1. Browse the Database
  2. View Redoxidase
Entry information : NoffCSD02-1B(Nasoff126g0113740.t1)
Entry ID 18949
Creation 2023-10-30 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-11-09 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2023-11-27 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NoffCSD02-1B(Nasoff126g0113740.t1)
Name NoffCSD02-1B(Nasoff126g0113740.t1)
Class Cu/Zn SOD     [Orthogroup: CSD001]*
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Nasturtium officinale    [TaxId: 65948 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value NoffCSD02-1B
start..stop		 S start..stop
NoffCSD02-1A 359 2.44e-128 1..207 1..215
AtCSD02 339 1.45e-120 2..207 3..216
TsCSD02 329 1.83e-116 1..207 1..226
HaCSD04 294 1.45e-102 7..207 14..225
Literature and cross-references NoffCSD02-1B(Nasoff126g0113740.t1)
Protein sequence: NoffCSD02-1B(Nasoff126g0113740.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   207
PWM (Da):   %s   21408.75  
PI (pH):   %s   7.01
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAANTILAFS SSYTLPIPSS NLRSSFRGIS LNHPQSISFS SKAQSNKPFT VVSAFKKAVA VLKGTSDVEG VVTLSQEDQG ATTVNVRITG LTPGPHGFHL HEFGDTTNGC ISTGPHFNPN 
NMTHGAPEDK IRHAGDLGNI YANADGMAET TIVDCQIPLT GPNSVVGRAF VVHELKDDLG KGGHELSLTT GNAGGRLACG VIGLTPL 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTGCCA ACACCATCCT CGCATTCTCA TCATCTTATA CTCTTCCCAT TCCTTCTTCC AATCTCCGTT CCTCCTTCCG TGGCATCTCT CTCAACCATC CTCAATCCAT TTCCTTCTCC  TCCAAAGCTC AATCTAATAA ACCTTTTACA GTTGTTTCCG CCTTTAAAAA AGCTGTTGCA GTTCTTAAAG GTACCTCTGA TGTTGAAGGA GTTGTTACTT TGTCTCAAGA AGACCAAGGT  TCGTCACCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTTTC AATCTGATGA CCATTTTCAA AATCCCTAAT TTGAGATCAC TGATGTGTTT TTTGGTTCTT TGTAATTGAC GATTTACTGA TTAGAATAAA  AAAGGATTAA GCTTTAGATT TTGATTAACA TTTATAGTCA AAACTCTTCT TTTTTTTTGC ATATTTTGTG TTGATTCAAA TGGTTCTTTG AAGTTTATAC AAAGTTTATT TAAAATGGCT  TCTAAGAAGA TTGTTTATAT GTTTCAATTG TTAGTGTTTT TTGGTTCCTT ACTGTTCTTT TGTGTAATTT AAGATGTGCT GCTTAACAAA GGATTAAGCT TTAGATTTGA TTAACATTTA  TATTGAACTT CTTTTTGCTG ATTCAATGGT TCTGTAAAGT TTGAACAAAG TAGCTTATAA GAAGATTATT TATATGTTTC AGTTGTTAGT GTTTTTGGTT CTTTACTCGT TTTCTGTGTA  ATTGAAGATG TGCTGATTAA GAAAGGATTT AGCTTTAGAT TTGATTAAGA TTTTATAGTT AACTTTTTAA GCTGATTTTA ATTGGGTTTG TGAAGTTCTT ACAAAGTAAT ATAAATGATA  TCTTATAAGA AGATTGTTTA TTTGGGTTTC TTGCTAGTTA GTTTTTGACT GATGTGAATG ATATGTTAAT GATAAAACAG GTGCTACAAC TGTGAATGTT CGTATTACTG GTCTCACTCC  AGGACCTCAT GGATTTCACC TTGTAAGTCT TGATCATGTG TTCTTATTCT TATTTGGTTT CATTAGTGTT AAGATTCTTT TGAGCTATAA CGATGTATGT AATTGTGTCT TCTGTTTGCT  AATTTTCTAC AGCATGAGTT TGGTGATACA ACTAATGGTT GCATCTCAAC AGGTTTGTAT TTTAATACCA ATGATGTCAT TCCTTTGATA CCTATATCTT GATTTTATTT TCTAAAAAGG  ATTATCTTGT TTGAAGGACC ACATTTCAAC CCTAATAACA TGACACACGG AGCTCCTGAA GACAAGATCC GTCATGCGGG TGACCTGGGA AACATATATG CCAATGCTGA TGGTATTACA  TCTTCATATC CATATTTTTG CTGTCATATC CCACAATCAA AAAACTTGTT TTGAACTAAA CTATTGTTTT TTTTTGTAAC AACAGGCATG GCAGAAACAA CAATTGTGGA CTGTCAGGTT  GGGATTATCG CGTCTTCTTC TAAGTATTCT CTTTTAAGAA GATCTTTATT TACTGGTGAA ATCAATTGAG CAGATTCCTC TGACTGGTCC TAATTCTGTT GTTGGAAGAG CCTTTGTGGT  TCATGAGCTT AAGGATGATC TTGGAAAGGG TAAGCAACCA TTATACTTTA CTTCCTACTC TTGATAAAAC TATTGACTTG TTAGTTAATA GGATGTTGCC AAGTTGTGAT CTGATTACTT  CTCATCGATT GGATAATATA GGTGGACATG AGCTTAGTCT GACCACTGGA AATGCAGGCG GGAGATTGGC TTGCGGTATG ATTAAACTTT TGATCCCTAT GACTTAGGCT GCAACTGTTT 
CATCTGTAGA GAATAACCTC ACGAGTTATG TTGGTTTGAT TGCAGGTGTG ATTGGCTTGA CGCCACTCTA A 

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTGCCA ACACCATCCT CGCATTCTCA TCATCTTATA CTCTTCCCAT TCCTTCTTCC AATCTCCGTT CCTCCTTCCG TGGCATCTCT CTCAACCATC CTCAATCCAT TTCCTTCTCC  TCCAAAGCTC AATCTAATAA ACCTTTTACA GTTGTTTCCG CCTTTAAAAA AGCTGTTGCA GTTCTTAAAG GTACCTCTGA TGTTGAAGGA GTTGTTACTT TGTCTCAAGA AGACCAAGGT  GCTACAACTG TGAATGTTCG TATTACTGGT CTCACTCCAG GACCTCATGG ATTTCACCTT CATGAGTTTG GTGATACAAC TAATGGTTGC ATCTCAACAG GACCACATTT CAACCCTAAT  AACATGACAC ACGGAGCTCC TGAAGACAAG ATCCGTCATG CGGGTGACCT GGGAAACATA TATGCCAATG CTGATGGCAT GGCAGAAACA ACAATTGTGG ACTGTCAGAT TCCTCTGACT  GGTCCTAATT CTGTTGTTGG AAGAGCCTTT GTGGTTCATG AGCTTAAGGA TGATCTTGGA AAGGGTGGAC ATGAGCTTAG TCTGACCACT GGAAATGCAG GCGGGAGATT GGCTTGCGGT 
GTGATTGGCT TGACGCCACT CTAA 

Retrieve as FASTA