protTMHMM
MyspiTrxH106	437	19.78	19.74	1	i7-29o

View Redoxidase 19199
Entry information : MyspiTrxH106(Myrspi0036g0747790.t1)
Entry ID 19199
Creation 2025-07-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2025-07-03 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: MyspiTrxH106(Myrspi0036g0747790.t1)
Name MyspiTrxH106(Myrspi0036g0747790.t1)
Class Thioredoxin Type H    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Myriophyllum spicatum    [TaxId: 208873 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value MyspiTrxH106
start..stop
S start..stop
MyspiTrxH116 875 0 1..437 1..436
MyspiTrxH113 870 0 1..437 1..436
CbraTrxH27 323 2.71e-109 3..279 11..288
CbraTrxH25 162 1.02e-45 32..269 38..266
CbraTrxH25 105 4.7e-25 30..150 154..275
CbraTrxH25 95 1.48e-21 159..283 36..165
Literature and cross-references MyspiTrxH106(Myrspi0036g0747790.t1)
Protein sequence: MyspiTrxH106(Myrspi0036g0747790.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   437
PWM (Da)   %s   47300.32 Transmb domain   %s   i7-29o
PI (pH)   %s   6.03
A INSERT TMH
INSERT INTO TMH(TMH_IdPerox,TMH_PeroxName,TMH_Type,TMH_Length, TMH_Expa,TMH_First60,TMH_PredHel,TMH_Topo) VALUES ('19199','MyspiTrxH106','pep','437','19.78','19.74','1','i7-29o')

Insert TMH record :
INSERT INTO TMH(TMH_IdPerox,TMH_PeroxName,TMH_Type,TMH_Length, TMH_Expa,TMH_First60,TMH_PredHel,TMH_Topo) VALUES ('19199','MyspiTrxH106','pep','437','19.78','19.74','1','i7-29o')

Update Perox 19199 Properties = '437;6.03;47300.32'
signalp /usr/local/bioinfo/src/SignalP/signalp-4.1/signalp -m ./assets/temp/tmp_mature ./assets/temp/tmp_pep 2>/dev/null
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSRSKSSQPL IALALTLFFV SASVHALYGP STPVLQLTPS NFKSKVLDSN RVVLVEFFAP WCGHCQALTP IWEKAATVLK GVATVAALDA DAHKSLAQEY GIKGFPTIKV FSPGKPPVDY  QGAREAKPIA EFALSQIKAL LKERLSGKTT GGGSTEKSEP SASVELNSRN FDELVIKSKE LWVVEFFAPW CGHCKKLAPE WKKAANNLKG KVKLGHVNCD EDKSLMSRFN VQGFPTILVF  GADKDTPVPY EGARTASGIE SFALEQLDTN SPPPEVTELT GPNVLEEKCG PAAICFVSFL PDILDSKAEG RNKYLQQVLS VAEKFKRSPY SYVWAAAGKQ PDLEKHVGVG GYGYPAMVAL 
NLKKGAYAPL RSAFEVDQIT EFVKEAGRGG KGNLPLEATP TIVKTEPWDG KDGEIIEEDE FSLEELMGED TTGKDEL 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCAAGAT CAAAGTCATC TCAGCCGTTG ATCGCCCTTG CACTGACCCT CTTCTTCGTT TCCGCCAGCG TTCACGCTCT CTATGGTCCA TCTACGCCTG TTCTTCAACT GACTCCTTCC  AACTTCAAGT CCAAGGTAGC TTGCAAACCC TACCTATTGA TTTTTGGATT ATCTTTTTGA TTTATTTTCC TTATTGTTTA GTCATTATCT CGATTTGATG CAGTTTTGGA TCTAATATAT  CTGGAGTAAT TTTTGCTAGA GTTCCCTTGA CCCCGCTGTA CAATATAGAG AATACTTTTG TTTGATGCTA AAGGATGCAC ATGAAACTTA TAGAAACTCA TTTTGTTGAC GGTTGCTAAG  ATATTACTAT TAAACATGTA ATTTAGTTTT TGAAATTATG AGACATGGTA TTCCGTGAGA ATCCAGAGGT GGACTATGAT TCTCAATCCA TAGCATAACA TTTTTTTTCT GTTTCACATT  GGTTCTAGTT TGTAAAATTT TTAATCTAAC GACTTAGACT AGAATCATTT ACATTTATAA AGATCGTGCG GGTTCTTTTA TAAATGCCGA GTACACTGGT GCTTGTTGAG TAAAATTCAT  TGCAAATTTA GTTGGATTTC TGTTAAATGC ATTTAAATAG AATGGAGGAT AGTTACAGAA AGTGCCACTG CTATGAGCCT ATGAGGCATG AGCTTAGGTT TGTCAAAGAA AAACTTGTTG  GATTAAATTT GCGCTTAAAA GGACAAAAAC AAAGAAAAAT AGAGTCTTTT ATGACATTGG AGAAATTAAA TAACTGGTGC CCTCGCATGA GGACAGATAG AGAATGGGAT GAGTTCCTGA  TAAACCATGC CTGTCTCTGG TGATATGTGG CTTTTTTCTT ACCTTTTCCT ATGTCCTGGT TTTATTTAAA TTTCCCCTTT TTTATTGTGC TTATTGATTT CTCAACTTGC CGGCAGGTAT  TGGACTCAAA CAGAGTTGTT CTAGTTGAGT TCTTTGCACC TTGGTGCGGC CACTGTCAGG CCTTGACTCC AATATGGGAG AAGGCCGCCA CTGTCTTGAA AGGTGTTGCT ACTGTAGCAG  CACTTGATGC CGACGCTCAC AAGTCCCTTG CTCAGGTTTT TTTCTACTTT TCCCAGTTGT TTTTCTATTC TTTCTTACCC ATTCATAAAG CACAAAATAA AGTGGATCCT CGACAACATT  TATTGGAAAA TTGATGGTTA TGTCTAAATT ATGCCCCCCA AATTTGTGTT CCTTGGGTCG AAGTCAACTG CCAAATCATG TTATATGCCT ATAGGGTGTC TTTTTCATAT TTACTTTTGT  CTCCATGGTG CTATTGGGTA TATGCTAAAT CATTAGGTAA AGTAAATTTC ATGTCCACGG ACTTTGACTA GTTTATTTAA TTGGTTGGTC TCATGGTTTC TGATTCTCCC AGTATGTGCA  TTCCACTAAT TGACTAAACA TAAGATGGAG TTTGTTTGCT GTTCTGTTTG TGTAGAATTT GCTAAGGTTG ATTACCTGGA CTGATTCTTT GCGTTTGATT ATGACAGGAG TATGGGATTA  AAGGATTCCC TACGATAAAG GTCTTTTCCC CTGGGAAACC TCCTGTAGAT TATCAAGGTG CCAGGGAAGC GAAACCAATT GCAGAATTCG CACTCTCTCA GGTTTAGTAT GATCGGTTAA  CTTCAATTCT TTATATGTTG AAGTTAATCA GCTCTTACAT TTCTGTTAGT CTTACCTTTC TTGATAAGAA ACTACTTGCA TAAAATTGTG CACAATCTGT GTCTTTTTTA CCTTTCGTCA  CTGCTCTTCT CCTTCAATGC CTTCTTTCTA TTTCTGAATG TTGCTACAGT ATCTCATTTC ATTTGTCCTC TCTCTTAACA GATAAAGGCT CTTCTGAAGG AACGTTTAAG TGGAAAGACA  ACCGGAGGAG GGTCCACTGA AAAATCTGAA CCCAGTGCTT CTGTAGAATT GAATTCTCGC AATTTTGATG AGTTGGTGAT AAAAAGCAAA GAACTATGGG TCGTAGAATT TTTCGCTCCT  TGGTAAGTAC CATTTACTTT TAATAGTTCA GATATAAATT TGCATGCAGC CCGGTAATAG GGAACCTTTT CTTTTAACTT CTTTTGTTCT TAATATGGTC CCTGCTTGTT TCAGCATAGC  TGATATTAAT TAGTGACTGA AAAGATGTTA ATGTGCACGA CGGAAGACCA GAGGTGCACC TTTTGAGTAG GGCTTAGAAT CCTCCTAAAC TGCTTTAGGA TGAGATATAG AAAGCACGCC  ATATGGCATG CATCTATAGT TGTATGACTT GCCATGTAAC GATCATCAGT TTAAATTCTT CAGATCTCGT TGCAAATAGG CTGTAATAGG CAAGTTTTTT GGCATATATC ACTATTCAAT  ATTTCTTCTG ATCTCATTCT TTGTGAGATA TGAAAACAAG GTCTGCATAT TTACTTTGAC AATCATCAAT CTCTTGGTAC TGTGTACGTT GTGTATATCT GTGTTATTTT CCCCAGAGGT  TAAAATCATG TAACATCATT GATAGCTCTC TTTATATTTG TTTTCTTAAG GTGTGGACAC TGTAAAAAAC TGGCTCCGGA GTGGAAGAAA GCTGCCAATA ACTTGAAGGG GAAGGTGAAG  TTGGGTCATG TAAATTGTGA TGAAGACAAG GTAATTTTGA GTTTCAGTTA TTCAAACCAT ATGAGGTTAT CTTTTATGTG TCGCGTGTCA TGAAAGAGAT AGGATTGATT GGCATCTTTG  TCTTTGGCTT TAGAAATAAC TTCAGAACAC AATATCCAAG ACAGATCTAT TATGAGTTGG TAGTAGGTCT AACACATCCC CGTTACCAGT CTTTGATGAG CAGGTTTAAT GTCCAAGGAT  TCCCCACCAT CTTGGTCTTT GGTGCTGATA AAGACACCCC TGTTCCGTAT GAAGGCGCGA GAACAGCCTC TGGAATTGAA TCATTTGCTC TAGAGCAGCT AGATACAAAC AGCCCTCCTC  CTGAAGTTAC CGAGCTCACT GGTCCGGTAA GCCTGTAGTA CTATTCCTCG TTGTAACTTC ACTGGATCTC CAGTGGTCAT CACAGGAAGC ATTACTATGA AACTTCTTTC TGAATGTTAC  AGAATGTCTT GGAAGAAAAG TGTGGCCCAG CTGCCATCTG TTTTGTGTCA TTCTTGCCTG ACATTTTGGA CTCAAAGGCA GAAGGAAGAA ACAAGTATCT TCAACAGGTG TTGTCAGTTG  CTGAGAAGTT CAAAAGAAGT CCTTACAGGT ACCGACACTC TCACTTTAGC TTAGAGGTTT CCTTTCTCCA ACAGCACAAT TTGGCTCCAT GCTTCAGATG CTGAAAAGAA CCTCAACAAT  ATTCCGAAGT GAACATTAAA ACTCCCAATT CCGAATGGAA ACTGATAAAA ACAATCATTT TGCAGCTATG TTTGGGCAGC TGCTGGAAAG CAGCCTGATC TCGAGAAGCA TGTAGGAGTG  GGCGGATATG GGTATCCAGC TATGGTAGCC TTAAATTTGA AGAAAGGTGC ATATGCCCCA CTTCGAAGTG CATTCGAAGT AGACCAGATC ACGTAAGTAC TTTTTCTTTC TCGTCTCTCT  TTGCATTATC GTGCAAACAA TTACACAAAC TGAAGTGATT TGACATCCAT TATTACATCA GCGAGTTTGT CAAGGAAGCC GGGCGTGGAG GAAAAGGCAA CTTACCCCTT GAGGCCACTC 
CCACGATTGT AAAGACGGAA CCATGGGATG GAAAAGACGG GGAGATCATC GAAGAGGACG AGTTCTCGCT TGAAGAACTC ATGGGAGAGG ATACGACGGG CAAAGATGAG TTATAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCAAGAT CAAAGTCATC TCAGCCGTTG ATCGCCCTTG CACTGACCCT CTTCTTCGTT TCCGCCAGCG TTCACGCTCT CTATGGTCCA TCTACGCCTG TTCTTCAACT GACTCCTTCC  AACTTCAAGT CCAAGGTATT GGACTCAAAC AGAGTTGTTC TAGTTGAGTT CTTTGCACCT TGGTGCGGCC ACTGTCAGGC CTTGACTCCA ATATGGGAGA AGGCCGCCAC TGTCTTGAAA  GGTGTTGCTA CTGTAGCAGC ACTTGATGCC GACGCTCACA AGTCCCTTGC TCAGGAGTAT GGGATTAAAG GATTCCCTAC GATAAAGGTC TTTTCCCCTG GGAAACCTCC TGTAGATTAT  CAAGGTGCCA GGGAAGCGAA ACCAATTGCA GAATTCGCAC TCTCTCAGAT AAAGGCTCTT CTGAAGGAAC GTTTAAGTGG AAAGACAACC GGAGGAGGGT CCACTGAAAA ATCTGAACCC  AGTGCTTCTG TAGAATTGAA TTCTCGCAAT TTTGATGAGT TGGTGATAAA AAGCAAAGAA CTATGGGTCG TAGAATTTTT CGCTCCTTGG TGTGGACACT GTAAAAAACT GGCTCCGGAG  TGGAAGAAAG CTGCCAATAA CTTGAAGGGG AAGGTGAAGT TGGGTCATGT AAATTGTGAT GAAGACAAGT CTTTGATGAG CAGGTTTAAT GTCCAAGGAT TCCCCACCAT CTTGGTCTTT  GGTGCTGATA AAGACACCCC TGTTCCGTAT GAAGGCGCGA GAACAGCCTC TGGAATTGAA TCATTTGCTC TAGAGCAGCT AGATACAAAC AGCCCTCCTC CTGAAGTTAC CGAGCTCACT  GGTCCGAATG TCTTGGAAGA AAAGTGTGGC CCAGCTGCCA TCTGTTTTGT GTCATTCTTG CCTGACATTT TGGACTCAAA GGCAGAAGGA AGAAACAAGT ATCTTCAACA GGTGTTGTCA  GTTGCTGAGA AGTTCAAAAG AAGTCCTTAC AGCTATGTTT GGGCAGCTGC TGGAAAGCAG CCTGATCTCG AGAAGCATGT AGGAGTGGGC GGATATGGGT ATCCAGCTAT GGTAGCCTTA  AATTTGAAGA AAGGTGCATA TGCCCCACTT CGAAGTGCAT TCGAAGTAGA CCAGATCACC GAGTTTGTCA AGGAAGCCGG GCGTGGAGGA AAAGGCAACT TACCCCTTGA GGCCACTCCC 
ACGATTGTAA AGACGGAACC ATGGGATGGA AAAGACGGGG AGATCATCGA AGAGGACGAG TTCTCGCTTG AAGAACTCAT GGGAGAGGAT ACGACGGGCA AAGATGAGTT ATAG 

Retrieve as FASTA