Entry information : LminPrx16(Lemmin2g0044730.t1)
Entry ID 18814
Creation 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LminPrx16(Lemmin2g0044730.t1)
Name LminPrx16(Lemmin2g0044730.t1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx028]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminPrx16
start..stop
S start..stop
LminPrx31 644 0 1..324 1..323
LminPrx30 612 0 1..324 1..324
SpolPrx26 537 0 26..324 16..314
CescPrx48 483 1.13e-173 1..324 1..322
Literature and cross-references LminPrx16(Lemmin2g0044730.t1)
Protein sequence: LminPrx16(Lemmin2g0044730.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   324 (303)
PWM (Da):   %s   34750.46 (32563.3)  
PI (pH):   %s   7.7 (7.70) Peptide Signal:   %s   cut: 22 range:22-324
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASSRLTEML LLMAIIGLTA AASSSNVEAL STDYYAASCP FAEMIVRNSV AEALRRDPTL TAPLLRMHFH DCFVEGCDGS VLIDSTKGNK AEKDSPANLS LRGFEVIDQA KAAVEQHCPG  VVSCADIVAM AARDAVLWAG GPVYEIPKGR LDGRRSRIED TVNLPPPTLN SSALIRTFGQ RGFTVQDMVA LSGGHTLGVA RCASFKNRLS NFDSVNKVDP TLDQNFAKML TRTCASGDSA 
VVSLDSTRTF FDNAYFRALT VGGGLLTSDQ TLFTSPETRG LVYGYAINQA KFFVDFSQAM VKMGLLNVKG GAMGEVRRDC RRVN 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TAATGTTATG GCCATCATTT GTCTTAATCA ACTCAAAATC ATTGACTAAG ATACTAATTT GGATATGTTT GACTTATAAA GTTCCCTTAT ATGAGATAAA AGCTTTTCCC AAATATCCTT  TGCTGTATCC CAGTTGGAGA CTCGAGGGAA TTCATTCTCT TCCATCTTAA TGAATAGCAA GTTCCTAGTT TTGGCGTTGT TTCTCTTTGC ACCTTGTTGA TATTCTTTAA GGATTTCTTT  GGTCCTACCG CGATCATTTC CCACAAGTTT TACCCCACAC CATACCATAA CCAACCTTCA AGTGCATAGA TAGTCTCATT GAGGCTATGA GGATGTATTT GCTATTCCCC ACCCATTCTA  AATCTACGTG TGATTAGCAA CAATTAAAAA AAACAATTTA GGCTATAATA TACAATGAAC TAGCTTAATG GTGGCTTTGT AAATAAGGAG ATAAATTAGC TTTATAAGTA ATTGTAATTT  TTATTTTGAA TTTGTAATAA TTTATTATTC TAGTTTGCTT GATCGTTTAT ACCACCAATG CACATCGATA TATACTAGTT CAGGGCAACT ATTGTACTCC AGTTTCAATG TAACATGTCT  TGGTGCCTCA ATTATGTTAC TCCTAAACAA GTTTAGTTCA CGTAAAATCG GATCGTTTCA AACTTAGAAA ATGATTGTAT GATTGTCTTA TTGCAACCCC ACTTTTCTCT ATGTCATCCT  CTACCATACC TCGATAAGGG ATCGACCTTC ACTAGACCAC AATGCTTGTT GACCAAGATG GTAGAATCTC CACCAAGGAT ATGTTGTCAA TGTGTAGGTC ATTTTTCCTC CCACTAGAGC  ATGCTTTAAT ACATTGGTAG CCTTCTTCAT CTCACCGCCA TGCCATAAGA ATGGTGTAAA TGCAATGAGC GATTAGATGT TACTGAATGA CGTGAATGAA GCCCGTGAAC TTTTACTAGA  TTCCTCTCTT TCTTGATGAT ATTGTGCCTT TGGCTCCTCG ATAATTCACG CCCCTTATTT GGCTTCAATG CTCACATTGG GCATGTAAGT ACTTCATCTT CCAAATCAGA TCAAGTGATA  TGAATATTTA ATGAATAAAC AATGATTGAT TTAAACTTCC CTAATTATTG GTCATTTGAT TTTGGCTTCT TGACTGTTGA CTCCCAGTTT TCATGAAATA GCTTTCTTTC TATCCCATTC  GTGGGCAAAC TAGAAATAGC TTAGAAGAGT CTCTTTTAAG CAGACGAGGG GTGGAGAACC AGCTCATTCC GCACTGGGAC GCAGGCATGA ACGCTTCAGG ACTTGTTTCT CGAACTTCAC  AGAACCATCG TGCGAATTAG GCAGAGCTCC ATGGAACCAG GCTTCCTATT CTTTGAAGTA TCGTGAACAG TGCGGTCCGT GTTCGACAAT CAGTTCGAGC GGCTTTCAAG AACCACGAGC  TTTTGACCAG TGGATGGCAA GAAAGGTTTC AGGAGAGAAA GAAGAAACCT TTAGGCTGTG TCGGAACGCA GTTGAGGACG ATGTGCATGT CGATCTCTCT CTCTCTCCTC TTCGGCTGGA  AGAGAGAGAA GTCTTGGAGA CCGCCATTGC CGGGAAACTG CGAGTTGGGA AACAATATCG TATCACGCGG AGGATAACGT CGGCGTGGAG AATAAAGAAG GAAGAGAATC TGAACGTGGA  AACCAGCTGC AACCTATTGA CTTGAGGTCA ACCTGCCCAG CTTGTCGGTT TCTTTGTGTA ACGTTTGCTG CTGATGATGA TAGATTATAT GAGGAGCTTT GAGAGCTTTT TCAAAACAAA  AGCAGCTTCT TGTGCTGGTG TGAGTGCCCT TCCTAGCTCA GCAGGAGTCC TTATCTGGTT CTCACCGAGA GACAGATAGG AAGGCGATGG CGGCTATAAA TACACAAACA AGACGGCACT 
CGTCCTGCAC ATCGAACACC AGCTCACACA TCCTAGTCTT TCTTCTTGCT CATCCTCTCG AAGATCGTGA AAGGAGTCTA 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GCGACAGGAG ACACTTCGGC TAAGATTGGG TGTGTCAACT CAGACCTTTT CAGACTATTG AAAGTCAGGA ATAAAGCTCG CAAGGGCCCT TGCCTCAATC CAAAGTGGAT TTCAACGGCG  TGATTTGGGG GTGATTTTCT CTGTAATCTC ATGTGCTCTT GAATATTTCG TTATCTCATT ATGTCTTGAT GCCATTGTAA TAACAGTAAC TTGACTACTA CACGGTACCA TCGTCTATAT  CCTATTCCAG GGGTCCTCTA CCGTGAACTA AGAAATTCAT CCGATCTGGC GCTAAACTCG TCTCTCTAAG GCACCGGAGG GTTCCCCTAC CCCTGTTTCT TATCCCCTCT TTTTTCTCTC  CGGTTTCTCC CTTTTGTCTC TCTTTTTTCA TGGTACCAGA GCTCAATTTC CCTTCTAGCA CACGGTTATC TTCTTTTTCT TCCCATTCCC AGGGTAATCT TCCACTCAGC TGCTTCCCTT  TCATGGCTGA ATGGTGTTCA AAGATGGAAA CTTTATAGAA TCTAGCAGCT GCATCAAAGT TCTTTTTACC CATCGAAATT TTTTCTTCTG ACAGAATCTT GCAGCTGCAT CATTTCCTTT  GCTTAGCATA CATCAATCTC TTTTGTTCTT CCTTGACTCT CATCTTTTAT TTGAATGTTA GTTGAGATAT ATCCCATTGC TTTGCACATA TCTTGAAGTC ATTTGACACT CATGGTGGTT  CATTAGTCTG ATTTTTTTGC AGTTACCTAT TGCGCTAATT TTGACATGTT CTGAAATTCC ATGGCTCTTT TATTAGTGCA TTGGTATATT GCATTGATTT GGAGATAAAT TGAGGTACTT  TTGTCTCTCT TATTAGTGCA ATGGTTGAAT TTTTTTGCAC TATCACTAGC TTGTGATGAA GACAATTCGT GATGGCATTT GAAGTACACA TTTGAATGGA TCATTTTTTC TCATATATTT  CATTGTCTTC ATGGATGAGT AATGGTGATC TTACAGCCTC ATTTGGACAA TTTCCTCGCT TCTATCAATA AAACAAAATT CCAAATATTG TCAACTTTGT CACTACTAGT TTGGATCCAC  AACCTAAAAA TACTACGCTC TCTCGATACT TTGGTTCTGG AGCTACGGAT AATATGACCC CTTCTACGAA ATGGATGCAT ATTATAAATT TATTTCTATT CCCAAATCTA TTAACAATGT  TAAATTCTCG CCCATTTCTT TACGTGATGT TTACTCTATA TTTATCGCCC ATCTCTCTGT TACAAGTGTT CTTCATGTAC CCAATCTATA TACTGGCCTC ATACTTGTTA ACTAACTAGG  TAATCTGATG AGGTCAACAA GCTAGTCAAT ACGTCTATTA CCCAAGTCAA CTCTAGGGAG ACAACACACA CTCAAAGAAC ATTACAAGAG AGATATCACC AAGTTCCTAG GTCAGCCCTT  CCAAAGAGGA CTGCAAGAAT TAGGCTTAAC CCTAATAGAG GGGTCTACTT GGACCAAGTC AATCAGAAAC TTCCCCTTCT ATTGGAACCT AATAGGGATA TTGAGTCACC CATTATTGGA  ACCCATAGAC CAAATGAGGG TTTATCCCAA GAAAATATGA GGAGGATCCT TTGAAGGAGG AAATGCCACT AATTGGGAAC TCACAAAAGG CCTAGTGCTT CCGTACAAGA AAGAAAATTC  TCCAAGTGGA TATCATAAGA GTTGGATTGT GAGAAGACTA TGAGTTCAAA GAGAGGTGTA GGAATAGATA TGAATCCCAA AATTTTAAGA ATATTTGAAT CTTATAATTA CCTATTTTGG  GCTGTCAAGT TCACTGGGAC AAAGATGGAT TTGCCACCGA GGGTAATAGA TCACCAAATA TGATAATTAG TGGCTAATCA TATAGGTCCC TTTCTAAGAA TCAAGGGAAT TTTCAAGATA 
TCGACCAAAT TATCACAAGA TAAATGGAAA TCAACAACCC CACAGATTTT TGGAGAATAA AAAATCTTTC ACATCTTGAT 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTAGCT CTCGCTTGAC GGAGATGCTG CTCCTTATGG CGATCATCGG GTTGACGGCT GCCGCGTCGA GCTCAAATGT GGAAGCTCTG TCGACGGATT ACTACGCAGC CTCCTGCCCT  TTCGCGGAGA TGATAGTCAG GAACAGTGTA GCGGAAGCTC TCCGGAGGGA TCCCACTCTC ACGGCGCCGC TTCTGAGGAT GCACTTCCAC GACTGCTTCG TGGAGGTACT AGGTTTTTAA  TCTCTGTTAT TCTTATATCC TTTATCCTCG GCGTGTTCTT CATCCAGTTG GCTTGTTCAG GGATGCGACG GCTCTGTTCT GATCGATAGC ACGAAGGGGA ACAAGGCAGA GAAAGACTCC  CCCGCAAATC TAAGCCTCCG GGGCTTCGAG GTCATCGACC AGGCAAAAGC AGCCGTAGAA CAGCACTGTC CCGGAGTCGT CTCCTGCGCG GATATCGTCG CCATGGCGGC CAGGGATGCG  GTCCTCTGGG TAATGAACTC ATAATATAAG TAAAAACTCT TCGTCGGGGA CGTTAACTTT TTTGTTTGAC TGAATGTTTG ACCCCTCTCA GGCCGGAGGT CCGGTGTACG AGATCCCCAA  GGGACGACTG GACGGACGGA GATCAAGAAT CGAGGACACC GTCAACCTCC CTCCCCCGAC TCTCAACAGC TCTGCCCTGA TCAGAACGTT CGGTCAACGA GGGTTCACTG TTCAGGATAT  GGTCGCCCTG AGTGGTATAT TTCGGTCAAC GCGGACCTAC TTTGACTTTT TGCTTGCGGG ATCTGACGAT GACTGTATTG CAGGCGGGCA CACTCTGGGC GTGGCGCGGT GCGCCTCGTT  CAAGAACAGG CTGAGCAACT TTGATTCGGT CAACAAGGTT GACCCCACCC TTGACCAGAA CTTCGCCAAG ATGTTGACCA GAACCTGCGC CTCGGGGGAC AGTGCAGTAG TCTCCTTAGA  CTCTACCAGG ACCTTCTTCG ACAACGCTTA CTTCAGGGCG TTGACCGTAG GGGGAGGACT GTTGACCTCC GACCAGACTC TATTCACTAG CCCGGAGACG AGGGGACTGG TGTACGGGTA  CGCCATAAAC CAGGCCAAGT TCTTCGTGGA CTTCTCGCAG GCCATGGTCA AGATGGGTCT GCTCAACGTG AAAGGCGGCG CCATGGGGGA GGTCCGCAGG GACTGCCGTA GAGTCAACTG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTAGCT CTCGCTTGAC GGAGATGCTG CTCCTTATGG CGATCATCGG GTTGACGGCT GCCGCGTCGA GCTCAAATGT GGAAGCTCTG TCGACGGATT ACTACGCAGC CTCCTGCCCT  TTCGCGGAGA TGATAGTCAG GAACAGTGTA GCGGAAGCTC TCCGGAGGGA TCCCACTCTC ACGGCGCCGC TTCTGAGGAT GCACTTCCAC GACTGCTTCG TGGAGGGATG CGACGGCTCT  GTTCTGATCG ATAGCACGAA GGGGAACAAG GCAGAGAAAG ACTCCCCCGC AAATCTAAGC CTCCGGGGCT TCGAGGTCAT CGACCAGGCA AAAGCAGCCG TAGAACAGCA CTGTCCCGGA  GTCGTCTCCT GCGCGGATAT CGTCGCCATG GCGGCCAGGG ATGCGGTCCT CTGGGCCGGA GGTCCGGTGT ACGAGATCCC CAAGGGACGA CTGGACGGAC GGAGATCAAG AATCGAGGAC  ACCGTCAACC TCCCTCCCCC GACTCTCAAC AGCTCTGCCC TGATCAGAAC GTTCGGTCAA CGAGGGTTCA CTGTTCAGGA TATGGTCGCC CTGAGTGGCG GGCACACTCT GGGCGTGGCG  CGGTGCGCCT CGTTCAAGAA CAGGCTGAGC AACTTTGATT CGGTCAACAA GGTTGACCCC ACCCTTGACC AGAACTTCGC CAAGATGTTG ACCAGAACCT GCGCCTCGGG GGACAGTGCA  GTAGTCTCCT TAGACTCTAC CAGGACCTTC TTCGACAACG CTTACTTCAG GGCGTTGACC GTAGGGGGAG GACTGTTGAC CTCCGACCAG ACTCTATTCA CTAGCCCGGA GACGAGGGGA  CTGGTGTACG GGTACGCCAT AAACCAGGCC AAGTTCTTCG TGGACTTCTC GCAGGCCATG GTCAAGATGG GTCTGCTCAA CGTGAAAGGC GGCGCCATGG GGGAGGTCCG CAGGGACTGC 
CGTAGAGTCA ACTGA 

Retrieve as FASTA