Entry information : LminPrx31(Lemmin6g0175480.t1)
Entry ID 18829
Creation 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LminPrx31(Lemmin6g0175480.t1)
Name LminPrx31(Lemmin6g0175480.t1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx028]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminPrx31
start..stop
S start..stop
LminPrx16 644 0 1..323 1..324
LminPrx30 603 0 1..323 1..324
SpolPrx26 541 0 23..323 14..314
CescPrx48 485 1.79e-174 1..323 1..322
Literature and cross-references LminPrx31(Lemmin6g0175480.t1)
Protein sequence: LminPrx31(Lemmin6g0175480.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   323 (299)
PWM (Da):   %s   34768.45 (32309.1)  
PI (pH):   %s   7.98 (7.70) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-323
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASSRLAEML LLTVIGLMAA GSRSNVEALS MDYYAATCPF AEMIVRNSVA EALRRDPTLT APLLRMHFHD CFVEGCDGSV LIDSTKGNKA EKDSPANLSL RGFEVIDQAK AAVEQHCPGV  VSCADIVAMA ARDAVLWAGG PVYEIPKGRL DGRRSRIEDT VNLPPPTLNS SALIRTFGQR GFTVQDMVAL SGGHTLGVAR CASFKNRLSN FDSVNKVDPT LDQNFAKMLT RTCASGDSAV 
VSFDSTRTFF DNAYFRALTV GGGLLTSDQT LFTSPETRGL VYGYAINQAK FFVDFSQAMV KMGLLNVKGG AMGEVRRDCR RVN 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TCTCATGAGT AAGCAAGGAA CCAACACTAT TCTCCAGTGT AGTCGCGCTT AGGTTATTTA CCTCTTTGAG GGCAAAGACC TTAATTTTCC ACTCAACACC GAGTGAATTT AGGAGTTTCA  TATTGAACTA AAGAGTTTTA TAAGTCTTTC TTAGGTTCCT CGTTGTGTTG ACTAATTAGC GCAACAAATC AAACCCTCCT ACAACATCTC TAATGTTCTG TCCATCCTTC GCCTTAATCA  ACTCAAAGTC ATTGTCTAAG ATCCTTATTT TGATATATTT GGCTTATAAC AACCTTTTCC CAAATATTCT TTGTTGTATC CCAGTTGGAG ACTCGAGGAA ATTCAATGTC TGAGAATAAT  CATGGTGAGT CTCGATCAGA TCATGGTGAG TCTGAGTATC AAATCATGAC GAATCAAAGA AAAACAGATC ATGGGATATA AGGAATCAGA TAGTAATGAT TGAATTGACA GATCAAACTG  TGGTGAATAT ATTAATACAG TTCGTGGACG AGATTCGGTT ATGATATGAT GAAAATGGCA TCCATAGTAT CACACATGAT TAAGGGTGGC GAAAATCTTA TCTTGAGAAC AGATGGAGAT  GAATTAGTGA TCTGTAGAGG AAGATTTTGA TACTTTCTTT GATATCAGAT GATAGAAACC TAATGGAGGA TGAGCATCTT GATGATTTCT TGAAAATCAG ATGGTGATGC CTTGATGAAT  TCAAAATATC CTATTGTTTC TCTCTCCACT GTATATATTT CCTCTCTCTC TCTCTCTCAT CAAATCTCAC TTCCAGATCT CTCTCTTATC AATCACCCAT TTTGAAAATT CAAAATCCTT  GACTATATTT ACAGATCTTG AATCTCTCTC ATCTCCTTTC AAGTTTGACT CCAAAATTGA CTATTCTTTG ACCCACATTA AATTAATGAT TACCCTAATT TTAATCTTCA ATTCCATTCA  ATCTGATCTC AAACTCATGA TCGATGGGGA CATTCATCAA AACATACCCA AATTGTGAAA CTTTATCTAA GACTAGATGT CTTCGTCTTC CAGTCTTACA GATATCCAAG ATTATCCATG  CCGTTCTATG CAGCCGACTA GCTATCATGG CGGATTAGCT ATGTAGATTT GATCTCTCGT ACATCGATGA CCTCAACAGA ATCCCCGGTT TTCATGAAAT AGATTTCCTT CTATCCCATT  CGTGGGCAAA CAAGAAATAG CCTAGAAGAG TCTCTTTTCA GCAAACGAGG AGTGGAGAAC CAGCTCATTC CGCACTTGGA CGCAGGCATG AACGCTTCAG GACTTGTTTC TCGAACTTCA  AGGAACCATC GTGCGAATTA GGCAGAGCTC CATGGAACCA GGCTTCGTAT TCTTTGAAGT ATCGTGAACA GTGCGGTCCG TGTTCGACAA TCAGTTCGAG CGGCTTTCAA GAACCAGGAG  CTTTGACCAG TGGATGCCAA GAAAGGTTTC AGGAGAGAAA GAAGAAACCT TTAGCCTGCG TCGGAAAGCA GTTGAGGACG ATGTGGATGC TGATCTCTCT CTCTCTCCTC TTCGGCTGGA  AGAGAGAGAA GCCTTGGATA CCGCCATTGC CGGGAAACTG CGAGTTGGGA AATACTATCG TATCATGCGG AGGCTAACAT CGGCGTGGAG AATAAAGAAG GAAGAGAATC TGAACGTGGA  AACCAGCTGC AACCTATTGA CTCGCGGTCA ACCTGTCCAG CTTGTCGTTT TCTCTGTGTA ACGTTTGCTG CTGATGATGA TCGAGGATAT GAGTAGCTTT GAGAGCTGTT TTTAAACAAA  AGCAGCTTCT TGTGCTGGTG TGAGTGCCCT TCCTTGCTCA GCAGGATTCC TTATCTGGTT CTCACAGAGA GACAGATAGG AAGGCCATGT CGGCTATAAA TACACAAACA AGGCGGCACT 
CGTTCTTCCC ATCGAACACC AGCTCACACA TCTTAGTCTT CCTTCTTGCT CATCCTCTCC AAGATCGTGA AAGCAGTCTG 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GCGAAAGGAG AAAAATCAAA TAATCATGCT AAGATTGGGG GTGACAACTC AGACCCTTTT CAGACTGTTG AGAGTCAGGA ATAAAGCTCG CAAGGGCCCT TGTATCAATC CAAAGTGGAT  TTCAATGGCG TGATTTGGAG TGATTTCTCT CTGTAAGGCA CTGGGCGAGT GGAGGGTTTA CCTCTCCCGT TGCCCTACCT CATTTTTTTA TCTGATATCC CCACTTCTCT CTTTTTTCAT  GGTACCAGAG CTCAATTTCC CTCATAGCAC ATGGTTTTCT TCTTTTTCTT CCCATTCCAA GGGTAATCTT CTACTCAGCT GCTTCCCCTT CATGGCTAAA TGGTGTTCAA AGATGGAAAC  TTCATAGAAT CTAGCAGCTG CATCACAGTT CTATTTGAGA TGTCCTGAAA CTCCCTGATT CTCTTATTGG TGCATTGGTA TATTGCATTG ATTTGGAGAT ATAATGGGGT ACTTTTTCTC  TCTTCTTGGT GAAATGGTTA AATTGTTTTG CACTATGACT AGCTTGTGAT GGAGACAATT CATGATGTCA TTTGAATGGA TCATTTTAGT CTTTATGGAT GAGTTATGGT GATCTTAAAG  CCTCATTTGA ACCATTTCCT CACTTTTATC AATAAAATAA AATTCTAAGT ACTGTCAAAT TTATCCCTAC TAGTTTAGCC CCACAACCTC AAAATACTAC TATCTCTTGG TACTTAGGTT  CTGGAGCTAC TGATCATATG ACCCCTTCTA CGAAATGGCA TGCATATTCT AAATTTATTT CTATTCCTAA AGCTATTAAC GCTGTTAACT TCTCACCCAT TTCCTTACGT GTTTTTTGCG  CTATATTTAT CTCCCATATC TCTGTTACAA ATGTTCTTCA TGTACCCAAT CTATATGCTG GCCTCGTACT TGTTTACTAA GTAACTAATC TGATGAGGTC AACAAGCTAC TCAATACGCC  TATCTCTCAA GTAAACTCTA GGGAGACAAC ACACACTCAA AGAGCACTAC AAGAGAGATA TCACCAAGTT CTTGGGTCAG CCCTTCCAAA GGGGACTGCA AGAATTAGGG TTAACCCTAA  TAGAGGGGTC TACTTGGACC AAGTCAATCA GATACTTCCC CTTATATTGG ATCCTAATTG GGATATTAAG TCACCCATTG TTGGAGCCCT TAGATCAAAT GAGGGTTTAT CCCAAGAAAA  ATATGAGGAG GAACCTTTGA AGAAGTATAT GTCACTAGTT GAGGACTCAA AAAAGGCCTA GTGATGTGGT ACAAGAAAGA AAATTCTCCA AGTGAATATC TTGAGAGTTG GATCGTGAGA  AGACTATGAC TTCAAAGAGA GGTATAGGAA TATATATGAA TCCCACAATT TTAAGAAGAT TAGAACCTTA TAATGACCTC TTTTGACCTG TCAAGTTCAC TGGGACAAAG ATGGACTTGC  AACTGAGGGT AATAGATCAC CAAATGTGAT CATTAGTGGC TAATCCTATA AGTCCCTCTC TAAGAATCAA GGGAATTTAA AAAATATCGA CCAAATTATC ACTAGATAAA TGGAAATCAA  CAACCACGTA TCTCGTTGGA GAATCAATGG ATGAAGAGTT CATGTGGTTC TTGATTGGTG AAATTCTCCA TATATGATTT ACCACATCTT GGAAAGAGAA AGAATGAGAA TTTTGAAGAG  GAACAAGAGA ATGGAGTATA AACTCCTAGG TTCAAGAAAG GGGAAGTAGA TGGATGTTAT GGGGGAAGGG AGAGAGGTAG CGTTGGATAG GATGAAGAGG GGAAACAAAG AGAGAGAAAG  AGATCTTCAA CTTTCATTTA ACCTTAAAAA TAGAGAACAT AGCGTAATTT ATAGGAACTA ATTTTGGGGG CGGATACATG TGTACGAGAA AGAAGGGGAA GTTAATAGGT ATATCTTAAA 
TTAGGGAAGT TAAGGGCTCC TATTAATGCG GGCATCCACT AAAGAATAGA GGGAGTTTTG GCATCCCTTC CTCGAGCAAC 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTAGCT CTCGCTTGGC GGAGATGCTG CTCCTTACGG TGATCGGGTT GATGGCTGCG GGGTCGAGGT CAAATGTGGA AGCTCTGTCG ATGGATTACT ACGCAGCCAC CTGCCCTTTC  GCGGAGATGA TAGTCAGGAA CAGTGTAGCG GAAGCTCTAC GGAGGGATCC CACTCTCACG GCGCCACTTC TGAGGATGCA CTTCCACGAC TGCTTCGTGG AGGTACTTTG TTTTTATTCT  CTGTTATTCT TATATCCTTT ATCCTCCGCG TGCGCTTCAT CGAGTTGGCT TGTTCAGGGA TGCGACGGCT CCGTTCTGAT CGATAGCACG AAGGGGAACA AGGCAGAGAA AGACTCCCCC  GCAAATCTAA GCCTCCGGGG ATTCGAGGTC ATCGACCAGG CAAAAGCAGC CGTAGAACAG CACTGCCCCG GAGTCGTCTC CTGCGCGGAT ATCGTCGCCA TGGCGGCCAG GGATGCGGTC  CTCTGGGTAA TGAACGCATA ATCTTAGTAA AAACTCTTCG TCTGGGACGT CAACTTTTTT GTTGGACTGA ATGTTTGACC TCTGTCAGGC CGGAGGTCCG GTGTACGAGA TCCCCAAGGG  ACGACTGGAC GGACGGAGAT CCAGAATCGA GGACACGGTC AACCTCCCTC CCCCAACTCT CAACAGCTCT GCCTTGATCA GAACGTTCGG TCAGCGAGGG TTCACTGTTC AGGATATGGT  CGCCCTGAGT GGTATATTTC GGTCAACGCG GAGCTAATTT GACTTTTTGC TTGCGGGATC TGACGATGAC TACATTGCAG GCGGGCACAC TCTCGGCGTG GCGCGGTGCG CCTCCTTCAA  GAACAGGCTG AGCAACTTTG ACTCGGTCAA CAAGGTTGAC CCCACCCTTG ACCAGAACTT CGCCAAGATG TTGACCAGAA CCTGCGCCTC GGGGGACAGT GCAGTGGTCT CCTTTGACTC  GACGAGGACC TTCTTCGACA ATGCTTACTT CAGGGCGTTG ACCGTCGGGG GAGGACTGTT GACCTCCGAC CAGACTCTAT TCACTAGCCC GGAGACGAGG GGATTGGTGT ACGGTTACGC 
CATAAACCAG GCCAAGTTCT TCGTGGACTT CTCGCAGGCC ATGGTCAAGA TGGGTCTGCT CAACGTGAAA GGCGGCGCCA TGGGGGAGGT CCGGAGGGAC TGCCGTAGAG TCAACTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTAGCT CTCGCTTGGC GGAGATGCTG CTCCTTACGG TGATCGGGTT GATGGCTGCG GGGTCGAGGT CAAATGTGGA AGCTCTGTCG ATGGATTACT ACGCAGCCAC CTGCCCTTTC  GCGGAGATGA TAGTCAGGAA CAGTGTAGCG GAAGCTCTAC GGAGGGATCC CACTCTCACG GCGCCACTTC TGAGGATGCA CTTCCACGAC TGCTTCGTGG AGGGATGCGA CGGCTCCGTT  CTGATCGATA GCACGAAGGG GAACAAGGCA GAGAAAGACT CCCCCGCAAA TCTAAGCCTC CGGGGATTCG AGGTCATCGA CCAGGCAAAA GCAGCCGTAG AACAGCACTG CCCCGGAGTC  GTCTCCTGCG CGGATATCGT CGCCATGGCG GCCAGGGATG CGGTCCTCTG GGCCGGAGGT CCGGTGTACG AGATCCCCAA GGGACGACTG GACGGACGGA GATCCAGAAT CGAGGACACG  GTCAACCTCC CTCCCCCAAC TCTCAACAGC TCTGCCTTGA TCAGAACGTT CGGTCAGCGA GGGTTCACTG TTCAGGATAT GGTCGCCCTG AGTGGCGGGC ACACTCTCGG CGTGGCGCGG  TGCGCCTCCT TCAAGAACAG GCTGAGCAAC TTTGACTCGG TCAACAAGGT TGACCCCACC CTTGACCAGA ACTTCGCCAA GATGTTGACC AGAACCTGCG CCTCGGGGGA CAGTGCAGTG  GTCTCCTTTG ACTCGACGAG GACCTTCTTC GACAATGCTT ACTTCAGGGC GTTGACCGTC GGGGGAGGAC TGTTGACCTC CGACCAGACT CTATTCACTA GCCCGGAGAC GAGGGGATTG  GTGTACGGTT ACGCCATAAA CCAGGCCAAG TTCTTCGTGG ACTTCTCGCA GGCCATGGTC AAGATGGGTC TGCTCAACGT GAAAGGCGGC GCCATGGGGG AGGTCCGGAG GGACTGCCGT 
AGAGTCAACT GA 

Retrieve as FASTA