Entry information : LminPrx30(Lemmin6g0175460.t1)
Entry ID 18828
Creation 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LminPrx30(Lemmin6g0175460.t1)
Name LminPrx30(Lemmin6g0175460.t1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx028]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminPrx30
start..stop
S start..stop
LminPrx16 612 0 1..324 1..324
LminPrx31 603 0 1..324 1..323
SpolPrx26 523 0 24..324 14..314
CescPrx48 468 8.29e-168 1..324 1..322
Literature and cross-references LminPrx30(Lemmin6g0175460.t1)
Protein sequence: LminPrx30(Lemmin6g0175460.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   324 (303)
PWM (Da):   %s   34515.59 (32360.4)  
PI (pH):   %s   7.7 (7.70) Peptide Signal:   %s   cut: 22 range:22-324
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASSRLTEML LLVAIIGLTA AGSRSNVEAL STDYYAATCP FAEMIVRNSV AEALRSDPTL TAPLLRMHFH DCFVEGCDGS VLIDSAKGNK AEKDSSANLS LRGFEVIDQA KAAVEQHCPG  VVSCADIVAM AARDAVLWAG GPAYEIPKGR LDGRRSRIED TVNLPPPTLN SSALIKTFGQ RGLTVQDMVA LSGAHTLGVA RCASFKNRLS NFDSVNKVDP TLDQTFAKSL TKTCAAGDGV 
LVPLDSTRTL FDNAYFRALT VGGGLLTSDQ TLFTSPETRE LVSGYALNKA KFFVDFSQAM VKMGLLNVKV GAAGEVRRDC RRFN 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTAGATTCAC CACATCTTGG TCAACACGAT TTACCTAAAT TTGGTAAAAC CAAACTGAAC AAATTTTTTG GTTTTCAAAA ATTGGGAATA CCGAATTTCA GTATTGGATC TAGTTTGTCG  TTTCAATAAA ACCGGAATAC TGATCTACAG GAGATCAAAG GCTAGTTGGG TGAGACAATG GTTCAGGCCC AACAATGGAG TGCATCCCCA ATGGGTCAAT GAGAGAGAGG AATAGAGTGA  TAGAGAGATA GCAAGATATA GAGAAATATG AGAAAAAGAG GGAGAGAGAG AGACTGGAGA GATAGATAGA GAGAAAGAGA GAGATAGAGT GATAGAGAGA AGAGAGAGAT AGAGTGATAG  AGGGGTAGAT ACATAGTGAT AAAGAGAGAT ATAATGAAAG AGAGATAAAG GGATAGAGAG GGATAGAGAG ATAGTGATAA AGAGAGATAG AGGGATAGAG AGAGATAGAG TGATAGAGAG  AGATAGAGTG ATAGAGAGAT AAAGAGATAG AGACTTGAGA GATTGAAGAT AGAGTGGTAA AGAACTAGAG AGAGATATAG AGAGAGAGAT GATAGAGAGA TAAAGAGAGA GATATAGAGA  TGGAGTGATA GAGAGAGATA TAGTGATAGA GAGATAGAGA TAGAGATAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GGTTAGTAGT GATTGAGAGA GATAGAGAGG  TTAATGAGGG ATTGAGAGAG ATAGAGATAG ATAGAGAGAG AGGGACAGAG ATAAAGTGAT GTAGCGAGAT AAAGTGATAC AAAGATATAG AGATTGAGAG ATAGAAGAAG ATAAAGCTTT  GGTCAGCATT TTGGGAAACC TCTCACTGGT TAAGTTTCGG TAAACTGGTC AACAGTCATG ACATAAATGA TATGACAGTC AGGAACAGGT ACCTGACCAA ATCTATGTAT AGGTTTATGT  TATTTATGAA AAACTGAAAC GAAACCAAAA ACGTTGATCC CTAACCGCAT CATTGTCACT CAACCATTGA GGGAGGTAAT GATGTTGATC AACTTCCACG GGTATCAATC AGAAATAGCC  CTAAAACCCT TGATTGATGG TCAGTTTTCT TTAAAGAAGG TCAGGTACTG CTTGATTTCA GCATATTCTT CAGCTTTTTT CATTCCTATT TCCGACTGTT GGTTCCTGCA GGCGATTGAT  GATCTCCATT GACGACTTTC TCTCCATGTA ATACACGTAT CACGCAGTCT CCCCAAATAT CAAGTCTTCC CCAAGGATGA TCGTATCTAA TTGATGACTA CGAGATCATC GTGCGAATTC  GGTCGAGCTC CACGGAACCA AGTTTCATCT GGCACAGACG AATCCTTTTA AATCTCACGA TTCACGAACA GTGCGATCCG AGTGTTAGAC GATCAGTTCT ACCGGTATTC AAGTACCTAG  AGCTTTGACC ACAGAATTCC AGGCCAGAAG AAACTTTTAG TCAATGCCCA ACTGCGGTTG AGGAAGATGT GGCCACTCCA GTCTTTCCCG ATCCCTTTCT CCCTCCTCTT ACGGTCATTG  GGGGGGAGGA GAGAGAGAGT AGCGATGTTA TGGGAGATAA TCTTATCACC CGGAAGGGGA TAAAGAAAGA CGAGAATCAG AACGTGGAGA TCAACTGCAA CCTCTTGACT GCCGGTCAAC  GCGTCCCGGC TTGTCGTTTT CCCTCTGCAA AAGAACATGC TCGCACCGGC GGCGTCCATG CTGATGATAA TGGTCAGGAA GATCATGAGC TTTTAGAGCT GTTGTTTAAG TAAAGCAGCT  TCTTGTGCTG GGGTGAGTGT CATTCGTTGT CAGCAGGAGT CCTTATCTAA TGCATCACCG AGCAAGTGAC GTGTGTTTTA GGCAGATGGG GAGGCGATAG CGGCTATAAA TTCCCGAACA 
AGCTTTGCCT TCCAACATCA GCTCGCAAAT CCACGTCTTC TTCCGTCTTG AGCCTCTCGA AGAACTGTGA AAGGATTCTG 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GTCATTGGAG GAACAGAGAT CAAAGATCGT GATTAGGTTT CAATTGTGAA CTCCACCGCT TCACTCTAAT TTGGAGCCAG GAATAAAGCT CGCGAGAGCC ATTTTCTCAG TCCTAAGTGG  ATTTCAGCTT TACATGAGTT TTCAATGTAG TTCGACGTGC TTTTTTATTG AGTAATAAAA ATATGGGAAG ACAAGGACCG TGTTGAACAT TTGGACATTG TTCTGAACAT CTTTGAGCTT  CTACCATTCT TCCAGAATGG TATGGTTGAT GATCAAATTT TCATATTCCT ATTGGTATGT CTGGAGTTCT ATTGCTTGAG TTGCTCATCT GTTGGGATAT TACTAGGCCT TAAATGTGTA  TTCTTTGATG TCTAGATGTG ACTTGTAATT TGCCTTCAAA TGGGCCTCCA ACTGCCTTCA AAGTGGGCCT TCAAATTGGT GCCTTAGCAG GCTTCAGTTG TGGGTCTTCA ATTAAGCCTA  GTAGGCTTCT GTCTCCCCGT TCTTTTTGAG CCATGAATAA AGGCCCCCTC TCTCGGAGCT TAATGGACCT CATGATAAAA CGAAGATGAT GCTCCTCTTA GCTCTTCTTG TTCTCCAATG  GATGATGCTC AATGATATGC TCTTACAAGG TTTGTATGAC CTTCTATATT CTATCACTTA TGTAACTTTG GATCAATCTT GAATAAGATC GAGTAATGTG GGTTTATAAC TTGATATAGT  TTATGATGCT TACCCAAGCG ATGGAATTGT GGCTGCAAGA TGAAAAGTGG GTGCTTGAAG CATCCTCGTC ACATGTAAAA GAATTTATCT TTTTCAATTA TCTCATATTT GAAGATGTTG  GCAATTATGC TCATCTAACC TTGCATAATC AATGTCAAGA ACACTGCGAG AACTCGTGCC AAGTGATTTC AAGAAGCATG ATTGTTAATA GATGCAATTG TGCCCTCTTG TCCTAATAAG  CTAATGGGAC TCAATGTACT TACTTTCTTT CCTCTATATA TATGTATAAA TATGACTATT GATCGTAGTA TGATTAAAAT ATGAATAAAA AACTATTTTC TCTATCAATT GACTAAGGAG  ACTAACTCTA TAGACAATGT TCAATCAAGT CACTGTGAGG TAGATTAGCT TCTCAAGTAG ACGTTAGTAA CAACTAGCGT CATCCAGTAG TAGTGAGTAA GCATCCTAGA ATTTAGGACG  AGCCTCTATG GGTGATGACT CTAGCTTGCA TCCAACAAGA CATTTTCTTG AGAAGATCAA GAGCACACTT CTATTAGAAT AGAGCGAGTT TGCCTAGCTG TTAGGCGAAT TCGATCGCAA  TGAAGTAGCG AGGAGTCCCC ATGTTCGAAG TACTAAAATG TTGTTAGAGA TAGGTCGTGA TGTATGTCTC ATTACTACTT GTCAACAAAA TATCATCGAC ATAGACCACG GTGACCACCA  TACTTCCAGG AGTTTGTTCG ATGGGAACTG TGGAATCGAT GACACAGGGA GTGAAGCCTA CGTAGGAGAG GTGTCCAATG AACCATAATC GAGGGCTTTT TTTGAGGTCG TAGAGTACTT  TTTGAAGGAT ACGAGACCTT GGAAGATGCC CTATTAGCAA CCTACCTTGG AGTTTGCTCC ATTTAGACTT GTTGGTCTAA ATCACCTTAT AGAGAGATGT TAGACACATC TAGCTAATGA  AGGCTATAAT TTTGATTGAT AGCCAAGGAG ATGAGCACAT GGATGGAGAT CAATTAGGAG ATATGATATA AGGTCTCGGT GAAGTCCATA CTATAGGTAG GCCTAAATGA AGCCATGCAC  CACCAAGAGA GCTTCATGAT GAGCGATGTT GTCATCCAGG TTATATTTGA TTGCAAAAAC CATTTGAAAA TCACAATATT GGTGTCACCA GGGCGAGGAA CAAACTCCCA TGTCACACAT 
GTAAGAAGAA TTCCAACTTT CATGTCCATA GCTTCCTTCC ATTCAGGGAC CTAAAGTATC TCAACATCCG ATCGTGGTAT 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTAGCT CTCGCTTGAC GGAGATGCTG CTTCTTGTAG CGATCATCGG GTTGACGGCT GCCGGGTCGA GGTCAAATGT GGAAGCTCTG TCGACGGATT ACTACGCGGC CACCTGCCCT  TTCGCGGAGA TGATAGTCAG GAACAGTGTA GCGGAGGCTC TCCGGAGCGA TCCCACTCTC ACGGCGCCGC TTCTGAGGAT GCACTTCCAC GACTGCTTCG TGGAGGTACT AGGTTTTTAT  TCGCTGTTGT TTTTCTTAAT CCCTTATCCT CCGCGTGTTC TTCACCGGGT TGGCCTGTTC AGGGATGCGA CGGCTCCGTT CTGATCGACA GCGCGAAGGG GAACAAGGCA GAGAAAGACT  CCTCCGCAAA TCTAAGTCTC CGGGGTTTCG AGGTCATCGA CCAGGCAAAA GCAGCGGTGG AACAGCACTG CCCCGGAGTC GTCTCCTGCG CGGACATCGT CGCCATGGCG GCCAGGGACG  CAGTCCTCTG GGTAATGAAG CCGGTGAATT TCTCGGTAGG AAGCCGGTGA CTATATTTGA CCATATTTTG TATCCCTCTC AGGCCGGAGG TCCGGCATAC GAGATCCCGA AGGGAAGACT  AGACGGCCGG AGATCCAGAA TCGAGGACAC GGTCAACCTC CCTCCCCCGA CTCTCAACAG CTCGGCCCTG ATCAAAACGT TCGGTCAACG AGGGCTCACT GTTCAGGATA TGGTCGCCCT  CAGCGGTATA CTTCGGTCAA CGACTGTTAG CTTCGGCTTC TAGCTCTCCT TCTCTCACCA CGATTGCGTT GCAGGTGCAC ACACTCTGGG CGTGGCGCGG TGCGCCTCGT TCAAGAACAG  GCTGAGCAAC TTTGATTCGG TCAACAAGGT TGACCCGACC CTCGACCAGA CCTTTGCGAA GTCGCTGACC AAGACCTGCG CCGCCGGAGA TGGTGTGCTG GTCCCCTTGG ACTCGACCAG  GACCTTGTTC GACAACGCTT ACTTCAGGGC GTTGACCGTG GGTGGTGGAC TGCTGACCTC CGACCAGACT CTATTCACGA GCCCGGAGAC GAGGGAGCTG GTCAGCGGGT ATGCTCTGAA 
CAAGGCCAAG TTCTTCGTGG ACTTCTCGCA GGCCATGGTC AAGATGGGCC TGCTCAACGT CAAAGTAGGG GCGGCGGGGG AGGTGCGCCG GGACTGTCGC AGATTCAACT AA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTAGCT CTCGCTTGAC GGAGATGCTG CTTCTTGTAG CGATCATCGG GTTGACGGCT GCCGGGTCGA GGTCAAATGT GGAAGCTCTG TCGACGGATT ACTACGCGGC CACCTGCCCT  TTCGCGGAGA TGATAGTCAG GAACAGTGTA GCGGAGGCTC TCCGGAGCGA TCCCACTCTC ACGGCGCCGC TTCTGAGGAT GCACTTCCAC GACTGCTTCG TGGAGGGATG CGACGGCTCC  GTTCTGATCG ACAGCGCGAA GGGGAACAAG GCAGAGAAAG ACTCCTCCGC AAATCTAAGT CTCCGGGGTT TCGAGGTCAT CGACCAGGCA AAAGCAGCGG TGGAACAGCA CTGCCCCGGA  GTCGTCTCCT GCGCGGACAT CGTCGCCATG GCGGCCAGGG ACGCAGTCCT CTGGGCCGGA GGTCCGGCAT ACGAGATCCC GAAGGGAAGA CTAGACGGCC GGAGATCCAG AATCGAGGAC  ACGGTCAACC TCCCTCCCCC GACTCTCAAC AGCTCGGCCC TGATCAAAAC GTTCGGTCAA CGAGGGCTCA CTGTTCAGGA TATGGTCGCC CTCAGCGGTG CACACACTCT GGGCGTGGCG  CGGTGCGCCT CGTTCAAGAA CAGGCTGAGC AACTTTGATT CGGTCAACAA GGTTGACCCG ACCCTCGACC AGACCTTTGC GAAGTCGCTG ACCAAGACCT GCGCCGCCGG AGATGGTGTG  CTGGTCCCCT TGGACTCGAC CAGGACCTTG TTCGACAACG CTTACTTCAG GGCGTTGACC GTGGGTGGTG GACTGCTGAC CTCCGACCAG ACTCTATTCA CGAGCCCGGA GACGAGGGAG  CTGGTCAGCG GGTATGCTCT GAACAAGGCC AAGTTCTTCG TGGACTTCTC GCAGGCCATG GTCAAGATGG GCCTGCTCAA CGTCAAAGTA GGGGCGGCGG GGGAGGTGCG CCGGGACTGT 
CGCAGATTCA ACTAA 

Retrieve as FASTA