protTMHMM
MyspiTrxH116	436	19.79	19.74	1	i7-29o

View Redoxidase 19209
Entry information : MyspiTrxH116(Myrspi0043g0819210.t1)
Entry ID 19209
Creation 2025-07-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2025-07-03 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: MyspiTrxH116(Myrspi0043g0819210.t1)
Name MyspiTrxH116(Myrspi0043g0819210.t1)
Class Thioredoxin Type H    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Myriophyllum spicatum    [TaxId: 208873 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value MyspiTrxH116
start..stop
S start..stop
MyspiTrxH106 875 0 1..436 1..437
MyspiTrxH113 870 0 1..436 1..436
CbraTrxH27 323 3.02e-109 3..278 11..288
CbraTrxH25 160 3.59e-45 32..268 38..266
CbraTrxH25 105 4.83e-25 30..132 154..259
CbraTrxH25 95 1.75e-21 152..282 33..165
Literature and cross-references MyspiTrxH116(Myrspi0043g0819210.t1)
Protein sequence: MyspiTrxH116(Myrspi0043g0819210.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   436
PWM (Da)   %s   47282.32 Transmb domain   %s   i7-29o
PI (pH)   %s   6.28
A INSERT TMH
INSERT INTO TMH(TMH_IdPerox,TMH_PeroxName,TMH_Type,TMH_Length, TMH_Expa,TMH_First60,TMH_PredHel,TMH_Topo) VALUES ('19209','MyspiTrxH116','pep','436','19.79','19.74','1','i7-29o')

Insert TMH record :
INSERT INTO TMH(TMH_IdPerox,TMH_PeroxName,TMH_Type,TMH_Length, TMH_Expa,TMH_First60,TMH_PredHel,TMH_Topo) VALUES ('19209','MyspiTrxH116','pep','436','19.79','19.74','1','i7-29o')

Update Perox 19209 Properties = '436;6.28;47282.32'
signalp /usr/local/bioinfo/src/SignalP/signalp-4.1/signalp -m ./assets/temp/tmp_mature ./assets/temp/tmp_pep 2>/dev/null
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSRSKSSQPL IALALTLFFV SASVHALYGP STPVLQLTPS NFKSKVLDSN RVVLVEFFAP WCGHCQALTP IWEKAATVLK GVATVAALDA DAHKSLAQEY GIKGFPTIKV FSPGKPPVDY  QGAREAKPIA EFALSQIKAL LKERLSGKTT GGSNEKSEPN VSVELNSRNF DELVIKSKEL WVVEFFAPWC GHCKKLAPEW KKAANNLKGK VKLGHVNCDE DKSLMSRFNV QGFPTILVFG  ADKDTPVPYE GARTASGIES FALEQLDTNS PPPEVTELTG PNVLEEKCGP AAICFVSFLP DILDSKAEGR NKYLQQVLSV AEKFKRSPYS YVWAAAGKQP DLETHVGVGG YGYPAMVALN 
LKKGAYAPLR SAFQVDQITE FVKEAGRGGK GNLPLEATPT IVKTEPWDGK DGEIIEEDEF SLEELMGEDT TGKNEL 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCAAGAT CAAAGTCATC TCAGCCGTTG ATCGCCCTTG CACTGACCCT CTTCTTCGTT TCCGCCAGCG TTCACGCTCT CTACGGTCCA TCTACGCCTG TTCTTCAACT CACTCCTTCC  AACTTCAAGT CCAAGGTAGC TTGCAAACCC TACCTATCGA TATTTGGATT ATCTTATTAA TTTATTTTCC TTATTGTTTA GTCATTATCT CGATTTGATG CAGTTTTGGA TCTAATATAT  CTGGTGTAAT TCTTGCTAGA GTTCCCTTGA CCCCGCTGTA CAATATAGAG AATACTTTTG TTGGTGGCAG ATAGTTGTCA TTCGTACTTT GTATTTAGAA TGTAATTACT AAGTATGGTA  TTTTGTTTCT TTATGATTTT TTATGCATAG ATGACATTAT GTATACGAAC ATTTGATGCT AAGGAATGCA CATGAAACTT GTAGAAACTC ATTTTGTTGA CGGTTGCTAA GGTATTACTA  TTAAACATGT AATTTTGTTT TTGAAATTAT GAGACATGGT ATTCCGTGAG AGTCCATAGG TGGACTATGA TTCTCAATCC ATAGCATAAC ATTTTTTCTG TTGCACATTG GTTCTAGTTT  GTAAAATTTT AAATCTAACG ACTTAGACTA GAATCATTTA CATTTATAAA GATTGTGCGG TTTTTTTGAT AAATGCCGAG TACACTGGTG CTTGTTGAGT AAAATTCATT GCAAGTTGAG  TACATTTATA AAGATTGTGC GGTTTTTTTG ATAAATGCCG AGTACACTGG TGCTTGATTT TTCCTATGTC CTGGTTTTAT TTAAATTTTT TTTATTGTGT TTATTGATTT CTCAACTTGC  CGGCAGGTAT TGGACTCAAA CAGAGTTGTT CTAGTTGAGT TCTTTGCACC TTGGTGCGGC CACTGTCAGG CCTTGACTCC AATATGGGAG AAGGCCGCTA CTGTCTTGAA AGGTGTTGCT  ACTGTAGCAG CACTTGATGC CGACGCTCAC AAGTCCCTTG CTCAGGTTTT TTTTCTACTT TTCCCAGTTC TTTTTCTTTT CTTTCTTACC CATTCATAAA GTACAAAAGA AAGTGGATCC  TCGACAACAT TTATTGGACA ATTGATGGTT ATGTCTAAAT TATGCCCCCC AAATTTGCGT TCCTTGGGTC GAAGTCAACT GCGAAATCAT GTTATATGCC TATAGGGTGT GTTTTTCATC  TTTACTTTTG TCTCCATTGT GCTATTTGGT ATATGCTAAA TCATTAGGTA AAGTAAATTT CATCTCCACA GACTTTGACT AGTTTATTTA AGTGGGTGGT CTCATGGTTT CTGATTTTCC  CAGTATGTGC ATTCCACTAA TTGGCTAAAC ATATAAACTT CAACCTGAGC TGGATAGATG TCAGGAGCTT TTCTTATAGG CTGTGCTTCA GAGCTGGAGT TTGTTTGCTG TTTTGTTTGT  GTAGAATTTG CTAAGGTTGA TGCATACAAC TAGGGTAGTT GCTGATTTTA CCTGGACTGA TTCTTTGCGT TTGATTATGA CAGGAGTATG GGATTAAAGG ATTCCCTACG ATAAAGGTCT  TTTCCCCTGG GAAGCCTCCT GTAGATTATC AAGGTGCCAG GGAAGCGAAA CCAATTGCAG AATTCGCACT CTCTCAGGTT TAGTATGATC GGTTAACTTC AATTCTTTAA ATGTTGATGT  TAATCAGCTC TTACATTTCT GTTATTCTTA CTTTACTTCT TGTTAAGAAA CTGCTTGCAT AAAATTGTGC CCAATCTGTG TCTTTTTTAC CTTTTGTCAC TGCTCTTCTT CTTCAATGCC  TTCTTTCTAG TTCTGAATGT TGCTACAGTA TCTCATTTCA TTTGTCCTCT CTCTTAACAG ATAAAGGCTC TTCTGAAGGA ACGTTTAAGT GGAAAGACAA CCGGAGGGTC CAATGAAAAA  TCTGAACCCA ATGTTTCTGT AGAATTGAAT TCTCGCAATT TTGATGAGTT GGTGATAAAA AGCAAAGAAC TATGGGTCGT AGAATTTTTC GCTCCTTGGT AAGTACCATT TACTTTTAAT  AGTTCAGATA TAAATTTGCA TGCAGCCAGG TAATAGGGAA CCTTTTCTTT AACTTCTTTT GTTCTTAATA TGGTCCCTGC TCGTCTCAGC ATAGCTGATA TTAATTAGTG TCTGAAAAGA  TGCTAATGTG CACGACGGAA GACCAGAGGT GCACCATTTG AGTAGGGTTC AGAATCCTCC TAAACTGCTT TAGGATGAGA TATAGAAGGC ACGCCATATG ACATGCATCT ATAGTTGTAT  GACTTGCCAT GTGACAATCA TCAGTTTAAA TTCCTCAGAT CTCGTTGCTA ATAAGCTGTA AAAGGCAAGC TTTTTGGCAT ATATCACTAT TCAATATTTT TTCTGATCTC ATTCTTCGTG  AGATATGAAA ACAAGGTCTG CATATTTACT TCAACAATCA TCAATCTCAT TGGTACTGTG TACGTCGTGT ATATCTGTGT TATTTTCCCC AGAGGTTAAA ATCATGTAAC ATCATTGATA  GCTCTCTTTA TATTTGTTTT CTTAAGGTGT GGACACTGTA AAAAACTGGC TCCGGAGTGG AAGAAAGCTG CCAATAACTT GAAGGGGAAG GTGAAGTTGG GTCATGTAAA TTGTGATGAA  GACAAGGTAA TTTTGAGTTT CAGTTATTCA AACCATATGG GGTTATCTTT TATGTGTCGC GTGTCATGAA AGAGATAGGA TTGATTGGCA TCTTTGTCTT TGGCTTTAGA ACTAACTTCA  GAACACGATA TTGACAGCAT TTCCCTAGAC AGATCTATTA TGAGTTGGTA GTAGGTCTAA CACATCCCCG TTACCAGTCC TTGATGAGCA GGTTTAATGT CCAAGGCTTC CCCACCATCT  TGGTCTTTGG TGCTGATAAA GACACCCCTG TTCCGTATGA AGGCGCGAGA ACAGCCTCTG GAATTGAATC ATTTGCTCTA GAGCAGCTAG ATACAAACAG CCCTCCTCCT GAAGTTACTG  AGCTCACTGG TCCGGTAAGC CTGTAGTACT ATTCCTCGCT GTAACTTCAC TGGACCTCCA GTGGTCACCT CAGGAAGCAT TACTATGAAA CTTTTTTCTG AATGTTACAG AATGTCTTGG  AAGAGAAGTG TGGCCCAGCT GCCATCTGTT TTGTATCATT CTTGCCTGAC ATTTTGGACT CAAAGGCAGA AGGAAGAAAC AAGTATCTTC AGCAGGTGTT GTCAGTTGCT GAGAAGTTCA  AAAGAAGTCC TTACAGGTAC CGACACTTTC ACTTTAGCAT AGGTTTTCCT TTCTCCAACA GCACAATTTG GCTCCATGCT TCAGATGCTT AAAAGAACCT CGATATCATT CCGAAGTGAA  CATTAAAACT CCCCATTCCG AATGGAGACT GATAAAAACA ATCATTTTGC AGCTATGTTT GGGCAGCTGC TGGAAAGCAG CCTGATCTCG AGACGCATGT AGGAGTTGGC GGATATGGGT  ATCCAGCAAT GGTAGCCTTA AATTTGAAGA AAGGCGCATA CGCCCCACTT CGAAGTGCAT TCCAAGTAGA CCAGATCACG TAAGTACTTT TTCTTTCTCG TCTCTCTTTC CATTATCATG  CAAACAATTA CACAAACTGA AGTGATTTGA CATTCATTAT TACATCAGTG AGTTTGTCAA GGAAGCCGGG CGTGGAGGAA AAGGCAACTT ACCCCTTGAG GCCACTCCCA CGATTGTAAA 
GACGGAACCA TGGGATGGAA AAGACGGAGA GATCATCGAA GAGGACGAGT TCTCGCTTGA AGAACTCATG GGAGAGGATA CGACGGGCAA AAATGAGTTG TAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCAAGAT CAAAGTCATC TCAGCCGTTG ATCGCCCTTG CACTGACCCT CTTCTTCGTT TCCGCCAGCG TTCACGCTCT CTACGGTCCA TCTACGCCTG TTCTTCAACT CACTCCTTCC  AACTTCAAGT CCAAGGTATT GGACTCAAAC AGAGTTGTTC TAGTTGAGTT CTTTGCACCT TGGTGCGGCC ACTGTCAGGC CTTGACTCCA ATATGGGAGA AGGCCGCTAC TGTCTTGAAA  GGTGTTGCTA CTGTAGCAGC ACTTGATGCC GACGCTCACA AGTCCCTTGC TCAGGAGTAT GGGATTAAAG GATTCCCTAC GATAAAGGTC TTTTCCCCTG GGAAGCCTCC TGTAGATTAT  CAAGGTGCCA GGGAAGCGAA ACCAATTGCA GAATTCGCAC TCTCTCAGAT AAAGGCTCTT CTGAAGGAAC GTTTAAGTGG AAAGACAACC GGAGGGTCCA ATGAAAAATC TGAACCCAAT  GTTTCTGTAG AATTGAATTC TCGCAATTTT GATGAGTTGG TGATAAAAAG CAAAGAACTA TGGGTCGTAG AATTTTTCGC TCCTTGGTGT GGACACTGTA AAAAACTGGC TCCGGAGTGG  AAGAAAGCTG CCAATAACTT GAAGGGGAAG GTGAAGTTGG GTCATGTAAA TTGTGATGAA GACAAGTCCT TGATGAGCAG GTTTAATGTC CAAGGCTTCC CCACCATCTT GGTCTTTGGT  GCTGATAAAG ACACCCCTGT TCCGTATGAA GGCGCGAGAA CAGCCTCTGG AATTGAATCA TTTGCTCTAG AGCAGCTAGA TACAAACAGC CCTCCTCCTG AAGTTACTGA GCTCACTGGT  CCGAATGTCT TGGAAGAGAA GTGTGGCCCA GCTGCCATCT GTTTTGTATC ATTCTTGCCT GACATTTTGG ACTCAAAGGC AGAAGGAAGA AACAAGTATC TTCAGCAGGT GTTGTCAGTT  GCTGAGAAGT TCAAAAGAAG TCCTTACAGC TATGTTTGGG CAGCTGCTGG AAAGCAGCCT GATCTCGAGA CGCATGTAGG AGTTGGCGGA TATGGGTATC CAGCAATGGT AGCCTTAAAT  TTGAAGAAAG GCGCATACGC CCCACTTCGA AGTGCATTCC AAGTAGACCA GATCACTGAG TTTGTCAAGG AAGCCGGGCG TGGAGGAAAA GGCAACTTAC CCCTTGAGGC CACTCCCACG 
ATTGTAAAGA CGGAACCATG GGATGGAAAA GACGGAGAGA TCATCGAAGA GGACGAGTTC TCGCTTGAAG AACTCATGGG AGAGGATACG ACGGGCAAAA ATGAGTTGTA G 

Retrieve as FASTA