protTMHMM
MyspiTrxH46	437	22.06	0.28	1	o378-400i

View Redoxidase 19139
Entry information : MyspiTrxH46(Myrspi0011g0300450.t1)
Entry ID 19139
Creation 2025-07-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2025-07-03 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: MyspiTrxH46(Myrspi0011g0300450.t1)
Name MyspiTrxH46(Myrspi0011g0300450.t1)
Class Thioredoxin Type H    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Myriophyllum spicatum    [TaxId: 208873 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value MyspiTrxH46
start..stop
S start..stop
MyspiTrxH61 861 0 1..437 1..437
MyspiTrxH39 790 0 1..437 1..437
MyspiTrxH41 110 1.12e-26 34..157 31..158
MyspiTrxH41 57 0.00000000757 43..137 385..479
MyspiTrxH63 110 2.53e-26 34..157 31..158
MyspiTrxH63 56 0.0000000139 43..137 385..479
Literature and cross-references MyspiTrxH46(Myrspi0011g0300450.t1)
Protein sequence: MyspiTrxH46(Myrspi0011g0300450.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   437
PWM (Da)   %s   48418.82 Transmb domain   %s   o378-400i
PI (pH)   %s   4.7
A INSERT TMH
INSERT INTO TMH(TMH_IdPerox,TMH_PeroxName,TMH_Type,TMH_Length, TMH_Expa,TMH_First60,TMH_PredHel,TMH_Topo) VALUES ('19139','MyspiTrxH46','pep','437','22.06','0.28','1','o378-400i')

Insert TMH record :
INSERT INTO TMH(TMH_IdPerox,TMH_PeroxName,TMH_Type,TMH_Length, TMH_Expa,TMH_First60,TMH_PredHel,TMH_Topo) VALUES ('19139','MyspiTrxH46','pep','437','22.06','0.28','1','o378-400i')

Update Perox 19139 Properties = '437;4.7;48418.82'
signalp /usr/local/bioinfo/src/SignalP/signalp-4.1/signalp -m ./assets/temp/tmp_mature ./assets/temp/tmp_pep 2>/dev/null
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSLMKTLLLA VTTVSLISLC SSSSSPEFSV DGKVLELVES NFDSAISSFD YILVDFYAPW CSHCKRLAPE LDAAAPVLSG LRQPIVIAKL NADKFKRLAH KYDIDGYPSL KLFIHGVPTD  YFGPRKADLL VRFLKKYVAA DVANLDSDSA VSTFVEEAGT YFPIYIGFGV DESMISDLSI KYKKKAWFAV AKDFSEDAMI KYDFDKVPAL VAVQPNYNEQ SIFYGPFEGK FLDDFIKQSL  FPLAIPINYE TLKLLRDDER KIALALLSDD GDEDSLKFIK LLKAAASANR DLVFAYIGVK QWGDFADTFG VNKQSELPKM VVWDGNEEYY TVVGSESIAK EDQGSEITRF LEGYRAGKTV 
KERVGGGLSF LGFLNSMMGI RTMYIIVFMF AVLLLILTIS KEEPLRVGTR DQGDQSSGSS DSRVESSEGQ LSGEKED 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCGTTAA TGAAGACATT GTTGTTAGCA GTTACCACAG TGAGCTTAAT ATCACTCTGT TCGTCTTCTT CATCACCTGA GTTCTCCGTT GATGGGAAAG TATTGGAACT CGTTGAGTCG  AATTTCGACT CGGCGATTTC GTCTTTCGAT TACATCCTCG TTGATTTTTA CGCTCCTTGG TGTAGTCACT GCAAGCGTCT TGCTCCCGAG GTATGATCAA TTTTCGACGT CGGAAATGAT  TTTAGACAGT ATGTATGTAG TAGTTGAATT AGCTATTATA GTTACTGATA GGATGTCAAT TTCATTTTCT GTAGCTGGAC GCTGCTGCTC CCGTTCTTTC CGGATTAAGG CAGCCGATCG  TCATTGCGAA ATTAAATGCG GACAAGTTTA AACGTCTCGC TCACAAATAT GACATTGAGT ATGTGTTTTA CTTTGGTGTC TTTAGTGTAG TGGAACACAA TGCCGATTGA TCCTATGTTG  TTTGATGTTT GGTAGAATTT TTCTAGTGTA CTTTAAGACA TTATATGGTT AAAGTGCTGA TGGATCGAGC TCACTTTGGC TTCTCTAAAA TTCGTGTTTT TCCACAGTGG GTATCCTTCA  CTCAAGCTAT TTATCCATGG TGTCCCTACT GATTATTTCG GGCCGAGAAA AGCAGATTTG CTTGTCCGTT TCCTAAAGAA ATATGTCGCT GCTGATGTTG CTAATCTCGA TTCAGATTCA  GCGGTTAGTA CCTTCGTGGA GGAAGCCGGA ACTTACTTTC CTATATACAT AGGATTTGGT GTGGATGAAT CCATGATATC TGACTTGTCC ATCAAGTACA AGAAAAAAGC TTGGTTTGCA  GTGGCTAAGG ATTTTTCAGA AGATGCCATG ATTAAGTATG ATTTTGATAA AGTCCCTGCC TTGGTGGCCG TTCAGCCAAA TTACAATGAG CAGAGCATTT TCTATGGCCC CTTTGAAGGT  TAGCCAGGAA TTCATTTTGC TTCTTTATTC CTATCAGTTA GACATGCTCG TATTTTAATA AGTTGTAAAT GGTAGATCTC ACTTTCTTCC CCAAGGGTCA ACGTTGTTCT CTTCCATGTA  TGAGCTTTTA GCGAGAGGTA ACACGTGTCT TGTCAATCCT TCAGTCCTTT AACTAGATGA TAAACAGGTG AAGTTTATTC CAGTCTGGTT ATTGCTTTCC AGGTCTATGA GCCTCTCATC  GTCCATTTTG TTCCAATTCA GTAACTTTAC TCAGTGAGGT TAGGATGAGA AAACATTTCA ATATTTTTTC CCAGGTTTTA AATTAAGATT CCCTTTCAGC CAACATTCTG TTCTCCACGT  ATCTTTTATT TGATTTCACC TTTGTGAAAT GTGATTTATT TCATATAGCA TCTCAGTGTG CAACATACTT TCTTAGGAAA AAGAGTGGTT ATAGAGAACT GTCCTTTTTG GCGTATAAAA  ATTATTCTTT GGCCAGAGAA GTAATGGTCG TCCCTGTTTT ATTCGTGCAG GTAAGTTCCT GGATGATTTT ATCAAACAAA GTTTGTTCCC TCTTGCCATT CCTATTAACT ATGAGACACT  GAAATTGTTG AGAGACGATG AGAGAAAAAT TGCTCTGGCA TTGTTAAGTG ATGATGGGGA TGAGGATTCT TTGAAATTTA TCAAATTGTT GAAGGCTGCT GCATCAGCAA ATCGTGATTT  AGTGTTTGCC TACATTGGAG TGAAGCAATG GGGAGATTTT GCTGATACAT TTGGCGTTAA TAAACAGTCA GAACTACCAA AAATGGTCGT TTGGGATGGG AATGAGGAGT ACTACACTGT  AAGATCTCTC TCTTCTTATT TCTCTATTTG GCACAGTATG CTACCTATTA ATCTATATCA AGACTCAATA AAAGTACTAT AATTAACTGA ATGGTAGACA TTAAAATATT TTGCTTTTTC  ATCTTCTAAT CGTATGAAAA TTGTCTCCTT GGCCACTATT TCTTTTTCCT CTTTTTAAAA ACTAAAAAAA ATGCTGAAAG AAAAATATCT AGCTTCTCTT CACATAGTTT CTTGTCTGTC  TTTGGACAAT CATTTGCGTA TCTGATGTGT AACTCATCGA CTGATTTTTG TATATGTTTA AAGGTTGTTG GGTCTGAAAG CATTGCCAAG GAGGATCAAG GTTCTGAAAT CACACGATTC  CTAGAAGGAT ATAGGGCGGG AAAAACAGTG AAAGAAAGAG TTGGAGGTGG TCTGTCATTT CTTGGTTTTC TCAATTCGAT GATGGGAATC AGAACAATGT ACATAATTGT TTTTATGTTT  GCTGTCTTGC TGCTTATCTT AACTATAAGC AAAGAAGAAC CTCTTCGTGT CGGTACCCGA GACCAGGGTG ATCAAAGTAG CGGCTCCTCT GACTCTAGGG TTGAGAGCAG CGAGGGACAG 
CTATCTGGTG AAAAGGAAGA TTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCGTTAA TGAAGACATT GTTGTTAGCA GTTACCACAG TGAGCTTAAT ATCACTCTGT TCGTCTTCTT CATCACCTGA GTTCTCCGTT GATGGGAAAG TATTGGAACT CGTTGAGTCG  AATTTCGACT CGGCGATTTC GTCTTTCGAT TACATCCTCG TTGATTTTTA CGCTCCTTGG TGTAGTCACT GCAAGCGTCT TGCTCCCGAG CTGGACGCTG CTGCTCCCGT TCTTTCCGGA  TTAAGGCAGC CGATCGTCAT TGCGAAATTA AATGCGGACA AGTTTAAACG TCTCGCTCAC AAATATGACA TTGATGGGTA TCCTTCACTC AAGCTATTTA TCCATGGTGT CCCTACTGAT  TATTTCGGGC CGAGAAAAGC AGATTTGCTT GTCCGTTTCC TAAAGAAATA TGTCGCTGCT GATGTTGCTA ATCTCGATTC AGATTCAGCG GTTAGTACCT TCGTGGAGGA AGCCGGAACT  TACTTTCCTA TATACATAGG ATTTGGTGTG GATGAATCCA TGATATCTGA CTTGTCCATC AAGTACAAGA AAAAAGCTTG GTTTGCAGTG GCTAAGGATT TTTCAGAAGA TGCCATGATT  AAGTATGATT TTGATAAAGT CCCTGCCTTG GTGGCCGTTC AGCCAAATTA CAATGAGCAG AGCATTTTCT ATGGCCCCTT TGAAGGTAAG TTCCTGGATG ATTTTATCAA ACAAAGTTTG  TTCCCTCTTG CCATTCCTAT TAACTATGAG ACACTGAAAT TGTTGAGAGA CGATGAGAGA AAAATTGCTC TGGCATTGTT AAGTGATGAT GGGGATGAGG ATTCTTTGAA ATTTATCAAA  TTGTTGAAGG CTGCTGCATC AGCAAATCGT GATTTAGTGT TTGCCTACAT TGGAGTGAAG CAATGGGGAG ATTTTGCTGA TACATTTGGC GTTAATAAAC AGTCAGAACT ACCAAAAATG  GTCGTTTGGG ATGGGAATGA GGAGTACTAC ACTGTTGTTG GGTCTGAAAG CATTGCCAAG GAGGATCAAG GTTCTGAAAT CACACGATTC CTAGAAGGAT ATAGGGCGGG AAAAACAGTG  AAAGAAAGAG TTGGAGGTGG TCTGTCATTT CTTGGTTTTC TCAATTCGAT GATGGGAATC AGAACAATGT ACATAATTGT TTTTATGTTT GCTGTCTTGC TGCTTATCTT AACTATAAGC 
AAAGAAGAAC CTCTTCGTGT CGGTACCCGA GACCAGGGTG ATCAAAGTAG CGGCTCCTCT GACTCTAGGG TTGAGAGCAG CGAGGGACAG CTATCTGGTG AAAAGGAAGA TTAA 

Retrieve as FASTA