protTMHMM
MyspiTrxH39	437	22.13	0.36	1	o378-400i

View Redoxidase 19132
Entry information : MyspiTrxH39(Myrspi0009g0245580.t1)
Entry ID 19132
Creation 2025-07-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2025-07-03 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: MyspiTrxH39(Myrspi0009g0245580.t1)
Name MyspiTrxH39(Myrspi0009g0245580.t1)
Class Thioredoxin Type H    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Myriophyllum spicatum    [TaxId: 208873 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value MyspiTrxH39
start..stop
S start..stop
MyspiTrxH46 800 0 1..437 1..437
MyspiTrxH61 790 0 1..437 1..437
CbraTrxH28 115 6.11e-28 34..246 70..285
MyspiTrxH41 114 1.01e-27 34..167 31..172
MyspiTrxH41 59 0.00000000144 43..137 385..479
Literature and cross-references MyspiTrxH39(Myrspi0009g0245580.t1)
Protein sequence: MyspiTrxH39(Myrspi0009g0245580.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   437
PWM (Da)   %s   48351.67 Transmb domain   %s   o378-400i
PI (pH)   %s   4.67
A INSERT TMH
INSERT INTO TMH(TMH_IdPerox,TMH_PeroxName,TMH_Type,TMH_Length, TMH_Expa,TMH_First60,TMH_PredHel,TMH_Topo) VALUES ('19132','MyspiTrxH39','pep','437','22.13','0.36','1','o378-400i')

Insert TMH record :
INSERT INTO TMH(TMH_IdPerox,TMH_PeroxName,TMH_Type,TMH_Length, TMH_Expa,TMH_First60,TMH_PredHel,TMH_Topo) VALUES ('19132','MyspiTrxH39','pep','437','22.13','0.36','1','o378-400i')

Update Perox 19132 Properties = '437;4.67;48351.67'
signalp /usr/local/bioinfo/src/SignalP/signalp-4.1/signalp -m ./assets/temp/tmp_mature ./assets/temp/tmp_pep 2>/dev/null
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSLMKTLLLV VTTASLISLC SSSSSPEFSV DGKVLELVES NFDSAISSFD YILVDFYAPW CGHCKRLAPE LDAAAPVLSG LMRPIVIAKL NADKFKRLAH KYDIDGYPSL KLFIHGVPTD  YFGPRKADLL VRFLKKYVAA DVANLDSDSA VSTFVEEAGT YFPLFIGFGV DESMISELAI KYKKKAWFAV AKDFSEDAMI KYDFDKVPAL VAVQPNYNEQ SIFYGPFEGK FLEDFIKQSL  FPLVVPINYE TLKLLRDDER KIALALLSDD GDEDSLKFIK LLKAAASANR DLAFAYIGVK QWGDFADTFG VNKQSELPKM VVWDGNEEYY TVAGSESIAK EDQGSEITRF LEGYRAGKTV 
KERVGGGLSF LGFLNSMMGI RTMYIIVFMF AVLLLILTIS KEEPLCVGTR DQGDQSSGSS DSRDESSEGQ RSGEKED 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCGTTAA TGAAGACGTT GTTGTTAGTA GTTACCACAG CGAGCTTAAT ATCACTTTGT TCTTCTTCTT CATCACCTGA GTTCTCCGTC GATGGGAAAG TATTGGAACT CGTTGAGTCG  AATTTCGACT CGGCGATTTC CTCTTTCGAT TACATCCTCG TTGATTTTTA CGCTCCTTGG TGTGGTCACT GCAAGCGTCT TGCTCCGGAG GTATGATCAA TTTTCAACAT CGGAAATGAT  TTTAGACAGT ATGTATGTAG TAGTTGAATT AGCTATTATA GTTATTGATA GGATGTCAAT TTCATTTTCT CTAGCTGGAC GCTGCTGCTC CCGTTCTGTC CGGATTAATG CGGCCGATCG  TCATTGCGAA ATTAAATGCG GACAAGTTTA AACGTCTCGC TCACAAATAT GACATTGAGT ATGTTTTACT TTGGTGATTT AAGTGTAGTG GAACACAATG CCGATTGATC CTATGCAGTT  TGATGTTTGG TAGAATTTTT CTAGTGTACT TTAAGACGTT ATATGGTTAA AGTGCTGATG GATCGAGCTC ACTTTGGCTT CTCTTAAATT CGTGTTTTTC CACAGTGGGT ATCCTTCACT  CAAGCTATTT ATCCATGGTG TCCCTACTGA TTATTTCGGG CCGAGAAAAG CAGATTTGCT AGTCCGTTTC CTTAAGAAAT ATGTCGCTGC TGATGTTGCT AATCTCGATT CAGATTCAGC  AGTTAGTACC TTTGTGGAGG AAGCCGGAAC TTACTTTCCT TTATTCATAG GGTTTGGTGT GGATGAATCC ATGATATCTG AATTGGCCAT CAAGTACAAG AAGAAAGCTT GGTTTGCAGT  GGCTAAGGAT TTTTCAGAAG ATGCCATGAT TAAGTATGAT TTTGATAAAG TCCCTGCCTT GGTGGCCGTT CAGCCAAATT ACAATGAGCA GAGCATTTTC TATGGCCCCT TTGAAGGTTA  GCCAGGAATT CATTTTGCTT CATTATTCCC ATCAATTAGA CATGCTCATA TTTTAATAAG TTGTAAATGG TAGATCTCAC TTCCTTCCCC AAGGGTCGAC ATTGTTCTCT TCCATGTATG  AGTGTTTAGC GAGAGGTACA TACGTGTCTT GTCAATGCTT ACAGTCCTTT AACTAGATGA TAAACAGGTG AAGTTTATTC CAGGTCTGGT TTTTGCTTTC CAGGTATATG ACCCCCTCAT  TGTCCGTTTT GTTCCAATTC AGTAACTTTA CTCGGTGAGG TTAGGATTTG AAAACATTTC AATATTTTTT CCCAGTTTTT AAATTAAGAT TCCCTTTCAG CCAACAATCT GTTCTCCACG  TATCTTTTTC AATATTTTTT CCCAGGTTTT AAATTAAGAT TTCCTTTCAG CGAACAATCT GTTCTCCACA TATCTTTTAT TTGATTTCAC CTTTGTGAAA TGTGATTTAT TTCATATAGC  ATCTCAGTGT GCCACATGCT TTCTTAGGAA AAACAGTGGT TATAGAGAAC TGTCCTTTTT GGCTTAAAAA AATTATTCTT TGGACGGAGA AGTAATGATC ATCCCTGTTT TATCCGTGCA  GGTAAGTTCC TGGAAGATTT TATCAAACAA AGTTTGTTCC CTCTTGTCGT TCCTATTAAC TATGAGACAC TGAAATTGTT GAGAGACGAT GAGAGAAAAA TTGCTCTGGC ATTGTTAAGT  GATGATGGGG ATGAGGATTC TTTGAAATTT ATCAAGTTGT TGAAGGCTGC TGCATCAGCA AATCGCGATT TAGCGTTTGC CTACATTGGA GTGAAACAAT GGGGAGATTT TGCTGATACA  TTTGGTGTTA ATAAACAGTC AGAACTACCA AAAATGGTCG TTTGGGATGG GAATGAGGAG TACTACACTG TAATATCTCT CTCTTCTTAT TTCTCTATTT GGCAAAGTAT GCTACCTATT  AATCTATATC AAGACTCAAT AAAAGAACTA TAATTAACTG AATGGTGTAC ATTAAAATAT ATTGCTTTTT CATCTTCTAA TCGTATGAAA ATTTGTCTCC TGGGCCACTA TTTCTTTTTC  CACTTTTTAA AAACTCAAAA AAGCTGAAAG AAAAATATCT AGCTTCTCTT CACATAGTTT CTTGTCAGTC TTTGGACAAT CATTTGCATA TCTGATGTCT AACCCATTGA CTGATTTTTG  TATATGTTTA AAGGTTGCTG GATCTGAAAG CATTGCCAAG GAGGATCAAG GTTCTGAAAT CACACGATTC CTAGAAGGAT ATAGGGCGGG AAAAACAGTG AAAGAAAGAG TTGGAGGTGG  TCTGTCATTT CTTGGTTTTC TCAATTCGAT GATGGGAATC AGAACAATGT ACATAATTGT TTTTATGTTT GCTGTCTTGC TGCTTATCTT AACCATAAGC AAAGAAGAAC CTCTTTGTGT 
CGGTACCCGA GACCAGGGTG ATCAAAGTAG CGGCTCCTCT GACTCCAGGG ATGAGAGCAG CGAGGGACAG CGATCTGGTG AAAAGGAAGA TTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCGTTAA TGAAGACGTT GTTGTTAGTA GTTACCACAG CGAGCTTAAT ATCACTTTGT TCTTCTTCTT CATCACCTGA GTTCTCCGTC GATGGGAAAG TATTGGAACT CGTTGAGTCG  AATTTCGACT CGGCGATTTC CTCTTTCGAT TACATCCTCG TTGATTTTTA CGCTCCTTGG TGTGGTCACT GCAAGCGTCT TGCTCCGGAG CTGGACGCTG CTGCTCCCGT TCTGTCCGGA  TTAATGCGGC CGATCGTCAT TGCGAAATTA AATGCGGACA AGTTTAAACG TCTCGCTCAC AAATATGACA TTGATGGGTA TCCTTCACTC AAGCTATTTA TCCATGGTGT CCCTACTGAT  TATTTCGGGC CGAGAAAAGC AGATTTGCTA GTCCGTTTCC TTAAGAAATA TGTCGCTGCT GATGTTGCTA ATCTCGATTC AGATTCAGCA GTTAGTACCT TTGTGGAGGA AGCCGGAACT  TACTTTCCTT TATTCATAGG GTTTGGTGTG GATGAATCCA TGATATCTGA ATTGGCCATC AAGTACAAGA AGAAAGCTTG GTTTGCAGTG GCTAAGGATT TTTCAGAAGA TGCCATGATT  AAGTATGATT TTGATAAAGT CCCTGCCTTG GTGGCCGTTC AGCCAAATTA CAATGAGCAG AGCATTTTCT ATGGCCCCTT TGAAGGTAAG TTCCTGGAAG ATTTTATCAA ACAAAGTTTG  TTCCCTCTTG TCGTTCCTAT TAACTATGAG ACACTGAAAT TGTTGAGAGA CGATGAGAGA AAAATTGCTC TGGCATTGTT AAGTGATGAT GGGGATGAGG ATTCTTTGAA ATTTATCAAG  TTGTTGAAGG CTGCTGCATC AGCAAATCGC GATTTAGCGT TTGCCTACAT TGGAGTGAAA CAATGGGGAG ATTTTGCTGA TACATTTGGT GTTAATAAAC AGTCAGAACT ACCAAAAATG  GTCGTTTGGG ATGGGAATGA GGAGTACTAC ACTGTTGCTG GATCTGAAAG CATTGCCAAG GAGGATCAAG GTTCTGAAAT CACACGATTC CTAGAAGGAT ATAGGGCGGG AAAAACAGTG  AAAGAAAGAG TTGGAGGTGG TCTGTCATTT CTTGGTTTTC TCAATTCGAT GATGGGAATC AGAACAATGT ACATAATTGT TTTTATGTTT GCTGTCTTGC TGCTTATCTT AACCATAAGC 
AAAGAAGAAC CTCTTTGTGT CGGTACCCGA GACCAGGGTG ATCAAAGTAG CGGCTCCTCT GACTCCAGGG ATGAGAGCAG CGAGGGACAG CGATCTGGTG AAAAGGAAGA TTAA 

Retrieve as FASTA