAMV KMGNIGVLIG YEGEIRLNCR VVNS 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GAAACGTTCC GATGTGCATC GACTGACCTG GAACTCTCTG TCCCGCAGAA AACTCTAGAT CCTGCGTAGA AGACGACGCC TCGACACGCT TCGGCGGCAT TTCTCCACAA TCGAGCAAGG  CCTGGATCTA ACCCGCTCTG ATACCAAATG TTGAATCGAC GGAGACGGAA GATTTTGAGC AACAAAATTT GAAACGGAAG TGGAAAATGC TCTGCAACAC GCCTGCAGAG TAGCGGGGTT  ATTTATACCC GTAATGAAAT GAATCAGCCA ATCAGATGGC TTCATTCCAC GATCTAACCG TCGCCGCACC AACCTTCATC TCAGCCGTTA TAACTGCTGA GATGGACGGT CAGGATTACA  CGGAGAATCA GACTTTCGTT ACGCAGAGGA GGAGAGAGAA AACAGAGCAA ATCGGGCGAG ATCTGAAGGT TGACCCAACA TAAATGAATG AGAAAGCTAT TCACGAACAG ACATGGAATG  CGGACAAGGT CTTTCATTCT CTGTCGGATC ACTACTTTCC TCTACGAACT CCGTTTCGTA ACAGAGCAGA TACAAAAATC TTCAGATTTT TTGATCCGAC AATTCCATCT ATCAGAATAT  TTATGAACTA TATATGGAAA AACGTAAAAT GCCGAACTGC TTATTCGTCC GTTTTCCGGG CAAAAATCCA GTCTTCATTA TTGTTGAAGT GGGCAACCGG AATGCCATTT TTTTACCGTC  GTTTAGCTGT GTTGTTCATT TGTGGATGTC TCCTTTTTAG GTATAGAAAT AGTATTTACT TCTCGGTTTG TTTGCGCGCC AATACGAAAT TAAACGATAT CAACAAATTA TCGTTAGGCT  TTGGCCCTGG TTACTGTCAA AGAAAAAGGG AAATATATGA CAGATGAATT GGCTATTATT TGGCAAAATT GAATATCTCA AAATTGTATT ATTAGTCTAC TCCTCCGGAA TAAATAAACA  TCACACGAAA TGTTAGACTT GATCTTTTTC AACTCCACCA TCATATGCAC ATAGCTTATC GCTCGTCCTT GGGTTCTCCG CATCGAACGC AATGTCCTCG AGAATAAAAT TTCACGGGCT  AGTTCCCATT CTTCAAGACA GCGTAGACCG TGGATATATC AGACTTGCGA TCATTCATCG TGTTTACTAA CTCTTCTCTG CATGATATAG TTTGGCAGCT ATTTATCGCA GTTTCGCCAC  TATTTCGCAT CTTTCTACAC GGCTGTTCGA CTACAACTAG CGTCATAACT TATGGCAGCC ACGTTAGACT CTCGACAGCT CCGATCTTGG AAAAAGTCCT GGGCGCCTGA GGTGCCAGTG  AACTTCTAAT ATACGGGTGT TAAGAGATGT CGTCGTTTCA GCACTGCATT TTGAAGAACT CACGGTCGCA TTGGAGAGGC CCTCAATCGT AGGCTCGATG TCAGAAAACT ATGACTAGAG  AGAGAGAGAG AGAGAGAGTG CACATATAAT AGGTACCTAA TTTCCCTTGG AAGGCTTCGT GGAGGATGTA ATGAGTTTGT TGATATCTGT GCACAATTAA AGAAGACCAG TCCTAAAATT  CATGCGGTCA AGATTCCCGG GAGGGCGCGG TTCCGAGATC GCTTTCGGAC TCTTTTTAAC TTGTTTAAGG TTTTCTGTGT CAGAAATGTT CTATTAGCGT TCGTTGGTCT TCTAGCCGCC  ACGAATATAG GCTGGTGGGG GATAAAAAAG TCTGGTTCGC GATGAACAAG GGGAACGCTG CTTACGTAAT CACCACCAAA TGGTTTACGC TCTACACTTG ATTATCCAGG TTCATCTCCC  TCCAACCCGT TGGCGTCCAG ACCAGGTCCA GCGTGCCTTT GACCGACTAG GAGATTTCTA TCCATCGCCT GAATTATATG ACCTCGTGCC AGCCATAAAT AGACCTCCTT GTTCATCGAA 
GTTCCCAGGA ACTCGAGGAT TACTATCCTT GAAAGAGAGA GACAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGGATCA GCAGGGGATC 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TAGTTGCACC ACCTTGTCGT CCGCAGCCAT GAACATGGTT TGGTTTGTTC CTGTATTTAT CTTTATTCTC CCTGAATGCC CAATAAGAAT TGCTTGCAAC CTCCAAAAGT TGCATGTAAT  GGTTCAATAA AAATCATTAT ATTACTACAA GTCTACTCGA TCAGAATCCA TTGAAAAACT GTTATAACAG AAAGAGATCT ATCGAGAAAT ATCTCTTTAA AAAAGTATTA TTCTCACACC  GGTTGTTACT ATCTATACTA CTATTATTCT TCAAGATAAA ATTTTCCTCG TTATTACGAT AATGGCCAAT CATTATGTGA GTTAATCTGA GAATTAATCG TGAATCCAGC ATATCCGATT  AACTCACATG ATCAGTTGAT GACACATTCC TCCGTGGTCA AAGATCTCAC TCACTCCGAA TTTCCTCCAA TTTCAAATCA AACTCAGTCG AATATGTCTG ATTGTGGTCG AGGAGGACCT  AGGGGGCAAT CAAACAGAGG ACGTGGCAGA AATGGGGTCA GATACACTCC GCGATGCCAA ATTTATTGGC AATTCGGACA TCGCGCTCAA GATTCTCGGG AAAGGTTCAA TAAGATCTAT  TATGGATGGA AAAATCTACT TCCAAGTGAC CAGAAAGCAC CTCACGCATA TATATCTTCC ATGGCACCCC CTCAACTGCA ATGTGACAAC ACAAATTGGT ACCCTGATAG CGGATCAACA  CATCATGTGA CCAATGATCC ACAAACCCTC AGCGATCCAG CATTGTATCA TGGAAGCGAT CAGCTGCAAG TTGGGAATGG AACAGGTTTG AAAATATTCT CAACTAGAGC CTCCACTCTG  TGTTCAAATT GAAACTCAAT AAAGTTACTA AATATTCTGC ACGTTCCAGA AATTCAGAAA AAACCTCCTC TCGATTCATA GACTAACCAA TGATAACAAT GTCTATGTTG AGTTTCACGC  TACATACTGT GTTGTGAAGG CCGAGTCAAC CGGGAAGCCC CTGCTCAGGG GAATAGTCAA GGACGGACTT TATCTTCTTC CTAACACAAA TAATGCACAA GCTTTCCTGA GTCAGAAGGT  AGGGTTGGAC TTAAGGCACA AACGGCTTGG TCATTCAAAT TTCAAAGTTC TTAGACATGT GATCGCCTCT TATGAGCTGC CCACTCTGGT TGTCAATAAA ACTCACTTTT GTGAAGCGTG  TGCATCATCA AAGACCACAA ACTCCCTTAC TCTCCATCAC TTCACCATTC GTCACAACCA TTGGAATTGA TCCACTACGA TCTGTGGGGA CCTTCGACGA TTGTATTTCA TCTTGGTTAC  AAATATTATG TCATCTTTAT TGATGACTAT TCTCGGTATA TGTGGTTGTA TCCATTGAAG CACAAGAGTG ATGTCATGCC GACGTTCAAA AACTTCCAGA AAAGAGTCGA AAGACAGTTC  AGTCTGAAAA TTAAGAATTT TCAGTCAGAC TGGCGAGGCG AATTTTAATA TCTAAACCAA AATCTCAAGG ATCAAGGGAT ATTTCACAGG ATATCATGCC AACATACCCC ATCTCAAAAT  TGCACAACAG AGAGAAAGCA CATACACCTT GTGGAGGCAG CACTTGCTCT CCTTAAGCAT TCAAGTTTGC CGCAGAGATA TTGGGACGAA GCGGTGTCAA CCGCTACCTA TTTGATAAAC  TAAATGCCAA CACCATTGCT GAGGTACAAG TCTCTTTTTC AAATGATCTG TAACTGTGAG CCTGAGTACA AATTCCTAAA AATTTTGGGT GCTTGTGTTA TCCACAACAA AGCTTGATTC  TAGATCCGAA AGGTGTGTGT TTCTTGGTTA AAGTGCTTTT CACCATGGCT ACAGATGCTT GTCACTATTA ACTGGTCGAA TCTACATCTC AAGGGATGTT ATTTTCAATG AAAGTTCACT 
GTCATTCACA GAGAAATCCA ATCACTACAA TTTCTCCACT CAGCCAAGCA AAGGTATAAT GGGTGCATCT CCACTTGACC 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACTCGGG GCCGGGGAGC GATTTTCTTG GCTTTCGCGC TTGCGTTCTG CATGGCTTCT CCGCTGGAAG CTGATCTTAA AGTGGGATTT TACGAGGATA CTTGCCCAAA GGCTGAGCTG  ATCGTGAGGA AGGAAGTCGA AAAAGTTTTC AAAGAAGACA ACGGCATCGT GGCGGATTTC GTGCGCATGC ATTTCCATGA TTGTTTCGTT AGGGTAAGCA TGCCTCGTGC CTTGATAAAT  AGTTCAATTT ATTCTCGACT ATCGCACTGA AATAATATGT TCTATTTTTA GGGTTGCGAT GGATCAATCC TCCTGGACTC TACGCCGGGT AACACCGCAG AGAAGGACTC GCCCATCAAC  AGCCCTAGCC TGGAAGGCTT CGACGTCATT GATAACATTA AAAGCAGACT CGAAGCCACC TGCAAAGGCG TAGTCTCCTG CGCCGATATC ATTGCATTCG CGGCCAGAGA CAGTGTCAAA  CTGGTACGTC CTCTGTCCTG GAAATCAAAT ACTGTGTACT AGTTTTTATT CATATAAACT CAACCTATCG ATCTATAGAT GTCTCACTTT CTCTTCCTCC CGATTGGCAG AGCAAAGGTA  TCTACTATGA CTTGCCTTCC GGAAGACGGG ACGGAAGACT GTCCTTCAGC TCGGAGACGT TCACGGACTT GCCTCCGCCG TCAGATAATC TTCATCAGCT CACACACAAG TTCGCCAGGA  AGGGCCTGTC ACAGAAGGAT TTAGTCACCC TCTCCGGTGA GTATATACGA TATATTTTAA AAGGCTCCGC CCGAGCGTAA GTCTAATCTA AGTCATCTTA CTTCATGCGG GTGTACAACA  GGTGCTCATT CCATCGGCAA AGCTGACTGC ACCTCGTTCA GCGACCGGCT CTACAACTTC AGCGCCACGG AGAAGACAGA CCCGAGCCTG GATCCGGCGT ACGCCGCTCA GTTGAAACAC  AAGTGTCCCC CGGGAATCAA CGGGACTAAC GTGCTAATTG ATCCTCGCTC CCCCTTGGCG CTCGATTCCA GCTACTACCG AGACCTGATA AGGAACCGCG AGCTGTTGAC GTCGGACCAG  GCCCTAATGT CCAGCCACGC CACCGCGAGA CAAGTGAAGG CCTTTCGCAA AAACTCCCTC TTCAAAAAGA AATTTGCGAA GGCCATGGTG AAGATGGGTA ACATTGGCGT GCTCATCGGA 
TATGAAGGAG AGATCCGTTT GAACTGCAGG GTCGTCAACA GTTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACTCGGG GCCGGGGAGC GATTTTCTTG GCTTTCGCGC TTGCGTTCTG CATGGCTTCT CCGCTGGAAG CTGATCTTAA AGTGGGATTT TACGAGGATA CTTGCCCAAA GGCTGAGCTG  ATCGTGAGGA AGGAAGTCGA AAAAGTTTTC AAAGAAGACA ACGGCATCGT GGCGGATTTC GTGCGCATGC ATTTCCATGA TTGTTTCGTT AGGGGTTGCG ATGGATCAAT CCTCCTGGAC  TCTACGCCGG GTAACACCGC AGAGAAGGAC TCGCCCATCA ACAGCCCTAG CCTGGAAGGC TTCGACGTCA TTGATAACAT TAAAAGCAGA CTCGAAGCCA CCTGCAAAGG CGTAGTCTCC  TGCGCCGATA TCATTGCATT CGCGGCCAGA GACAGTGTCA AACTGAGCAA AGGTATCTAC TATGACTTGC CTTCCGGAAG ACGGGACGGA AGACTGTCCT TCAGCTCGGA GACGTTCACG  GACTTGCCTC CGCCGTCAGA TAATCTTCAT CAGCTCACAC ACAAGTTCGC CAGGAAGGGC CTGTCACAGA AGGATTTAGT CACCCTCTCC GGTGCTCATT CCATCGGCAA AGCTGACTGC  ACCTCGTTCA GCGACCGGCT CTACAACTTC AGCGCCACGG AGAAGACAGA CCCGAGCCTG GATCCGGCGT ACGCCGCTCA GTTGAAACAC AAGTGTCCCC CGGGAATCAA CGGGACTAAC  GTGCTAATTG ATCCTCGCTC CCCCTTGGCG CTCGATTCCA GCTACTACCG AGACCTGATA AGGAACCGCG AGCTGTTGAC GTCGGACCAG GCCCTAATGT CCAGCCACGC CACCGCGAGA  CAAGTGAAGG CCTTTCGCAA AAACTCCCTC TTCAAAAAGA AATTTGCGAA GGCCATGGTG AAGATGGGTA ACATTGGCGT GCTCATCGGA TATGAAGGAG AGATCCGTTT GAACTGCAGG 
GTCGTCAACA GTTAA 

Retrieve as FASTA