protTMHMM
MyspiTrxH61	437	22.58	0.62	1	o378-400i

View Redoxidase 19154
Entry information : MyspiTrxH61(Myrspi0015g0393890.t1)
Entry ID 19154
Creation 2025-07-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2025-07-03 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: MyspiTrxH61(Myrspi0015g0393890.t1)
Name MyspiTrxH61(Myrspi0015g0393890.t1)
Class Thioredoxin Type H    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Myriophyllum spicatum    [TaxId: 208873 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value MyspiTrxH61
start..stop
S start..stop
MyspiTrxH46 861 0 1..437 1..437
MyspiTrxH39 790 0 1..437 1..437
MyspiTrxH41 112 2.41e-27 34..157 31..158
MyspiTrxH41 59 0.00000000168 43..137 385..479
MyspiTrxH63 111 5.88e-27 34..157 31..158
MyspiTrxH63 58 0.00000000314 43..137 385..479
Literature and cross-references MyspiTrxH61(Myrspi0015g0393890.t1)
Protein sequence: MyspiTrxH61(Myrspi0015g0393890.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   437
PWM (Da)   %s   48574.94 Transmb domain   %s   o378-400i
PI (pH)   %s   4.82
A INSERT TMH
INSERT INTO TMH(TMH_IdPerox,TMH_PeroxName,TMH_Type,TMH_Length, TMH_Expa,TMH_First60,TMH_PredHel,TMH_Topo) VALUES ('19154','MyspiTrxH61','pep','437','22.58','0.62','1','o378-400i')

Insert TMH record :
INSERT INTO TMH(TMH_IdPerox,TMH_PeroxName,TMH_Type,TMH_Length, TMH_Expa,TMH_First60,TMH_PredHel,TMH_Topo) VALUES ('19154','MyspiTrxH61','pep','437','22.58','0.62','1','o378-400i')

Update Perox 19154 Properties = '437;4.82;48574.94'
signalp /usr/local/bioinfo/src/SignalP/signalp-4.1/signalp -m ./assets/temp/tmp_mature ./assets/temp/tmp_pep 2>/dev/null
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSLMKTLLLV VTTVSLISLC SSSSSPEFSV DGKVLELVES NFDSAISSFD YILVDFYAPW CGHCRRLAPE LDAAAPVLSG LRQPIVIAKL NADKFKRLAH KYDIDGYPSL KLFIHGVPTD  YFGPRKADLL VRFLKKYVAA DVANLDSDSA VSTFVEEAGT YFPIYIGFGV DESMISDLAI KYKKKAWFAV AKDFSEDAMI KYDFDKIPAL VAVQPNYNEQ SIFYGPFEGK FLEDFIKQSL  FPLAVPINYE TLKFLRDDER KIALALLSDD RDEDSLKFIK LLKAAASANR DLVFTYVGVK QWGDFADTFG VNKQSELPKM VVWDGNEEYY TVVGSESIAK EDQGSEITRF LEGYRAGKTV 
KERVGGGLSF LGFLNSMMGI RTLYIIVFMF AVLLLILTIS KEEPLRVGTR DQGDQSSGSS DSRGESSEGQ RSGEKED 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCGTTAA TGAAGACATT GTTGTTAGTA GTTACCACAG TGAGCTTAAT ATCACTTTGT TCGTCTTCTT CATCACCTGA GTTCTCCGTT GATGGGAAAG TATTGGAACT CGTTGAGTCG  AATTTCGACT CGGCAATTTC GTCTTTCGAT TACATCCTCG TTGATTTTTA CGCTCCTTGG TGTGGTCACT GCAGGCGTCT TGCTCCCGAG GTATGATCAA TTTTCGACAT CGGAAATGAT  TTTAGACAGT ATGTATGTAT GTAGTTGAAT AAGCTATTAT AGTTACTGAT TGGATGTCAA TTTCATTTTC TGTAGCTGGA CGCTGCTGCT CCCGTTCTGT CCGGATTAAG GCAGCCGATC  GTCATTGCGA AATTAAATGC GGACAAGTTT AAACGTCTCG CTCACAAATA TGACATTGAG TATGTGTTTT ACGTTGGTGT TTTAAGTGTA GTGGAACACA ATGCCGATTG ATCCTATGCA  GTTTGATGTT TGGTAGAATT TTTCTAGTGT ACTTTAAGAC ATAATATGGT TAAAGTGCTG ATGGATCGAG CTCACTTTGG CTTCTCTAAA ATTCGTGTTT TTCCACAGTG GGTATCCTTC  ACTCAAGCTA TTTATCCATG GTGTCCCTAC TGATTATTTC GGGCCGAGAA AAGCAGATTT GCTTGTCCGT TTCCTTAAGA AATATGTCGC TGCTGATGTT GCTAATCTCG ATTCAGATTC  AGCGGTTAGT ACCTTCGTGG AGGAAGCCGG AACTTACTTT CCTATATACA TAGGGTTTGG TGTGGATGAA TCCATGATAT CTGACTTGGC CATCAAGTAC AAGAAAAAAG CTTGGTTTGC  AGTGGCTAAG GATTTTTCAG AAGATGCCAT GATTAAGTAT GATTTTGATA AAATCCCTGC CTTGGTGGCC GTTCAGCCAA ATTACAATGA GCAGAGCATT TTCTATGGCC CCTTTGAAGG  TTAGCCAGGA ATTCATTTTG CTTCTTTATT CCTATCAGTT AGACATGCTC GTATTTTAAT AAGTTGTAAA TGGTAGATCT CACTTTCTTC CCCAAGGGTC AACGTTGTTC TCTTCCATGT  ATGAGCGTTT AGCGAGAGGT AACACGTGTC TTGTCAATGC TTCAGTACTC TAACTAGATG ATAAACAGGT GAAGTTTATT CCAGGTCTGG TTTTTGCTTT CCAGGTCTAT GAGCCTCTCA  TCGTCCATTT TGTTCCAATT TAGTAACTTT ACTCAGTGAG GTTAGGATGA GAAAACATTT CAATATTTTT TCCCAGGTTT TAAATTAAGA TTCCCTTTCA GCCAACATTC TGTTCTCCAC  GTATCTTTTA TTTGATTTCA CCTTTGTGAA ATGTGATGTA TTTCATATAG CATCTCAGTG TGCCACATAC TTTCTTAGGA AAAACAGTGG TTATAGAGAA CTGTCCTTTT TGGCTAAAAA  AAAATTATTC TTTGGGCAGA GAAGTAATGA TCGTCCCTGT TTTATCCGTG CAGGTAAGTT CCTGGAAGAT TTTATCAAAC AAAGTTTGTT CCCTCTTGCC GTTCCTATTA ACTATGAGAC  ACTGAAATTT TTGAGAGATG ATGAGAGAAA AATTGCTCTG GCATTGTTAA GTGATGATAG GGATGAGGAT TCTTTGAAAT TTATCAAGTT GTTGAAGGCT GCTGCATCAG CAAATCGCGA  TTTAGTGTTT ACCTACGTTG GAGTGAAGCA ATGGGGAGAT TTTGCTGATA CATTTGGTGT TAATAAACAG TCAGAACTAC CAAAAATGGT CGTTTGGGAT GGGAATGAGG AGTACTACAC  TGTAAGATCT CTCTCTTCTT ATTTCTCTAT TTGGCACAGT ATGCTACCTA TTAATCTATA TCAAGACTCC ATAAAAGGAC TATAATTAAC TGAATGGTAT ACATTAAAAT ATTTTGCTTT  TTCATCTTCT AATCGTATGA AAATTGTCTC CTTGGCCACT ATTTCTTTTT CCTCTTTTTA AAAACTAAAA AAAGCTAAAA GAAAATATCT AGCTTCTCTT CACATAGTTT CTTGTCAGTC  TTTGGACAAT CATTTGCGTA TCTGATGTGT AACTCATCGA CTTATTTTTT TTTGTATGTT TAAAGGTTGT TGGGTCTGAA AGCATTGCCA AGGAGGATCA AGGTTCTGAA ATCACACGAT  TCCTAGAAGG ATATAGGGCG GGAAAAACAG TGAAAGAAAG AGTTGGAGGT GGTCTGTCGT TTCTTGGTTT TCTCAATTCG ATGATGGGAA TCAGAACATT GTACATAATT GTTTTTATGT  TTGCTGTCTT GCTGCTTATC TTAACCATAA GCAAAGAAGA ACCTCTTCGT GTCGGTACCC GAGACCAGGG TGATCAAAGT AGCGGCTCCT CTGACTCCAG GGGTGAGAGC AGCGAGGGAC 
AGCGATCTGG TGAAAAGGAA GATTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCGTTAA TGAAGACATT GTTGTTAGTA GTTACCACAG TGAGCTTAAT ATCACTTTGT TCGTCTTCTT CATCACCTGA GTTCTCCGTT GATGGGAAAG TATTGGAACT CGTTGAGTCG  AATTTCGACT CGGCAATTTC GTCTTTCGAT TACATCCTCG TTGATTTTTA CGCTCCTTGG TGTGGTCACT GCAGGCGTCT TGCTCCCGAG CTGGACGCTG CTGCTCCCGT TCTGTCCGGA  TTAAGGCAGC CGATCGTCAT TGCGAAATTA AATGCGGACA AGTTTAAACG TCTCGCTCAC AAATATGACA TTGATGGGTA TCCTTCACTC AAGCTATTTA TCCATGGTGT CCCTACTGAT  TATTTCGGGC CGAGAAAAGC AGATTTGCTT GTCCGTTTCC TTAAGAAATA TGTCGCTGCT GATGTTGCTA ATCTCGATTC AGATTCAGCG GTTAGTACCT TCGTGGAGGA AGCCGGAACT  TACTTTCCTA TATACATAGG GTTTGGTGTG GATGAATCCA TGATATCTGA CTTGGCCATC AAGTACAAGA AAAAAGCTTG GTTTGCAGTG GCTAAGGATT TTTCAGAAGA TGCCATGATT  AAGTATGATT TTGATAAAAT CCCTGCCTTG GTGGCCGTTC AGCCAAATTA CAATGAGCAG AGCATTTTCT ATGGCCCCTT TGAAGGTAAG TTCCTGGAAG ATTTTATCAA ACAAAGTTTG  TTCCCTCTTG CCGTTCCTAT TAACTATGAG ACACTGAAAT TTTTGAGAGA TGATGAGAGA AAAATTGCTC TGGCATTGTT AAGTGATGAT AGGGATGAGG ATTCTTTGAA ATTTATCAAG  TTGTTGAAGG CTGCTGCATC AGCAAATCGC GATTTAGTGT TTACCTACGT TGGAGTGAAG CAATGGGGAG ATTTTGCTGA TACATTTGGT GTTAATAAAC AGTCAGAACT ACCAAAAATG  GTCGTTTGGG ATGGGAATGA GGAGTACTAC ACTGTTGTTG GGTCTGAAAG CATTGCCAAG GAGGATCAAG GTTCTGAAAT CACACGATTC CTAGAAGGAT ATAGGGCGGG AAAAACAGTG  AAAGAAAGAG TTGGAGGTGG TCTGTCGTTT CTTGGTTTTC TCAATTCGAT GATGGGAATC AGAACATTGT ACATAATTGT TTTTATGTTT GCTGTCTTGC TGCTTATCTT AACCATAAGC 
AAAGAAGAAC CTCTTCGTGT CGGTACCCGA GACCAGGGTG ATCAAAGTAG CGGCTCCTCT GACTCCAGGG GTGAGAGCAG CGAGGGACAG CGATCTGGTG AAAAGGAAGA TTAA 

Retrieve as FASTA