protTMHMM
MyspiTrxH113	436	19.78	19.74	1	i7-29o

View Redoxidase 19206
Entry information : MyspiTrxH113(Myrspi0042g0812010.t1)
Entry ID 19206
Creation 2025-07-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2025-07-03 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: MyspiTrxH113(Myrspi0042g0812010.t1)
Name MyspiTrxH113(Myrspi0042g0812010.t1)
Class Thioredoxin Type H    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Myriophyllum spicatum    [TaxId: 208873 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value MyspiTrxH113
start..stop
S start..stop
MyspiTrxH116 870 0 1..436 1..436
MyspiTrxH106 870 0 1..436 1..437
CbraTrxH27 318 2.07e-107 3..278 11..288
CbraTrxH25 160 3.17e-45 32..268 38..266
CbraTrxH25 104 6.51e-25 30..150 154..275
CbraTrxH25 93 5.7e-21 165..282 43..165
Literature and cross-references MyspiTrxH113(Myrspi0042g0812010.t1)
Protein sequence: MyspiTrxH113(Myrspi0042g0812010.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   436
PWM (Da)   %s   47258.25 Transmb domain   %s   i7-29o
PI (pH)   %s   5.78
A INSERT TMH
INSERT INTO TMH(TMH_IdPerox,TMH_PeroxName,TMH_Type,TMH_Length, TMH_Expa,TMH_First60,TMH_PredHel,TMH_Topo) VALUES ('19206','MyspiTrxH113','pep','436','19.78','19.74','1','i7-29o')

Insert TMH record :
INSERT INTO TMH(TMH_IdPerox,TMH_PeroxName,TMH_Type,TMH_Length, TMH_Expa,TMH_First60,TMH_PredHel,TMH_Topo) VALUES ('19206','MyspiTrxH113','pep','436','19.78','19.74','1','i7-29o')

Update Perox 19206 Properties = '436;5.78;47258.25'
signalp /usr/local/bioinfo/src/SignalP/signalp-4.1/signalp -m ./assets/temp/tmp_mature ./assets/temp/tmp_pep 2>/dev/null
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSRSKSSQPL IALALTLFFV SASVHALYGP STPVLQLTPS NFKSKVLDSN RVVLVEFFAP WCGHCQALTP IWEKAATVLK GVATVAALDA DAHKSLAQEY GIKGFPTIKV FSPGKLPVDY  QGAREAKPIA EFALSQIKAL LKERLSGKTT GGSNEKSEPG ASVELNSRNF DELVIKSKEL WVVEFFAPWC GHCKKLAPEW NKAANNLKGK VKLGHVNCDE DKSLMSRFNV QGFPTILVFG  TDKDAPVPYE GARTASGIES FALEQLDTNS PPPEVTELTG PNVLEEKCGP AAICFVSFLP DILDSKAEGR NKYLQQVLSV AEKFKRSPYS YVWAAAGKQP DLEKHVGVGG YGYPAMVALN 
LKKGAYAPLR SAFEVDQITE FVKEAGRGGK GNLPLEATPM IVKTEPWDGK DGEIIEEDEF SLEELMGEDT TGKDEL 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCAAGAT CAAAGTCATC TCAGCCGTTG ATCGCCCTTG CACTGACCCT CTTTTTCGTT TCCGCCAGCG TTCACGCTCT CTACGGTCCA TCTACGCCTG TTCTTCAACT CACTCCTTCC  AACTTCAAGT CCAAGGTAGC TTGCAAACCC TACCTATTGA TTTTTGGATT ATCTTATTGA TTTATTCTCC TTATTGTTTA GTCATTATCT CGATTTGATG CAGTTTTGGA TCTAATATAT  CTGGTGTAAT TCTTGCTAGA GTTCTCTTGA CCCCGCTGTA CAATATAGAG AATACTTTTG TTGGTGGCAG ATAGTTGTCA TTCGTACTTT GTATTTAGAA TGTAATTACT AAGTATGATA  TTTTGTTTCT TTATGATTTT TTATGCATAG ATGACATTAT GTATACGAAC ATTTGATGCT AAGGAATGCA CATGAAACTT GTAGAAACTC ATTTTGTTGA CGGTTGCTAA GATATTACTA  TTAAACATGT AATTTTGTTT TTGAAATTAT GAGACATGGT ATTCCGTGAG AGTCCAGAAG TCGACTATGA TTCTCAATCC ATAGCATAAC ATTTTTTCTG TTGCACATTG GTTCTAGTTT  ATAAAATTTT AAATCTAACG ACTTATACTA GAATCATTTA CATTTATAAA GATTGTGCGG TTTCATTGAT AAATGCCGAG TACACTGGTG CTTGTTGAGT AAAATTCATT GCAAGTTTAG  TTGGATTTCT GTTAAGCACA ATGCATTTAA ATAGAATGGA GGATAGTTAC AGAAAGTGCC ACTGCTATGA GGCATGAGCT TAGGTTTGTC ATAGAAAAAA CTTGTTGGAT TAAATTTGCG  CTTAAAAGGA CAAAAATAAA GAAAAATGGA GTCTTTTTAT GACATTGAAG AAATTAAATA ACTGGTGCCT CGCACGAGTA CAGATAGAGA ATGGGATGAG TTCCTGATAA ACCATGTCTG  TCTCTGGTGA TGATGTGGCT TTTTTCTTAC TTTTTCCTAT GTCCTGGTTT TATTTAAATT TCCCTTTTTT TTATTGTGCT TATTGATTTC TCAACTTGCG GCAGGTATTG GACTCAAACA  GAGTTGTTCT AGTTGAGTTC TTTGCACCTT GGTGCGGCCA CTGTCAGGCC TTGACTCCAA TATGGGAGAA GGCCGCTACT GTCTTGAAAG GTGTTGCTAC TGTAGCAGCA CTTGATGCCG  ACGCTCACAA GTCCCTTGCT CAGGTTTTTT TTTCTACTTT TCCCAGTTCT TTTTCTTTTC TTTCTTACCC ATTTATAAAG TACAAAAGAA AGTGGATCCT CGACAATGTT TATTGGACAA  TTGATGGTTA TATCTAAATT ATGCCCCCCA AATTTGCGTT CCTTGGGTTG AAGTCAACTG TGAAATCATG TTATATGCCT ATAGGGAGTG TTTTTCATCT TTACTTTTGT CTCCATGTTG  CTATTTGGTA TACGCTAAAT CATTAGATAA AGTAAATTTC ATGTCCACAG TGGTGGTCTC ATGGTTTCTG ATTCTCCCAG TATGGGCATT CCACTAATTG GCTAAACATA TAAACTTCAA  CCTGAGCTGG ATAGATGTCA AGAACCTTTC TTATAGGCTG CGCTTCAGAG CTGGAGTTTG TTTGCTGTTT TGTTTGTGTA GAATTTGCTA AGGTTGATTA GCATACAACT AGGGTAGTTG  CTGATTTTAC CTGGACTGAT TCTTTGCGTT TGATTATGAC AGGAGTATGG GATTAAAGGA TTCCCTACGA TAAAGGTCTT TTCCCCTGGG AAGCTTCCTG TAGATTATCA AGGTGCCAGG  GAAGCGAAAC CAATTGCAGA ATTCGCACTC TCTCAGGTTT AGTATGATCG TTAACTTCAA TTCTTTAAAT GTTGATGTTA ATCAGCTCTT ACATTTCTGT TATTCTTACC TTTACTTCTT  GATAAGAAAC TGCTTGCATA AAATTGTGCC CAATCTGTGT CTTTTTTACC TTTCGTCACT GCTCTTCTTC TTCAATGCCT TCTTTCTAGT TCTGAATGTT GCTACAGTAT CTCATTTCAT  ACATCCTCTC TCTTAACAGA TAAAGGCTCT TCTGAAGGAA CGTTTAAGTG GAAAGACAAC CGGAGGGTCC AATGAAAAAT CTGAACCAGG TGCTTCTGTA GAATTGAATT CTCGCAATTT  TGATGAGTTG GTGATAAAAA GCAAAGAACT ATGGGTCGTA GAATTTTTCG CTCCTTGGTA AGAACCATTT ACTTTTAGTA GTTCAGATAT AAATTTGCAT GCAGCCAGGT AACAGGGAAC  CTTTTCTTAT GGTCCTTGCT CGTCTCAGCA TAGCTGATAT TAATTAGTGT CTGAAAAGAT GCTAATGCGC ACGACGGAAG ACCAGAGGTG CACCATTTGA GTAGGGTTCA GAATCCTCTT  AAACTGCTTT AGGATGAGAT ATAGAAGGCA CGCCATATGG CATGCATCTA TAGTTGTATG ACTTGCCATG TGACGATCAT CAGTTTAAAT TCCTCAGATC TCGTTGCTAA TAAGCTGTAA  AAGGCAAGCT TTTTGGCATA TATCACTATT CAATATTTCT TCTGATCTCA TTCTTTGTGA GATATGGAAA CAAGGTCTGC ATATTTACTT TAACAATCAT CAATTTCATT GGTACTGTGT  ACGTCGTGTA TATCTGTGTT ATTTTCCCCA GAGGTTAAAA TCATGTAACA TCATTGGTAG CTCCCTTTAT ATTTGTTTTC TTAAGGTGTG GACACTGTAA AAAACTGGCT CCGGAGTGGA  ACAAAGCTGC CAATAACTTG AAGGGGAAGG TGAAGTTGGG TCATGTAAAT TGTGATGAAG ACAAGGTAAT TTTGAGTTTC AGTTATTCAA ACCATATGAG GTTATCTTTT ATGTGTCGCG  TGTCATGAAA GAGATAGGAT TGATTGGCAT CTTTGTCTTT GACTTTAGAA ATAACTTTCA GAACATGATA TTGACAGTAT TTCCCTAGAC AGATCTATTA TGAGTTGGTA GTAGGTCTAA  CACATCCCCG TTACCAGTCC TTGATGAGCA GGTTTAATGT CCAAGGATTC CCCACCATCT TGGTCTTTGG TACTGATAAA GATGCCCCTG TTCCGTATGA AGGCGCGAGA ACAGCCTCTG  GAATTGAATC ATTTGCTCTA GAGCAGCTAG ATACAAACAG CCCTCCTCCT GAAGTTACTG AGCTCACTGG TCCGGTAAGC CTGTAGTACT ATTCCTCGCT GTAACTTCAC TGGACCTCCA  GTGGTCACCA AAGGAAGCAT TACTATGAAA CTTCTTTCTG AATGTTACAG AATGTCTTGG AAGAGAAGTG TGGCCCAGCT GCCATCTGTT TTGTGTCATT CTTGCCTGAC ATTTTGGACT  CAAAGGCAGA AGGAAGAAAC AAGTATCTTC AACAGGTGTT GTCAGTTGCT GAGAAGTTCA AAAGAAGTCC TTACAGGTAC CGACACTTTC AATTTAGCAT AGAGGTTTCC TTTCTCCAAC  AGCACAATTT GGCTCCATGC TTCAGATGCT GAAAAGAACC TCAACAATAT TCCGAAGTGA ACATTAAAAC TCCCCATTCC GAATGGAAAC TGATAAAAAC AATCATTTTG CAGCTATGTT  TGGGCAGCTG CTGGAAAGCA GCCTGATCTC GAGAAGCATG TAGGAGTTGG CGGATATGGG TATCCAGCTA TGGTAGCCTT AAATTTGAAG AAAGGCGCAT ATGCCCCACT TCGAAGTGCA  TTCGAAGTAG ACCAGATCAC GTAAGTACTT TTTCTTTCTC GTCTCTTTTT GCATTATCGT GCAAACAATT ACACAAACTG AAGTGATTTG ACATCCATTA TTACATCAGC GAGTTTGTCA  AGGAAGCCGG GCGTGGAGGA AAAGGCAACT TACCCCTTGA GGCCACTCCC ATGATTGTAA AGACGGAACC ATGGGATGGA AAAGACGGAG AGATCATCGA AGAGGACGAG TTCTCGCTTG 
AAGAACTCAT GGGAGAGGAT ACGACGGGCA AAGATGAGTT ATAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCAAGAT CAAAGTCATC TCAGCCGTTG ATCGCCCTTG CACTGACCCT CTTTTTCGTT TCCGCCAGCG TTCACGCTCT CTACGGTCCA TCTACGCCTG TTCTTCAACT CACTCCTTCC  AACTTCAAGT CCAAGGTATT GGACTCAAAC AGAGTTGTTC TAGTTGAGTT CTTTGCACCT TGGTGCGGCC ACTGTCAGGC CTTGACTCCA ATATGGGAGA AGGCCGCTAC TGTCTTGAAA  GGTGTTGCTA CTGTAGCAGC ACTTGATGCC GACGCTCACA AGTCCCTTGC TCAGGAGTAT GGGATTAAAG GATTCCCTAC GATAAAGGTC TTTTCCCCTG GGAAGCTTCC TGTAGATTAT  CAAGGTGCCA GGGAAGCGAA ACCAATTGCA GAATTCGCAC TCTCTCAGAT AAAGGCTCTT CTGAAGGAAC GTTTAAGTGG AAAGACAACC GGAGGGTCCA ATGAAAAATC TGAACCAGGT  GCTTCTGTAG AATTGAATTC TCGCAATTTT GATGAGTTGG TGATAAAAAG CAAAGAACTA TGGGTCGTAG AATTTTTCGC TCCTTGGTGT GGACACTGTA AAAAACTGGC TCCGGAGTGG  AACAAAGCTG CCAATAACTT GAAGGGGAAG GTGAAGTTGG GTCATGTAAA TTGTGATGAA GACAAGTCCT TGATGAGCAG GTTTAATGTC CAAGGATTCC CCACCATCTT GGTCTTTGGT  ACTGATAAAG ATGCCCCTGT TCCGTATGAA GGCGCGAGAA CAGCCTCTGG AATTGAATCA TTTGCTCTAG AGCAGCTAGA TACAAACAGC CCTCCTCCTG AAGTTACTGA GCTCACTGGT  CCGAATGTCT TGGAAGAGAA GTGTGGCCCA GCTGCCATCT GTTTTGTGTC ATTCTTGCCT GACATTTTGG ACTCAAAGGC AGAAGGAAGA AACAAGTATC TTCAACAGGT GTTGTCAGTT  GCTGAGAAGT TCAAAAGAAG TCCTTACAGC TATGTTTGGG CAGCTGCTGG AAAGCAGCCT GATCTCGAGA AGCATGTAGG AGTTGGCGGA TATGGGTATC CAGCTATGGT AGCCTTAAAT  TTGAAGAAAG GCGCATATGC CCCACTTCGA AGTGCATTCG AAGTAGACCA GATCACCGAG TTTGTCAAGG AAGCCGGGCG TGGAGGAAAA GGCAACTTAC CCCTTGAGGC CACTCCCATG 
ATTGTAAAGA CGGAACCATG GGATGGAAAA GACGGAGAGA TCATCGAAGA GGACGAGTTC TCGCTTGAAG AACTCATGGG AGAGGATACG ACGGGCAAAG ATGAGTTATA G 

Retrieve as FASTA