Entry information : LminAPx09(Lemmin31g0659960.t1)
Entry ID 18912
Creation 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LminAPx09(Lemmin31g0659960.t1)
Name LminAPx09(Lemmin31g0659960.t1)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx2002]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminAPx09
start..stop
S start..stop
LminAPx08 696 0 1..363 1..363
SpolAPx04 560 0 1..362 1..362
CescAPx05 521 0 1..360 36..392
SpolAPx02 517 0 35..362 47..372
Literature and cross-references LminAPx09(Lemmin31g0659960.t1)
Protein sequence: LminAPx09(Lemmin31g0659960.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   363
PWM (Da):   %s   39558.08  
PI (pH):   %s   8.42
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MACLRASVLS PAVAASRPMI SPSGYFPSPS SFSFVSVPPS ASRLSSTRFF AVCPSRPIIY LNPHAGLGPV RASSGNPSAK SFASDPKQLR SAKNDIVELL RTTFCHPIMI RLGWHDAGTY  DKNIREWPKR GGANGSLRFE VELKHAANAG LVNALNLLRP IKDRYPGITY ADLFQLASAT AVEHAGGPKI PMKYGRVDVT KSEESPEEGR LPDAGPPSPA AHLRAVFYRM GLDDKEIVAL  SGAHTLGRSR PERSGWGKSE TKYTKDGPGK PGGHSWTVQW LKFDNSYFKE IKERKDEDLL VLPTDAVLFE DPSFKVYAER YAEDERAFFE DYAAAHSKLS NLGAEFDPPP GVSIDDVSES 
SKA 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGGTATAAAA AAAAGCTCCA TAATTGATAC GGCAATATAA CAAATTATAG GTTGGTTGAG CCCTTGGTAT GGATTGTGCC ACCTAGACTC AATCCTAGCC ATCCAAATCA AGGGAAATTA  AAGGGCCACG TTGAGTCATG GTGGATGAAG GTTAGGTAAC AACCTAGACA CGCACACCAC CTTCCTAGCC TCTTCATGGT GATCGAAAAG TGTCCAAGGG CTGTTCATCT CTCTCAAAGA  CACGTAAGTT AGAATTATGG GATAGATGAA ACCAAAGAGG GGGAGAGATT TAGGTTTCCA TGTTTTTTTA ATCCAATTTT ATCTTTTTTC TTAAATTGTT TAATTACTAT TCTAGATCAC  TCGCCCATGA AAAAAGACTG ATTTTTATAC TAGTTAGGCA TGTATATGTC TAATCAATGC CAACAAGAAG TAGCATGCCA AGAAAGAGAG GCATGAAAGG TGGTTCAAAT TAGGTGCAAA  TAGGGACTTT GTTAACTCCC TAGTTAGAGA GCAGCCAGCC ACTTGGTTAA AGTGGATGCT CAAGACCCGT TCAAGCTTCT CCATTGTGAG ATTACAAACA TCATTTTTGT TCTTATAAGT  GGTAATTTTT TTGTGGTTAT CCTTGAGCCA CCTTGTTAGA ATAGAGGCTT ATTAGGCCCC TTAGGCCCCA TCAGCCCATT AAAGGGTAAC CTCACCTAGG GGGTGACCAC ACCTAGGTTC  ACCCTCCTTA GCCTCTCTTC TTCACATTCC ATCTCTTCGC CTCCTACCTC TTCACCTTCT ACTCTCACCC AATAATTAGT GACTCCATTT ATGTATCAAC TTGCTCAATC TAGTATAACT  ATATTCCCCG TGTCATTTGT CAACACACTC AAGAAAACAC ATGGGAGTTA TGGTGAGAGA ACGAGGATGA ATGGTAACAT AGCTCTAGGA TCTTTGATAA CCTGAGATCT TTAATTCGTT  ACATAGATCA CCGTTCATTC TATTAACCAA GGGAGCACTT CTATTAAATG AGCTCTATTT TGATTGCTCA TCATTCATAT AATCATCGTT TGATCTTCTA TTGAAAGGTA ATTTCATAAA  GGATCAAAAA GAACCTCAAG GAGAGAGACA TAAGATTCAT CAAGAGCATT AAAGGATATC AATAACCATC AACATGTACG AGAGATAATT TTGGGGGATT TATTCATTTA AATTATTCGA  TGATTGAATG TACTCTTGCC TTGATCTATA TTTTTCGAGC TATATTCCTT TTGTCCCATT AGATTAGGTG AAAGAGCCAA GGGGAGAGCA ACAAAGTGAA AGACCCGTTA AGGCATTTTC  AAGACACATT AAGAGAGCAA AAGTTCAAGG CCCAATTAGA GGAGTCAAAG TCCATGAATC TGGCACAAAA CTAAGGTCCA CAAAAGGAAG AGTTCGAGGG CCATAAAACA AGCTCAAACT  TTAAGCCCAA TAAAGCGTAT TCAAGGCCCA ATAAGAAAAA GATGGCCACC TTTAATCCAA TGAAGTGGAG AATCATTAGT GGCCACTCAA CAATGAGTCT TTGTCATGTG AATTAGAAAA  AAAGTGATAG TTTTGGTTAG TTTAGGGTTG AAAGTTTTAC TAATTTTTCT AGTCATTCAA AAACATAAAT CTTCTCCTAT GGTTTTCATT TACCAAAATG AATTATTCAA AAGAAGTCTT  ACAAGTTTCA ATGGGCAATG GAAAAAAAGA AGATTTTCAG TGGGATTCAA ACAGTGTTAA AAAACCAATC GAGGTTTTTG CCCACATGCC TTCAAGAAAG AAATAAAAAT CTGATTTTTT  TCTTGGGTGA GAGGAACTAG GGCCTTTGGG CCTTTGGGGT CTCTCTAGAG TCTAGAAGAT TGTCTGGCTC GATGTCGTGT GCCCCCAACG CAGCCTTATT CGACGATGTG TACTGACTTC 
TAAGCAAAAG GAACCAGTCT CACTGTCTCC TGATACCTGG GTCACTGGGT GTTTGTCTCC GAAACAGAGA AGCTCCCTCC 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AGAACTTTCT GCCTTCCTAA ATGGGCCGTG CCTGAAAAAG CCCATCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCCCCTCT TCGAGGACTT GTTGGACGTT ATTTGATTTA TAAATAGCGA  ATTTTTCGGA CTAGATAGAT GATCTTGAGT GGAAGCGGTG TTCTTCGAGT AGGGGGGACT GACGAACAGA GAATTCTCCA TTGACGGCAC GTTCCCCTAT CACGATCGAT TCGGCTGGAA  GGAAGAAGAT GAACCCAATT CCGGATTCGT GGCGTTTTCG CGGCTAGAGA AGAAGAAGAG AGAGAAAGTG GGTTTCTTCT TCTCGAACGT TTTCGCGTGA TCGAGATATC TCGGTTCTTT  CCTCCCGTTC TTCTCGTCGC GTCATAGGTT TCGGTATTGC TGTGGATTTG CTTAATGGCG AATTAGATCA GATTCGAATA GAATTTCGGG GGAAATTATT CGGCGTTGGG GGAAGAGGAT  CGTGGAGAAC CTCCCGTTGG CGGATTCGAT GATGATTCTT CCTTTGCTTT TTTGATCTTC TTACCAGTGA GTTAGTCACT TTTTTCTTGA GATTCAACGA AGAATACGTG TTCTTTTCTT  CTCAATTTGA GGATGGATCA AGCGATTCCC CTCTGTGTTG TACTCTTTCT CCGATTCTCC CGCCGAGATT GCAGTATCTT ACGATCAAAT ATGAACACCG CTTGTTCATA ACCATTCATC  AAGTTCCATT TCAAATTCCA GCTCATTCAT CTCAATAATT TTACACTAAA TACCTTCCCT ATAGTTCGTC TAATTTCCTG ATCAAGAACT TCATGATCCC TAGAAACTGA ATGCTGATTT  ATTATGATCA TTAAAGCATC TCCAAAAATA GGGATTTGAT TTTTGTACTG TTCTTACAGC TCTTTCTCAT TTGAATCATG CAGGCTATTC AATTAAACAT CGATGATGGA TCGTTCAAAG  ATATCTCAGT ATGAATAATG GCAGTCAATG AGGAACAAGT CAGTGACGAA AGTCAACAGT CAAGTGTTGA CCTTGACGTC GATGCATCCT GCCGAGTTTG TCATTGCGTG AGATCTGAAA  AATGGGCCAA CTCTGCCTTG GCTCACTTGA ACGTCATCCC TCCGTCAGGT TCAGAGTCCA AACCCAATCA AAATGATTCC AATTTTAACA CAAATCCAGC GATCGAGTTT GTGGGTCCAG  ATGGAAAAAT ATTTGTTTGT GACTCTGACC TCGAATCAGG ATCGTTCCGG TGGAAAGATT CTCTCTCAGA TCTCGGGTGT TCATGTAAGA ACGACCTCTC CCGGGCCCAT TATGCCTGCG  CGTTGAAGTG GTTCATCAGC CGAGGATCCA CTGTCTGCGA GATCTGCGGG TCCACGGCAA AAAACATCCG GCCTGAAGAT CTCAAGAAGA TTACATCATG TCTGAGAGAT TATGAATTAT  TGAGGGAAAG GACGGAAAAT GGGATTGTTG ACCGTTTACA AGTCAACGAA GACTCCGGGT TAGATCCTGT TGCTGTGGCA GCAGTGAGGA GACAGAGGCT CAGCGAGATA TCGGGCTGGT  TTAATCCTCG GAGCAGTTTC GGGCCCGTTT CGGTGGAAAC CAGCGGTCAA ATTGGTCAAC ATTTTATTGC AGAGAGGTCT CCCGAAAGTC AAAGTTCTGT AAGTAAGAGG GCGATGAAAC  TGACTGGGAT CCTAATCGCT ACCGGTCTGT TGAGTACTAC GTTGGCATGG CTGATTGCCC CTCGTGTTGG AAAGGTGTAT ATAGTTCGAA GAGTATTAAA TCCAAATTTA TTTATTTAAT  TAATTTCTCG CATTACTACG ATTAATGTAT TTATGTCTTA TTTATGCAGA ATACGGCAAA AAATGGTCTC CATATTCTAC TTGGAGGAAC GTGCGCTTTG GCGGTGGTGA TCTTCCTTCG 
TTTTGTAAGC AATAATTTTC AAAAAAAAAA AATTATTCTG TCAAAAATAA TTAGCGACAA AAAATGAGAA TATTAGGATA 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCTGTC TTCGCGCCTC CGTCCTCTCC CCTGCTGTGG CCGCGTCGAG GCCGATGATT TCTCCATCTG GGTATTTTCC ATCGCCGTCT TCTTTCAGCT TCGTCTCGGT TCCACCCTCC  GCTTCCCGCC TCTCTTCAAC AAGATTCTTC GCCGTCTGCC CTTCCCGCCC CATCATATAC CTGGTACGGA TCTCGCTCCT TTGAAGCCCA ATACGACGAA TTCTCGATGG CATTGTTCAC  TAGTTTGTCT TCCTGTTGGC AGAATCCCCA TGCCGGACTT GGACCAGTGC GCGCTTCTTC CGGAAACCCA TCTGCAAAGT CCTTCGCCTC CGATCCTAAA CAATTAAGAA GCGCAAAAAA  TGACATCGTG GAGCTACTTA GAACTACTTT TTGCCATCCC ATCATGGTTT ATTCTACACC TGTCATCTCT CTGTCATCGC TTCCTGGATC ATCTAATGAT CTTCTGTTTT TCAATGTTAG  ATCCGTCTGG GATGGCATGA TGCTGGCACA TACGATAAGA ACATCAGAGA GTGGCCCAAA AGAGGCGGCG CAAACGGAAG CCTGAGATTC GAAGTGGAGT TGAAACACGC TGCCAATGCC  GGTTCGTCTC TATTCTAGGG TTTAGGGTTT ATGGTTAAGG GTTTTGCTGA CGTGGCATTC TTCAGGCCTT GTAAATGCTT TGAATCTACT TAGGCCCATT AAGGACCGAT ACCCTGGAAT  CACTTACGCT GATCTATTTC AATTAGCTAG CGCGACTGCA GTGGAGGTTC ATAATCAATT TTTTTTAATT GTAATTTATT TTTTATTTAT AATTTTTGTT TTGTAAAATC AGCATGCAGG  AGGGCCCAAA ATTCCAATGA AGTATGGCCG AGTTGACGTC ACTAAGTCAG AGGAAAGCCC AGAAGAGGGA AGACTTCCTG GTATGCTAAT TTCATGTTTT TATTTAATGG AAATTCCTTT  ATCAATTGAG CATGAAATCC CCTTATTGCA TTATTTATTG GTTTTTTATT TAATTTCCTA GATGCTGGTC CACCCTCTCC TGCTGCACAC TTACGGGCCG TGTTCTACAG AATGGGTCTC  GATGATAAGG TTTGGATATA TCTATTTGTA TATATATAAT TAGAGAGAGA ATGAGTGAGG GGGGGGAGAG ATAGAGAGAG AGAGCAAAAT AAGAATTTGT GTGTCATGGA TAGAGAGACC  AAGAGGTTGT GTGTGTGAGA GATAGAGAGA GAGAGCAAAA TAAGAATTTG TGTGTCAGGG ATAGAGAGAC CAAGAGGTTG TGAGAGAGAG CGAGAGGGCG CACAATATGA ATGTGTGTGA  GAGATAGAGA GACCAAGAGA CTGTGTGTGT GTGTGTGTGA AAGAGAGAGA GAGATTAGCC AATTTTTTAA ATTATGGTTT TTGTGCATAG GAAATTGTTG CATTATCAGG GGCGCATACG  TTGGGAAGAT CGAGACCTGA ACGAAGCGGT TGGGGAAAGT CAGAGACAAA ATATACGGTA TGAATAAATA CCATCATTCA TTTTTGTTTT TTGATTGGAT AAAAAATTTG TGACTGGGAG  AAATTTTACT TGCCAAATTA TCTTCTACCT TACAGAAAGA TGGGCCTGGC AAACCCGGTG GTCATTCGTG GACCGTCCAG TGGTTGAAGT TCGACAACAG TTATTTCAAG GTGAGAATTA  AGATATAATT TAGTGAAAAA TCACCTTCTA TATATCTTGA ATCTTATGTG CCCACGGACC CAGAAAGTCC GTGGGCGGGC CCACACAATT GGGCCAAACC CATTGGCGGG TTCTTAAGCA  GTGATTACTG CTGGGAGTGG GAAGGAGAAT CGAAAGGAAG AAGATCCCTC TTGATAGGTA AGTGACATTA GGAAACCAGG AGCTTCTTGA ATTGCTCCCA CCTAACCCAC TGTCCATCTC  TCTGTCCTCT TGTTATCCTC CATCTCTCGT GAACTCAAAT AGTTTTCAAC ATCTATCATA CTAGTGTTCC ATCGCTGGTA TCCGAGCCAA TCTCGATGTC TTGCGCCTCT GCTTCCTGCC  TCTACCGCCC TTGTCTTCTC CACTCCTGCC ATCCCTGCCC CAGTCGCCTT GGTCTGGCAG CGCCACTGTC CTCTGCCGTC ACTACCATCC CCTCCATCCC CTCCATTGGG CCTTGAAGAA  CACCCCTCTT GATAGGGAGG TGACATTAGG AAACAAGGAG CTTCTTGAAT TGCTCCCACC TATCTCACTG TCCATCTCTC TAGCCTCTTG TCATCCTCCA TCTCTTGTGA AATCGATAGT  TTTCAATGTC TATCATTCTA GTGTTCCATC ACTGGTATCA GAGCCAATCT CGCTGTCTGC CGCCTCTGTT TGCTGCCTCT ACCGCTCCCA TCGTCTCCAC TCCTGCCATC TCTGCCTCTG  CCACCTCAGC CTAGCAGCGT CACTGTCCTC TGCCGTCGCC GCCAGCCCCC TCCATCCCCT CCCTCACGCC TTGGCCTCGC AACCCACAAG CCCAAGAAAA AGAACAAAAA AACTATCAAG  TTTGGGAGGT CCTCACAAGT ATTTTGCTTG TGCTCCAACT GGTGCCTGCT GGCCCACCAC TCATTGCCCC CAAAGAGAAC AAGCTGGAGG CCCCAGAGAT TGACTTGGTG GTGTTTAAAG  CTGAGGCAAT GGATTTGCAA GAGCCGAGCT TCTGCATGAC AACCTAGATA GCAGAGTCCC AGGTGACCAT CCTTTGATAC ATGGAGCATC ATCTGGGTTG TCCTCCTGAC TCTACAAGAC  CACTCATCGC ATCCAATGCA GACGAATGCT GATTCTGTCG TTCAACAGTG GCAATTCCTG TCATTCAAAA AATTCCATGG TTCAAAAAAT AAACAAAGGA AATGTACTTT TCCACCCATC  CCATGCCGGA ACAGGACTAA CTGGTGCTGG CAGCTATCTC CCTCAAAGAT CATGCATTGG TAAGGCACCA ATTGCGCATA CGGAAGCATC ACTTTTTCTC ATGGGTGGAC CTTTCGTTCT  CGCAACGCTT CAAGGCAACA TATGTGAGCA ACCTTTTGCA GCAAGGCTTC AGTTTCTAGG AACATGTTTC GGTGGCAGAT TATCACAAGG AGTCTGAGCG CCTCTCAGAG ACAATGAAGT  ATATGTCGGA GGACTCCCAG ATGCAGATAG TCTTCAAGGA ATTGAAACCT AAAATTTGTG AGGTCTGCCT TCAAGAGCCC CTCGATCTAT GGGTGACCAT GTGGCTCACA CAAAGGCAAA  GACTTGTAAT TCTGCACGGG GAGCCTCTGG CCACTTCAAG CACATAGAGA GGATGGCGCG TCTCCAGACA AGGCTAATTC AAGGGAAGTC ATCATGTGGA CCAGCAGAAG AACTCAAGGG  GAATCTAAGC TTGCTATCAG TGAACTACAT AAGCTGGATG GCCATTGGAC CCTCAGACGT TTGCTTGACC TGACAGAGGC AAAGATTTAA GCTAGACGCT TCAAGGTACC TGGTTTTTAC  TACGATCGCA AGTTTTCTCG TGGCAATCCA TGCATTGAGT TCAACTTTAT GCTTATCTCA TATATTGTCT CACTACAGGA TATTGCCAAG GACAAACTGC TCGAAGACCT GGTTGACTAT  CGCATTTAGG CTGTCAAGCT CGCCGCCAAG TAATTGAACA AACCTTGGAG CTGCCACCAG CTTTTGAATT CATGCATTCT TTCCTCCTTG AGGACAAGCA CTTCGAGATG AGTAATGATC  AGCCCACGGA TCTTATTGCC CGTGGCCCGA CCCACACAAT TGGGACAAAC CCACAGGAGG GCCGCGAAGG GAAGGGAGAA TCAGAATTAA GAAGAGGTCC CCGATTGCTG GGGAAGTTAC  ACTAGGAGTT CGGAAGCTTC TCCAATTGCT CCCACCTATC CCACTTTCCA TCTCTCTGTC CTCTCATCGG CGTTTTTCCA ACTTAGAACT ATGTCAAATA ATTGCAAAAA TTGCCTTTTA  TGGATATCTT GAATCCAAAC CAGATCAAAT TAACTGATGC AATTGCCTTG CACAGGAGAT CAAAGAACGA AAAGACGAGG ATCTGCTTGT TCTGCCCACT GATGCCGTCC TCTTCGAAGA  TCCCTCCTTC AAGGCACGTT AAAAAATCCC ACCTTTTTAT CAATTCCACA GCTGGGTTTT GGAATAAAGT TGAACGATAC TCAAATAAAT CATTTTCATT GAATATTCAG GTATATGCAG  AGCGATACGC TGAGGATGAG AGAGCATTTT TCGAGGATTA TGCAGCCGCC CACTCCAAGC TGAGCAATCT CGGCGCTGAG TTTGACCCTC CTCCGGTTTG ACTTTTACCT CTTCGTTGAC 
TTTTTCAATG CTCTAGCAGA GAAGATTCTA ACTTATGATC GTTTCTCTAA CTAGGGTGTC TCCATAGATG ACGTCTCCGA GAGCTCCAAG GCCTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCTGTC TTCGCGCCTC CGTCCTCTCC CCTGCTGTGG CCGCGTCGAG GCCGATGATT TCTCCATCTG GGTATTTTCC ATCGCCGTCT TCTTTCAGCT TCGTCTCGGT TCCACCCTCC  GCTTCCCGCC TCTCTTCAAC AAGATTCTTC GCCGTCTGCC CTTCCCGCCC CATCATATAC CTGAATCCCC ATGCCGGACT TGGACCAGTG CGCGCTTCTT CCGGAAACCC ATCTGCAAAG  TCCTTCGCCT CCGATCCTAA ACAATTAAGA AGCGCAAAAA ATGACATCGT GGAGCTACTT AGAACTACTT TTTGCCATCC CATCATGATC CGTCTGGGAT GGCATGATGC TGGCACATAC  GATAAGAACA TCAGAGAGTG GCCCAAAAGA GGCGGCGCAA ACGGAAGCCT GAGATTCGAA GTGGAGTTGA AACACGCTGC CAATGCCGGC CTTGTAAATG CTTTGAATCT ACTTAGGCCC  ATTAAGGACC GATACCCTGG AATCACTTAC GCTGATCTAT TTCAATTAGC TAGCGCGACT GCAGTGGAGC ATGCAGGAGG GCCCAAAATT CCAATGAAGT ATGGCCGAGT TGACGTCACT  AAGTCAGAGG AAAGCCCAGA AGAGGGAAGA CTTCCTGATG CTGGTCCACC CTCTCCTGCT GCACACTTAC GGGCCGTGTT CTACAGAATG GGTCTCGATG ATAAGGAAAT TGTTGCATTA  TCAGGGGCGC ATACGTTGGG AAGATCGAGA CCTGAACGAA GCGGTTGGGG AAAGTCAGAG ACAAAATATA CGAAAGATGG GCCTGGCAAA CCCGGTGGTC ATTCGTGGAC CGTCCAGTGG  TTGAAGTTCG ACAACAGTTA TTTCAAGGAG ATCAAAGAAC GAAAAGACGA GGATCTGCTT GTTCTGCCCA CTGATGCCGT CCTCTTCGAA GATCCCTCCT TCAAGGTATA TGCAGAGCGA  TACGCTGAGG ATGAGAGAGC ATTTTTCGAG GATTATGCAG CCGCCCACTC CAAGCTGAGC AATCTCGGCG CTGAGTTTGA CCCTCCTCCG GGTGTCTCCA TAGATGACGT CTCCGAGAGC 
TCCAAGGCCT GA 

Retrieve as FASTA