1. Browse the Database
  2. View Redoxidase
Entry information : NoffCSD02-1A(Nasoff2579g0446520.t1)
Entry ID 18953
Creation 2023-10-30 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-11-09 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2023-11-27 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NoffCSD02-1A(Nasoff2579g0446520.t1)
Name NoffCSD02-1A(Nasoff2579g0446520.t1)
Class Cu/Zn SOD     [Orthogroup: CSD001]*
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Nasturtium officinale    [TaxId: 65948 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value NoffCSD02-1A
start..stop		 S start..stop
NoffCSD02-1B 386 5.28e-139 1..215 1..207
AtCSD02 357 2.05e-127 2..215 3..216
TsCSD02 347 2.36e-123 1..215 1..226
HaCSD04 301 4.32e-105 25..215 31..225
Literature and cross-references NoffCSD02-1A(Nasoff2579g0446520.t1)
Protein sequence: NoffCSD02-1A(Nasoff2579g0446520.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   215
PWM (Da):   %s   21955.01  
PI (pH):   %s   6.6
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAANTILAFS SSSRLLISSS SSSSSSSSNL RSSFRGISLN HPQSISFSAK AQSNKPLTVV SALKKAVAVL KGTSDVEGVV TLSQEDEGPT TVNVRITGLT PGPHGFHLHE FGDTTNGCIS 
TGPHFNPNNM THGSPEDEIR HAGDLGNINA NADGVAETTI VDCQIPLTGP NSVVGRAFVV HELKDDLGKG GHELSLTTGN AGGRLACGVV GLTPL 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTGCCA ACACCATCCT CGCATTCTCA TCATCTTCTC GTCTTCTCAT TTCTTCTTCT TCTTCTTCTT CTTCATCTTC TTCCAATCTC CGTTCCTCCT TCCGTGGCAT CTCTCTCAAC  CATCCTCAAT CCATTTCTTT CTCCGCCAAA GCTCAATCTA ATAAACCTTT AACAGTTGTT TCCGCCTTGA AGAAAGCTGT TGCAGTTCTT AAAGGTACCT CCGATGTTGA AGGAGTTGTT  ACTTTGTCTC AAGAAGACGA AGGTCCGTCA CTAAATCCCT ATCTCTCTCT CTTTCTCTTA GCCATTTTCA AAATCCCTAA ATTGAGATCA CTGATTGTGG TTTAATCCAC TGTTCTTTGT  GATTGAAGAT TTTCTTATTA AAAGATAAAA GATTTAAGCT TTTGTGCTGA TTCAATGGTT CTGTGAAGTT TATAAACAAA GTTGGTTATA AGAAGATTTG TTTATATGTT TCAGTTGTTA  ATGTTTTTGG TTCTTTATTG TTCTTTTGTG TAATTGAAGA TGTGTTGATT AAGAAAGGAT TTAGTTTTAG AGTGATTAAG ATTTATGCCA ACTCTTCTTT AGCTTTAGAT GTAATGATAT  CTTATAAGAA GATTGTTTAT TTGGGTTTCT TGTTACTTAG TTTTTGACTG ATGTGAATGA TTTGTTGATG GTAAAACAGG TCCTACAACT GTGAATGTTC GTATCACTGG TCTCACTCCA  GGACCTCATG GATTTCACCT TGTACGTCTT GATCATGAGT TCTTCTTCTT ATTTGGTTTT TACTAATGTT AAGATTCTTT TGAGCTATAA TGAATGATGT GATTGTGTCT TTTGTTTGCT  TTTTAATAGC ATGAGTTTGG TGATACAACT AATGGTTGCA TCTCAACAGG TTTGTACTAA TACCAATGGT GTCATTCTTC TCATATATCA TGATTTTATC TTCTAAAAGG ATTATCTTGT  GTTGAATGTT CCTAGGACCA CATTTTAACC CTAATAACAT GACACACGGA TCTCCTGAAG ATGAGATCCG TCATGCGGGT GACCTGGGAA ACATAAATGC CAATGCTGAT GGTATTACTT  ACATCTTCAT ATTCAAGTTC CTATTTTAGT TATGGCAATC ATATTCAATA ATCCAATACT TGTTTTGAAC TAAGTACTGT TTTTGCTAAC AACAGGCGTG GCAGAAACAA CAATCGTGGA  CTGTCAGGTT GGTATTAGTG ATTGTTTATG TTTTTCCTTC AATTATTCTC TTTTAAGAAG CTTATTGTTT ATTGTGAGAT CAATTGTGCA GATTCCTCTG ACTGGTCCTA ACTCTGTTGT  TGGAAGAGCC TTTGTGGTTC ATGAGCTTAA GGATGATCTT GGAAAGGGTA AGCTATTATA CTTTACTTCC TGAGTTTCGA TACAGTATTA GGCACGGTTG CACTATTGCC ATGATAGTTA  AAAGTATGTT GCCATGTTGT GGTCTGATTA CTTCTCTTTG ATTGAATAAT ATAGGTGGAC ATGAGCTTAG TCTGACCACT GGAAACGCAG GCGGGAGATT GGCTTGCGGT ATGATTTAAC  TTTCAATCCC TATGTCTTAG GCTGCAATTG TTTCAAACGC CAATAGTTGT GATTTCATTT GTAGAAACAC ACACTTTACT ACAAAGTTAA AACGCAGATG TGGACTCGTT GTTTCGATAT 
TCTCACGAGT GATGTTGGTT TGATCGCAGG TGTGGTTGGC TTGACGCCAC TCTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTGCCA ACACCATCCT CGCATTCTCA TCATCTTCTC GTCTTCTCAT TTCTTCTTCT TCTTCTTCTT CTTCATCTTC TTCCAATCTC CGTTCCTCCT TCCGTGGCAT CTCTCTCAAC  CATCCTCAAT CCATTTCTTT CTCCGCCAAA GCTCAATCTA ATAAACCTTT AACAGTTGTT TCCGCCTTGA AGAAAGCTGT TGCAGTTCTT AAAGGTACCT CCGATGTTGA AGGAGTTGTT  ACTTTGTCTC AAGAAGACGA AGGTCCTACA ACTGTGAATG TTCGTATCAC TGGTCTCACT CCAGGACCTC ATGGATTTCA CCTTCATGAG TTTGGTGATA CAACTAATGG TTGCATCTCA  ACAGGACCAC ATTTTAACCC TAATAACATG ACACACGGAT CTCCTGAAGA TGAGATCCGT CATGCGGGTG ACCTGGGAAA CATAAATGCC AATGCTGATG GCGTGGCAGA AACAACAATC  GTGGACTGTC AGATTCCTCT GACTGGTCCT AACTCTGTTG TTGGAAGAGC CTTTGTGGTT CATGAGCTTA AGGATGATCT TGGAAAGGGT GGACATGAGC TTAGTCTGAC CACTGGAAAC 
GCAGGCGGGA GATTGGCTTG CGGTGTGGTT GGCTTGACGC CACTCTAA 

Retrieve as FASTA